侯曉暉 陳祥盛
摘要:通過PCR擴增獲得了飛虱科3屬5種昆蟲的16 S rDNA序列,對DNA序列進行測定,分析了其序列組成及變異。采用Mega 4.0軟件,利用鄰接法(NJ)和最大簡約法(MP)進行5種飛虱的系統發育分析,結果顯示構建的MP和NJ分子系統樹拓撲結構一致,3個簇角飛虱屬物種中華簇角飛虱(Belocera. sinensis)、褐額簇角飛虱(B. fuscifrons)和爬竹簇角飛虱(B. ampelocalamus)單獨聚為一支,與偏角飛虱屬海南偏角飛虱(Neobelocera hainanensis)的親緣關系較近,與短頭飛虱屬顯脊短頭飛虱(Epeurysa distincta)的親緣關系較遠,分子生物學分析結果與形態學研究結果一致。
關鍵詞:飛虱科;簇角飛虱屬(Belocera);16 S rDNA;系統發育
中圖分類號:Q969.35文獻標識碼:A文章編號:0439-8114(2012)15-3355-03
Evolutionary Relationships among Three Belocera Species Inferred from 16 S rDNA Sequences
HOU Xiao-hui1,2,CHEN Xiang-sheng1
(1. Institute of Entomology, Guizhou University/Guizhou Key Laboratory for Plant Pest Management of Mountainous Region, Guiyang 550025, China; 2. Zunyi Medical College, Zunyi 563003, Guizhou, China)
Abstract: The 16 S rDNA sequences of 5 plant hoppers belonging to 3 genus in the family of Delphacidae were obtained by PCR and then sequenced. The sequence composition and mutation were analyzed. Molecular phylogenetic trees were constructed by maximum parsimony method(MP) and neighbor-joining method(NJ) using Mega 4.0 software. The result showed that the topologies of MP tree and NJ tree constructed were the same. Belocera Sinensis, B. fuscifrons and B. ampelocalamus were clustered into one group, which had closer relationship to Neobelocera hainanensis while further distance from Epeurysa distincta. These results were identical with those of morphology research.
Key words: Delphacidae; Belocera; 16 S rDNA; phylogeny
飛虱科(Delphacidae)隸屬于半翅目(Hemiptera)蠟蟬總科(Fulgoroidea)[1]。該科昆蟲許多種類是重要的農林害蟲,它們通過刺吸汁液、產卵或傳播植物病毒病等方式為害水稻、玉米、蘆葦、甘蔗、竹子等,給農林生產造成巨大損失[2]。其中簇角飛虱屬(Belocera)為外形比較獨特的一個屬,其觸角矢狀,嚴重危害竹類植物[2,3]。該屬目前記錄5種,均為東洋種,僅中國云南、貴州、海南、廣東、臺灣等地有分布記載[2,4,5]。與簇角飛虱屬外形相似,同樣具備矢狀觸角的偏角飛虱屬(Neobelocera)也為害竹類植物,且與簇角飛虱屬的分布極其相似[1,2,5]。為了更好地進行兩近緣屬的分類研究,選取飛虱科簇角飛虱屬、偏角飛虱屬及外類群短頭飛虱屬的5個物種,利用其16 S rDNA序列片段進行系統發育分析,探討兩屬間及種間的分子進化關系,以期為實際生產中害蟲的鑒定提供一定的科學依據。
1材料與方法
1.1實驗材料
簇角飛虱屬中華簇角飛虱(B. sinensis)、褐額簇角飛虱(B. fuscifrons)和爬竹簇角飛虱(B. ampelocalamus),偏角飛虱屬海南偏角飛虱(N. hainanensis)及短頭飛虱屬顯脊短頭飛虱(Epeurysa distincta),采集地信息見表1,采樣后保存于無水乙醇中備用[6]。
1.2基因組DNA的提取
將保存于無水乙醇中的供試蟲體研磨碎,采用柱式動物基因組DNA抽提試劑盒提取總DNA,測定濃度后調整為1~2 ng/μL,保存于-20 ℃冰箱備用。
1.3PCR 擴增及產物檢測
16 S rDNA序列的引物設計參照文獻[6]的方法,引物序列為16S-PF 5′-GCCTGTTTAT CAAAAA
CAT-3′;16S-PR 5′-CCGGTCTGAACTCAGATCA-3′,由生工生物工程(上海)有限公司合成。PCR反應體系為25 μL,內含10 mmol/L Tris(pH 8.3),50 mmol/L KCl,0.01%Triton X-100,2.0 mmol/L MgCl2,
0.2 mmol/L dNTPs,0.2 mmol/L引物,1.0 U Taq酶以及1 μL DNA模板。PCR反應程序為:95 ℃預變性7 min;95 ℃變性50 s,50 ℃退火1 min,72 ℃延伸1 min,35個循環;72 ℃延伸10 min。PCR產物用1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測其片段大小、純度及含量。
1.4PCR產物回收與測序
瓊脂糖凝膠電泳檢測后,對于擴增效果良好且足量的PCR產物采用柱式膠回收試劑盒進行回收純化,樣品濃度達100 ng/μL以上時,送寶生物工程(大連)有限公司測序。
1.5序列分析及分子系統樹的重建
利用Clustal X 2.0對獲得的序列進行比對,其參數設置為默認參數[7],使用MEGA 4.0軟件分析各物種間16 S rDNA的堿基組成、遺傳距離和轉換/顛換值等[8],在Kimura-2-parameter模型的基礎上,用鄰接法(Neighbor-joining method,NJ)和最大簡約法(Maximum parsimony,MP)進行系統發育分析。在重建系統樹時,以顯脊短頭飛虱的16 S rDNA序列作為外類群,同時應用Bootstrap[9]自舉檢驗1 000次檢驗系統樹中各結點的置信值。
2結果與分析
2.15種飛虱16 S rDNA序列堿基組成及序列變異
研究中獲得的5種飛虱16 S rDNA序列已登錄GenBank,登錄號見表2。利用Mega 4.0軟件對所測16 S rDNA序列進行統計,結果表明,這5種飛虱的16 S rDNA序列平均長度為477 bp(包括Gap),其中A、T、G、C含量分別為37.3%、40.8%、14.1%、7.8%,A+T的平均含量為78.1%,G+C的平均含量為21.9%;共檢測到變異位點123個,其中簡約信息位點59個,自裔位點64個,約占總序列的25.8%。供試5種飛虱16 S rDNA序列間顛換高于轉換,轉換數/顛換數平均值為0.48。
2.2系統發育分析結果
從各物種16 S rDNA序列的遺傳距離(表2)來看,同屬物種間的遺傳距離較小,3種簇角飛虱間的遺傳距離為0.153~0.291;屬間遺傳距離較大,為0.401~0.964,其中3個簇角飛虱屬物種與海南偏角飛虱的遺傳距離為0.401~0.526,與顯脊短頭飛虱的遺傳距離均較遠,為0.759~0.964。
根據序列分析結果,分別采用最大簡約法(MP)和鄰接法(NJ)構建5種飛虱的分子系統樹,得到一致的拓撲結構(圖1、圖2),Bootstrap 1 000次檢驗系統樹各支均得到較高的支持率。從圖1和圖2中可以看出,簇角飛虱屬3個種聚為一支,與海南偏角飛虱有較近的親緣關系,短頭飛虱屬的顯脊短頭飛虱與其他4種飛虱的親緣關系較遠。
3討論
3.1屬間親緣關系
如前所述,偏角飛虱屬與簇角飛虱屬形態較為相似,關系密切。由遺傳距離分析結果來看,簇角飛虱屬物種與偏角飛虱屬間的遺傳距離為0.401~0.526,遠高于屬內物種之間的遺傳距離。另外,簇角飛虱屬與偏角飛虱屬雖親緣關系較近且互為姐妹群,但仍各自構成一單系群,故兩者作為獨立的屬級階元是成立的;而簇角飛虱屬與短頭飛虱屬親緣關系相對較遠,這與形態學研究結果非常吻合[2,5,9,10]。
3.2屬內親緣關系
目前,中國已報道5種簇角飛虱[10],其形態特征較相似,本研究涉及了其中3種,其中爬竹簇角飛虱與褐額簇角飛虱間的遺傳距離為0.153,而中華簇角飛虱與兩者的遺傳距離分別為0.291和0.283,表明其與這兩個物種的親緣關系相對較遠,這一結果與形態分類的結果相吻合[10]。
綜上所述,本研究分析結果與丁錦華等[2]、Hou[11]形態學分類的結果一致,這為用分子手段與形態學分類方法相結合,進行飛虱科昆蟲種屬的鑒定奠定了一定的基礎。
參考文獻:
[1] 陳祥盛.同翅目:飛虱科[A].金道超,李子忠. 習水景觀昆蟲[M]. 貴陽: 貴州科技出版社, 2005.151-158.
[2] 丁錦華.中國動物志:第45卷[M].北京: 科學出版社,2006.
[3] 陳祥盛.中國飛虱科系統分類研究(同翅目:蠟蟬總科)[D].重慶:西南農業大學,1999.
[4] MUIR F. On some new Fulgoroidea[J]. Proceedings of the Hawaiian Entomological Society,1913,2(5):237-269.
[5] 丁錦華,楊蓮芳,胡春林. 我國云南害竹飛虱的新屬和新種記述(同翅目:飛虱科)[J]. 昆蟲學報,1986,29(4):415-425.
[6] YEH W B, YANG C T, HUI C F. A molecular phylogeny of planthoppers (Hemiptera: Fulgoroidea) inferred from mitochondrial 16 S rDNA sequences[J]. Zoological Studies,2005,44(4):519-535.
[7] THOMPSON J D, HIGGINS D G, GIBSON T J. Clustal W: Improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice[J]. Nucleic Acids Research, 1994,22(22):4673-4680.
[8] TAMURA K, DUDLEY J, NEI M, et al. Mega4: Molecular evolutionary genetics analysis (MEGA) software version 4.0[J]. Molecular Biology and Evolution,2007,24(8):1596-1599.
[9] FELSENSTEIN J. Confidence limits on phylogenies: An approach using the bootstrap[J]. Evolution, 1985,39(4):783-791.
[10] CHEN X S, YANG L, TSAI J H. Revision of the bamboo delphacid genus Belocera (Hemiptera: Fulgoroidea: Delphacidae)[J]. Florida Entomologist,2007,90(4):674-682.
[11] HOU X H, CHEN X S. Review of the Oriental bamboo delphacid genus Neobelocera Ding & Yang (Hemiptera: Fulgoromorpha: Delphacidae) with the description of one new species[J]. Zootaxa,2010,2387:39-50.