李睿,戴詩皎,楊敬鏡,瞿敏,劉志國
(武漢工業學院生物與制藥工程學院,湖北武漢 430023)
食品中產志賀毒素大腸桿菌的多重PCR檢測
李睿,戴詩皎,楊敬鏡,瞿敏,劉志國
(武漢工業學院生物與制藥工程學院,湖北武漢 430023)
針對產志賀毒素大腸桿菌的stx2、wzy、hlyA的保守序列,設計特異性的引物,建立一種新的多重PCR檢驗方法。結果顯示,該方法特異性強,擴增結果與各參考菌株基因型一致,并能良好的區分出O157菌株和非O157型產志賀毒素大腸桿菌。該方法能用于食品樣品的檢測和流行病學分離株的快速鑒定。
產志賀毒素大腸桿菌;多重PCR;hlyA;stx2;wzy
Abstract:Specific primers were designed according to the conserved loci of stx2,wzy and hlyA genes of Shiga toxin-producing Escherichia coli(STEC).A Multiplex PCR method was then developed.The result demonstrated that this method was highly specific.It detected the presence of the three target genes in a manner consistent with the known genotype of each reference strain.O157 and non-O157 STEC strains could also be well distinguished.The multiplex PCR developed in this study could be used for mass screening of food samples,and identification of clinical STEC isolates.
Key words:Shiga toxin-producing Escherichia coli;multiplex PCR;hlyA;stx2;wzy
產志賀毒素大腸桿菌(Shiga toxin-producing Escherichia coli,STEC;或稱 Vero toxin-producing Escherichia coli,VTEC)是食品主要病原菌之一[1]。STEC 包括 O157:H7、O157:H- 、O6、O26、O111、O91 等血清型[2]。世界上許多國家相繼發生了STEC的感染流行,對食品安全造成嚴重危害[3]。STEC主要毒力因子是stx1、stx2基因,分別編碼志賀毒素1和志賀毒素2。兩種毒素毒力不同,志賀毒素2比志賀毒素1毒力更強,更易引起出血性腸炎、溶血性尿毒綜合癥等食物中毒并發癥[4]。大質粒上編碼溶血素的hlyA基因亦是STEC重要毒力因子[5]。目前STEC的檢測是一個難點。以O157特異的標志基因-O抗原聚合酶基因wzy和stx2、hlyA基因開發多重PCR檢測技術,為檢測食品中的STEC菌株提供新的思路和方法。
1.1.1 菌株
大腸桿菌 O157:H7 EC1、EC2、EC3:均為日本九州大學生命科學與技術學院食品衛生實驗室贈送;大腸桿菌O157:H7 EC4號菌株、單核增生李斯特氏菌、副溶血弧菌、沙門氏菌:武漢市疾病預防控制中心提供;大腸桿菌O157:H7 EC5號菌株、普通大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、蠟樣芽孢桿菌由武漢工業學院食品安全實驗室保存。
1.1.2 試劑
CT-SMAC培養基:青島海博生物技術有限公司;新生霉素:上海創賽科學儀器有限公司;GoldView核酸染料:上海賽百盛基因技術有限公司;AxyPrep細菌基因組試劑盒、Taqmix預混合PCR試劑盒武漢華順生物技術有限公司;DNA marker、引物合成:武漢鼎國生物技術公司。
1.2.1 DNA模板制備
將O157菌株接種到LB液體培養基中,37℃過夜培養,然后用AxyPrep細菌基因組試劑盒提取DNA。
1.2.2 多重PCR檢測體系
PCR 體系為:8 μL dd H2O,12.5 μL 2×Taqmix 混合液,10 μM wzy 上下游引物各 1 μL,10 μM stx2 上下游引物各 0.5 μL,10 μM hly 上下游引物各 0.25 μL,1 μL DNA。PCR擴增程序:94℃變性1 min,55℃45 s,72℃60 s,共35個循環;72℃延伸10 min。
1.2.3 多重PCR特異性實驗
用本實驗室保存的各種菌株提取DNA,做多重PCR檢測,確定引物的特異性。
1.2.4 多重PCR靈敏度實驗
用大腸桿菌EC1號菌株DNA為模板,梯度系列稀釋后,做多重PCR檢測,確定靈敏度。
1.2.5 人工染菌樣品實驗
將EC1號菌株LB液體培養基過夜培養16 h~20 h,然后10倍梯度稀釋。取100 μL梯度稀釋菌液營養瓊脂平板培養,進行菌落計數。同時取無大腸桿菌O157感染的新鮮牛肉25 g,將牛肉均質,加入10-1梯度稀釋菌液,振蕩混合0.5 h。取1 mL混合液,離心后用AxyPrep細菌基因組DNA試劑合提取DNA。然后梯度稀釋,進行多重PCR,確認檢出限。
在 NCBI GenBank數據庫(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)下載wzy和stx2基因序列,在保守區內設計引物。hlyA基因引物參照文獻[6]。引物對見表1。

表1 多重PCR引物序列信息Table 1 Sequences of primers in the multiplex PCR
前期研究結果表明,大腸桿菌O157:H7 EC1、EC2、EC3、EC4、EC5 號菌株均攜帶兩種志賀毒素和hlyA基因,多重PCR檢測結果與之一致,3組引物擴增均能得到預期PCR產物,見圖1。單核增生李斯特氏菌、副溶血弧菌、沙門氏菌、普通大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、蠟樣芽孢桿菌等則呈陰性結果(圖片未附),表明多重PCR特異性強。
用純菌DNA做多重PCR靈敏度驗證試驗,DNA濃度為1.88 ng/μL時,3組基因都能良好擴增出。DNA濃度持續降低,stx2、wzy引物對靈敏性下降,但hlyA基

當稀釋度為10-5時,stx2、wzy基因有模糊的產物條帶。稀釋度為10-9時,仍可檢測hlyA基因,對應平板菌落計數為平板菌落計數為1.2 cfu/mL。將3組基因均能獲得良好擴增的對應稀釋度作為檢測的最高靈敏度,則多重PCR檢測的最高稀釋度為10-5。每個稀釋度相應進行平板計數,稀釋度為10-5時,平板菌落計數為 1.2×104cfu/mL。
STEC的檢測是一個難點,傳統檢測方法一般是通過平板分離出單菌落后,采用免疫試劑盒測定志賀毒素,或采用特異性核苷酸探針鑒定單菌落的stx基因[7]。STEC毒力復雜,大質粒上編碼溶血素的hlyA基因、編碼緊密粘附素的eae基因等,可增強STEC的毒力[7]。此種檢測STEC的多重PCR技術,可同時檢測stx2、hlyA兩種毒力基因和wzy基因。O抗原聚合酶基因wzy基因是O157血清型大腸桿菌的特異基因,可鑒別出O157菌株。O157是STEC最主要的血清型,也是STEC最常見的引起食物中毒的血清型。通過擴增這三組基因,不僅可區分出O157,還可鑒定出菌株的毒力情況,為流行病學研究和食品安全控制提供更全面的信息。本文報道的多重PCR技術,能滿足實際檢驗要求。多重PCR引物之間容易相互干擾,形成引物發夾環或引物二聚體,導致檢測靈敏度降低。多重PCR體系中hlyA基因擴增優于另兩組基因,可在后續試驗中繼續優化PCR體系和反應條件,以進一步提高stx2和wzy基因的檢測靈敏度。
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A Multiplex PCR System for the Detection of Shiga Toxin-producing Escherichia Coli in Food
LI Rui,DAI Shi-jiao,YANG Jing-jing,Qü Min,LIU Zhi-guo
(College of Biological and Pharmaceutical Engineering,Wuhan Polytechnic University,Wuhan 430023,Hubei,China)
2010-04-13
李睿(1972—),女(土家),副教授,博士,現從事食品安全方向研究工作。