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均勻設(shè)計在釀酒酵母電轉(zhuǎn)化條件研究中的應用

2014-07-21 18:42:47張啟聲李珺王翠峰蔡祿
湖北農(nóng)業(yè)科學 2014年3期

張啟聲+李珺+王翠峰+蔡祿

摘要:電穿孔方法是一種高效導入外源DNA的技術(shù)。通過電轉(zhuǎn)化法對酵母YPH 500進行外源DNA轉(zhuǎn)化,研究了電轉(zhuǎn)化中各因素對酵母轉(zhuǎn)化率的影響。結(jié)果表明,電場強度、外源DNA濃度、感受態(tài)細胞狀態(tài)對轉(zhuǎn)化率有明顯影響。采用均勻設(shè)計試驗,利用逐步回歸方法對試驗結(jié)果進行分析, 結(jié)果表明,當電場強度在1 750 V,酵母OD 600 nm在1.3,外源DNA濃度為7.5 mg/L時,酵母轉(zhuǎn)化率較高,約為24×102轉(zhuǎn)化子數(shù)/μg DNA。

關(guān)鍵詞:電轉(zhuǎn)化;釀酒酵母;均勻設(shè)計

中圖分類號:Q785;S963.32+7 文獻標識碼:A 文章編號:0439-8114(2014)03-0693-04

釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)是一種模式生物,常常作為表達系統(tǒng)。近些年,研究者常利用它進行外源基因的表達或其他基因操作技術(shù),所以外源基因的導入是進行試驗的先決條件。20世紀80年代,研究者開始利用電轉(zhuǎn)化法將外源DNA導入酵母細胞,該方法現(xiàn)已成為常用方法[1,2]。在轉(zhuǎn)化時,試驗結(jié)果往往受感受態(tài)細胞狀態(tài)、外源DNA濃度、電場強度等多個條件的影響,需要探索最佳電轉(zhuǎn)化率的條件。但其中涉及多因素、多水平的試驗,常規(guī)探索性試驗工作量較大。均勻設(shè)計具有試驗次數(shù)少,信息量大的優(yōu)點,只需做少量試驗,建立數(shù)學模型,就可得到最佳的配比。本試驗將穿梭質(zhì)粒通過電轉(zhuǎn)化到釀酒酵母YPH 500中,從中考察電場強度、外源DNA濃度和酵母細胞不同的生長狀態(tài)下3個因素對電轉(zhuǎn)化的影響,以期為釀酒酵母電轉(zhuǎn)化的應用提供參考依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 試驗材料與儀器

1.1.1 菌種和質(zhì)粒 釀酒酵母YPH 500(遺傳背景:MATα ura3-52 lys2-801anber ade2-101ochre trp1-Δ63 his3-Δ200 leu2-Δ1)、穿梭質(zhì)粒pRS405由美國新澤西州醫(yī)學院微生物學與分子遺傳學部Carol S. Newlon教授贈送。

1.1.2 培養(yǎng)基 YPD培養(yǎng)基:1%酵母粉,2%蛋白胨,2%葡萄糖(固體培養(yǎng)基瓊脂含量1.5%)。SD篩選培養(yǎng)基:1.34%YNB,2%葡萄糖,2%瓊脂,氨基酸(ade、ure、trp、his、lys,均為20 mg/L),SD全營養(yǎng)培養(yǎng)基:在SD篩選培養(yǎng)基的基礎(chǔ)上加100 mg/L leu。

1.1.3 試劑與主要儀器 1 mol/L山梨醇(南京博爾迪生物科技有限公司);DP103型小提試劑盒[天根生化科技(北京)有限公司]。2510型電轉(zhuǎn)儀、高速冷凍離心機(Eppendorf公司);722型可見光分光光度計(上海馳唐電子有限公司);紫外分光光度計(美國Merinton公司);光學顯微鏡[OLYMPUS(中國)有限公司]。

1.2 試驗方法

1.2.1 酵母YPH 500生長曲線的測定 將凍存菌種在YPD固體培養(yǎng)基上劃線,30 ℃培養(yǎng)3~4 d。立即挑取單菌落接種于含有100 mL YPD液體培養(yǎng)基的250 mL錐形瓶中,30 ℃、180 r/min培養(yǎng)。每隔2 h取樣測定OD600 nm值,同時通過細胞計數(shù)板計數(shù)。繪制酵母菌生長曲線。

1.2.2 外源DNA的制備 在穿梭質(zhì)粒pRS405上搭載酵母ARS304片段,導入大腸桿菌DH5α中儲存。采用DP103型小提試劑盒提取pRS405- ARS304質(zhì)粒。將所得產(chǎn)物用紫外分光光度計測量質(zhì)粒含量。

1.2.3 感受態(tài)細胞的制備 挑取活化好的酵母單菌落接種于含有50 mL YPD液體培養(yǎng)基的250 mL錐形瓶中,30 ℃ 180 r/min培養(yǎng)。將培養(yǎng)好的細胞冰上放置10 min,倒入50 mL離心管中,4 ℃、1 300 r/min離心5 min。去掉培養(yǎng)液,用50 mL預冷的無菌水將菌體沉淀重懸,重復此步驟,洗滌2遍。再加入10 mL冰冷的1 mol/L山梨醇重懸菌體。最后加入1 mL冰冷的1 mol/L山梨醇。

1.2.4 電轉(zhuǎn)化單因素驗證 將制備好的不同時期感受態(tài)細胞、外源DNA分別混勻進行以下處理,電轉(zhuǎn)化體系均為60 μL。①外源DNA 濃度5.0 mg/L,取不同感受態(tài)細胞的OD600 nm(0.2、0.4、0.7、1.1、1.3、1.4、1.5)進行處理,感受態(tài)細胞用量80 μL,電場強度1 500 V;②感受態(tài)細胞OD600 nm為 1.1,用量為80 μL,取不同外源DNA濃度(0.25、1.25、2.5、5.0、7.5、10.0、12.5 mg/L )進行處理,電場強度1 500 V;③感受態(tài)細胞OD600 nm 為1.1,外源DNA濃度5.0 mg/L,取不同電場強度(600、900、1 200、1 500、1 800、2 100、2 400 V)進行處理。將反應液在冰上加入到空管中混勻,轉(zhuǎn)移到電轉(zhuǎn)杯中進行電轉(zhuǎn)化。

1.2.5 電轉(zhuǎn)化均勻試驗 確定所要研究的感受態(tài)細胞狀態(tài)、外源DNA濃度、電場強度3個因素的不同水平,根據(jù)均勻設(shè)計[2]進行試驗,試驗因素和水平見表1。

1.2.6 電轉(zhuǎn)化效果評價 將轉(zhuǎn)化產(chǎn)物加入1 mol/L 冰冷的山梨醇溶液中進行洗滌。高速離心5 s去部分上清,輕柔混勻后涂布于SD篩選培養(yǎng)基上。每個試驗3次重復,其中對照組分別涂布于SD 篩選培養(yǎng)基和SD全營養(yǎng)培養(yǎng)基上。30 ℃培養(yǎng)4 d,統(tǒng)計平板菌落個數(shù)。計算轉(zhuǎn)化率,評價每組試驗效果[3],其定義如下:

轉(zhuǎn)化率=轉(zhuǎn)化子/外源DNA量×稀釋倍數(shù)。

2 結(jié)果與分析

2.1 外源DNA的制備

將酵母YPH 500中的ARS304片段進行克隆,通過 BamHⅠ和SacⅠ進行雙酶切后搭載于穿梭質(zhì)粒pRS405上形成pRS405-ARS,該質(zhì)粒結(jié)構(gòu)如圖1所示。

在轉(zhuǎn)化時,環(huán)狀質(zhì)粒線性化便于整合到宿主細胞基因組中從而提高轉(zhuǎn)化率[4]。pRS405作為穿梭質(zhì)粒,在一定條件下可以帶ARS304自由穿梭于原核生物和真核生物中,ARS(Autonomously replicating sequence)為酵母染色質(zhì)復制所依賴的順式作用元件,ARS序列可提高導入質(zhì)粒的復制活性,減少質(zhì)粒丟失率,同時少部分可整合到基因組中并隨基因組復制,所以目的基因不需要線性化。該質(zhì)粒攜帶有亮氨酸基因,可在亮氨酸缺陷性酵母菌株中篩選。

2.2 酵母YPH 500生長曲線的測定

由酵母YPH 500細胞數(shù)量和OD600 nm可以看出(圖2),在30 ℃、180 r/min的條件下培養(yǎng),酵母YPH 500在16~26 h可達到對數(shù)期,其OD600 nm為0.2~1.5,酵母YPH 500數(shù)量約為3.86×1011~5.04×1012個/mL。其中在28 h之后酵母數(shù)量與OD600 nm沒有相關(guān)性。

2.3 酵母YPH 500不同的生長狀態(tài)對電轉(zhuǎn)化效果的影響

酵母菌生長狀態(tài)對轉(zhuǎn)化率的影響主要是由于分裂時酵母細胞壁的結(jié)構(gòu)發(fā)生變化[5]。在電壓1 500 V、外源DNA濃度5.0 mg/L的條件下,取處于不同階段(OD600 nm為0.2~1.5)的酵母YPH 500感受態(tài)細胞80 μL進行電轉(zhuǎn)化。通過統(tǒng)計發(fā)現(xiàn),不同階段的感受態(tài)細胞對轉(zhuǎn)化率的影響差異較大,在對數(shù)初期和對數(shù)末期效率較低,是由于在初期菌量較少,外源DNA進入細胞的概率較小,而在對數(shù)末期其細胞壁較為致密不利于電穿孔。所以酵母菌生長狀態(tài)主要受2個因素控制,即細胞數(shù)和細胞壁的結(jié)構(gòu)。其中OD600 nm為1.3時的酵母YPH 500細胞電轉(zhuǎn)化率最高,達到19.5×102轉(zhuǎn)化子數(shù)/μg DNA(圖3)。

2.4 外源DNA濃度對酵母電轉(zhuǎn)化效果的影響

在電壓為1 500 V,感受態(tài)細胞OD600 nm為1.1,用量為80 μL的條件下,分別加入不同濃度的外源DNA進行電轉(zhuǎn)化。結(jié)果如圖4所示,當外源DNA濃度在7.5 mg/L時轉(zhuǎn)化率最高,但在2.5~10.0 mg/L 的范圍內(nèi)其轉(zhuǎn)化率差異較小。當外源DNA濃度較少時,有效電擊會減少[6],而當量多時反應原理尚未弄清。有研究者猜想[7]可能是由于DNA較多時,會對細胞表面點位造成影響或者是由于堵塞轉(zhuǎn)化孔道所致。當外源DNA量低于2.5 mg/L或高于10.0 mg/L時其轉(zhuǎn)化率明顯下降。本試驗中,外源DNA在一定范圍內(nèi)(2.5~10.0 mg/L)酵母電轉(zhuǎn)化率變化不大,而超出此范圍,轉(zhuǎn)化率則明顯減少。

2.5 電場強度對酵母電轉(zhuǎn)化效果的影響

采用1 mm寬度的電轉(zhuǎn)化杯,在OD600 nm為1.1的感受態(tài)細胞,用量為80 μL,外源DNA 濃度5.0 mg/L的條件下,分別施以不同的電壓進行電轉(zhuǎn)化,結(jié)果如圖5所示。在不同電壓下酵母轉(zhuǎn)化率差異較大,其中在電場強度為1 500 V時轉(zhuǎn)化率最高,1 800 V時次之,當電場強度大于1 800 V時,會造成細胞形成難以自愈的較大孔道,細胞內(nèi)大分子容易溢出,造成細胞死亡,轉(zhuǎn)化率下降。而當電場強度過小時,在細胞表面形成的孔道較小,外源DNA難以進入,使轉(zhuǎn)化率降低。在本試驗中電場強度對酵母轉(zhuǎn)化率的影響較為明顯,其閾值范圍較小(1 500~1 800 V),超出此范圍,酵母轉(zhuǎn)化率明顯降低。

2.6 均勻設(shè)計試驗結(jié)果

為進一步探討電場強度、外源DNA濃度、感受態(tài)細胞狀態(tài)3個參數(shù)及其交互作用對酵母電轉(zhuǎn)化率的影響,以轉(zhuǎn)化率為考核指標進行優(yōu)化試驗。優(yōu)化試驗結(jié)果見表2。

利用SPSS 17.0數(shù)據(jù)處理軟件對試驗數(shù)據(jù)進行回歸分析處理,得到轉(zhuǎn)化率與各因素的回歸方程為:Y=321.4+46.75X1-32.54X2-12.9X3-26.151X12+103.48X22+1 343.5X32。其中相關(guān)系數(shù)R為0.999 9,F(xiàn)值為987,作F 檢驗,F(xiàn)>F0.05(8,1)=238.9,回歸方程顯著。將試驗中的數(shù)據(jù)通過回歸方程進行預測,結(jié)果如表3所示,觀測值與擬合值誤差較小,準確度高。通過單因素分析,其通徑系數(shù)為X1(0.827 6)>X3(-0.364 9)>X2(-0.283 4)。在3個參數(shù)中,感受態(tài)細胞狀態(tài)對酵母轉(zhuǎn)化率的影響最大,電場強度次之,外源DNA濃度最小。通過對回歸方程進行極值分析,發(fā)現(xiàn)酵母感受態(tài)細胞OD600 nm為1.3,電場強度為1 750 V,外源DNA濃度為7.5 mg/L時可得到較高的電轉(zhuǎn)化效率,約為24×102轉(zhuǎn)化子數(shù)/μg DNA。

3 小結(jié)與討論

本試驗通過電場強度、外源DNA濃度、感受態(tài)細胞狀態(tài)進行單因素試驗,發(fā)現(xiàn)各因素對酵母電轉(zhuǎn)化率的影響較大,其中酵母感受態(tài)細胞OD600 nm達到1.3,電場強度達1 500~1 800V,DNA濃度達到7.5 mg/L時可在各自水平中取得較好的試驗結(jié)果。

對以上3個因素進行均勻設(shè)計,研究各因素的交互作用對酵母轉(zhuǎn)化率的影響,發(fā)現(xiàn)3個因素對酵母轉(zhuǎn)化率的影響各不相同,感受態(tài)細胞狀態(tài)影響最大,電場強度次之,外源DNA濃度最小。通過對回歸方程的極值運算,可預測酵母感受態(tài)細胞OD600 nm達到1.3,電場強度達到1 750 V,外源DNA濃度達到7.5 mg/L時可得到較高的電轉(zhuǎn)化效率。本研究結(jié)果表明電轉(zhuǎn)化效率的條件優(yōu)化利用均勻設(shè)計試驗簡單、可信度較高。如果加入其他條件的研究,將大大降低試驗組數(shù),節(jié)省試驗材料。

參考文獻:

[1] HASHIMOTO H, MORIJAWA H, YAMATA Y, et al. A novel method for transformation of intact yeast cells by electroinjection of plasmid DNA[J]. Applied Microbiol Biotechnol,1985, 21(5):336-339.

[2] 方開泰.均勻設(shè)計與均勻設(shè)計表[M].北京:科學出版社,1994. 13-17.

[3] 劉秀蓮,王宇光,雷祿旺. 海洋紅酵母電轉(zhuǎn)化條件的研究[J].生命科學研究,2008,12(2):136-140.

[4] 秦玉靜,金建玲,鮑曉明,等.影響釀酒酵母電擊轉(zhuǎn)化率的條件[J]. 山東大學學報(自然科學版),1999,34(2):236-240.

[5] BECHER D M, GUARENTE L. High-efficiency transformation of yeast by electroporation[J]. Methods Enzymol,1991,194:182-187.

[6] MEIHOC E, MASSON J M, TEISSIE J. High efficiency transformation of intact yeast cellls by electric field pulses[J].Biotechnol,1990,8:223-227.

[7] HICKS J B, HINNEN A, FINK G P. Properties of Yeast Transformation[M]. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press,1978.

在轉(zhuǎn)化時,環(huán)狀質(zhì)粒線性化便于整合到宿主細胞基因組中從而提高轉(zhuǎn)化率[4]。pRS405作為穿梭質(zhì)粒,在一定條件下可以帶ARS304自由穿梭于原核生物和真核生物中,ARS(Autonomously replicating sequence)為酵母染色質(zhì)復制所依賴的順式作用元件,ARS序列可提高導入質(zhì)粒的復制活性,減少質(zhì)粒丟失率,同時少部分可整合到基因組中并隨基因組復制,所以目的基因不需要線性化。該質(zhì)粒攜帶有亮氨酸基因,可在亮氨酸缺陷性酵母菌株中篩選。

2.2 酵母YPH 500生長曲線的測定

由酵母YPH 500細胞數(shù)量和OD600 nm可以看出(圖2),在30 ℃、180 r/min的條件下培養(yǎng),酵母YPH 500在16~26 h可達到對數(shù)期,其OD600 nm為0.2~1.5,酵母YPH 500數(shù)量約為3.86×1011~5.04×1012個/mL。其中在28 h之后酵母數(shù)量與OD600 nm沒有相關(guān)性。

2.3 酵母YPH 500不同的生長狀態(tài)對電轉(zhuǎn)化效果的影響

酵母菌生長狀態(tài)對轉(zhuǎn)化率的影響主要是由于分裂時酵母細胞壁的結(jié)構(gòu)發(fā)生變化[5]。在電壓1 500 V、外源DNA濃度5.0 mg/L的條件下,取處于不同階段(OD600 nm為0.2~1.5)的酵母YPH 500感受態(tài)細胞80 μL進行電轉(zhuǎn)化。通過統(tǒng)計發(fā)現(xiàn),不同階段的感受態(tài)細胞對轉(zhuǎn)化率的影響差異較大,在對數(shù)初期和對數(shù)末期效率較低,是由于在初期菌量較少,外源DNA進入細胞的概率較小,而在對數(shù)末期其細胞壁較為致密不利于電穿孔。所以酵母菌生長狀態(tài)主要受2個因素控制,即細胞數(shù)和細胞壁的結(jié)構(gòu)。其中OD600 nm為1.3時的酵母YPH 500細胞電轉(zhuǎn)化率最高,達到19.5×102轉(zhuǎn)化子數(shù)/μg DNA(圖3)。

2.4 外源DNA濃度對酵母電轉(zhuǎn)化效果的影響

在電壓為1 500 V,感受態(tài)細胞OD600 nm為1.1,用量為80 μL的條件下,分別加入不同濃度的外源DNA進行電轉(zhuǎn)化。結(jié)果如圖4所示,當外源DNA濃度在7.5 mg/L時轉(zhuǎn)化率最高,但在2.5~10.0 mg/L 的范圍內(nèi)其轉(zhuǎn)化率差異較小。當外源DNA濃度較少時,有效電擊會減少[6],而當量多時反應原理尚未弄清。有研究者猜想[7]可能是由于DNA較多時,會對細胞表面點位造成影響或者是由于堵塞轉(zhuǎn)化孔道所致。當外源DNA量低于2.5 mg/L或高于10.0 mg/L時其轉(zhuǎn)化率明顯下降。本試驗中,外源DNA在一定范圍內(nèi)(2.5~10.0 mg/L)酵母電轉(zhuǎn)化率變化不大,而超出此范圍,轉(zhuǎn)化率則明顯減少。

2.5 電場強度對酵母電轉(zhuǎn)化效果的影響

采用1 mm寬度的電轉(zhuǎn)化杯,在OD600 nm為1.1的感受態(tài)細胞,用量為80 μL,外源DNA 濃度5.0 mg/L的條件下,分別施以不同的電壓進行電轉(zhuǎn)化,結(jié)果如圖5所示。在不同電壓下酵母轉(zhuǎn)化率差異較大,其中在電場強度為1 500 V時轉(zhuǎn)化率最高,1 800 V時次之,當電場強度大于1 800 V時,會造成細胞形成難以自愈的較大孔道,細胞內(nèi)大分子容易溢出,造成細胞死亡,轉(zhuǎn)化率下降。而當電場強度過小時,在細胞表面形成的孔道較小,外源DNA難以進入,使轉(zhuǎn)化率降低。在本試驗中電場強度對酵母轉(zhuǎn)化率的影響較為明顯,其閾值范圍較小(1 500~1 800 V),超出此范圍,酵母轉(zhuǎn)化率明顯降低。

2.6 均勻設(shè)計試驗結(jié)果

為進一步探討電場強度、外源DNA濃度、感受態(tài)細胞狀態(tài)3個參數(shù)及其交互作用對酵母電轉(zhuǎn)化率的影響,以轉(zhuǎn)化率為考核指標進行優(yōu)化試驗。優(yōu)化試驗結(jié)果見表2。

利用SPSS 17.0數(shù)據(jù)處理軟件對試驗數(shù)據(jù)進行回歸分析處理,得到轉(zhuǎn)化率與各因素的回歸方程為:Y=321.4+46.75X1-32.54X2-12.9X3-26.151X12+103.48X22+1 343.5X32。其中相關(guān)系數(shù)R為0.999 9,F(xiàn)值為987,作F 檢驗,F(xiàn)>F0.05(8,1)=238.9,回歸方程顯著。將試驗中的數(shù)據(jù)通過回歸方程進行預測,結(jié)果如表3所示,觀測值與擬合值誤差較小,準確度高。通過單因素分析,其通徑系數(shù)為X1(0.827 6)>X3(-0.364 9)>X2(-0.283 4)。在3個參數(shù)中,感受態(tài)細胞狀態(tài)對酵母轉(zhuǎn)化率的影響最大,電場強度次之,外源DNA濃度最小。通過對回歸方程進行極值分析,發(fā)現(xiàn)酵母感受態(tài)細胞OD600 nm為1.3,電場強度為1 750 V,外源DNA濃度為7.5 mg/L時可得到較高的電轉(zhuǎn)化效率,約為24×102轉(zhuǎn)化子數(shù)/μg DNA。

3 小結(jié)與討論

本試驗通過電場強度、外源DNA濃度、感受態(tài)細胞狀態(tài)進行單因素試驗,發(fā)現(xiàn)各因素對酵母電轉(zhuǎn)化率的影響較大,其中酵母感受態(tài)細胞OD600 nm達到1.3,電場強度達1 500~1 800V,DNA濃度達到7.5 mg/L時可在各自水平中取得較好的試驗結(jié)果。

對以上3個因素進行均勻設(shè)計,研究各因素的交互作用對酵母轉(zhuǎn)化率的影響,發(fā)現(xiàn)3個因素對酵母轉(zhuǎn)化率的影響各不相同,感受態(tài)細胞狀態(tài)影響最大,電場強度次之,外源DNA濃度最小。通過對回歸方程的極值運算,可預測酵母感受態(tài)細胞OD600 nm達到1.3,電場強度達到1 750 V,外源DNA濃度達到7.5 mg/L時可得到較高的電轉(zhuǎn)化效率。本研究結(jié)果表明電轉(zhuǎn)化效率的條件優(yōu)化利用均勻設(shè)計試驗簡單、可信度較高。如果加入其他條件的研究,將大大降低試驗組數(shù),節(jié)省試驗材料。

參考文獻:

[1] HASHIMOTO H, MORIJAWA H, YAMATA Y, et al. A novel method for transformation of intact yeast cells by electroinjection of plasmid DNA[J]. Applied Microbiol Biotechnol,1985, 21(5):336-339.

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[3] 劉秀蓮,王宇光,雷祿旺. 海洋紅酵母電轉(zhuǎn)化條件的研究[J].生命科學研究,2008,12(2):136-140.

[4] 秦玉靜,金建玲,鮑曉明,等.影響釀酒酵母電擊轉(zhuǎn)化率的條件[J]. 山東大學學報(自然科學版),1999,34(2):236-240.

[5] BECHER D M, GUARENTE L. High-efficiency transformation of yeast by electroporation[J]. Methods Enzymol,1991,194:182-187.

[6] MEIHOC E, MASSON J M, TEISSIE J. High efficiency transformation of intact yeast cellls by electric field pulses[J].Biotechnol,1990,8:223-227.

[7] HICKS J B, HINNEN A, FINK G P. Properties of Yeast Transformation[M]. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press,1978.

在轉(zhuǎn)化時,環(huán)狀質(zhì)粒線性化便于整合到宿主細胞基因組中從而提高轉(zhuǎn)化率[4]。pRS405作為穿梭質(zhì)粒,在一定條件下可以帶ARS304自由穿梭于原核生物和真核生物中,ARS(Autonomously replicating sequence)為酵母染色質(zhì)復制所依賴的順式作用元件,ARS序列可提高導入質(zhì)粒的復制活性,減少質(zhì)粒丟失率,同時少部分可整合到基因組中并隨基因組復制,所以目的基因不需要線性化。該質(zhì)粒攜帶有亮氨酸基因,可在亮氨酸缺陷性酵母菌株中篩選。

2.2 酵母YPH 500生長曲線的測定

由酵母YPH 500細胞數(shù)量和OD600 nm可以看出(圖2),在30 ℃、180 r/min的條件下培養(yǎng),酵母YPH 500在16~26 h可達到對數(shù)期,其OD600 nm為0.2~1.5,酵母YPH 500數(shù)量約為3.86×1011~5.04×1012個/mL。其中在28 h之后酵母數(shù)量與OD600 nm沒有相關(guān)性。

2.3 酵母YPH 500不同的生長狀態(tài)對電轉(zhuǎn)化效果的影響

酵母菌生長狀態(tài)對轉(zhuǎn)化率的影響主要是由于分裂時酵母細胞壁的結(jié)構(gòu)發(fā)生變化[5]。在電壓1 500 V、外源DNA濃度5.0 mg/L的條件下,取處于不同階段(OD600 nm為0.2~1.5)的酵母YPH 500感受態(tài)細胞80 μL進行電轉(zhuǎn)化。通過統(tǒng)計發(fā)現(xiàn),不同階段的感受態(tài)細胞對轉(zhuǎn)化率的影響差異較大,在對數(shù)初期和對數(shù)末期效率較低,是由于在初期菌量較少,外源DNA進入細胞的概率較小,而在對數(shù)末期其細胞壁較為致密不利于電穿孔。所以酵母菌生長狀態(tài)主要受2個因素控制,即細胞數(shù)和細胞壁的結(jié)構(gòu)。其中OD600 nm為1.3時的酵母YPH 500細胞電轉(zhuǎn)化率最高,達到19.5×102轉(zhuǎn)化子數(shù)/μg DNA(圖3)。

2.4 外源DNA濃度對酵母電轉(zhuǎn)化效果的影響

在電壓為1 500 V,感受態(tài)細胞OD600 nm為1.1,用量為80 μL的條件下,分別加入不同濃度的外源DNA進行電轉(zhuǎn)化。結(jié)果如圖4所示,當外源DNA濃度在7.5 mg/L時轉(zhuǎn)化率最高,但在2.5~10.0 mg/L 的范圍內(nèi)其轉(zhuǎn)化率差異較小。當外源DNA濃度較少時,有效電擊會減少[6],而當量多時反應原理尚未弄清。有研究者猜想[7]可能是由于DNA較多時,會對細胞表面點位造成影響或者是由于堵塞轉(zhuǎn)化孔道所致。當外源DNA量低于2.5 mg/L或高于10.0 mg/L時其轉(zhuǎn)化率明顯下降。本試驗中,外源DNA在一定范圍內(nèi)(2.5~10.0 mg/L)酵母電轉(zhuǎn)化率變化不大,而超出此范圍,轉(zhuǎn)化率則明顯減少。

2.5 電場強度對酵母電轉(zhuǎn)化效果的影響

采用1 mm寬度的電轉(zhuǎn)化杯,在OD600 nm為1.1的感受態(tài)細胞,用量為80 μL,外源DNA 濃度5.0 mg/L的條件下,分別施以不同的電壓進行電轉(zhuǎn)化,結(jié)果如圖5所示。在不同電壓下酵母轉(zhuǎn)化率差異較大,其中在電場強度為1 500 V時轉(zhuǎn)化率最高,1 800 V時次之,當電場強度大于1 800 V時,會造成細胞形成難以自愈的較大孔道,細胞內(nèi)大分子容易溢出,造成細胞死亡,轉(zhuǎn)化率下降。而當電場強度過小時,在細胞表面形成的孔道較小,外源DNA難以進入,使轉(zhuǎn)化率降低。在本試驗中電場強度對酵母轉(zhuǎn)化率的影響較為明顯,其閾值范圍較?。? 500~1 800 V),超出此范圍,酵母轉(zhuǎn)化率明顯降低。

2.6 均勻設(shè)計試驗結(jié)果

為進一步探討電場強度、外源DNA濃度、感受態(tài)細胞狀態(tài)3個參數(shù)及其交互作用對酵母電轉(zhuǎn)化率的影響,以轉(zhuǎn)化率為考核指標進行優(yōu)化試驗。優(yōu)化試驗結(jié)果見表2。

利用SPSS 17.0數(shù)據(jù)處理軟件對試驗數(shù)據(jù)進行回歸分析處理,得到轉(zhuǎn)化率與各因素的回歸方程為:Y=321.4+46.75X1-32.54X2-12.9X3-26.151X12+103.48X22+1 343.5X32。其中相關(guān)系數(shù)R為0.999 9,F(xiàn)值為987,作F 檢驗,F(xiàn)>F0.05(8,1)=238.9,回歸方程顯著。將試驗中的數(shù)據(jù)通過回歸方程進行預測,結(jié)果如表3所示,觀測值與擬合值誤差較小,準確度高。通過單因素分析,其通徑系數(shù)為X1(0.827 6)>X3(-0.364 9)>X2(-0.283 4)。在3個參數(shù)中,感受態(tài)細胞狀態(tài)對酵母轉(zhuǎn)化率的影響最大,電場強度次之,外源DNA濃度最小。通過對回歸方程進行極值分析,發(fā)現(xiàn)酵母感受態(tài)細胞OD600 nm為1.3,電場強度為1 750 V,外源DNA濃度為7.5 mg/L時可得到較高的電轉(zhuǎn)化效率,約為24×102轉(zhuǎn)化子數(shù)/μg DNA。

3 小結(jié)與討論

本試驗通過電場強度、外源DNA濃度、感受態(tài)細胞狀態(tài)進行單因素試驗,發(fā)現(xiàn)各因素對酵母電轉(zhuǎn)化率的影響較大,其中酵母感受態(tài)細胞OD600 nm達到1.3,電場強度達1 500~1 800V,DNA濃度達到7.5 mg/L時可在各自水平中取得較好的試驗結(jié)果。

對以上3個因素進行均勻設(shè)計,研究各因素的交互作用對酵母轉(zhuǎn)化率的影響,發(fā)現(xiàn)3個因素對酵母轉(zhuǎn)化率的影響各不相同,感受態(tài)細胞狀態(tài)影響最大,電場強度次之,外源DNA濃度最小。通過對回歸方程的極值運算,可預測酵母感受態(tài)細胞OD600 nm達到1.3,電場強度達到1 750 V,外源DNA濃度達到7.5 mg/L時可得到較高的電轉(zhuǎn)化效率。本研究結(jié)果表明電轉(zhuǎn)化效率的條件優(yōu)化利用均勻設(shè)計試驗簡單、可信度較高。如果加入其他條件的研究,將大大降低試驗組數(shù),節(jié)省試驗材料。

參考文獻:

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