種子企業應以確立其主體地位為契機,找準方向。主要農作物種子經營(兩雜種子)逐步轉向以企業為主體的運作形式,加快兼并重組,要研究創新戰略,找準創新方向,理清創新思路,要根據農業生產和市場需求確定育種目標,運用現代育種方法和技術,著力培育具有自主知識產權,適合機械化作業、設施化栽培和高產、優質、多抗、適應性廣的新品種。

加強科企合作,著力建立基礎性、前瞻性、戰略性、社會性的研究,以公益性科研教學單位為主體,在未來的10年左右的歷史進程中,商業化育種逐步轉換成以企業為主體的種業科研新體制,打造科研“龍頭”和企業“航母”,加快種業科研體制改革,明確科研分工,促進科研教學單位與種子企業之間的產學研結合。實行科企聯盟,實現優勢互補,是提升我國種業創新能力和競爭能力有效途徑。主要有如下具體措施:一是科研單位的育種資源、檢驗設備、實驗設施等科研條件平臺應對企業全方位開放,做好服務工作;另一方面,企業的營銷網絡作為科研單位成果轉化的平臺,促進新品種推廣應用。二是科研單位育種研發團隊(如玉米、水稻)整建制進入種子企業,納入企業管理,成為企業育種科研的核心力量;為解決科技創新人員思想顧慮,保留其科研事業單位身份不變,編制保留在原單位。三是根據生產需要、市場需求和企業的發展戰略,確定育種目標;種子企業每年投入一定數額的研發經費用于新品種選育,并負責研發團隊的相關費用,研究成果雙方共享,使用權歸企業所有。