張擁軍
2011年12月23日,美國《科學(xué)》雜志罕見地在未征得當(dāng)事人同意的情況下,宣布全部撤銷了2009年刊登的一篇文章[1],至此,這場吸引國際上眾多科學(xué)家參與、歷時(shí)兩年多的慢性疲勞綜合征與XMRV關(guān)系的爭論落下帷幕。本文擬對(duì)這一事件的來龍去脈進(jìn)行綜述,及時(shí)澄清可能產(chǎn)生的一些誤導(dǎo),探討該事件對(duì)今后病原生物學(xué)研究領(lǐng)域的啟迪。
1.1 慢性疲勞綜合征 慢性疲勞綜合征(chr onic fatigue syndrome,CFS)又稱為肌痛性腦脊髓炎(myal gic encephalo myelitis,ME),是一種以慢性疲勞為主要表現(xiàn)的臨床綜合征。主要癥狀包括持續(xù)6個(gè)月以上不明原因的持續(xù)性疲勞,活動(dòng)能力的顯著下降,即使適度休息也不能減輕。出現(xiàn)記憶力下降、睡眠障礙、全身關(guān)節(jié)和肌肉疼痛、咽喉酸痛、頭痛、淋巴結(jié)觸痛等癥狀,還可能出現(xiàn)其它癥狀如腹痛、惡心、腹瀉、胸痛、對(duì)光聲音和氣味敏感、抑郁、易激惹、焦慮等[2-4]。據(jù)估計(jì),全球有大約1 700萬不同程度的CFS病例,多為女性,男女比例為1∶6[4]。
關(guān)于CFS的致病因子,多年來一直沒有定論。曾經(jīng)有人提出過CFS產(chǎn)生及癥狀持續(xù)的生物學(xué)、遺傳學(xué)、感染以及心理學(xué)機(jī)制,其中候選的感染因子有EB病毒、腸道病毒、細(xì)小病毒B19、博爾納病毒、貝氏柯克斯體、肺炎衣原體等,均告失敗[2-4]。因此,CFS病例缺乏具有診斷價(jià)值的特征性異常指標(biāo)。
目前CFS研究中,廣泛采用的是1994年美國CDC修訂的診斷標(biāo)準(zhǔn)。在CFS的治療方面,藥物治療的作用十分有限[3],也不存在特異性治療藥物。
1.2 XMRV 異嗜性鼠白血病病毒相關(guān)病毒(xenotr opic murine leukemia vir us-related vir us,XMRV)為單股RNA病毒,屬于逆轉(zhuǎn)錄病毒科,γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒屬,同屬的還有鼠白血病病毒(MLV)、Friend病毒、貓白血病病毒(FLV)等。XMRV基因組全長約8100個(gè)核苷酸,與多種小鼠的內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒同源性達(dá)95%,而與部分小鼠外源性病毒相似性為93%~94%[5]。2006年首次發(fā)現(xiàn)XMRV,并認(rèn)為該病毒感染與前列腺癌存在一定聯(lián)系。
1.3 2009年《科學(xué)》論文 2009年10月,美國內(nèi)華達(dá)州 Whittemore Peterson研究所(WPI)的 Mikovits實(shí)驗(yàn)室在《科學(xué)》雜志發(fā)表《在CFS患者血液細(xì)胞中感染性逆轉(zhuǎn)錄病毒XMRV的檢測》一文,首次宣布了該實(shí)驗(yàn)室的研究成果[1]。他們發(fā)現(xiàn)從101例CFS患者外周單核細(xì)胞(PBMCs)中,有68例(67%)檢測到XMRV的gag基因序列,而218名健康對(duì)照僅檢出8例(3.7%)。而且,他們的合作實(shí)驗(yàn)室——CCF的Sil ver man實(shí)驗(yàn)室也通過PCR擴(kuò)增和序列測定證實(shí)了11例WPI提供的CFS樣品中,有7例患者的PBMC DNA中檢測到352nt的XMRV env基因片段和736 nt的gag基因片段。同時(shí),他們還采用流式細(xì)胞儀和蛋白印跡的方法測定了患者PBMC中XMRV的蛋白表達(dá),并發(fā)現(xiàn)從一名患者PBMC分離的T細(xì)胞和B細(xì)胞經(jīng)過活化,能夠感染XMRV。細(xì)胞培養(yǎng)也顯示來自患者的XMRV具有感染性,病毒可能通過細(xì)胞和無細(xì)胞傳播。未感染的原代淋巴細(xì)胞及指示細(xì)胞系暴露于激活的CFS患者PBMCs、B細(xì)胞、T細(xì)胞或血漿均可引起繼發(fā)感染。根據(jù)以上幾個(gè)方面的事實(shí),作者認(rèn)為XMRV可能是CFS致病的促進(jìn)因子。
這篇論文在《科學(xué)》雜志發(fā)表后,立即受到全世界新聞媒體、病毒學(xué)及CFS臨床和研究領(lǐng)域的高度關(guān)注。雖然少數(shù)學(xué)者仍然持懷疑態(tài)度,一些知名學(xué)者還是根據(jù)文章里提供的數(shù)據(jù)肯定了這項(xiàng)發(fā)現(xiàn)的重要意義。而2010年8月,美國國立衛(wèi)生研究院(NI H)、食品藥品管理署(FDA)以及哈佛大學(xué)的研究人員聯(lián)合發(fā)表在美國《國家科學(xué)院院刊》的論文,也支持了《科學(xué)》論文中類似的觀點(diǎn)[6]。雖然他們檢測到的不是XMRV本身的序列,但他們發(fā)現(xiàn)90年代中期,哈佛大學(xué)CFS專家Ant hony Ko mar off收集的37名CFS患者樣品(PBMC和全血)中,有32名(87%)可以檢測到 MLV相關(guān)病毒(MLV-related vir us)的gag基因序列,而44名健康對(duì)照僅3名(6.8%)陽性。
1.4 影響 這篇論文的問世,迅速在生物醫(yī)學(xué)多個(gè)領(lǐng)域產(chǎn)生了巨大影響。在CFS研究領(lǐng)域,研究人員正苦于找不到合適的生物致病因子作為診斷指標(biāo),因此當(dāng)務(wù)之急是盡快證實(shí)該病毒在本地CFS研究人群中的檢出率,以便及時(shí)調(diào)整研究方向和策略,有針對(duì)性地研制相應(yīng)的治療藥物;對(duì)診斷試劑廠商來說,無疑是一個(gè)新的商機(jī)。盡快研發(fā)特異而穩(wěn)定的診斷試劑,意味著早日占領(lǐng)市場,最初的診斷試劑就一度超過600美元;對(duì)血液中心,如果CFS患者XMRV感染率較高,病毒是否會(huì)通過輸血傳播,直接關(guān)系到輸血安全。因此需要對(duì)獻(xiàn)血員進(jìn)行篩查,并考慮是否應(yīng)該對(duì)CFS患者獻(xiàn)血采取限制措施;而對(duì)CFS患者,一旦證實(shí)XMRV感染是致病元兇,就可能結(jié)束CFS無藥可治的困境,也意味著可以嘗試一些抗逆轉(zhuǎn)錄藥物治療。為了早日康復(fù),甚至有患者已經(jīng)迫不及待地開始自行服用這類藥物。
然而,《科學(xué)》論文刊出后不久,接踵而至的質(zhì)疑估計(jì)作者始料未及。盡管沒有統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)試劑,世界各地一直致力于CFS致病因子研究的團(tuán)隊(duì)立即創(chuàng)建了各自的相關(guān)檢測體系,重新檢測現(xiàn)有患者樣品中XMRV。令人驚奇的是,得到的檢出率與該文結(jié)果大相徑庭。其中,英國倫敦帝國大學(xué)的 Mc-Cl ure實(shí)驗(yàn)室[7]率先報(bào)告了他們的陰性結(jié)果。他們從186名CFS患者血液樣品中提取DNA,用套式PCR的方法檢測可能存在的XMRV前病毒序列,但沒有發(fā)現(xiàn)任何XMRV或MLV相關(guān)序列。而后,英國國家醫(yī)學(xué)研究所也報(bào)告了類似結(jié)果[8]。他們檢測了170名CFS患者及395名對(duì)照的樣品,用PCR方法未能從299份樣品(患者及健康對(duì)照)中檢測到XMRV相關(guān)DNA,血清學(xué)方法從565份樣品中發(fā)現(xiàn)26份有中和抗體陽性,但只有1份為CFS病例。幾乎同時(shí),荷蘭學(xué)者[9]對(duì)76名CFS患者及69名對(duì)照PBMC,采用實(shí)時(shí)熒光PCR檢測X MRV整合酶基因及套式PCR檢測gag基因,也沒有檢測到XMRV序列。除了CFS人群,為了確定CFS獻(xiàn)血員或其它人群中是否存在XMRV,保障輸血安全,各國研究人員還對(duì)部分獻(xiàn)血員血樣進(jìn)行了篩查,普遍得到極低的檢出率[10]。因此,隨著一系列陰性結(jié)果的出爐,人們逐漸開始懷疑該論文的結(jié)果,如此懸殊的檢出率,究竟是XMRV毒株的變異?患者群體的差異(地域、種屬、病例標(biāo)準(zhǔn))?還是實(shí)驗(yàn)室污染?而面對(duì)蜂擁而至的質(zhì)疑,Mikovits實(shí)驗(yàn)室[11]強(qiáng)調(diào)這些陰性結(jié)果采用的檢測方法和實(shí)驗(yàn)步驟與他們論文中描述的不完全一致,尤其是樣品DNA不是來自經(jīng)過活化的PBMC,檢出率會(huì)低一些。
為了打消公眾的疑慮,準(zhǔn)備平行盲樣、采用敏感性相當(dāng)?shù)臋z測方法、同時(shí)在多家實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行檢測得出的結(jié)果才最具有說服力。美國CDC[12]采集了51例CFS患者及56名健康人血樣,CDC的實(shí)驗(yàn)室采用蛋白印跡實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)51例CFS及53名對(duì)照均為陰性,德國的羅伯特.郭霍研究所(Robert Koch-Instit ute,RKI,為德國聯(lián)邦公共衛(wèi)生機(jī)構(gòu))實(shí)驗(yàn)室采用ELISA方法發(fā)現(xiàn)51例CFS及53名對(duì)照各有一例弱陽性;而CDC實(shí)驗(yàn)室還用套式PCR方法檢測病毒gag和env基因,50名CFS患者、56名對(duì)照、41名獻(xiàn)血員全部陰性;美國加州一家實(shí)驗(yàn)室也獲得了同樣的PCR結(jié)果。這樣的結(jié)果顯然不支持XMRV與CFS存在聯(lián)系。隨后,NI H組織了9個(gè)實(shí)驗(yàn)室(其中包括來自 WPI、NI H、CDC、FDA等機(jī)構(gòu)的實(shí)驗(yàn)室)參與的盲樣測試[13]。他們采集了15名以前報(bào)道XMRV/MLV陽性的血樣(其中14例為CFS),以及15名先前報(bào)道陰性的健康獻(xiàn)血員,編號(hào),以盲樣分發(fā)給9家實(shí)驗(yàn)室,檢測XMRV/MLV核酸、病毒復(fù)制和抗體。結(jié)果僅2家實(shí)驗(yàn)室發(fā)現(xiàn)XMRV/MLVs相關(guān)證據(jù);盡管所有實(shí)驗(yàn)方法對(duì)CFS樣品及陰性對(duì)照的敏感性相似,得到的平行樣品結(jié)果卻不一致,說明目前血樣中XMRV/MLV的檢測方法重復(fù)性較差,不足以用于獻(xiàn)血員篩查。另外,一項(xiàng)規(guī)模更大、由哥倫比亞大學(xué)Ian Lipkin實(shí)驗(yàn)室率領(lǐng)的調(diào)查仍然在進(jìn)行中,該項(xiàng)目由NI H下屬的國家過敏及傳染性疾病研究所(NIAID)資助,有WPI、NI H及CDC幾家實(shí)驗(yàn)室參與,測試對(duì)象來自150名CFS患者、150名健康對(duì)照樣品,患者群體分別來自6個(gè)美國臨床機(jī)構(gòu)[14]。
但2010年底,陸續(xù)出現(xiàn)一系列不利于Mikovits實(shí)驗(yàn)室的證據(jù),實(shí)驗(yàn)室污染源頭包括樣品制備、試劑及細(xì)胞系本身等多個(gè)因素[15-19]。
首先,樣品制備過程中可能出現(xiàn)污染,尤其是鼠源DNA污染。對(duì)于經(jīng)常開展小鼠細(xì)胞系(如NI H3 T3)及動(dòng)物實(shí)驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)室來說,鼠源DNA無處不在,因此在采血、PBMC分離以及DNA純化步驟,極有可能混入鼠源DNA。最初的質(zhì)疑多數(shù)采用PCR擴(kuò)增XMRV相關(guān)片段的方法(傳統(tǒng)PCR、RTPCR、套式PCR或?qū)崟r(shí)熒光PCR等),因此又暴露出一系列來自PCR試劑的污染源。由于PCR突出的擴(kuò)增效率,尤其是套式PCR需要對(duì)首輪產(chǎn)物進(jìn)行二次擴(kuò)增,在提高了檢測靈敏度的同時(shí),也增加了假陽性的風(fēng)險(xiǎn)。美國CDC的實(shí)驗(yàn)室[15]調(diào)查發(fā)現(xiàn),6個(gè)廠家的重組逆轉(zhuǎn)錄酶,無論是來自MLV還是A MV,都存在MLV的pol基因DNA序列,而不是gag基因或小鼠DNA。由于序列分析顯示與Moloney MLV高度相關(guān),推測是存在含RTase基因的質(zhì)粒污染。而一些商業(yè)化PCR試劑盒中,采用了熱啟動(dòng)Taq DNA聚合酶,其中關(guān)鍵的單克隆抗體,制備過程中可能會(huì)帶來痕量小鼠DNA[16]。這些痕量小鼠DNA的存在,很難排除一些小鼠內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒前病毒的污染,因此對(duì)先前從CFS患者樣品檢出X MRV/MLV序列的結(jié)果高度懷疑。
然而,更加致命的證據(jù)是發(fā)現(xiàn)細(xì)胞系受到污染。PNAS論文發(fā)表后,英國學(xué)者[18]就通過序列分析,發(fā)現(xiàn)前列腺癌細(xì)胞系22 Rv1中的X MRV序列是所有CFS患者序列的祖先,PCR檢測到的患者XMRV片段可能是小鼠DNA污染所致,22Rv1細(xì)胞系可能在裸鼠體內(nèi)移植過程中感染了XMRV。隨后,幾家美國實(shí)驗(yàn)室合作[19],通過對(duì)22 Rv1相關(guān)的一系列細(xì)胞系遺傳背景的研究,發(fā)現(xiàn)最初的人類前列腺癌細(xì)胞系CWR22并不存在XMRV。在小鼠體內(nèi)傳代過程中,前病毒Pre-XMRV1與 Pre-XMRV2發(fā)生重組,現(xiàn)在常用的22Rv1細(xì)胞系中的XMRV實(shí)際為兩種小鼠內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒重組的產(chǎn)物。而且,通過分析這些前病毒在小鼠基因組染色體位點(diǎn)以及整合位點(diǎn)等資料,發(fā)現(xiàn)Pre-XMRV1主要存在于亞洲小鼠,而Pre-XMRV2存在于歐洲小鼠。沒有任何一個(gè)野生小鼠系同時(shí)含有這兩種前病毒,僅在3個(gè)實(shí)驗(yàn)小鼠品系中同時(shí)存在這兩種前病毒[20]。另外,針對(duì)PNAS論文中檢測到的相隔15年的CFS患者病毒序列,英國學(xué)者同樣通過序列分析[21],發(fā)現(xiàn)在兩個(gè)時(shí)間點(diǎn)的患者序列代表的是完全不同的內(nèi)源性小鼠逆轉(zhuǎn)錄病毒,顯然不符合逆轉(zhuǎn)錄病毒在患者體內(nèi)的進(jìn)化模式,表明存在污染。
雖然面對(duì)質(zhì)疑,有兩位這篇《科學(xué)》論文的作者后來在重復(fù)檢測樣品時(shí),發(fā)現(xiàn)部分CFS患者PBMC DNA提取過程中存在XMRV質(zhì)粒的污染,于2011年10月同意對(duì)該文部分撤稿,其余作者仍然不同意全部撤稿。在12月23日《科學(xué)》正式撤稿出臺(tái)后,12月28日唯一支持該文的PNAS論文也被撤稿。
前后持續(xù)了兩年多的XMRV與CFS關(guān)系之爭,為了證明這個(gè)假說的真?zhèn)危瑺可媪硕鄠€(gè)國家眾多研究人員參與。對(duì)于病原生物學(xué)領(lǐng)域來說,尤其是今后提出任何新的病原體感染與人類疾病的關(guān)系,這場爭論值得研究人員反思。首先,需要隨時(shí)警惕實(shí)驗(yàn)室污染。這次事件的調(diào)查表明,除了偶爾操作不當(dāng)可能引入污染,一些廠商的PCR試劑(DNA聚合酶和逆轉(zhuǎn)錄酶)也可能會(huì)有痕量的鼠源DNA污染,同時(shí),一些關(guān)鍵實(shí)驗(yàn)步驟中新引進(jìn)的細(xì)胞系,必須清楚其來源及傳代背景。其次,不要迷信權(quán)威。雖然這次事件的始作俑者是一家不知名的私立實(shí)驗(yàn)室,但在質(zhì)疑聲中,也有一些知名科學(xué)家以及部分FDA、NI H的實(shí)驗(yàn)室參與,甚至輕率地得出了錯(cuò)誤的結(jié)論,使質(zhì)疑過程拖延了過長時(shí)間。再次,今后提出任何新的病原體感染與人類疾病關(guān)系的假說,都需要嚴(yán)格遵循“郭霍原則”或者“分子郭霍原則”,并進(jìn)行嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶?shí)驗(yàn)證明,謹(jǐn)慎得出結(jié)論,以免誤導(dǎo)公眾。
[1]Lo mbardi VC,Ruscetti FW,Das Gupta J,etal.Detection of an infectious retr ovir us,XMRV,in blood cells of patients with chronic fatigue syndro me[J].Science,2009,326(5952):585-589.DOI:10.1126/science.1179052
[2]Centers for Disease Contr ol and Prevention.Chronic Fatigue Syndro me[EB/OL].[2012-02-07].htt p://www.cdc.gov/cfs/general/sy mpto ms/index.ht ml.
[3]Wikipedia.Chronic fatigue syndrome[EB/OL].[2012-02-07].http://en.wikipedia.org/wiki/Chronic_fatigue_syndrome
[4]Devanur LD,Kerr JR.Chronic fatigue syndrome[J].J Clin Virol,2006,37(3):139-150.DOI:10.1016/j.jcv.2006.08.013
[5]Wikipedia.Xenotropic murine leukemia virus-related virus[EB/OL].[2012-02-07].http://en.wikipedia.org/wiki/Xenotropic_murine_leukemia_virus-related_virus
[6]Lo SC,Pripuzova N,Li B,etal.Detection of MLV-related virus gene sequences in blood of patients with chronic fatigue syndrome and healthy blood donors[J].Proc Natl Acad Sci U S A,2010,107(36):15874-15879.DOI:10.1073/pnas.1006901107
[7]Erl wein O,Kaye S,Mc Cl ure MO,etal.Failure to detect the novel retrovirus XMRV in chronic fatigue syndrome[J].PLoS One,2010,5(1):e8519.DOI:10.1371/journal.pone.0008519
[8]Groom HC,Boucherit VC,Makinson K,etal.Absence of xenotropic murine leukaemia virus-related virus in UK patients with chronic fatigue syndrome[J].Retrovirology,2010,15(7):10.DOI:10.1186/1742-4690-7-10
[9]van Kuppeveld FJ,de Jong AS,Lanke KH,etal.Prevalence of xenotropic murine leukae mia vir us-related vir us in patients wit h chronic fatigue syndr o me in the Netherlands:retrospective analysis of sa mples from an established cohort[J].BMJ,2010,340:c1018.DOI:10.1136/b mj.c1018
[10]Dodd RY,Hackett Jr J,Linnen JM,etal.Xenotropic murine leuke mia vir us-related vir us does not pose a risk to blood recipient safety[J].Transf usion,2012,52(2):298-306.DOI:10.1111/j.1537-2995.2011.03450.x.
[11]Mikovits JA,Lo mbardi VC,Pf ost MA,etal.Detection of an infectious retr ovir us,X MRV,in blood cells of patients wit h chr onic fatigue syndr o me[J].Vir ulence,2010,1(5):386-390.DOI:10.1126/science.1179052
[12]Switzer WM,Jia H,Hohn O,etal.Absence of evidence of xenotr opic murine leukemia vir us-related vir us infection in persons wit h chronic fatigue syndr o me and healt hy controls in the United States[J].Retrovir ology,2010,7:57.DOI:10.1186/1742-4690-7-57
[13]Si mmons G,Glynn SA,Ko mar off AL,etal.Fail ure to confir m X MRV/MLVs in the blood of patients wit h chr onic fatigue syndr o me:a multi-laboratory study[J].Science,2011,334(6057):814-817.DOI:10.1126/science.1213841
[14]Kaiser J.Chronic fatigue syndro me.St udies point to possible conta mination in X MRV findings[J].Science,2011,331(6013):17.DOI:10.1126/science.331.6013.17
[15]Zheng H,Jia H,Shankar A,etal.Detection of murine leukemia vir us or mouse DNA in co mmercial RT-PCR reagents and hu man DNAs[J].PLoS One,2011,6(12):e29050.DOI:10.1371/journal.pone.0029050
[16]Weiss RA.A cautionar y tale of vir us and disease[J].BMC Biol,2010,8:124.DOI:10.1186/1741-7007-8-124
[17]Sat o E,F(xiàn)ur uta RA,Miyazawa T.An endogenous murine leukemia viral geno me conta minant in a co mmercial RT-PCR kit is a mplified using standar d pri mers for X MRV[J].Retrovirology,2010,7:110.DOI:10.1186/1742-4690-7-110
[18]HuéS,Gray ER,Gall A,etal.Disease-associated X MRV sequences are consistent wit h laboratory conta mination[J].Retrovir ology,2010,7(1):111.DOI:10.1186/1742-4690-7-111
[19]Papr otka T,Delviks-Frankenberry KA,Cing?z O,etal.Reco mbinant origin of the retr ovir us XMRV[J].Science,2011,333(6038):97-101.DOI:10.1126/science.1205292
[20]Cing?z O,Paprot ka T,Delviks-Frankenberry KA ,etal.Characterization,mapping,and distribution of the t wo XMRV parental pr ovir uses[J].J Vir ol,2012,86(1):328-338.DOI:10.1128/JVI.06022-11.
[21]Katzourakis A,HuéS,Kellam P,etal.Phylogenetic analysis of murine leukemia virus sequences from longitudinally sampled chronic fatigue syndrome patients suggests PCR contamination rather than viral evol ution[J].J Virol,2011,85(20):10909-10913.DOI:10.1128/JVI.00827-11