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從RNA酶解液中分離5′-尿苷酸

2011-07-27 05:48:48李德瑩丁慶豹
化學與生物工程 2011年12期

李德瑩,丁慶豹

(1.三峽大學化學與生命科學學院,湖北 宜昌 443002;2.華東理工大學 生物反應器工程國家重點實驗室,上海 200237)

核苷、核苷酸是構成生物遺傳信息DNA和RNA的基礎,在生物細胞的物質代謝和能量轉換中起著重要作用。核酸的分解產物及其衍生物在食品、醫藥和保健領域應用廣泛[1~3]。核苷酸類物質的應用源于5′-肌苷酸呈鮮味性質的發現,20世紀70年代以來,核苷酸及其衍生物在抗病毒和抗癌方面受到醫藥界的普遍重視,現在普遍使用的利巴韋林、齊多夫定、拉米夫定、氟鐵龍等均為核苷酸的衍生物。其中尿苷酸(UMP)參與肝解毒物質葡萄糖醛酸酐的生物合成,用于治療肝炎,還可作為生產核酸類藥物、保健食品及生化試劑的中間體,如用于合成尿苷三磷酸(UTP)、聚腺尿、氟鐵龍等藥物。

傳統的UMP制備方法通常是先采用1根陽離子交換柱分離4種單核苷酸[4~6],分別得到UMP、胞苷酸(CMP)、腺苷酸(AMP)的稀溶液和鳥苷酸(GMP)、CMP的混合液;再將UMP調pH值后,上陰柱分離純化、濃縮。該法存在樹脂利用率低、4種核苷酸不易完全分離、UMP的質量較差、分離周期較長、環境溫度較高時上柱液容易滋生微生物等問題;若要進行工業化生產,還需要增加洗脫液貯罐[7]。肖林平[8]研究了一種新的陽離子交換樹脂,可以將4種核苷酸在該陽柱上分離,但各產品色譜峰之間幾乎沒有距離,導致流出液產品收集存在一定困難。

作者在此采用串聯的陽離子交換柱在酸性條件下首先吸附AMP、CMP和GMP,未經吸附的UMP流經弱堿性樹脂柱和強堿性樹脂柱后,經洗脫、濃縮、干燥,得到高純度的UMP。

1 實驗

1.1 材料、試劑與儀器

麥芽根、酵母RNA,上海線磊生物科技有限公司;001×8、D301、D312、717樹脂,華東理工大學華震公司;實驗用試劑均為市售化學純。

紫外分析儀,752型紫外可見分光光度計,超級恒溫水浴,酸度計,島津高效液相色譜儀。

1.2 方法

利用麥芽根內提取的磷酸二酯酶作用于酵母RNA,可同時獲得4種5′-單核苷酸,即5′-腺苷酸(AMP)、5′-胞苷酸(CMP)、5′-鳥苷酸(GMP)和5′-尿苷酸(UMP)。AMP、CMP、GMP在pH值1.5時所帶的正電荷不同,強弱順序依次為AMP>CMP>GMP;UMP因為沒有氨基解離,帶負電荷,從而不被陽離子樹脂吸附而直接從柱上流出。因此,首先用陽離子樹脂吸附AMP、CMP和GMP,從而將UMP單獨分離出來。

1.2.1 磷酸二酯酶的制備[9,10]

稱取100 g麥芽根(金黃色,無異味,雜質少),加入800 mL去離子水,于室溫(低于25 ℃)浸泡16 h后,置于組織搗碎機粉碎,用尼龍布擠出浸汁,置于4 ℃冰箱保存備用。

1.2.2 酵母RNA的酶解

將200 mL磷酸二酯酶酶液加到2 L 1%的酵母RNA溶液中,于70 ℃攪拌反應2 h,反應停止后,迅速升溫至90 ℃,加入少量硅藻土、活性炭過濾,濾液經超濾處理。

1.2.3 UMP的分離

采用4柱串聯的方法。即2根陽柱與2根陰柱串聯,其中1#與2#柱裝填強酸性陽離子交換樹脂001×8、3#柱裝填大孔弱堿性陰離子交換樹脂D312、4#柱裝填強堿性陰離子交換樹脂717。將酵母RNA酶解液依次經過4柱處理后,用2 mol·L-1的HCl調pH值為1.5。

1.3 分析檢測

1.3.1 5′-核苷酸的鑒定

1.3.1.1 比值分析

將洗脫液的吸光度比值(A250/A260、A280/A260)與文獻值比較,定性判斷核苷酸種類[11]。4種核苷酸的標準吸光度比值見表1。

表1 4種核苷酸的吸光度比值

1.3.1.2 瓊脂糖電泳

取適量瓊脂糖水浴加熱溶解,加入pH值3.5的檸檬酸-檸檬酸三鈉緩沖溶液,混勻,趁熱吸取3.7 mL鋪在2.5 cm×7.5 cm的白料玻璃板上。冷卻凝固后距一端1.5 cm處開一狹縫,注入樣品液,以點樣處為負極,電壓約300 V,于電泳儀上電泳5 min。將電泳后的瓊脂糖凝膠板移入紫外分析儀中觀察。

1.3.2 5′-核苷酸的純度分析

采用高效液相色譜儀測定洗脫流出液中4種核苷酸的濃度[12,13]。色譜條件如下:Shim-pack VP-ODS色譜柱(4.6 mm×150 mm);流動相為pH值5.5的0.05 mol·L-1乙酸胺溶液;流速1 mL·min-1;紫外檢測波長254 nm;柱壓5.8 MPa。

1.3.3 UMP的收率計算

2 結果與討論

2.1 UMP的陽柱分離

將1800 mL RNA酶解液按序通過1#、2#串聯柱,1#裝柱量為250 mL,2#裝柱量為380 mL,流速約200~250 mL·h-1。檢測2#柱出口,經吸光度比值分析,上樣時陽柱的流出液為UMP;上樣完畢后,陽柱中還殘留有少量的UMP,用0.01 mol·L-1的HCl洗柱,流速200~250 mL·h-1。流出曲線如圖1所示。

圖1 UMP流出曲線

由圖1可知,流出液體積約2 L后,260 nm下的吸光度值很小,意味著柱出口處未檢測到核苷酸。在隨后的繼續洗脫過程中,經過一段空白后,2#柱出口處得到GMP。經HPLC分析,收集的1.8 L流出液中僅可檢測出UMP,未檢測出其它3種核苷酸,這表明使用1.8 L強酸性陽離子交換樹脂可以將UMP與其它核苷酸分離。因此可采用4柱串聯方式,將殘留在1#、2#、3#柱中的5′-UMP全部洗至4#柱,控制操作條件將AMP保留在1#柱,CMP、GMP保留在2#柱,便于其分離。

2.2 UMP流出液的陰柱純化與濃縮

通過瓊脂糖電泳分析陽柱流出液,發現在UMP的前端(正極端)仍有兩條明顯的雜質帶,說明RNA酶解液中含有比UMP帶有更多負電荷的物質,在陽柱分離的過程中,這些物質與UMP一起流出。若直接對UMP流出液進行陰離子交換樹脂濃縮,對后期UMP的結晶影響較大,幾乎得不到UMP的結晶。考慮到主要雜質所帶的負電荷明顯大于UMP,采用弱堿性的大孔陰離子交換樹脂(3#柱)對這些物質進行吸附,并用0.01 mol·L-1HCl洗脫吸附在弱堿性陰離子交換樹脂上的UMP。經此處理,UMP流出液電泳只有一條帶,無明顯的雜質帶,且后期得到晶形非常好的固體UMP。

2.2.1 3#柱樹脂種類與用量的選擇

3#柱采用大孔弱堿性陰離子交換樹脂D301,裝柱量為100 mL;4#柱采用強堿性陰離子交換樹脂717,裝柱量為100 mL。3#柱的作用一方面是對含有雜質的UMP流出液進行純化,另一方面是起到調節pH值的作用。UMP在pH值較高時,其磷酸基和烯醇式基團均解離帶負電荷,可被陰離子交換樹脂所吸附,在pH值2.0~2.5范圍內上述基團離解度降低。而陽柱流出液的pH值為1.0~1.5,此時UMP是不可能被陰離子交換樹脂吸附的,但是當其通過大孔陰離子交換樹脂后,溶液的pH值會升高到9.0~11.0。因此,3#柱的離子交換樹脂種類與裝柱量是關鍵的因素。

當3#柱的樹脂量為100 mL時,將1800 mL RNA酶解液按序通過1#、2#、3#、4#串聯柱,結果發現4#柱的流出液中UMP漏穿,檢測漏穿時3#柱的出口pH值為1.5,說明3#柱的樹脂量偏低。于是將3#柱的樹脂量增加到150 mL,漏穿現象仍然發生,此時,3#、4#柱的出口pH值變化見圖2。

圖2 3#、4#柱的出口pH值(3#柱的樹脂量為150 mL)

由圖2可見,在流出體積為1600 mL時,3#柱的出口pH值迅速降到2.5以下,說明3#柱的樹脂量仍然偏低,對pH值的緩沖能力達不到要求。

將3#柱的樹脂量增加到200 mL,并改用交換容量比較大的D312樹脂,檢測3#柱出口pH值為8.5,4#柱出口pH值為7.0,流出液中UMP未漏穿,但有部分UMP被吸附到3#柱。采用pH值2.0的稀鹽酸溶液洗滌3#柱,可將UMP全部洗出,而雜質全部留在3#柱。3#柱樹脂種類及用量對UMP純化的影響見表2。

表2 3#柱樹脂種類及用量對UMP純化的影響

由表2可知,采用D312樹脂,裝柱量為200 mL時的純化效果最好,UMP收率高達92.1%。

2.2.2 4#柱洗脫劑的選擇

若4#柱未漏穿,則采用0.01 mol·L-1HCl洗柱,將UMP全部洗至4#柱,然后斷開3#柱與4#柱,對4#柱進行洗脫。分別采用0.01 mol·L-1HCl、0.03 mol·L-1HCl作為洗脫劑,發現洗脫液體積過大,洗脫液中雜質含量較高。改用0.01 mol·L-1HCl-0.5 mol·L-1NaCl洗脫4#柱,洗脫曲線見圖3。

圖3 4#柱UMP洗脫曲線

洗脫所得到的UMP的吸光度比值與標準品的相比有一些偏差,這可能是因為洗脫劑的離子強度較高,將一些吸附較牢的雜質也洗脫下來的緣故。因此,降低NaCl濃度至0.2 mol·L-1進行洗脫,結果見表3。

表3 洗脫劑對UMP純化的影響

由表3可見,用0.01 mol·L-1HCl-0.2 mol·L-1NaCl洗脫下的UMP吸光度比值與用0.01 mol·L-1HCl-0.5 mol·L-1NaCl的吸光度比值接近,說明降低NaCl濃度對提高其洗脫選擇性并未起到明顯作用,但前者洗脫液總體積為390 mL,相比于后者洗脫液總體積300 mL,增加幅度較大,對后續的乙醇結晶不利。因此,選用0.01 mol·L-1HCl-0.5 mol·L-1NaCl作為洗脫劑,雖然所得溶液中含有雜質,但經瓊脂糖電泳分析其含量非常少,而且分離后的結晶也是一個純化過程,極少量的雜質不會沉淀出來。

收集液加入少量糖用活性炭,60 ℃水浴保溫30 min,用砂芯漏斗過濾,然后調pH值至7.0~7.5。加入3 BV 95%的乙醇,攪拌、靜置后用無水乙醇洗滌,真空干燥即得固體UMP,純度達86%以上。

3 結論

先采用2根強酸性陽離子交換柱串聯操作,使得AMP保留在1#柱,可以有效解決洗脫液用量過多、濃度低的問題;再采用大孔弱堿性陰離子交換樹脂,有效去除陽柱分離時上柱流出液中的雜質,并自動調節4#柱的pH值使其有利于UMP吸附;最后直接從4#柱洗脫得到純度較高的UMP,結晶純度達86%以上,收率92.1%。縮短了分離周期,節省了設備成本。

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