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基于Photoshop CS5的植物葉面積測定方法

2012-04-29 17:57:43于守超張秀省冀蘆莎
湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2012年15期

于守超 張秀省 冀蘆莎

摘要:利用掃描儀對廣玉蘭葉片進行數(shù)字化處理,運用Photoshop CS5軟件自動化提取葉面積,并與葉面積儀法、剪紙稱重法等測定方法進行比較。結(jié)果表明,Photoshop CS5軟件的圖像處理法與葉面積儀法和剪紙稱重法呈極顯著線性相關(guān),相比之下其具有快速、準確、易普及等優(yōu)點;歸結(jié)出了Photoshop CS5中像素大小與葉片數(shù)字化時分辨率、縮放比例的數(shù)學(xué)關(guān)系,為今后葉面積的快速測定提供了依據(jù)。

關(guān)鍵詞:葉面積測定;圖像處理;自動化分析

中圖分類號:S126;TP391.41文獻標識碼:B文章編號:0439-8114(2012)15-3340-02

A Method for Leaf Area Measurement of Plant Based on Photoshop CS5 Software

YU Shou-chao1a,2,ZHANG Xiu-sheng1a,JI Lu-sha1b

(1. Liaocheng University, a. School of Agricultural Science; b. College of Life Science, Liaocheng 252059, Shandong, China;

2. College of Landscape Architecture,Beijing Forestry University, Beijing 100083,China)

Abstract: The magnolia leaves were digitalized through the scanner, then the leaf area was automatically analyzed by the software of Photoshop CS5. The data from this method was compared with the data from other methods, such as instumental scanning method, etc. The result showed that there were highly significant linear correlation between digital image processing method and the other traditional methods. Moreover, digital image processing method has the dominant advantage in its speediness, accuracy and easy popularity. Mathematical relationship between pixel size in photoshop CS5 and digital resolution and scaling mathematical relationship were also summed up. This will provide the basis for the rapid measurement of leaf area.

Key words: measurement of leaf area; image manipulation; automatically analysis

葉片作為植物進行光合作用、呼吸作用和蒸騰作用的主要器官,其葉面積大小是植物生長狀態(tài)診斷中重要的參數(shù)之一,也是研究生理生化、遺傳育種、作物栽培等內(nèi)容常參考的參數(shù)。因此建立簡便、快速和準確的葉面積測定方法對植物的研究和生產(chǎn)實踐有著重要的意義。

目前葉面積的測定方法有很多,如剪紙稱重法(復(fù)印稱重法)、打孔稱重法、網(wǎng)格交叉法、系數(shù)法、葉面積儀測定法[1,2]等。隨著科技的發(fā)展,應(yīng)用數(shù)碼相機或掃描儀與Photoshop等軟件相結(jié)合的圖像處理法[3-5]越來越受到研究人員的重視,但目前使用的圖像處理法操作比較繁瑣。為此,亟待探尋一種新的基于圖像處理技術(shù)的葉面積快速測定方法。

1材料與方法

1.1材料

試驗隨機選取完整的、大小各異的廣玉蘭(Magnolia grandiflora Linn)新鮮葉片50片,編號并于4 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2試驗方法

1.2.1葉面積儀法采用美國CI-203手持式激光葉面積儀測定葉面積,每片葉片測量重復(fù)3次,取其平均值。

1.2.2剪紙稱重法將葉片平鋪到卡紙上,沿其邊緣準確畫線并沿線剪下,準確稱其質(zhì)量,根據(jù)事前測算的1 cm2同種紙張的質(zhì)量換算葉面積。

1.2.3圖像處理法

1)葉片數(shù)字化。取植物葉片展平后置于掃描儀上,設(shè)定掃描參數(shù),因數(shù)字化后的圖像像素數(shù)與其存貯格式無關(guān)[1],預(yù)覽后將其數(shù)字化圖像存貯為JPG壓縮格式,從而用較小的圖像文件得到較好的圖像質(zhì)量。

2)葉面積獲取。利用Adobe公司的Photoshop CS5 軟件“分析”菜單,根據(jù)設(shè)定的測量比例,對選定各種形狀的葉片區(qū)域進行自動分析,獲取面積、葉長、葉寬、圓度及周長等參數(shù),并將結(jié)果記錄在“測量記錄”調(diào)板中,還可導(dǎo)出Excel支持的TXT格式文件,便于后續(xù)的數(shù)據(jù)分析。具體步驟如下:①Photoshop中測量比例(MS)的確定。分辨率表示每英寸的像素數(shù),同時像素數(shù)與掃描時縮放比例成正比,同一葉片和分辨率條件下,縮放比例越大像素數(shù)就越多。由此可以推出單個像素的邊長(即Photoshop中的測量比例),得到單位換算(1 inch=2.536 cm)后測量比例的計算公式:MS=2.536/(R×SC),式中MS為Photoshop中測量比例,R為掃描分辨率,SC為掃描時的縮放比例。②利用Photoshop打開數(shù)字化圖像,在工具欄中單擊“魔棒工具”,調(diào)整容差值為10(適合大多數(shù)植物葉片),然后用鼠標在圖像的非葉片區(qū)域內(nèi)單擊一下,之后右鍵單擊“反選”,準確選取葉片區(qū)域。③單擊Photoshop“分析”菜單中“設(shè)置測量比例”,設(shè)置邏輯長度為根據(jù)公式算出的MS值(單位為cm)。再單擊“分析”菜單中“記錄測量”,即可得到所選葉片的實際面積、葉長、葉寬、周長、圓度等一系列數(shù)據(jù)。圖像處理法流程見圖1。

2結(jié)果與分析

2.1不同方法測定標準面積紙的結(jié)果比較

為了比較葉面積儀法、剪紙稱重法、圖像處理法在準確性及穩(wěn)定性等方面的差異,以標準面積紙(10 cm×10 cm)為測算對象,分別用上述幾種方法5次重復(fù)測算,獲取面積并進行分析。結(jié)果(圖2)表明,圖像處理法重現(xiàn)性最強,變異系數(shù)僅為0.50%,準確度最高,相對誤差為0.20%,符合小于0.50%的精度要求;葉面積儀測定法受掃描速度影響,穩(wěn)定性較差,變異系數(shù)為3.6%,相對誤差達1.96%;而剪紙稱重法介于二者之間,變異系數(shù)為1.8%,相對誤差為1.26%。

2.23種葉面積測定方法在廣玉蘭葉面積測定中的應(yīng)用

為了進一步比較驗證所選的葉面積測定方法間的差異,對隨機選取的廣玉蘭葉片進行面積測定,數(shù)據(jù)經(jīng)SAS軟件分析后結(jié)果如表1。結(jié)果表明,3種葉面積測定方法兩兩均呈極顯著線性相關(guān)(P<0.01),其中剪紙稱重法和葉面積儀測定法之間相關(guān)性較好,而二者與圖像處理法的相關(guān)性也較好(r2>0.98)。說明基于Adobe Photoshop CS5分析模塊的圖像處理測定法比較適合植物葉面積的測定。

3小結(jié)

利用CI-203葉面積儀雖然可以快速、比較準確地測定葉面積,但設(shè)備價格昂貴,測定結(jié)果受掃描速度的影響較大,重現(xiàn)性較差,測量小葉片時誤差較大,這些因素限制了其在葉面積測定上的應(yīng)用。剪紙稱重法操作過程簡單易學(xué),所需材料成本低廉,但工作量較大,在測定形狀不規(guī)則或者面積小的葉片時精度大大降低,另外這種方法測定結(jié)果受紙張均勻性、人為等因素影響較大。

隨著計算機技術(shù)的發(fā)展和電子產(chǎn)品的普及,越來越多的研究人員探討使用圖像處理技術(shù)測定葉面積[1,3,4,6,7],但一些基于圖像處理技術(shù)的葉面積測定方法雖然具有成本低廉、儀器簡單等優(yōu)點,卻也存在如操作繁瑣、對操作水平要求較高等不足。與前人相比,此次提出的基于Photoshop CS5分析模塊的圖像處理法與葉面積儀等方法的測定結(jié)果呈極顯著相關(guān),同時該法與葉片數(shù)字化時選用的掃描分辨率或縮放比例值無關(guān),利用公式MS=2.536/(R×SC)均可快速準確地得到換算系數(shù)(即Photoshop中測量比例),進而自動化提取葉片的實際面積、周長、長度、寬度、圓度等一系列數(shù)據(jù)。該方法操作簡便快捷,精度高,適用范圍廣,幾乎不受葉片厚薄、形狀、大小的影響,為快速測定各種形狀、大小的植物葉片面積提供了可能。

參考文獻:

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