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云南松松塔中planchol E的手性結(jié)構(gòu)與光譜的密度泛函研究

2013-08-16 07:54:05劉光明莽朝永
大理大學(xué)學(xué)報(bào) 2013年4期
關(guān)鍵詞:振動(dòng)實(shí)驗(yàn)

楊 穎,劉光明,雷 婷,莽朝永,2*

(1.大理學(xué)院藥學(xué)與化學(xué)學(xué)院,云南大理 671000;2.大理學(xué)院藥物研究所,云南大理 671000)

云南松松塔中planchol E的手性結(jié)構(gòu)與光譜的密度泛函研究

楊 穎1,劉光明1,雷 婷1,莽朝永1,2*

(1.大理學(xué)院藥學(xué)與化學(xué)學(xué)院,云南大理 671000;2.大理學(xué)院藥物研究所,云南大理 671000)

立體化學(xué)結(jié)構(gòu)與手性光譜關(guān)系研究,對(duì)手性化合物在手性材料和手性藥物等方面的應(yīng)用,是前期性的基礎(chǔ)工作。對(duì)一種分離自云南松松塔的手性苯酚類(lèi)化合物(planchol E),進(jìn)行了密度泛函理論計(jì)算研究。計(jì)算結(jié)果表明:測(cè)定的NRM譜主要體現(xiàn)了異構(gòu)體1的特征,而測(cè)定IR譜主要是異構(gòu)體2的。由于異構(gòu)體2有分子內(nèi)氫鍵,導(dǎo)致兩種異構(gòu)體的光譜差異很大。

planchol E;密度泛函方法;電子圓二色譜;振動(dòng)圓二色譜;氫鍵

在云南省西北部,云南松(Pinus yunnanensis)是一種重要的資源植物,其化學(xué)成分具有抗癌和抗HIV-1活性。近年來(lái),從云南松中已分離出了多種化合物,包括萜類(lèi)、黃酮類(lèi)、木質(zhì)素類(lèi)和生物堿類(lèi)物質(zhì)〔1-2〕。我們從云南松松塔中分離到一種罕見(jiàn)的具有手性結(jié)構(gòu)的苯酚化合物〔3〕,命名為planchol E,分子骨架是剛性的,由一個(gè)苯酚環(huán)、一個(gè)含氧六元環(huán)、兩個(gè)含氧五元環(huán)融合而成。見(jiàn)圖1。實(shí)驗(yàn)上測(cè)定了該化合物的旋光度、核磁共振譜、紅外振動(dòng)光譜和紫外電子吸收光譜。

圖1 化合物1分子結(jié)構(gòu):異構(gòu)體1(a)和異構(gòu)體2(b)

手性化合物的不同對(duì)映異構(gòu)體,不但具有不同的手性光譜,而且常會(huì)表現(xiàn)出不同的生物活性。手性分子的立體結(jié)構(gòu)與手性光譜的關(guān)系研究,對(duì)研究手性材料和開(kāi)發(fā)手性藥物,是一項(xiàng)前期性的基礎(chǔ)工作。在目前的工作中,我們采用密度泛函(DFT)方法,優(yōu)化了planchol E的分子結(jié)構(gòu),并計(jì)算了核磁共振譜(NRM)、紫外電子吸收光譜(UV)和電子圓二色譜(ECD)、紅外振動(dòng)吸收光譜(IR)和振動(dòng)圓二色譜(VCD)。由于酚類(lèi)化合物含有活潑的羥基而具有抗氧化活性,對(duì)人體健康起到有益作用,是許多飲料如茶、葡萄酒和咖啡的主要成分,具有抗炎癥、抗病毒、抗變態(tài)、抗腫瘤等作用,對(duì)其分子結(jié)構(gòu)和光譜特征的深入研究,對(duì)這類(lèi)化合物在手性藥物方面的應(yīng)用具有重要意義。

1 計(jì)算方法

根據(jù)圖1,planchol E有兩種結(jié)構(gòu),一種是沒(méi)有分子內(nèi)氫鍵的異構(gòu)體1,另外一種是具有分子內(nèi)氫鍵的異構(gòu)體2。采用DFT方法〔4〕和Becke三參數(shù)雜化函數(shù)B3LYP〔5-6〕,結(jié)合全電子擴(kuò)展基組6-31+G*和6-311++G**〔7-8〕,對(duì)兩種異構(gòu)體進(jìn)行計(jì)算。計(jì)算工作是采用高級(jí)量子化學(xué)程序Guassian 09W〔9〕進(jìn)行的。首先,在B3LYP/6-31+G*水平上,優(yōu)化了planchol E的幾何構(gòu)型,并計(jì)算了諧性振動(dòng)頻率。由于發(fā)現(xiàn)沒(méi)有虛頻,表明所優(yōu)化的結(jié)構(gòu),其能量已達(dá)到局域最小值。然后,在B3LYP/6-311++G**水平上,計(jì)算了H1NRM譜的化學(xué)位移。最后,采用含時(shí)密度泛函方法(TDDFT)〔10〕,在B3LYP/6-31+G* 理論水平上,求解前20個(gè)激發(fā)態(tài)。在求解過(guò)程中,電子旋轉(zhuǎn)強(qiáng)度張量元由求得,其中為電偶極矩矢量為磁偶極矩矢量〔11〕。采用自編的小程序,擬合了具有洛倫茲線型特征的UV譜和ECD譜(20 nm半波寬),以及IR譜和VCD譜(30 cm-1半波寬,并采用0.962的頻率校正因子)。

2 結(jié)果與討論

2.1 分子結(jié)構(gòu)和核磁共振譜(NRM)優(yōu)化的分子結(jié)構(gòu)見(jiàn)圖1,planchol E具有四個(gè)手性碳中心,為RRRR結(jié)構(gòu)。在圖1(a)中,異構(gòu)體1的兩個(gè)六元環(huán)基本上是共面的(二面角小于3°),含氧六元環(huán)與中間含氧五元環(huán)之間二面角CCCC為157°和OCCO為75°;兩個(gè)含氧五元環(huán)之間二面角CCCO為120°和OCCC為117°。分子骨架為扭曲的雙螺旋結(jié)構(gòu)。分子中間的C=O鍵為1.222 ?,C-OH中的C-O鍵為 1.353 ?,O-H 鍵為 0.971 ?。在圖 1(b)中,異構(gòu)體2有一個(gè)分子內(nèi)氫鍵,導(dǎo)致比異構(gòu)體1更大的扭曲,而且比異構(gòu)體1更穩(wěn)定(能量低了37.2 kJ/mol)。兩個(gè)六元環(huán)是共面的,二面角約為2°。含氧六元環(huán)與中間含氧五元環(huán)之間二面角CCCC為87°和OCCO為160°。兩個(gè)五元環(huán)之間二面角CCCO為96°和OCCC為138°。由于分子內(nèi)氫鍵,C=O鍵被拉長(zhǎng)了(1.241 ?),C-OH 中的 C-O 鍵縮短了 (1.340 ?),O-H 鍵拉長(zhǎng)了(0.994 ?),H…O氫鍵為1.720 ?。

計(jì)算的H1NRM譜見(jiàn)圖2。在圖2(a)中,由于異構(gòu)體1中沒(méi)有分子內(nèi)氫鍵,兩個(gè)OH上的H化學(xué)位移相近,分別為11.2和11.4 ppm。實(shí)驗(yàn)上〔3〕,在氘代二甲亞砜(DMSO-d6)溶液中,測(cè)定的化學(xué)位移數(shù)值分別為11.1和11.7 ppm。可見(jiàn),計(jì)算值與實(shí)驗(yàn)值相符。在圖2(b)中,異構(gòu)體2中的分子內(nèi)氫鍵,使參與氫鍵的OH中的H具有強(qiáng)烈的去屏蔽作用,計(jì)算化學(xué)位移為19.5 ppm。沒(méi)有參與分子內(nèi)氫鍵的OH中的H的化學(xué)位移計(jì)算值為11.1 ppm。

圖2 在B3LYP/6-311++G**水平上計(jì)算的核磁共振譜:異構(gòu)體 1(a)和異構(gòu)體 2(b)

作為一種氣相單分子近似,計(jì)算結(jié)果表明:在氣相中異構(gòu)體2比異構(gòu)體1穩(wěn)定。但是,由于溶劑效應(yīng)等因素影響,使實(shí)驗(yàn)測(cè)定的H1NRM譜與異構(gòu)體1的計(jì)算結(jié)果更接近。我們推測(cè),在測(cè)定NRM譜的實(shí)驗(yàn)條件下,planchol E主要以異構(gòu)體1存在。

2.2 電子吸收光譜(UV)和電子圓二色譜(ECD)計(jì)算的UV譜、根據(jù)實(shí)驗(yàn)擬合的UV譜、計(jì)算的ECD譜(920 nm半波寬),見(jiàn)圖3。

圖3 計(jì)算的UV譜(a)、根據(jù)實(shí)驗(yàn)擬合的UV譜(b)、計(jì)算的ECD譜(c)(920 nm半波寬)

根據(jù)圖3(a),計(jì)算的電子吸收光譜有三個(gè)吸收峰。異構(gòu)體1的吸收波長(zhǎng)分別為302、264和209 nm。異構(gòu)體2的吸收波長(zhǎng)分別為330、274和207 nm。根據(jù)圖3(b)所示,在化合物1的甲醇溶液中〔3〕,測(cè)定的實(shí)驗(yàn)值分別為345、301和204 nm。雖然異構(gòu)體2的計(jì)算值更接近在甲醇溶液中的實(shí)驗(yàn)值,但僅憑這一點(diǎn),我們?nèi)匀粺o(wú)法把實(shí)驗(yàn)中的光譜歸屬到哪一個(gè)異構(gòu)體。在甲醇溶液中,異構(gòu)體2更可能穩(wěn)定一些。在圖3(c)中,我們發(fā)現(xiàn)兩種異構(gòu)體的ECD譜差異很大:異構(gòu)體2在318 nm附近有強(qiáng)的正Cotton效應(yīng),而異構(gòu)體2卻很弱在343 nm處有弱的正Cotton效應(yīng);異構(gòu)體2在221 nm處有強(qiáng)的負(fù)Cotton效應(yīng),而異構(gòu)體1在218 nm處有強(qiáng)的正Cotton效應(yīng)。

異構(gòu)體1在218 nm處的強(qiáng)峰起源于S0→S11的電子躍遷,電子從HOMO-4躍遷到LUMO軌道上。可知,HOMO-4的電荷布居在整個(gè)分子骨架上(見(jiàn)圖4),而LUMO的電荷主要布居在兩個(gè)六元環(huán)上,因此,電子躍遷導(dǎo)致了電荷密度發(fā)生了從五元環(huán)到六元環(huán)的轉(zhuǎn)移,產(chǎn)生了荷移峰。在343 nm處的峰起源于S0→S1的電子躍遷,是電子從HOMO-2躍遷到LUMO的結(jié)果,圖4表明這兩個(gè)分子軌道的電荷主要布居在苯環(huán)上,因此是電荷局域峰。

圖4 異構(gòu)體1對(duì)ECD譜有重要貢獻(xiàn)較大的分子軌道電荷分布

異構(gòu)體2在318 nm處的峰主要源于S0→S2的貢獻(xiàn),是電子從HOMO-2躍遷到LUMO的結(jié)果,可知,這個(gè)峰主要是苯環(huán)電荷局域峰(見(jiàn)圖5)。在221 nm處的峰是S0→S8的電子躍遷結(jié)果(電子從HOMO-3躍遷到LUMO+3)。圖5表明電荷密度從五元環(huán)轉(zhuǎn)移到苯環(huán),因此是一個(gè)荷移峰。

圖5 異構(gòu)體2對(duì)ECD譜有較大貢獻(xiàn)的分子軌道電荷分布

此外,我們計(jì)算了比旋度,異構(gòu)體1的比旋度是+116°,異構(gòu)體2的比旋度是+247°,都比在甲醇中的實(shí)驗(yàn)值大(-26.0°)〔3〕。由于計(jì)算值和實(shí)驗(yàn)值符號(hào)相反,這一結(jié)果提示我們,我們計(jì)算的異構(gòu)體可能是實(shí)驗(yàn)中的異構(gòu)體的光學(xué)對(duì)映體,需要更多的證據(jù)。

2.3 紅外振動(dòng)光譜(IR)和振動(dòng)圓二色譜(VCD)計(jì)算結(jié)果見(jiàn)圖6。

圖6 計(jì)算的紅外振動(dòng)吸收光譜(IR光譜(a)和振動(dòng)圓二色譜(b))(半波寬30 cm-1)

圖6(a)為計(jì)算的IR譜。在3 606 cm-1處吸收來(lái)源于O-H伸縮。兩個(gè)異構(gòu)體的IR譜在高頻區(qū)差別很大。對(duì)異構(gòu)體1,在2 952 cm-1處有較弱的吸收,由五元環(huán)上的CH2基團(tuán)的C-H伸縮,在1 783 cm-1處的吸收為五元環(huán)上的C=O伸縮。苯環(huán)骨架伸縮導(dǎo)致了在1 601 cm-1處的吸收峰。1 078 cm-1處的吸收是兩個(gè)五元環(huán)骨架伸縮結(jié)果。

對(duì)于異構(gòu)體2,參與形成分子內(nèi)氫鍵的羥基的O-H伸縮吸收峰出現(xiàn)在3 167 cm-1處,CH3中的C-H伸縮出現(xiàn)在3 016 cm-1處。1 786 cm-1處的吸收峰,是五元環(huán)上的C=O伸縮結(jié)果。在1 629 cm-1處的吸收,與苯環(huán)骨架伸縮有關(guān)。在1 139 cm-1處的吸收峰,來(lái)源于整個(gè)分子骨架伸縮貢獻(xiàn)。

采用KBr做壓片的planchol E樣品,實(shí)驗(yàn)測(cè)定表明:在3 415 cm-1處有強(qiáng)吸收峰〔3〕。這個(gè)峰只能起源于參與分子內(nèi)氫鍵的羥基的O-H伸縮。未校正的計(jì)算結(jié)果是3 292 cm-1,校正后是3 167 cm-1(見(jiàn)圖1)。據(jù)此推測(cè),在實(shí)驗(yàn)條件下,化合物主要以異構(gòu)體2存在。我們把1 760 cm-1處的實(shí)驗(yàn)歸屬為C=O伸縮(計(jì)算值1 786 cm-1),1 658 cm-1處的吸收峰歸屬于苯環(huán)振動(dòng)(計(jì)數(shù)值1 629 cm-1),1 170 cm-1處的吸收峰歸屬于整個(gè)分子骨架的振動(dòng)(計(jì)數(shù)值1 139 cm-1)。

在圖6(b)中,計(jì)算的兩個(gè)異構(gòu)體的VCD譜差別很大。異構(gòu)體1在2 952 cm-1處有弱的負(fù)Cotton效應(yīng),為五元環(huán)上CH2的C-H伸縮結(jié)果。最強(qiáng)峰出現(xiàn)在1 218 cm-1處,是苯環(huán)與端點(diǎn)五元環(huán)骨架伸縮結(jié)果。

在異構(gòu)體2的VCD譜中,在3 167 cm-1處有一個(gè)較強(qiáng)的負(fù)Cotton效應(yīng),是參與形成分子內(nèi)氫鍵的羥基O-H伸縮結(jié)果。在1 210 cm-1處有一個(gè)強(qiáng)的負(fù)Cotton效應(yīng),是苯環(huán)與端點(diǎn)五元環(huán)伸縮的結(jié)果,在1 084 cm-1處有一個(gè)強(qiáng)的正Cotton效應(yīng),是兩個(gè)五元環(huán)伸縮的結(jié)果。

3 結(jié)論

在本工作中,我們采用密度泛函方法,計(jì)算了化合物planchol E的兩個(gè)異構(gòu)體的核磁共振譜、電子吸收光譜、電子圓二色譜、紅外振動(dòng)光譜和振動(dòng)圓二色譜,并進(jìn)行了分子軌道和振動(dòng)模式分析。計(jì)算結(jié)果與實(shí)驗(yàn)比較,推測(cè)在測(cè)定核磁共振譜的條件下,由于沒(méi)有觀察到氫鍵羥基H的化學(xué)位移,planchol E主要以沒(méi)有分子內(nèi)氫鍵的異構(gòu)體1的形成存在;而在測(cè)定紅外振動(dòng)光譜的條件下,觀察到氫鍵羥基的振動(dòng)吸收峰,表明planchol E主要以具有分子內(nèi)氫鍵的異構(gòu)體2的形式存在。因此,planchol E是以分子內(nèi)氫鍵的形式存在,會(huì)隨實(shí)驗(yàn)環(huán)境的變化而變化。

此外,我們理論上預(yù)言了兩種異構(gòu)體的手性光譜(ECD和VCD譜),發(fā)現(xiàn)它們的手性光譜顯著不同。在ECD譜中,異構(gòu)體1在218 nm附近具有強(qiáng)的正Cotton效應(yīng),而異構(gòu)體2在221 nm附近卻出現(xiàn)強(qiáng)的負(fù)Cotton效應(yīng)。在VCD譜中,異構(gòu)體2在3167cm-1處出現(xiàn)較強(qiáng)的負(fù)Cotton效應(yīng),起源于分子內(nèi)氫鍵的OH伸縮。

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Density Functional Study of Chiral Structures and Spectral Properties of the Phenolic Compound Planchol E from Pinecones of Pinus yunnanensis

YANG Ying1,LIU Guangming1,LEI Ting1,MANG Chaoyong1,2*
(1.College of Pharmacy and Chemistry,Dali University,Dali,Yunnan 671000,China;2.Institute of Pharmaceutical Science,Dali University,Dali,Yunnan 671000,China)

The research on the relationship between stereo-chemical structures and chiral spectra is a fundamental job for the applications of chiral compounds in chiral materials and chiral drugs.The DFT computations of a chiral phenolic compound called as planchol E show that the experimental H1NRM spectra display the feature of isomer 1 without intramolecular H-bond while the measured IR spectra originate from isomer 2 with intramolecular H-bond.Due to the intramolecular H-bond in isomer 2,there are many differences in both the chiral spectra as ECD and VCD and the achiral spectra as NRM and IR.

plancholE;densityfunctionaltheoreticalmethod;electroniccirculardichroism;vibrationalcirculardichroism;hydrogen bond

O64

A

1672-2345(2013)04-0040-04

國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81260632)

2013-01-01

2013-02-20

楊穎,碩士研究生,主要從事藥物化學(xué)和物理化學(xué)研究.

(責(zé)任編輯 袁 霞)

10.3969/j.issn.1672-2345.2013.04.011

*通信作者:莽朝永,教授,博士.

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