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文獻推薦

2010-02-09 10:02:59
中國產前診斷雜志(電子版) 2010年3期
關鍵詞:檢測研究

1 Sites of Differential DNA Methylation between Placenta and Peripheral Blood.

Papageorgiou EA,Fiegler H,Rakyan V,Beck S,Hulten M,Lamnissou K,Carter N P,Patsalis PC

∥the Cytogenetics and Genomics Department,The CyprusInstitute of Neurology and Genetics,Nicosia,CyprusThe American Journal of Pathology.2009,5:1609-1618

該文章于2009年發表于《The American Journal of Pathology》雜志上。母體的全血與胎兒(胎盤)間的表觀遺傳學差異是非侵入性產前診斷的重點所在,但對染色體范圍內的不同甲基化位點的深入辨識限制了這種方法的應用。本研究對21、18、13號及X、Y染色體采用甲基化DNA免疫沉淀與高分辨率疊瓦式陣列寡核苷酸芯片分析相結合的方式進行研究,標本為女性全血與胎盤組織DNA。研究在每1條被檢測的染色體上都發現了超過2000個在全血與胎盤DNA中有不同甲基化程度的區域。而后,用實時PCR對一部分檢測到的有區別的甲基化的區域進行了確認,并研究了這些區域與Cp G島,基因和啟動子區域的關系。這些區域中的56%~83%都位于無效區域,只有1%~11%與CpG島有重合,而這其中的近65%在啟動子區。因此本研究找到了很大數目的以前未報道過的胎兒的表觀遺傳學分子標記,未來有可能發展成為對于染色體數目異常等疾病的非侵入性產前診斷的標記物。研究也同時證明了在富集高甲基化胎兒DNA時采用甲基化DNA免疫沉淀方法的有效性。

2 A microarray-based approach for the identification of epigenetic biomarkers for the noninvasive diagnosis of fetal disease.Chu T,Burke B,Bunce K,Surti U,Hogge W A,Peters DG

∥Centre for Fetal Medicine,Magee-Womens Research Institute,Pittsburgh,PA,USA

Prenat Diagn.2009,29:1020-1030.

該文章于2009年發表于《Prenat Diagn》雜志上。本研究結合1種215 060探針的定制寡核苷酸芯片與綜合性文庫預備方法,以及新式的統計工具,研究比較了絨膜絨毛樣本(CVS)與對應妊娠期的相配年齡的孕婦血細胞(MBC)樣本的DNA甲基化模式,借助定制寡核苷酸芯片可以給出人類13、18、21號染色體的高分辨率重合。

在研究的所有3對染色體中,有組織特異的不同Cp G甲基化模式的 Msp I/HpaII位點(即CCGG序列)共有6 311個。為了將得到有臨床意義的位點的可能性最大化,研究從得到的數據中又篩選出含有150bp的高單核苷酸多態性的 MspI/HpaII位點,這樣其等位基因頻率可以用于找出胎兒染色體數目異常。實驗的芯片陣列設計以及使用軟件都可以完整地下載到。

此妊娠早期胎盤中DNA甲基化模式的高分辨率分析在13、18、21號染色體上指出了用于診斷胎兒染色體數目異常的眾多標記物。

3 Array Comparative Genomic Hybridization in Prenatal Diagnosis:Another Experience.Vialard F,Molina Gomes D,Leroy B.Quarello E.Escalona A,Le Sciellour C,Serazin V, Roume J, Ville Y, de Mazancourt P,Selva J

∥Federation of Genetics,CHI Poissy Saint Germain,Poissy,fvialard@hotmail.com,France.

Fetal Diagn Ther2009;25:277-284.

該文章于2009年發表于《Fetal Diagn T her》雜志上。目前對多發先天性異常(MCA)的病原性診斷還非常缺乏。大片段染色體異常通過常規的細胞遺傳學方法就可以檢測出來,但是對于更加微小的染色體異常則需要通過mutil-FISH才能檢測出來。本文利用陣列比較基因組雜交(a-CGH)的方法在39名MCAs的患兒監測典型的亞顯微缺失和端粒重組。最后在2名患兒體內檢測到從頭開始的不平衡核型,這種異常利用常規細胞遺傳學方法是檢測不到的。目前對亞顯微結構的拷貝數變異(CNV)的檢測非常熱門,而a-CGH為其檢測提供了1種有力的工具。

4 Hsa-miR-222 is involved in differentiation of endometrial stromal cells in vitro.

Qian K.

∥Reproductive Medicine Center,Tongji Hospital, Tongji Medical College,Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430030,People's Republic of China.

Endocrinology.2009,10:4734-4743.

該文章于2009年10月發表于《Endocrinology》雜志上。子宮內膜蛻膜化是胚胎植入的1個重要過程,它的特點是子宮內膜基質細胞(ESCs)向蛻膜細胞分化。本研究是采用芯片尋找在體外ESCs蛻膜化和非蛻膜化過程中micro RNA表達的差別。研究共發現了49種microRNA,并對其中的miR-222、221、143、101、30d、30c、181b、27b、29b、507和23a用定量PCR的方法進行了驗證。研究還發現,下調mir-222可以減少ESCs分化過程中S期細胞的數量。Antimir-222可以增加報告基因CDKN1C/p57kip2 mRNA和蛋白水平的表達。說明micro RNA在ESCs蛻膜化過程中發揮了重要作用,并且mir-222參與調節ESCs終末期的分化。

5 STOX2 but not STOX1 is differentially expressed in decidua from preeclamptic women.

Fenstad MH,Johnson MP,Loset M,Mundal SB,Roten LT,Eide IP,Bjorge L,Sande RK,Johansson AK,Dyer TD,Forsmo S, Blangero J, Moses EK,Austgulen R.

∥Department of Cancer Research and Molecular Medicine,Faculty of Medicine,Norwegian University of Science and Technology(NTNU),Trondheim,7006,Norway.

MolHum.Reprod.2010,7.July 19,2010

該文章于2010年發表于《Hum.Reprod》雜志上。已有研究表明STOX1基因的突變與子癇前期的發生存在一定的關聯。在本研究中,作者以包含子癇患者和非子癇患者的獨立人群隊列作為調查對象,分析了STOX1的候選SNPs,同時比較了在子癇孕婦和(或)胎兒生長受限(FGR)孕婦以及正常孕婦蛻膜組織中的STOX1及其同源基因STOX2的表達水平。研究表明候選SNPs與子癇前期的發生并不存在確切的關聯(p>0.05);與正常組相比,病例組中STOX1的表達水平也沒有明顯的改變,相反,與對照組相比STOX2在子癇前期并發FGR孕婦的蛻膜組織中表達顯著降低(p=0.01)。已有報道指出絨毛膜癌細胞中存在轉錄改變引起的STOX1A過表達。文章最后,作者進一步提出這種轉錄改變與子癇前期并發FGR孕婦的蛻膜組織中該基因的表達改變存在密切聯系。

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