我國漢族人群單核甘酸多態(tài)性與前列腺癌風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性研究

楊亞東,郭海濱,李麗娜,張恩璐

(1寧河縣醫(yī)院,天津 301500;2中國醫(yī)科大學(xué)附屬第四醫(yī)院)

前列腺癌(PCa)發(fā)病率占世界上男性癌癥的第3位,在歐洲、北美及亞洲一些國家占第 1位[1]。我國的PCa發(fā)病率雖遠(yuǎn)低于西方國家,但近年其發(fā)病率呈明顯上升趨勢(shì)[2]。個(gè)體遺傳學(xué)上的差異是 PCa發(fā)生的必要條件。目前,以單核苷酸多態(tài)性(SNP)作為第 3代遺傳標(biāo)志物成為主要的研究方向。現(xiàn)已證實(shí)[3]位于染色體8q24上多個(gè)位點(diǎn)SNP與PCa風(fēng)險(xiǎn)有關(guān),尤其rs6983561、rs16901979、rs1447925位點(diǎn),已在歐洲裔美國人、美國黑人、亞洲印度人群中得到驗(yàn)證。但是這些SNP在我國漢族人群中與PCa的關(guān)聯(lián)性尚未得到證實(shí)。2007年 2月 ～2009年 4月,我們采用直接測(cè)序法對(duì)我國漢族 PCa患者rs6983561、rs16901979、rs1447925位點(diǎn)SNP基因分型頻率進(jìn)行檢測(cè),探討其與我國漢族人群PCa的相關(guān)性。

1 資料與方法

1.1 臨床資料 所測(cè)DNA樣本來源于在我院診治的120例中國漢族PCa患者(PCa組)及同期在我院體檢的120例漢族人群健康男性(對(duì)照組)。PCa組均經(jīng)活檢或術(shù)后病理學(xué)確診為 PCa,排除有任何其他腫瘤史者。PCa組年齡46～86歲,平均71.2歲;對(duì)照組年齡 50～79歲,平均 70歲。兩組年齡等一般資料比較,P＞0.05,有可比性。

1.2 檢測(cè)方法 ①主要試劑及儀器：采用上海Invitrogen公司的ABIPRISM實(shí)驗(yàn)平臺(tái),PCR試劑盒,激光檢測(cè)器。②DNA測(cè)序方法：取兩組靜脈采血 1 m l,抗凝后全血標(biāo)本 -70℃保存。用水抽提法提取DNA后行PCR擴(kuò)增,獲得含有SNP位點(diǎn)在內(nèi)的目的DNA片段。采用直接測(cè)序法對(duì) SNP位點(diǎn)(rs6983561、rs16901979、rs1447925位點(diǎn))基因進(jìn)行檢測(cè)。對(duì)PCR產(chǎn)物采用四色熒光染料(ddNTP)標(biāo)記,通過單引物PCR測(cè)序反應(yīng),生成含不同熒光染料的單鏈DNA混合物。通過激光檢測(cè)器窗口中的攝影機(jī)檢測(cè)器對(duì)熒光分子逐個(gè)檢測(cè),用Chromaslite 201測(cè)序分析軟件將不同熒光分子轉(zhuǎn)變?yōu)?DNA序列。

1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS13.0統(tǒng)計(jì)軟件。兩組基因型頻率Hardy-Weinberg遺傳平衡性檢驗(yàn),基因型及等位基因頻率行相關(guān)性檢驗(yàn),用非條件Logistic模型評(píng)估單個(gè)SNP位點(diǎn)風(fēng)險(xiǎn)基因與PCa關(guān)聯(lián)程度。計(jì)算比值比(OR)、95%可信區(qū)間(95%CI)。在計(jì)算風(fēng)險(xiǎn)等位基因時(shí)從野生型基因純合子、變異基因雜合子、變異基因純合子分別賦予 0、1、2值。P≤0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 兩組中3個(gè)位點(diǎn)SNP等位基因及基因型頻率與PCa關(guān)聯(lián)性檢驗(yàn)結(jié)果 ①rs6983561位點(diǎn)：PCa組C等位基因頻率比A等位基因頻率高,但PCa組與對(duì)照組C等位基因頻率比較,P＜0.05;rs6983561 C等位基因與PCa無關(guān)聯(lián)性(OR=1.19,P＞0.05)。與AA基因型相比,AC和CC基因型攜帶者的PCa風(fēng)險(xiǎn)雖增加,但P均＞0.05(OR=1.17、1.52),將AC與CC合并后,P仍＞0.05(OR= 1.22)。②rs16901979位點(diǎn)：PCa組A等位基因頻率比對(duì)照組頻率高,但P＞0.05,rs16901979 A等位基因與PCa無關(guān)聯(lián)性(OR=1.13,P＞0.05)。與CC基因型相比,AC和AA基因型攜帶者的PCa風(fēng)險(xiǎn)雖增加,但P均＞0.05(OR=1.11、1.34),將AC與AA合并后,P仍＞0.05(OR=1.14)。③rs1447295位點(diǎn)：rs1447295位點(diǎn)A等位基因能增加PCa風(fēng)險(xiǎn),與PCa明顯相關(guān)(OR=1.63,P=0.042)。由于AA基因型在人群中所占比例較低,將AC與AA合并后統(tǒng)計(jì),AC+AA基因型攜帶者的PCa風(fēng)險(xiǎn)明顯升高(OR=1.87,P＜0.05)。

2.2 單因素Logistic回歸分析結(jié)果 rs6983561、rs16901979位點(diǎn)與 PCa無關(guān)(P均 ＞0.05)。rs1447295位點(diǎn)與PCa有關(guān)(P＜0.05),為PCa發(fā)生的危險(xiǎn)因素。詳見表 1。

表1 3個(gè)位點(diǎn)SNP單因素Logistic回歸分析結(jié)果

3 討論

PCa是泌尿系統(tǒng)常見惡性腫瘤之一,在美國、加拿大等國家,PCa是男性最常見的惡性腫瘤。在歐洲大多數(shù)國家,PCa的發(fā)病率為 36/10萬。中國、日本等亞洲國家PCa發(fā)病率較低(2.3/10萬～9.8/10萬)。

PCa的發(fā)生發(fā)展與遺傳因素和生活方式密切相關(guān)。在我國,生活方式西方化和脂肪攝入量的持續(xù)增加導(dǎo)致PCa危險(xiǎn)因素和保護(hù)因素失衡是PCa發(fā)病的重要環(huán)境因素[4],而個(gè)體遺傳學(xué)上的差異是PCa發(fā)生的必要條件。近年來,各地PCa的檢出率均有不同程度增加,但人種間的差異仍很明顯,這可能與各人種間雄激素水平,5α還原酶活性及雄激素受體的差異有關(guān)。Gronberg等[5]報(bào)道,1個(gè)一級(jí)親屬患PCa危險(xiǎn)度為2,兩人患PCa上升至5;3個(gè)一級(jí)親屬患病危險(xiǎn)度達(dá)到 11。在其另一項(xiàng)對(duì)孿生兄弟PCa患病相關(guān)性跟蹤調(diào)查中發(fā)現(xiàn),單卵雙生的孿生兄弟PCa發(fā)生率是雙卵雙生者的 5倍,進(jìn)一步揭示了PCa的發(fā)生與遺傳因素存在密切關(guān)系。對(duì)歐美人PCa的全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)發(fā)現(xiàn),有多個(gè)基因位點(diǎn)與PCa的發(fā)病相關(guān)[6]。

SNP是人類基因組中遺傳學(xué)變異最常見的一種類型,通過對(duì)比健康和患病人群SNP發(fā)生頻率的差異,可以確定 SNP與疾病之間的相關(guān)性。當(dāng)一個(gè)遺傳標(biāo)記的頻率在患者中明顯超過非患者時(shí),即表明該標(biāo)記與疾病關(guān)聯(lián)。常見變異(CD-CV)假說[7]認(rèn)為,常見疾病的易患性是由于人群中某些位點(diǎn)特別是在基因的編碼區(qū)或調(diào)控區(qū)的常見變異引起的。如果這一假說成立,那么列出人群中頻率較高的 SNP,將其與疾病表型進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,就可能檢出疾病易感SNP。不同的SNP位點(diǎn)在不同人群中的分布頻率及雜合程度不同,在進(jìn)行疾病分析時(shí)提供的信息量可能存在較大差異。

目前我國的 PCa病例構(gòu)成以晚期為主。對(duì)于我國漢族人群研究較多為 5-α還原酶 Ⅱ基因(SRD5A2)、維生素D受體(VDR)基因、雌激素受體(ER)基因等[8,9]。本研究結(jié)果顯示,我國漢族人群中 rs1447295A等位基因與 PCa有關(guān)聯(lián)性, rs1447295A等位基因攜帶者PCa風(fēng)險(xiǎn)增加。

我們認(rèn)為,隨著有關(guān)SNP研究的不斷深入,可以在流行病學(xué)調(diào)查中確定PCa高危人群,進(jìn)行其危險(xiǎn)程度評(píng)價(jià),有助于建立有效的預(yù)警系統(tǒng),形成有效預(yù)防。

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