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小鼠CDC26基因短發夾RNA重組腺病毒載體的構建與表達分析

2014-10-27 09:04:52程然然閆永紅弓蒙蒙曹培麗賀福初王曉暉
生物技術通訊 2014年5期
關鍵詞:小鼠

程然然,閆永紅,弓蒙蒙,曹培麗,賀福初,,王曉暉

1.北京工業大學 生命科學與生物工程學院,北京 100124;2.軍事醫學科學院 放射與輻射醫學研究所,北京蛋白質組研究中心 蛋白質組學國家重點實驗室,北京 102206

細胞分裂周期蛋白26(cell division cycle 26,CDC26)是細胞周期后期促進復合物(cell cycle anaphase-promotingcomplex,APC)家 族 成 員 。CDC26基因是編碼泛素連接酶的基因之一,通過編碼細胞中泛素連接酶來調控細胞周期蛋白的合成與分解,以實現細胞周期性的分裂與增殖分化[1-2]。CDC26和APC6連接后,可以對細胞周期蛋白的降解產生作用[3]。

目前對CDC26基因的研究報道不多,大多都是對CDC25和CDC42基因所控制的其蛋白家族的研究[4-6]。RNA干擾(RNA interfering,RNAi)是近年發展迅速的一項生物技術,已成為基因功能研究和基因治療的強有力工具[7]。我們以短發夾RNA(short hair RNA,shRNA)腺病毒為介導,構建靶向干擾CDC26基因的表達載體,為CDC26基因功能的研究提供相關技術手段和積累資料。

1 材料與方法

1.1 材料

人293A細胞株、HeLa細胞株、小鼠胚胎成纖維細胞(mouse embryonic fibroblast,MEF)、大腸桿菌Top10菌株、穿梭載體pENTRY-EF1a-EGFP-Mir30、腺病毒載體pAd/pl-DEST均來自北京蛋白質組研究中心分子遺傳學實驗室;DNA限制性內切酶、T4DNA連接酶購自NEB公司;Gateway體外重組系統、PEI轉染試劑、TRIzol購自Invitrogen公司;DNA快速純化回收試劑盒、質粒提取試劑盒購自Promega公司;其他常規試劑均為進口或國產分析純級產品。

1.2 穿梭載體pENTRY-CDC26-shRNA的構建和鑒定

參考小鼠CDC基因(GenBank:NM_139291.3)設計CDC26基因的靶向shRNA序列(TGCTGTTGACA GTGAGCGCAGCTCAAGCTCGACGACATTGTAGTGAAGCCACAGA TGTACAATGTCGTCGAGCTTGAGCTTTGCCTACTGCCTCGGA)及對照組shRNA序列(為GFP的靶向序列,命名為S000)(TGCTGTTGACAGTGAGCGAAACGTCTATATCATGGCCG ACTAGTGAAGCCACAGATGTAGTCGGCCATGATATAGACGTTGT GCCTACTGCCTCGGA)。

本研究避開了傳統的PCR擴增靶向shRNA序列,而是依據DNA雙鏈互補性質將目的序列分割合成,而后以退火連接的方式構建其載體。CDC26序列拆分如下:

A:tcgagaaggtatattgctgttgacagtgagcgCAGCTCAAGCTCGACG ACATTG;B:ttcactaCAATGTCGTCGAGCTTGAGCTGcgctcactgtca acagcaatataccttc;C:tagtgaagccacagatgtaCAATGTCGTCGA GCTTGAGCTTtgcctactgcctcgg;D:aattccgaggcagtaggcaAAG CTCAAGCTCGACGACATTGtacatctgtggc。

S000對照組以同樣的方法拆分,由華大基因有限公司(北京)合成。A和B退火,C和D退火,退火產物直接暴露有XhoⅠ和EcoRⅠ酶切位點,無須再次酶切。將2段退火產物與pENTRY-EF1a-EGFPMir30(XhoⅠ和EcoRⅠ酶切回收)載體用T4DNA連接酶連接,轉化大腸桿菌TOP10感受態細胞,卡那霉素(Kan)抗性選擇陽性克隆,提質粒,送華大基因有限公司進行測序鑒定。

1.3 重組腺病毒載體pAd-CDC26-shRNA的構建

將測序鑒定正確的pENTRY-CDC26-shRNA載體用Gateway體外重組系統重組到pAd/pl-DEST。Gateway反應體系(10 μL)包括6 μL TE(pH8.0)、1 μL pENTRY-CDC26-shRNA(100 ng)、1 μL pAd-DEST(150 ng)、2 μL LRⅡ重組酶。室溫反應1 h,轉化大腸桿菌TOP10感受態細胞,氨芐西林(Amp)抗性選擇陽性克隆,提取質粒用EcoRⅠ酶切鑒定。

1.4 重組腺病毒的包裝與擴增

將正確的重組子用PacⅠ酶切線性化,乙醇沉淀法回收,用PEI轉染293A細胞,24 h后觀察GFP的表達,培養7~10 d后在顯微鏡下觀察細胞空斑病變,當細胞中出現病變且視野中局部或全部為綠色熒光時,表明重組腺病毒在293A細胞中包裝成功。當部分細胞開始變圓并脫落時,收集細胞及其培養液,于-80℃與37℃反復凍融3次裂解細胞以釋放病毒顆粒,4000 r/min離心10 min,取上清于-80℃保存,將回收到的病毒原液感染新的293A細胞,擴增病毒,回收備用。

1.5 病毒滴度的測定

準備生長良好的HeLa細胞,消化計數稀釋至1×105/mL,加入6孔板,1 mL/孔;將3個稀釋度(10-2、10-3、10-4)的病毒加入6孔板,24 h后觀察病毒感染細胞的熒光數量[8],利用流式細胞儀檢測病毒滴度。

1.6 CDC26 shRNA重組腺病毒在細胞內的表達及干擾效果鑒定

基礎細胞培養液加10%胎牛血清(FBS)培養MEF,其密度達90%時用已知滴度的病毒液感染細胞,24 h后觀察GFP的表達情況,以確定重組腺病毒是否感染MEF。收集感染的實驗組細胞與對照組(S000)細胞,TRIzol法提取總RNA,并反轉錄形成cDNA。采用實時熒光定量PCR(qPCR)檢測CDC26基因mRNA的表達情況[9-10]。以β-actin為內參,用NCBI Primer Blast設計各組的定量檢測引物CDC26-F(5'-TGCAGAGGCCTGAAAAGAGATTT-3')、CDC26-R(5'-ACTCCTCAATGTCGTCGAGC-3')、 β-ac?tin-F(5'-AACAGTCCGCCTAGAAGCAC-3')和 β-actin-R(5'-CGTTGACATCCGTAAAGACC-3')。用 2-ΔΔCt法進行相對定量分析,檢測CDC26基因mRNA的表達情況。

2 結果

2.1 穿梭質粒pENTRY-CDC26-shRNA的克隆

將克隆好的CDC26與對照組S000入門質粒進行測序鑒定,證實所設計的shRNA序列已正確插入pENTRY-EF1α-EGFP-Mir30載體。

2.2 重組腺病毒載體pAd-CDC26-shRNA的構建

pAd-CDC26-shRNA載體經EcoRⅠ酶切,結果與理論預期相符(圖1),表明成功構建了腺病毒重組載體pAd-CDC26-shRNA。

2.3 重組腺病毒的包裝

帶有GFP標記的線性化pAd-CDC26-shRNA及對照組pAd-S000-shRNA載體轉染293A細胞8 d后,在顯微鏡下觀察到細胞病變,且GFP充滿視野中的絕大多數細胞,表明腺病毒包裝成功(圖2)。

2.4 病毒滴度測定結果

用流式細胞儀檢測3個濃度梯度的細胞熒光產生情況,結果見圖3,陰性對照組無熒光產生,其余3組(10-2、10-3、10-4)都產生了不同層次的熒光數目。假定每一個細胞內只有一個病毒進入,則根據公式及10-2管的病毒感染率可計算出病毒初液的滴度(UT/mL)=0.835×1.18×106×100/0.9=1.09×1010。

2.5 CDC26 shRNA重組腺病毒在細胞內的表達及干擾效果

用已知滴度的病毒感染3代以內的MEF,24 h后在熒光顯微鏡下觀察,可見視野中有大量綠色熒光(圖4),說明重組腺病毒成功感染了MEF。收集各組細胞進行實時熒光定量PCR檢測,結果表明熒光定量PCR引物具有很好的溶解曲線(圖5),表明PCR引物特異性良好。被感染了病毒的細胞其相應的基因擴增率僅為26.85%,可計算出設計和構建的shRNA對細胞中CDC26基因的抑制率為73.14%(圖6),表明成功構建了具有較高敲低效果的shRNA腺病毒載體。

2.6 CDC26 shRNA重組腺病毒在小鼠肝臟內的干擾效果研究

用已知病毒滴度的腺病毒,尾靜脈注射6~8周雄性C57/BL6小鼠,1010/只,對照組和實驗組各5只,注射1周后測量小鼠空腹血糖。結果發現,與對照小鼠相比,注射CDC26 shRNA的小鼠的血糖值明顯降低(圖7),表明CDC26在小鼠體內血糖的維持中起重要作用,同時暗示了CDC26在糖代謝過程中的重要作用。

3 討論

CDC26是APC家族中的一員,由位于小鼠4號染色體上的CDC26基因編碼,對調控細胞周期具有重要作用。目前有關APC家族的研究主要集中在CDC25和CDC42上[11],對CDC26的研究報道較少。

圖1 pAd-CDC26-shRNA重組質粒的酶切鑒定

圖2 重組腺病毒包裝過程中的細胞病變效應及GFP表達(×40)

圖3 流式細胞術檢測pAd-CDC26-shRNA重組腺病毒滴度

圖4 重組腺病毒感染MEF(×40)

圖5 實時熒光PCR引物特異性的溶解曲線

圖6 構建的shRNA敲低CDC26 mRNA的RT-qPCR檢測結果

圖7 病毒注射7 d后C57/BL6小鼠的空腹血糖值

為了進一步研究CDC26在細胞中可能發揮的作用,我們設計了CDC26基因的shRNA。鑒于腺病毒具有感染效率高、宿主廣泛、容易制備表達、不整合入染色體、表達效率高等優點,我們選擇構建CDC26基因的shRNA腺病毒載體。通過限制性內切酶分析及堿基序列測定,證明構建了重組腺病毒載體pAd-CDC26-shRNA。我們在293A細胞中包裝了重組腺病毒。RT-qPCR檢測結果顯示,感染pAd-CDC26-shRNA腺病毒的MEF中CDC26基因的mRNA表達明顯減少,證明靶向shRNA表達成功。我們還發現CDC26敲低后小鼠的血糖值會明顯降低。以上結果為下一步機制研究奠定了基礎。

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