張廷婷等
摘要:通過規模測序和生物信息學分析,從花生莢果不同發育時期全長cDNA文庫中篩選出MADS-box家族的一個cDNA全長序列,命名為CEM1基因(GenBank登錄號為EY396043)。該基因全長1 061 bp,包含762 bp的開放閱讀框,編碼253個氨基酸,蛋白質的分子量為29405 ku,等電點(pI)為918。蛋白質信號肽分析和疏水性分析表明,該基因編碼的蛋白質信號肽剪切的可能性很小,具有親水性。同時構建CEM1基因的VIGS表達載體,為進一步研究該基因的功能奠定了基礎。
關鍵詞:花生;莢果發育;CEM1基因;生物信息學;載體構建
中圖分類號:Q785:S565.2 文獻標識號:A 文章編號:1001-4942(2013)08-0009-06
MADS-box的名稱來自釀酒酵母轉錄因子MCM1、擬南芥花同源異型基因蛋白AGAMOUS、金魚草花同源異型基因蛋白DEFICIENS和人血清應答因子SRF 4種蛋白的首字母,這4種蛋白質都有一個由56~58個氨基酸組成的高度保守的MADS盒,編碼含有這種保守序列蛋白因子的基因稱為MADS-box基因。病毒誘導的基因沉默(Virus-induced gene silencing, VIGS)是近年來發現的一種轉錄后基因沉默現象,可以引起內源mRNA序列特異性降解[1,2],即如果在病毒載體中加入目的基因片段,侵染寄主植物后,植物會表現出目的基因功能喪失或者表達水平下降的表型,從而確定基因功能。其作用機制為:含有目的基因片段的病毒載體在被侵染的植物組織中大量復制,病毒載體中的目的片段在RNA引導的RNA聚合酶作用下合成大量的雙鏈RNA(Double-stranded RNA, dsRNA);dsRNA在Dicer酶的作用下產生21~25個核苷酸的短干擾RNA(Small interfering RNA, siRNA);然后,siRNA的反義鏈和RNA誘導的基因沉默復合物(RNA-induced silencing complex, RISC)結合,特異性識別細胞質中目的基因的單鏈mRNA,造成目的基因mRNA的特異性降解,從而導致目的基因在RNA水平上的沉默[3~5]?!?br>