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小菜蛾p38MAPK基因的克隆與生物信息學分析

2013-04-29 00:51:08胡霞谷希樹劉曉琳等
山東農業科學 2013年8期

胡霞 谷希樹 劉曉琳等

摘要:小菜蛾(Plutella xylostella L)是一種危害十字花科植物的世界性害蟲,研究其基因功能為尋找新的小菜蛾防治方法具有重要意義。本研究克隆了小菜蛾p38 MAPK基因的開放閱讀框(ORF),并根據其DNA序列推導出了蛋白一級結構,發現該基因編碼一個含有349個氨基酸殘基的蛋白。通過SMART網站分析發現該蛋白在第20~304位氨基酸殘基區域存在著一個典型的絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶結構域,說明它是一個潛在的絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶。Blast比對發現Pxp38基因與家蠶Bmp38基因、釀酒酵母ScHOG1基因、人類Homo sapiens p38 基因在蛋白一級結構上的相似性分別是917%、516%和786%,說明p38 MAPK基因在進化上具有較高的保守性。

關鍵詞:小菜蛾;p38基因;MAPK;絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶;生物信息學分析

中圖分類號:Q785:Q969.42+5.2 文獻標識號:A 文章編號:1001-4942(2013)08-0015-04

小菜蛾(Plutella xylostella L)屬鱗翅目(Lepidoptera)菜蛾科(Plutellidae),其分布范圍廣,繁殖能力強,主要取食十字花科植物,嚴重危害蔬菜生產[1,2]。由于小菜蛾的抗藥性發展十分迅速,因此,尋找新的防治方法已經變得十分迫切[3,4]。為了更好地實現小菜蛾的防治,需要更多地了解小菜蛾的基因尤其是耐藥基因及響應外界刺激相關基因的生物學功能[5~7]。2012年福建農林大學的尤民生教授等[7]領導的國際合作小組第一次完成了小菜蛾的全基因組序列圖譜的繪制,這為小菜蛾基因功能的研究以及發展新的防治手段揭開了新的篇章,具有重要意義。本研究就是在小菜蛾全基因組測序的基礎上完成的。

蛋白質在細胞內發揮生物學功能經常需要磷酸化和去磷酸化修飾,細胞中具有磷酸化修飾功能的酶是蛋白激酶[8]。……

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