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白蕊:攢下勇氣,翻過科學(xué)更高的山

2024-02-01 16:10:11施晶晶
南風(fēng)窗 2024年1期
關(guān)鍵詞:科學(xué)結(jié)構(gòu)

施晶晶

在文字回復(fù)里,白蕊發(fā)來了三次“嘿嘿~”,顯得親切快活;到了鏡頭前,她就有些局促,不知道手往哪里放才好;但講起自己的研究,在流利的表達(dá)里,她又恢復(fù)了自信和從容。

許多時(shí)候,你都能在白蕊身上感受到青年給科學(xué)增添的朝氣和純真。

最讓人艷羨的是,31歲,她已經(jīng)在《科學(xué)》《細(xì)胞》上以第一作者的身份發(fā)表了10篇論文。在十年磨一劍的科學(xué)領(lǐng)域里,這是驚人的速度。

這些研究是突破性的,它揭開了RNA剪接體的工作機(jī)理,為探究生命科學(xué)之中心法則的奧秘開出了一條通道,把基因表達(dá)的研究推進(jìn)了一步,白蕊由此成為聯(lián)合國授予的“世界最具潛力女科學(xué)家”—她是如此年輕又成績斐然。

2023年12月,她把櫻桃小丸子發(fā)型燙成了更顯成熟的卷梨花,似乎更匹配她的新角色。現(xiàn)在,她不只是實(shí)驗(yàn)室里的師妹或師姐,還是逐漸獨(dú)當(dāng)一面的老師、西湖大學(xué)的副研究員。

在西湖大學(xué)的日子,她為擁有充分的自由而歡喜。沒有行政事務(wù)纏身,她可以自由地探索,自由地做實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證猜想—她前所未有地舒展著自己。

這不是故事的起點(diǎn)。羽翼豐滿、豁然開朗之前,白蕊也局促過、懷疑過、怯場過。初入清華,師從結(jié)構(gòu)生物學(xué)家、中國科學(xué)院院士施一公,她沒有“天之驕子”的感受,形容自己“是一個小白”,這并非謙虛之詞。

即將講述的,不是一個“年少成名”的故事,而是一個年輕人破繭而出、舒展自我,在科學(xué)道路上,探尋生命本質(zhì)的歷程。

科學(xué)探索,就像進(jìn)入一個未知的洞穴,那是一條少有人走的路,而科學(xué)家,是秉燭而入的探路者。

蹚入生物學(xué)的山洞,白蕊是被“誘惑”著、吸進(jìn)來的。

初高中的生物課,向她展示著生命的神奇。爸爸媽媽的基因?yàn)槭裁纯梢赃z傳到孩子身上?小小的胚胎干細(xì)胞怎么神通廣大,可以誘導(dǎo)分化成不同的細(xì)胞,在該長出手腳的時(shí)間和位置長出來,形成健全的個體?同樣是溫度變化,為什么樹葉只在秋天變黃落下,春天就不會?

為了更進(jìn)一步探究這些問題,她報(bào)考了武漢大學(xué),選了生物學(xué)。在這里,她發(fā)現(xiàn),高中之前的生物課,是有多么亂花漸欲迷人眼,“濃縮了生物里面最有意思的部分給大家學(xué)了”。本科再往前走,就展開了一個龐大的知識體系,術(shù)語也變得更生澀和復(fù)雜。

讓她頭疼的是,自己要像背單詞一樣,去記“界門綱目科屬種”,在“考得好不好,全憑背得好不好”的狀態(tài)里,她感到疲倦。葉子秋天變黃脫落的現(xiàn)象,詳盡地拆解成了一個長長的記憶段落,但成績排在專業(yè)第一的她還是覺得自己似懂非懂。

如果說做學(xué)問的第一重境界,是“望盡天涯路”,白蕊感受到的卻是,知識像碎片一樣,孤零零地散落一地,沒有打通。

她幫師兄做“質(zhì)粒小提”實(shí)驗(yàn),多的時(shí)候,一天要做四五十次。她機(jī)械式地重復(fù)“培養(yǎng)、純化、提取”的動作,卻不明白它具體做什么用。師兄給她做過解釋,她還是稀里糊涂,那沒有激發(fā)她的興趣,只是變成了一個任務(wù)。

陷入落差感時(shí),她想起了填報(bào)高考志愿時(shí)來自高中生物老師的提醒:大學(xué)所學(xué)的生物更微觀,和高中所學(xué)有很大區(qū)別,它可能不那么生動有趣,甚至很枯燥。而大學(xué)的任課老師開導(dǎo)她:如果你不了解它的全貌,會誤導(dǎo)你的判斷,得出并不準(zhǔn)確的結(jié)論。

消除意義焦慮需要一個契機(jī),白蕊通向科研的一躍,從一場講座開始。

大三那年,結(jié)構(gòu)生物學(xué)家施一公做客武大,那場題為《生命科學(xué)、藝術(shù)與結(jié)構(gòu)生物學(xué)》的演講,給了她看待生物學(xué)不一樣的視角。

在施一公的展示和描述里,生命不可或缺的蛋白質(zhì),它的晶體結(jié)構(gòu)很漂亮,有時(shí)華麗得就像孔雀羽毛。白蕊從沒這么想過。在此之前,這些只是教科書上平平無奇的棍棒模型。施一公又展示,利用X射線在晶體結(jié)構(gòu)上發(fā)生衍射(注:波遇到障礙物時(shí)偏離原來直線傳播的物理現(xiàn)象)的特性,就能像變魔方一樣重構(gòu)出新的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。10年后再次回想,白蕊依然覺得“很神奇”。

在施一公的講述里,她感受到的不僅僅是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的美妙和神奇,或者結(jié)構(gòu)對生命的重要意義,她還看到一種將知識融會貫通的狀態(tài),那正是當(dāng)時(shí)的她不具備的能力。

施一公的研究課題,和人類重大疾病相關(guān),疊加他極富激情和感染力的個人魅力,坐在地上聽講的白蕊隱隱約約找到了方向,“這才是我想要做的事情”。

2014年,在拒絕了多所高校和科研院所的offer,經(jīng)歷了清華夏令營落選、意外獲得推免資格之后,白蕊如愿進(jìn)入施一公的實(shí)驗(yàn)室,直接攻讀博士的同時(shí),開始接觸真正的科研。

至此,白蕊完成了科研方向的選擇,但那只是起點(diǎn),因?yàn)榭茖W(xué)探索圍著問題轉(zhuǎn)。

生命的奧秘寫在DNA里,決定了一個人的生物特質(zhì)。但就像電影底片需要放映才能呈現(xiàn)在我們眼前,DNA也像個存儲器,它需要層層傳遞和處理,才能把信息表達(dá)出來。

DNA會轉(zhuǎn)錄生成RNA,把信息提取出來,再接力傳遞給蛋白質(zhì)來翻譯和解碼,執(zhí)行生命活動。在多元到極致的生物學(xué)里,很少有什么定理或法則,但“遺傳信息的傳遞”是個例外,它太重要了,由此成為分子生物學(xué)的“中心法則”。

在“DNA—RNA—蛋白質(zhì)”構(gòu)建的關(guān)系里:從DNA傳遞到RNA,關(guān)鍵物質(zhì)是RNA聚合酶,從RNA到蛋白質(zhì),依賴于核糖體,科學(xué)家很早就解析了二者的結(jié)構(gòu),兩項(xiàng)研究也在2010年之前獲得了諾貝爾獎,但中心法則中的另一重要角色—RNA剪接體,因其復(fù)雜不穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)變化,科學(xué)家始終沒能解析出來。

RNA剪接體就像遺傳信息的剪輯師,負(fù)責(zé)把有用的非連續(xù)的DNA信息片段剪接在一起—這是一個自然的過程,但是個精細(xì)活兒。但凡它剪接出了一絲差錯,都可能誘發(fā)癌癥或罕見病,而要想治療這些疾病,就得從源頭找突破口,弄清楚“RNA剪接體”長什么樣子,怎么工作,剪接錯誤具體出現(xiàn)在哪個位置—這也是施一公實(shí)驗(yàn)室研究的一個課題。

2015年,進(jìn)實(shí)驗(yàn)室差不多1年,聽到自己能加入“RNA剪接體”課題組,白蕊很開心,下一秒又忐忑。要研究的問題這么難,國外又有3個課題組同時(shí)緊盯,前有險(xiǎn)峰,后有追兵,她覺得自己有點(diǎn)趕鴨子上架。

初生牛犢,怕虎是常態(tài)。組會上,施一公的一番話轉(zhuǎn)變了她暗自畏難的觀念。她轉(zhuǎn)述道:清華這么好的平臺、資源和環(huán)境,國家來培養(yǎng)你們,如果連挑戰(zhàn)難題的勇氣都沒有,那你們來清華要做什么課題呢?有這么好的機(jī)會就把它利用好,做一些重要的東西出來。

在施一公的話里,白蕊第一次強(qiáng)烈感受到一種她以往不曾感受到的使命感、敢于挑戰(zhàn)的勇氣。

白蕊說,自己在清華學(xué)到的、很重要的一件事,是勇敢:“不管它是什么山,要有勇氣去翻翻,翻不過也就翻不過,要是想辦法翻了過去,你就有更高的山,看見不一樣的景,那是不一樣的。”

科學(xué)的世界里有很多山頭,白蕊又想起施一公的另一句激勵:“我們要做就做世界級難題。”

“世界級難題”的標(biāo)簽下,白蕊覺得,有時(shí)人們顛倒了“重要性”和“難度”的順序:“其實(shí)第一個還是要看它多重要,再從里面看難度……有時(shí)一個課題特別難,但它其實(shí)沒有那么重要。”而科學(xué)家的勇氣,體現(xiàn)為:在重要問題上,為尋找突破性發(fā)現(xiàn)而努力。

你要研究什么問題?這是每一個科研人最現(xiàn)實(shí)的選擇,問題的重要性,也決定了一個科學(xué)家能走多遠(yuǎn)。找科學(xué)問題,就像找對象,在重要性和難度之間,往哪一邊傾斜,是做開拓者,還是錦上添花,是當(dāng)成任務(wù)還是真的心動,帶來不一樣的體驗(yàn)。

研究RNA剪接體的工作機(jī)理,既重要,也有難度。但2013年,冷凍電鏡技術(shù)的突破,為結(jié)構(gòu)生物學(xué)帶來了跨越式的變革。客觀上,技術(shù)進(jìn)展助推了RNA剪接體的研究,而在此之前,團(tuán)隊(duì)對這一課題的堅(jiān)持和積淀也不能忽視。他們才能比同樣虎視眈眈的另外3個實(shí)驗(yàn)室更早拿出成果,揭開剪接體催化RNA剪接的過程,并捕獲和解析RNA剪接體8個完全組裝狀態(tài)的高分辨率結(jié)構(gòu)。

《麻省理工科技評論》指出,在人體細(xì)胞中,95%的基因需要被剪接,至少35%的遺傳紊亂和眾多疾病與剪接異常相關(guān),而剪接體的組成成分包含300多個蛋白質(zhì),其完成一次RNA剪接至少包含8個完全組裝的工作狀態(tài)。對于剪接體結(jié)構(gòu)及RNA剪接分子機(jī)理的研究,是生物學(xué)最基礎(chǔ)的問題,也是治療相關(guān)疾病的重要一步。

科學(xué)突破的意義不是孤立和單一的,它可能同時(shí)解開多個謎題。

在此之前,結(jié)構(gòu)生物學(xué)家也想知道,剪接體的形態(tài)復(fù)雜多變,它究竟有沒有支撐這些變化的反應(yīng)中心?這個問題多年來沒有定論,科學(xué)家既不知道這個中心長什么樣,有的甚至認(rèn)為中心可能會變。這個時(shí)候,科學(xué)的高光時(shí)刻就是一錘定音。“我們解析出來的結(jié)構(gòu)直接證明,它只有一個反應(yīng)活性中心。”白蕊說,“結(jié)束爭論,我們的研究告訴大家,這才是真的。”

沉浸在“RNA剪接體”的日子,白蕊一次次感受到生命的神奇:“其實(shí)我們只是在嘗試從分子的層面去解釋它為什么這樣做,但是真正看明白的那一刻,我們還是很驚訝,它設(shè)計(jì)得太精密了,完全超乎想象。”

有了這種奇妙的體驗(yàn),白蕊不覺得做科研是苦差事,一頭扎進(jìn)“RNA剪接體”的世界,逐漸成為課題組成果產(chǎn)出的主力之一,她也是生命精妙設(shè)計(jì)的見證者、解密人。

她見證著,剪接體完成一次工作,要變換至少8個狀態(tài)—聽起來有點(diǎn)像變形金剛?但不同之處在于,剪接體每變換一次形態(tài),都會更換20個蛋白組分“零件”。起初白蕊也不理解,做這么大規(guī)模的蛋白變化,不是很耗費(fèi)能量,還可能增加出錯的概率嗎?如此大費(fèi)周章是必要的嗎?

直到做進(jìn)一步解析,白蕊才明白,這些變化恰恰是為了確保剪接體正常工作,換這20個蛋白就像是多重保險(xiǎn),必須全部到位,剪接體才能開始工作。

這8個組裝形態(tài)的剪接體,是剪接體已知兩條通路中最主要的一條,而另一條被稱為“次要剪接體”的三維結(jié)構(gòu),也很快成為白蕊的解析對象,它的含量更少,只有前一條通路的1%,分離的難度更大,相關(guān)研究更少。

歷時(shí)4個月,2020年8月底,她和師姐萬蕊雪解析成功。回憶出結(jié)果的時(shí)刻,白蕊依然興奮:“天吶,居然被我搞出來了。”他們又一次領(lǐng)先了。

這一張網(wǎng)撒下去,收獲頗豐,因?yàn)榇我艚芋w一點(diǎn)也不簡單。對比兩條通路,白蕊發(fā)現(xiàn),盡管它們的序列差異很大,形成的三維結(jié)構(gòu)卻很接近,它們以殊途同歸的方式,完成對遺傳片段的剪接。

但如此相似的結(jié)構(gòu),剪接體會更容易出錯嗎?白蕊目睹著生命設(shè)計(jì)出了許多糾錯和保障機(jī)制,來保證絕大多數(shù)時(shí)候它們不出錯,除了前面通過更換匹配新的零部件來上保險(xiǎn),在另一個課題里,白蕊注意到剪接體工作的剪接位點(diǎn)有3個,之前,大家不知道3個位點(diǎn)之間有什么關(guān)系。

“可是在我們解析出來的結(jié)構(gòu)里面,第一次看到這3個剪接位點(diǎn)有一個相互識別的過程,但凡其中一個突變、故障了,三個位點(diǎn)就對不上,就不能進(jìn)行剪接。這種嚴(yán)密的相互作用對于確保RNA剪接正常發(fā)生非常重要。”白蕊說,剪接體只是細(xì)胞中極小的部分,尚且設(shè)計(jì)出許多保障機(jī)制,這種相互識別的糾錯機(jī)制在生命科學(xué)里非常普遍,她驚嘆道:“這工程量多大啊。”

借助冷凍電鏡,在分子水平上研究生命,白蕊拿到的是更高精度的尺子、更強(qiáng)大的顯微鏡,得以去觀察不同物質(zhì)和構(gòu)造之間那種“非常直接的聯(lián)系”。

捧出10篇CNS論文的日子里,白蕊不再是聽施一公描述生命科學(xué)的結(jié)構(gòu)之美,她親身參與其中,去提純、分離、計(jì)算,成為第一個看結(jié)果的人,她也從那些“棍棒模型”里,近距離感受這份美妙。

“這種美,不是形容一個人長得好看那種表面的美,而是那種恰到好處的感覺,就算我絞盡腦汁,也想不到這樣的方式去設(shè)計(jì)(它的結(jié)構(gòu)和分子機(jī)制)……它有內(nèi)涵,值得你去好好琢磨這個事情,你不是一看到就知道該怎么分析它,你得充分了解它,通過實(shí)驗(yàn)佐證你的猜想。”她享受這個過程。

科學(xué)當(dāng)然不是為美而存在的,但科學(xué)相信:結(jié)構(gòu)決定性質(zhì),性質(zhì)決定功能,而對剪接體的基礎(chǔ)研究,其應(yīng)用價(jià)值與這份精妙美感相伴而生。

掌握了RNA剪接體的結(jié)構(gòu)和工作機(jī)理,未來人類可以更明確疾病的病因,而以剪接體為靶點(diǎn)進(jìn)行藥物研發(fā)、治療疾病,就是它和應(yīng)用轉(zhuǎn)化最直接的聯(lián)系。

即便有了這些突破,剪接體還有許多未知的領(lǐng)域。“我們現(xiàn)在看到的結(jié)構(gòu)都是我們想辦法從細(xì)胞里分離出來的,但是它在最原始的細(xì)胞里是什么樣子的,和上下游的關(guān)聯(lián)是什么,我們是不知道的。”白蕊說,那需要更多人一起來探索。

人生需要兩座山,一座用來佇立,一座用來眺望。31歲時(shí),白蕊已經(jīng)登上“RNA剪接體”的其中一座山峰,但現(xiàn)在,她的目光已經(jīng)望著另外的地方。生命科學(xué)仍有許多重大的問題懸而未決,她相信自己“未來肯定還是要挑戰(zhàn)更重要、更難、更有意思的科學(xué)問題”。而她盼著自己的下一座山峰和探究疾病有更直接的聯(lián)系,回應(yīng)她更早時(shí)候就埋下的、關(guān)于癌癥治療的理想種子。

如今,這個1992年出生的姑娘,擺脫了意義焦慮。她不會僅僅因?yàn)閷?shí)驗(yàn)失敗而沮喪,會“每次都很認(rèn)真地對待我的實(shí)驗(yàn)和結(jié)果”,專注地解決問題,不設(shè)限地探索。好的平臺、更新的實(shí)驗(yàn)設(shè)備、領(lǐng)先的團(tuán)隊(duì)、充分的自由和自信、足夠長的科研生命,對白蕊來說,這可能是她最好的狀態(tài)。

白蕊過去十余年走過的學(xué)術(shù)科研路,用王國維的“學(xué)問三境界”來描述不算貼切,倒是《桃花源記》更為暗合:“林盡水源,便得一山,山有小口,仿佛若有光。便舍船,從口入。初極狹,才通人。復(fù)行數(shù)十步,豁然開朗。”

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