《太湖流域管理條例》是我國第一部綜合性的流域水環境保護和管理的行政法規。在條例制定過程中,主要遵循了三條原則:一是認真總結幾年來太湖流域水環境綜合治理實踐經驗,將實踐證明行之有效的各項保護和治理措施規范化、制度化。二是妥善處理草案與水法、水污染防治法等相關法律的關系,在不與上位法相抵觸的前提下,按照溫家寶總理“高標準、嚴要求,采取更有力、更堅決的措施”的指示精神,針對太湖流域的特殊情況設計相關制度措施,以增強立法的針對性、有效性。三是強化地方政府責任,在水資源保護和水污染防治等方面,進一步明確責任范圍、細化管理制度、落實監督措施,確保相關制度措施得到全面正確執行。