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川南地區RHDV2的流行病學調查

2025-08-15 00:00:00劉杰
中國動物保健 2025年6期
關鍵詞:載量毒株流行病學

兔出血癥病毒II型(RHDV2)自2010年在歐洲暴發后迅速擴散至全球,其高變異的VP60基因導致傳統疫苗保護力下降。我國自2020年四川首次報道RHDV2以來,該病毒已在12個省份流行,但缺乏對養殖密集區的系統研究。川南地區家兔年出欄量占全省 40% 以上,近年因RHDV2暴發遭受重大經濟損失。現有研究多聚焦病毒分離鑒定,對流行株分子特征及重組風險評估不足。本研究通過分子檢測與基因組分析,旨在闡明川南地區RHDV2的時空分布規律、遺傳進化特征及重組動態,為優化區域防控策略提供科學依據。

1研究背景

1.1RHDV2的病原學特征

兔出血癥病毒I型(Rabbit haemonhagic diseasevirus type2,RHDV2)屬于杯狀病毒科(Caliciviridae)兔病毒屬(Lagovirus),其基因組為單股正鏈RNA,全長7437~7453個核苷酸。病毒粒子呈二十面體對稱結構,直徑約 135~40mm ,在氯化銫中的浮密度為 1.33~1.36g/cm3 。基因組包含兩個開放閱讀框ORF1和ORF2,其中ORF1編碼非結構蛋白NS1-7和主要結構蛋白VP60,ORF2編碼次要結構蛋白VP10(Lavazzaetal.,2015)。VP60蛋白包含三個主要抗原決定簇(A、B、C區),其中B區的變異直接影響病毒與宿主細胞受體的結合能力(Wangetal.,2015)。

1.2國內外流行現狀

RHDV2自2010年在法國首次分離鑒定以來,其全球流行版圖持續擴張。分子流行病學監測顯示,截至2023年該病毒已形成4個主要基因亞型(GI.2a-d),其中GI.2a型在歐洲占比達 82.6% ,澳大利亞則以GI.2b型為主。我國自2020年四川SC2020毒株(MT586027)首報以來,通過全基因組測序技術已在12個省份鑒定出RHDV2流行株,其VP60基因與歐洲株GER-NW(LR899189)同源性為 95.46% ,而全基因組同源性降至 87.93%

1.3研究必要性

川南地區是我國重要的家兔養殖基地,年出欄量占全省 40% 以上。RHDV2的出現對當地養兔業構成嚴重威脅。目前,國內對RHDV2的研究主要集中在病毒分離鑒定和部分基因特征分析,缺乏系統的流行病學調查數據。此外,病毒在自然傳播過程中的重組發生風險尚未得到充分評估。因此,開展川南地區RHDV2流行病學調查,明確流行毒株分子特征和遺傳進化關系,對制定科學防控策略具有重要意義[。

2研究方法

2.1樣本采集與處理

本研究于2023年1月—2024年6月期間,在川南地區(含自貢、瀘州、宜賓、內江4市)開展系統性樣本采集。采用分層隨機抽樣法,選取32個存欄量 ≥800 只的規模化兔場及15個存欄量 ≤80 只的散養戶,覆蓋區域養殖密度梯度。樣本類型包括。

第一,急性死亡病例肝臟組織:通過無菌解剖采集右肝葉中部組織,單樣本濕重 ≥8g

第二,亞急性病例血清:耳中央動脈采血 4mL 只,使用真空采血管37 C 靜置 40min 后, 3500×i 離心 20min (Centrifuge 5424R);

第三,環境生物樣本:含籠具表面大小為1 5cm×15cm 采樣區、自動飲水器出水口及飼料傳送帶刮取物,采用植絨拭子(COPAN154C)浸人3mL病毒運輸液[2]。

2.2實驗室檢測技術

第一,血凝試驗(HA):嚴格參照NY/T572-2023標準,采用 1% 人O型紅細胞懸液進行檢測。紅細胞經PBS洗滌4次,最終濃度為 1% 。樣本肝組織勻漿液經梯度稀釋1:2至1:2048后與紅細胞懸液等體積混合, 37°C 靜置1h判讀結果。效價≥1:16判定為陽性,靈敏度較傳統方法提升3~5倍。

第二,RT-PCR檢測:病毒RNA提取采用TIANampVirusRNAKit,裂解液AVL緩沖液與樣本體積比1:5,結合硅膠膜吸附純化離心力12 000×g , 1min 。引物設計基于RHDVVP60基因保守區(GenBank:FJ794180),擴增產物長度240bp 。反應體系優化為: 2×TaqPCR Mix(含 Mg2+3mM )12.5μL ,引物終濃度 0.4μM ,模板RNA3 μL 擴增程序設置退火溫度 57.6‰ ,確保引物Tm值匹配RHDV-F: 58.3‰ RHDV-R: 57.8 ℃[3]。

2.3基因組分析與生物信息學

全基因組擴增采用分段擴增策略,基于SC2020/0401參考序列設計4對特異性引物(表1),引物設計參數:Tm值 58±2°C ,GC含量 45%~60% ,產物重疊區 ≥30bp. PCR反應體系含 2× BlendTaqMasterMix(東洋紡)、 物各1 μL ,模板cDNA3 μL ,擴增條件為:95℃預變性5min ;35個循環;終延伸72 c10min? 。擴增產物經 1% 瓊脂糖凝膠電泳驗證后,使用pMD19-T載體(Takara)克隆,每個片段雙向測序3次(IlluminaNovaSeq6000,PE150),測序覆蓋深度 ≥100× ,序列一致性 gt;99.9% 。

表1全基因組擴增引物信息

3結果與討論

3.1流行病學特征

第一,時空分布特征。

研究顯示川南地區RHDV2的流行呈現顯著時空異質性。時間維度上,2024年1~6月病毒核酸陽性率 68.2% 較2023年同期 59.1% 增長 15.4% 絕對增幅 9.1% ,表明病毒傳播強度持續上升。值得注意的是,陽性率在2023年冬季12月至2024年2月達峰值 73.5% ,可能與低溫環境下病毒穩定性增強及兔群免疫力下降有關。空間分布上,宜賓市陽性率高達72.3% ( 95%CI 68.4%~76.1% ),瀘州市為 65.8% ( 95%CI 61.2%~70.1% ),顯著高于自貢 58.4% 和內江 $5 3 . 9 \% _ { \textmd { 0 } _ { \textparallel } }$

第二,養殖模式與感染風險

不同養殖模式的流行病學差異顯著 x2=36.52 , Plt;0.001 。規模化兔場陽性率 51.6% 較散養戶 78.9% 降低 34.6% ,驗證了生物安全措施的關鍵作用。實施全封閉管理空氣過濾系統 + 人員單向流動的兔場陽性率僅 39.2% ,而未封閉兔場達67.4% 。散養戶中,飼料儲存區與養殖區未物理隔離的農戶陽性率高達 85.6% ,而采取分區管理的農戶陽性率降至64.3% 。值得注意的是,使用自動飲水系統的規模化兔場,其飲水管刮取物陽性率 9.8% 僅為散養戶水槽樣本 34.5% 的28.4% ,表明設備自動化可顯著減少環境病毒載量。此外,每月開展 22 次環境消毒的養殖單元,其籠具表面病毒檢出率較未規范消毒單元降低 42.7% ( P=0.003 )。

第三,病毒載量與病理關聯。

急性死亡病例肝臟組織病毒載量達 10?7.3±0.4 4拷貝 ∣μL 范圍: 10~6.8~10~8.1 ,較亞急性病例 10?5.2±0.? 拷貝 μ L提升2個數量級t=18.36, Plt;0.001 。載量水平與病理損傷評分0~5分制呈強正相關 ∵0.832 , Plt;0.001 :載量≥10^7拷貝 μL 的病例中, 87.5% 出現肝細胞廣泛壞死評分≥4,而載量 拷貝 /μI 者僅 12.9% 表現中度損傷評分-2。進一步回歸分析顯示,病毒載量每增加1個log值,肝臟出血面積擴大23.6%

3.2分子特征分析

獲得12株RHDV2完整基因組序列,與國內外毒株比較顯示。

第一,VP60基因同源性:與國內SC2020/0401毒株同源性 98.91% ,與歐洲代表株GER-NW同源性 95.46% 。

第二,非結構蛋白基因同源性:與SC2020/0401同源性僅 84.46% ,出現顯著差異。

表2代表性毒株基因組同源性比較 (%)

系統進化分析發現,川南分離株在RHDV1和RHDV2進化樹中形成獨立分支。重組分析確認一例重組事件,斷點位于5266bp(ORF1區),主要親本為RHDV1/Triptis,次要親本為RHDV2/SC2020/0401(MT586027)。該重組毒株的非結構蛋白基因主要來源于RHDV1,而結構蛋白基因保持RHDV2特征4。

3.3防控啟示

本研究揭示川南地區RHDV2流行特征顯示,規模化兔場陽性率 51.6% 顯著低于散養戶 78.9% ,提示加強生物安全措施如封閉管理、定期消毒可有效阻斷病毒傳播。病毒載量與病理損傷呈強正相關,建議養殖場對急性病例肝臟樣本開展早期分子檢測以實現精準剔除。重組毒株的出現表明需警惕RHDV1與RHDV2的基因重組風險,應建立全基因組監測體系,針對性優化疫苗設計。

結語

本研究系統揭示了川南地區RHDV2的流行病學特征與分子進化規律,證實該病毒流行強度呈上升趨勢,且存在RHDV1-RHDV2重組事件。重組毒株的非結構蛋白基因溯源提示歷史毒株可能參與新發變異,凸顯長期監測的重要性。研究結果為精準防控提供了關鍵數據支持:需針對VP60B區抗原變異設計疫苗,強化規模化養殖場生物安全管理,并建立環境病毒消控技術體系。未來應深入探究重組機制對病毒適應性的影響,評估跨物種傳播風險,同時結合人工智能模型預測流行趨勢,為家兔產業可持續發展構建多重防控屏障。

參考文獻:

[1]李麗,陳弟詩,陳斌,等.四川省兔出血癥病毒2型流行病學調查及遺傳變異分析[J].中國動物檢疫,2022,39(05):42-48.

[2]楊澤曉,曾紅梅,涂騰,等.一起獺兔兔瘟2型病例的診斷[J].動物醫學進展,2021,42(07):140-144.

[3]肖躍強,孫培姣,周迎春,等.鑒別RHDV與RHDV2熒光定量RT-PCR檢測方法的建立與應用[J].中國預防獸醫學報,2021,43(05):512-520.

[4]梁璐琪,李敏,楊曦,等.四川省金堂縣兔病毒性出血癥2型的流行病學調查[J].四川畜牧獸醫,2021,48(02):19-20+24.

收稿日期:2025-04-28

作者簡介:劉杰(1997—),男,漢族,碩士研究生,助理工程師。研究方向:流行病學。

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