劉淑文,郭忠輝,劉 蕾,宮立程,楊 光,楊 軍*
(1.吉林省人口生命科學技術研究院,吉林 長春 130041;2.吉林大學中日聯誼醫院 手外科)
一個獨特臨床表型的SPD家系HOXD13基因突變分析
劉淑文1,郭忠輝1,劉 蕾1,宮立程2,楊 光2,楊 軍2*
(1.吉林省人口生命科學技術研究院,吉林 長春 130041;2.吉林大學中日聯誼醫院 手外科)
*通訊作者
先天性并指(趾)多指(趾)畸形(synpolydactyly,SPD)為Ⅱ型并指,典型的表現為手部3、4指并指和(或)足部4、5趾并趾,并伴有多指(趾)[1]。目前認為非綜合征的SPD為常染色體顯性遺傳疾病,位于2q31的H0XD13基因是其致病基因。我們收集到一個3代的SPD家系,其中3例患者表現為三種變異的并指多指畸形。對該家系HOXD13基因突變的研究發現,此家系中患者均攜帶發生9個丙氨酸延展突變的HOXD13基因。
1.1 對象一個位于中國吉林省內連續3代發生SPD的家系(圖1)。先證者Ⅲ1就診于吉林大學中日聯誼醫院手外科門診,我們通過先證者父母進行臨床及遺傳資料收集整理。該家系共3代6名成員,其中患者3人,均為男性患者,跨越3代并無隔代遺傳現象,符合常染色體顯性遺傳病特征。我們對3例患者進行了臨床診斷,并拍攝了數碼照片和X線片(圖2)。
患者Ⅰ1(A、A′、B、B′)根據數碼照片和線片可以看出表現為輕微的臨床表型。Ⅱ1(C、C′、D、D′)表現為雙手的屈指畸形和關節粘連。Ⅲ1(先證者,E、E′、F、F′)數碼照片為兩次手術后,X線片為未手術前原始照片,表現為獨特的復指、橫向指骨及掌指骨融合

圖1 SPD家系圖
1.2 方法
1.2.1 DNA提取和PCR擴增 經患者及家屬知情同意后,采集家系成員外周血6份(10ml/人),同時抽取100名無關志愿者靜脈血液進行對照試驗,其中男57名,女43名。之后采用TIANamp Blood DNA Kit提取基因組DNA,記錄DNA濃度后,EP管密封-4℃保存備用。設計引物擴增HOXD13基因外顯子1和2。擴增步驟為:預變性溫度為94度3分鐘,94度55秒,64度55秒,72度60秒,35個循環,最后延伸為72度10分鐘。PCR產物用1.5%瓊脂糖凝膠電泳分離,溴乙錠染色后觀察條帶。
1.2.2 測序 使用相同的引物,測序儀器為ABI PRISM 3730,測序試劑為BigDye terminator v3.1,由北京華大基因生物公司測序部對PCR擴增產物進行純化及測序。將突變片段的測序結果與Genebank中HOXD13第1,2外顯子中該DNA序列進行比較。

圖2 SPD家系雙側手足外形和X線片
2.1 臨床特征該家系患者臨床表型為一個較寬泛的SPD表型譜。其中患者I1為較輕微的臨床表型,僅表現為左中、環指并指,伴有環指短指、小指屈曲畸形,X線片見環指近節、中節指骨發育畸形,且近位指間關節發育異常。右中、環指遠節指骨輕度橈側偏斜。左足表現為第4、5足趾軟組織并指,右足未見異常。
患者Ⅱ1臨床表型較I1嚴重,雙手及雙腳均見異常。左2~5指屈曲畸形,且示指橈偏,中、環、小指尺偏,X線片環指掌指關節處見異常骨塊。右手較左手不同之處在于右手中、環指并指?;颊唠p足第4、5足趾并趾。
Ⅲ1(先證者)雙手曾進行過兩次手術。左手畸形重于右手,中、環、小指并指,伴環指短指、橈偏畸形、小指屈曲畸形。X線片可見異常發育指骨、橫向指骨及掌指骨融合。右手表現為中、環指并指畸形。雙足第4、5足趾并指多指。
2.2 HOXD13突變分析
我們用PCR和擴增PCR產物直接測序,分析家系中3個患者、3個正常個體及100個對照個體基因型,發現該家系中3名患者HOXD13基因第1外顯子中存在重復突變(c.186-212dup),此突變導致HOXD13蛋白氮端結構域多聚丙氨酸鏈延長9個丙氨酸(圖3),而在家系中正常個體及100名對照無關志愿者中沒有發現異常。

圖3 反向引物進行PCR產物測序峰圖
先天性并指畸形(Syndactyly)是人類最常見的肢端畸形之一,發生率為1:2000~1:2500,特征表現為兩個或兩個以上手指及其相關組織成分先天性病理相連[2]。1978年 Tentamy和 McKusick[3]將并指畸形分為五種類型,其中Ⅱ型為并指(趾)多指(趾)畸形(SPD)。根據臨床表型的不同,SPD可分為典型表型、輕微表型和特殊表型[4];而遺傳學上將SPD分為SPD1、SPD2和SPD3三種類型,分別定位于2q31,22q13.31 和 14q11.2-q12[3]。
HOX基因編碼一個轉錄因子超家族,在胚胎發育過程中起著重要的作用。HOX基因包括HOXA、HOXB、HOXC、HOXD4個基因簇,分別位于 不 同 的 染 色 體 上[5、6],其 中 HOXD 位 于 2q31。HOXD13位于HOXD簇最5′端,有兩個外顯子,其中外顯子1包含一個不完全的三核苷酸重復序列,編碼一個由15個丙氨酸殘基組成的多聚丙氨酸片段[7]。目前研究發現HOXD13的7~14個多聚丙氨酸鏈延展突變可導致具有典型臨床表現的SPD1,而少于6個丙氨酸插入不能引起表型異常[8]。我們報道的這個家系中3名患者HOXD13基因第1外顯子中存在重復突變,此突變導致HOXD13蛋白氮端結構域多聚丙氨酸鏈延長9個丙氨酸,這和以往的研究一致。
對于SPD1的臨床表型與多聚丙氨酸鏈延伸的長度是否相關存在爭議。Goodman等[9]搜集了20個聚丙氨酸延展突變的SPD家系進行研究,發現突變基因在逐代傳遞過程中,家系內部多聚丙氨酸鏈長度雖然沒有發生改變,但是在家系之間進行比較時,SPD表型的嚴重程度和外顯率隨著多聚丙氨酸鏈長度增加而明顯增加。其中一個插入14個丙氨酸家系的患者都表現為嚴重的表型,手部畸形均累計指骨和腕部,男性患者中還出現了尿道下裂。2004年Albrecht等[10]通過實驗證實,PAE突變型HOXD13蛋白不能進入核內,而野生型蛋白可以順利進入核內行使功能,據此推斷隨著插入丙氨酸鏈長度的增加,對蛋白結構的影響也增大,阻礙其行使正常的功能,能夠說明SPD獨特的臨床與遺傳異質性。但是近年另一個對32個SPD1家系的調查研究表明SPD1基因型與表現型之間無明顯相關性[4]。
我們報道的這個HOXD13基因9個丙氨酸延展突變的家系患者表現為輕重不等的臨床表型。其中先證者Ⅲ1為特殊表型,表現為獨特的復指、橫向指骨及掌指骨融合,此之前的文獻中未見描述,其意義在于增加了HOXD13多聚丙氨酸延展突變可能引起的表型范圍,但尚需進一步的研究探索此種變異的機制,解釋引起此表型異質性的原因。
[1]Goodman FR.Limb malformations and the human HOX genes[J].Am J Med Genet,2002,112(3):256.
[2]洪光祥,王 煒.手部先天性畸形[M].北京:人民衛生出版社,2004.67.
[3]Tentamy SA,McKusick VA.The Genetics of Hand Malformations.Birth Defects[J].Orig Artic Ser,1978,14(3):1.
[4]Malik S,Grzeschik KH.Synpolydactyly:clinical and molecular advances[J].Clin Genet,2008,73(2):113.
[5]Scott MP.Vertebrate homeobox gene nomenclature[J].Cell,1992,71(4):551.
[6]Kosaki K,Kosaki R,Suzuki T,et al.Complete mutation analysis panel of the 39human HOX genes[J].Teratology,2002,65(2):50.
[7]Akarsu AN,Stoilov I,Yilmaz E,et al.Genomic structure of HOXD13gene:a nine polyalanine duplication causes synpolydactyly in two unrelated families[J].Hum Mol Genet,1996,5(7):945.
[8]Malik S,Girisha KM,Wajid M,et al.Synpolydactyly and HOXD13polyalanine repeat:addition of 2alanine residues is without clinical consequences[J].BMC Med Genet,2007,11(8):78.
[9]Goodman FR,Mundlos S,Muragaki Y,et al.Synpolydactyly phenotypes correlate with size of expansions in HOXD13polyalanine tract[J].Proc Natl Acad Sci,1997,94(14):7458.
[10]Albrecht AN,Kornak U,Boddrich A,et al.A molecular pathogenesis for transcription factor associated poly-alanine tract expansions[J].Hum Mol Genet,2004,13(20):2351.
1007-4287(2012)10-1863-03
吉林省財政廳科研項目基金(編號2060302)
2011-08-17)