全基因組選擇及其在奶牛育種中的應用進展

摘要：試驗結果表明，奶牛育種中基于 GEBV 的遺傳評估可靠性在 20%～67%之間，如以之代替常規后裔測定體系，可節省92%的育種成本。由于可以提高育種值估計準確性、利于早期選種、顯著縮短世代間隔、減少育種成本，全基因組選擇作為一項新的育種策略在奶牛育種中逐漸得到應用，并將擁有良好的前景。本文綜述了全基因組選擇的基本原理、計算方法、影響因素及其在奶牛育種中的應用現狀和所面臨的問題。

關鍵詞：全基因組選擇；奶牛；育種；應用進展

中圖分類號：S823.9+12文獻標識號：A文章編號：1001-4942（2013）02-0131-05

1全基因組選擇的原理

中國奶牛養殖規模和生產性能都得到大幅度提高，傳統育種為奶牛產業的發展做出了巨大貢獻，例如奶牛產奶量平均單產在過去的30年間提高了3 000 kg，其中 40% 以上得益于育種。模擬和真實數據均表明，標記輔助選擇可提高奶牛育種效率。但是標記信息所能帶來的額外準確性主要取決于它能夠解釋的遺傳變異。畜禽遺傳改良的多數目標性狀都是數量性狀，受多個基因控制，每個基因只能解釋很小比例的遺傳變異。因此，通過候選基因（candidate gene）、數量性狀基因座定位（quantitative trait loci mapping，QTL mapping）和全基因組關聯分析（genome-wide association study，GWAS）等策略發現的基因或標記也只能解釋較小比例的遺傳變異。顯然，以上策略均難以顯著提高育種值估計的準確性。

全基因組選擇（Genomic Selection，GS），即全基因組范圍的標記輔助選擇（Marker Assisted Selection，MAS），指通過檢測覆蓋全基因組的分子標記，利用基因組水平的遺傳信息對個體進行遺傳評估，以期獲得更高的育種值估計準確度。……