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MS-IAS: 集成的質(zhì)譜代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)

2012-04-12 00:00:00林曉惠明迪張洋阮強(qiáng)王全才張瑞嚴(yán)康李紅李海燕許國旺
分析化學(xué) 2012年9期

摘要 針對代謝組學(xué)研究中的數(shù)據(jù)處理問題,本研究建立了基于質(zhì)譜的數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)MS-IAS(Mass spectrometry based integrated analysis system)。此系統(tǒng)集成了特征選擇、聚類、分類等多種方法,用以處理質(zhì)譜數(shù)據(jù),具有多種統(tǒng)計分析方法能對所選的特征變量進(jìn)行比較,以發(fā)現(xiàn)與所研究問題相關(guān)的潛在生物標(biāo)志物。MS-IAS支持?jǐn)?shù)據(jù)與多種算法結(jié)果可圖形化顯示,有助于對數(shù)據(jù)的解釋與分析。以肝病患者的質(zhì)譜代謝組數(shù)據(jù)為例,展示MS-IAS的功能,兩種特征選擇算法從數(shù)據(jù)集中篩選出了40個對肝病具有區(qū)分能力的特征變量,展示了MS-IAS成為代謝組學(xué)研究中的通用質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)的潛力。

關(guān)鍵詞 代謝組學(xué); 質(zhì)譜; 特征選擇; 分類; 聚類

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