楊澤華,丁毅鵬
(海南省人民醫院(海南醫學院附屬海南醫院)呼吸與危重癥醫學科,海南 海口570100)
慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)簡稱慢阻肺病,是一種異質性肺部疾病[1]。據最新WHO 數據顯示,COPD 是全球第三大死因。并且由于我國人口老齡化、空氣污染和吸煙率的上升等原因,預計未來COPD 的患病率、死亡率和社會負擔仍會增加[2]。在COPD 的研究中,常用到基因測序。傳統的測序方法獲得的是細胞群體的總平均反應,無法反映每個細胞之間的差異性,不能完全揭示疾病的發病機制等。單細胞測序(single cell sequencing,SCS)技術可以在單細胞水平上對基因組和轉錄組等進行測序,揭示基因結構和表達以及發現細胞間的異質性和稀有細胞等。目前迫切需要這項技術來幫助研究COPD 的發病機制以及發現可靠的早期診斷方法和治療方法等,從而減輕疾病負擔。本文將介紹單細胞測序技術及相關進展,并對其在COPD 研究中的應用進行綜述。
1977 年,Sanger 等[3]發明了第一代基因測序技術,基因測序成為探索細胞遺傳物質變化和疾病發展的強有利工具。2009 年Tang[4]首次通過單細胞RNA 測序方式實現了單個細胞內5 000 多個mRNA 表達信息的平行檢測,開啟了單細胞技術的測序時代。
SCS 技術的流程主要包括單細胞制備、文庫構建、高通量測序和數據處理分析[5]。
單細胞制備的質量極大影響測序分析結果,傳統分選方法有梯度稀釋法、顯微操作法、熒光激活細胞分選、激光顯微切割等,不僅效率低,而且容易損傷細胞。目前更多使用高通量的細胞捕獲方法,如微流控芯片捕獲等[6]。……