葉紅 王玉昆
(廣東省粵北食藥資源利用與保護(hù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 韶關(guān)學(xué)院生物與農(nóng)業(yè)學(xué)院,韶關(guān) 512005)
植物在長(zhǎng)期的生存過(guò)程中一直在與來(lái)自環(huán)境中的各種不利因素進(jìn)行斗爭(zhēng),病害就是這些不利因素中的重要一員。植物病害的危害不言而喻,其可在全球范圍內(nèi)造成極其嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)、社會(huì)和生態(tài)后果[1]。感染植物的病原體是多種多樣的,包括細(xì)菌、真菌、卵菌、線蟲(chóng)和食草動(dòng)物等[2]。但目前地球上的植物依然呈現(xiàn)出欣欣向榮的景象,這主要得益于植物擁有一套非常復(fù)雜的免疫系統(tǒng)。植物免疫系統(tǒng)在與病原體的長(zhǎng)期斗爭(zhēng)中得到協(xié)同進(jìn)化,最終達(dá)到并維持在一個(gè)相對(duì)穩(wěn)定的狀態(tài),保護(hù)植物抵御絕大多數(shù)的病害侵襲[3]。
2006 年,Jones 和Dangl[4]提出了植物免疫的“Zigzag”理論模型。該模型建立由微生物/病原體相關(guān)分子模式(microbe/pathogen?associated molecular patterns, M/PAMP)觸發(fā)免疫反應(yīng)(PAMP?triggered immunity, PTI),效應(yīng)子觸發(fā)敏感性(effector?triggered susceptibility, ETS)和效應(yīng)子觸發(fā)免疫(effector?triggered immunity, ETI)組成的四步免疫應(yīng)答機(jī)制。該模型涵蓋了植物不同的免疫系統(tǒng)并闡明了PTI 和ETI 如何在功能和進(jìn)化上與效應(yīng)子產(chǎn)生作用。
存在于細(xì)胞表面和細(xì)胞內(nèi)的各類免疫受體是植物感知病原體侵染時(shí)釋放的各種信號(hào)的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。模式識(shí)別受體(pattern recognition receptors, PRRs)定位于細(xì)胞表面,屬于植物第一層免疫防御體系。核苷酸結(jié)合域和富亮氨酸重復(fù)序列受體(nucleotide?binding domain and leucine?rich repeat containing receptors, NLRs)存在于細(xì)胞內(nèi),屬于植物第二層免疫防御體系。PRRs 可感知MAMP、PAMP 和宿主產(chǎn)生的損傷相關(guān)分子模式(damage?associated molecular patterns, DAMP)。當(dāng)感知到處于質(zhì)外體(apoplasm)的分子模式時(shí),PRRs 則激活PTI。研究表明,PRR信號(hào)參與了細(xì)胞質(zhì)Ca2+和質(zhì)外體活性氧(reactive oxygen species, ROS)爆發(fā)、Ca2+依賴性蛋白激酶(Ca2+?dependent protein kinases, CDPKs)、絲裂原活化蛋白激酶(mitogen?activated protein kinase, MAPK)級(jí)聯(lián)反應(yīng)、防御激素網(wǎng)絡(luò)以及廣泛的轉(zhuǎn)錄、翻譯和代謝重編程等免疫反應(yīng)[2,5]。
病原體進(jìn)化出多種機(jī)制來(lái)抑制或者逃避PTI。通過(guò)分泌效應(yīng)蛋白(effectors),這些效應(yīng)蛋白可以直接或間接地操縱、攻擊PTI 信號(hào)途徑的關(guān)鍵組分,從而增強(qiáng)效應(yīng)蛋白激活的感病性(ETS)[5]。相應(yīng)地,植物進(jìn)化出了NLRs 介導(dǎo)的胞內(nèi)防御體系,通過(guò)感知侵入胞內(nèi)的效應(yīng)物,啟動(dòng)具有特異性的免疫反應(yīng)ETI,從而將效應(yīng)蛋白引起的病害扼殺[6]。依據(jù)上述的“Zigzag”理論模型,PRRs 與NLRs 具有明顯的聯(lián)系,二者介導(dǎo)的免疫反應(yīng)信號(hào)通路有相互重疊的部分但又具有一定的區(qū)別[2]。關(guān)于NLRs 介導(dǎo)的免疫反應(yīng)機(jī)制已有較好的總結(jié)[7-8],此處不再贅述。本文以PRRs 介導(dǎo)的免疫反應(yīng)為重點(diǎn),結(jié)合近年來(lái)人們?cè)赑RR 功能研究方面取得的研究成果,對(duì)PRR及其參與調(diào)控植物對(duì)生物和非生物免疫應(yīng)答機(jī)制進(jìn)行綜述。
PRRs 是植物先天性免疫防線的受體。由先天性免疫產(chǎn)生的基礎(chǔ)抗性是植物抵御大多數(shù)病原體侵襲的根本原因。絕大多數(shù)PRRs 定位于植物細(xì)胞膜上,是一類由宿主編碼的蛋白質(zhì)[9]。目前普遍認(rèn)為PRRs主要分為類受體蛋白(receptor?like proteins, RLPs)和類受體蛋白激酶(receptor?like protein kinases,RLKs)兩大類[10-11](圖1)。多數(shù)植物的PRRs 屬于RLKs。RLK 蛋白含有一個(gè)胞外結(jié)構(gòu)域,作為MAMP或DAMP 的結(jié)合位點(diǎn),其次含有一個(gè)單跨膜結(jié)構(gòu)域和一個(gè)細(xì)胞質(zhì)蛋白激酶結(jié)構(gòu)域,能在細(xì)胞內(nèi)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中起作用[12]。許多RLKs 能夠響應(yīng)生物脅迫,也有些被證明對(duì)植物發(fā)育是不可缺少的[2]。RLP 蛋白結(jié)構(gòu)與RLK 相似但有一定區(qū)別。RLP 蛋白缺少細(xì)胞質(zhì)激酶結(jié)構(gòu)域,取而代之的是一個(gè)很短的細(xì)胞質(zhì)結(jié)構(gòu)域,且不具備信號(hào)傳導(dǎo)能力,故RLP 蛋白通常需要與RLK 或其他膜蛋白(共受體,coreceptors)相互作用才能在膜上傳遞信號(hào)[13]。

圖1 植物中主要PRR 受體及共受體結(jié)構(gòu)Fig. 1 Structures of main pattern recognition receptors and coreceptors in plants
RLKs 和RLPs 通過(guò)胞外結(jié)構(gòu)域與配體結(jié)合并將信號(hào)傳遞到細(xì)胞內(nèi)。PRRs 攜帶多種類型的胞外結(jié)構(gòu)域,如富含亮氨酸重復(fù)序列(leucine?rich repeats,LRRs)、凝集素(lectins)和lysin?motifs(LysMs)[14]。通過(guò)對(duì)350 種植物的PRRs 數(shù)量進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn),PRRs 的分布具有一定的物種特異性,其數(shù)量在不同物種中有明顯差異,其中包含LRR 結(jié)構(gòu)域的LRR?RLKs 和LRR?RLPs 是植物中最大的RLK 和RLP 基因家族。LRR?RLKs 可進(jìn)一步分為20 個(gè)亞組,每個(gè)亞組參與不同的生物學(xué)過(guò)程[15]。LRR?RLPs 基因家族成員數(shù)量在不同植物中也存在明顯差異。
作為細(xì)胞表面受體,PRRs 能夠識(shí)別來(lái)源于真菌、細(xì)菌、卵菌、寄生植物和食草動(dòng)物的分子模式,也有一些PRRs 可以識(shí)別自身的一些分子,如DAMPs和植物內(nèi)源性肽[3]。多數(shù)PRRs 與其共受體結(jié)合激活下游免疫反應(yīng),也有一些PRRs 不直接參與識(shí)別,而是作為共受體和免疫信號(hào)的負(fù)調(diào)節(jié)子發(fā)揮作用[2]。得益于結(jié)構(gòu)生物學(xué)技術(shù),植物中一些受體和MAMPs的結(jié)構(gòu)得到精確解析,相關(guān)的結(jié)果推動(dòng)了植物免疫受體與配體結(jié)合機(jī)制的研究。
目前,真菌源MAMPs 主要有幾丁質(zhì)(chitin)、乙烯誘導(dǎo)木聚糖酶(ethylene?inducing xylanase, EIX)、內(nèi)多聚半乳糖醛酸酶(endopolygalacturonases, PGs)等[3]。幾丁質(zhì)是真菌細(xì)胞壁主要組成成分,為真菌所特有,其由N?乙酰基葡萄糖聚合而成。幾丁質(zhì)及其片段(幾丁質(zhì)低聚糖或N?乙酰殼寡糖)是典型的真菌MAMP,在單子葉植物和雙子葉植物中都會(huì)引發(fā)各種防御反應(yīng),這表明在廣泛的植物物種中存在感知這些低聚糖的保守機(jī)制[16]。多年來(lái),人們一直在努力鑒定不同植物的膜組分中幾丁質(zhì)低聚物的高親和力結(jié)合位點(diǎn)。第一個(gè)幾丁質(zhì)結(jié)合蛋白CEBiP(chitin elicitor?binding protein)從水稻(Oryza sativa)懸浮細(xì)胞中利用親和層析法得到[17]。研究最清晰的LysM?PRRs 是CERK1(chitin elicitor receptor kinase 1),最初在擬南芥(Arabidopsis thaliana)中被發(fā)現(xiàn)與幾丁質(zhì)誘導(dǎo)的免疫反應(yīng)有關(guān)。CERK1 被認(rèn)為是主要的幾丁質(zhì)受體,它由具有三串聯(lián)LsyM 的細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域、跨膜結(jié)構(gòu)域、近膜結(jié)構(gòu)域和細(xì)胞內(nèi)絲氨酸/蘇氨酸激酶結(jié)構(gòu)域組成,其突變體不發(fā)生幾丁質(zhì)誘發(fā)的PTI 反應(yīng)[18]。晶體結(jié)構(gòu)研究表明幾丁質(zhì)低聚物(1,4?b?glcnac 的聚合物)能與CERK1 二聚體的LysM結(jié)構(gòu)域結(jié)合。在幾丁質(zhì)低聚物中,四聚體和五聚體直接以高親和度結(jié)合LysM 結(jié)構(gòu)域,但卻很少或沒(méi)有激活免疫反應(yīng),而七聚體和八聚體雖表現(xiàn)出最高的免疫活性,但與CERK1 的親和力較低。高聚幾丁質(zhì)可以同時(shí)結(jié)合兩個(gè)或多個(gè)CERK1 分子,而CERK1分子的聚集誘導(dǎo)其胞質(zhì)激酶結(jié)構(gòu)域的轉(zhuǎn)磷酸化,進(jìn)而導(dǎo)致下游級(jí)聯(lián)信號(hào)激活[16,19]。
CERK1 與高聚幾丁質(zhì)的親和力較低,含有LysM 結(jié)構(gòu)域的受體LYK5(lysin motif receptor kinase 5)與高聚幾丁質(zhì)的親和力要高得多。幾丁質(zhì)與LYK5 的結(jié)合對(duì)于LYK5 和CERK1 的異二聚化是必不可少的,是啟動(dòng)幾丁質(zhì)觸發(fā)的免疫反應(yīng)所必需的,說(shuō)明LYK5 是擬南芥的主要幾丁質(zhì)受體[20-21]。LYK4是另一種參與幾丁質(zhì)信號(hào)傳導(dǎo)的LysM?RLK,它也與LYK5 和CERK1 相互作用,并且對(duì)幾丁質(zhì)低聚物具有一定的結(jié)合親和力[21-22]。LYK5 和AtLYK4 的胞內(nèi)激酶結(jié)構(gòu)域均無(wú)活性,因此,二者需要與CERK1結(jié)合并利用CERK1 的胞內(nèi)激酶活性來(lái)進(jìn)行幾丁質(zhì)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)。這些結(jié)果說(shuō)明,CERK1 是幾丁質(zhì)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的共受體,而不是直接受體[16]。葡萄糖的乙酰化修飾影響幾丁質(zhì)激發(fā)子的活性。殼聚糖是完全去乙酰化的幾丁質(zhì),在植物中引起相當(dāng)弱的防御反應(yīng),而活性乙酰化殼聚糖低聚物需要聚合4-6 個(gè)N ?乙酰氨基葡萄糖[23-24]。許多真菌病原體在進(jìn)入宿主時(shí),通過(guò)幾丁質(zhì)去乙酰化來(lái)逃避宿主免疫系統(tǒng)的感知。去乙酰化的幾丁質(zhì)可能與CERK1 具有一定的結(jié)合親和力,因?yàn)槿ヒ阴;瘞锥≠|(zhì)處理能夠阻礙細(xì)胞中CERK1?LYK5 受體復(fù)合體對(duì)殼寡聚物的識(shí)別[25]。
水稻CERK1 能夠識(shí)別幾丁質(zhì),但不能結(jié)合幾丁質(zhì),而細(xì)胞膜糖蛋白CEBiP 能夠以高親和力結(jié)合幾丁質(zhì)[17,26]。CEBiP 是植物中第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)的幾丁質(zhì)受體,其結(jié)構(gòu)中含有3 個(gè)串聯(lián)LysM 結(jié)構(gòu)域和一個(gè)短的跨膜結(jié)構(gòu)域,但缺少發(fā)揮信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域[17,27]。大量研究表明,在識(shí)別和結(jié)合幾丁質(zhì)后,CEBiP 二聚體招募CERK1 形成免疫復(fù)合體,進(jìn)一步導(dǎo)致CERK1 同二聚化,隨后CERK1 被磷酸化并激活免疫反應(yīng)[27-28]。此外,另外兩個(gè)含有LysM 結(jié)構(gòu)域的RLPs,即LYP4(lysin motif?containing protein 4)和LYP6,能夠以中等親和力結(jié)合可溶性幾丁質(zhì)和不溶性蟹殼幾丁質(zhì),且二者為防御應(yīng)答所必需[29]。
除了幾丁質(zhì), 植物PRRs 還能識(shí)別其他真菌源MAMPs 從而觸發(fā)免疫反應(yīng)。在擬南芥中,RBPG1(RESPONSIVENESS TO BOTRYTIS POLYGALACTURONASES 1, 屬于LRR?RLP) 能夠識(shí)別多種活性和非活性PGs,并通過(guò)與SOBIR1(SUPPRESSOR OF BIR1)互作激活免疫反應(yīng)[30-31]。在番茄(Lycopersicon esculentum)中,Eix1 和Eix2屬于LRR?RLP,二者均能結(jié)合EIX,但只有Eix2 能介導(dǎo)免疫反應(yīng)。Eix1 是Eix2 的誘餌受體,其需要與BAK1(BRI1?ASSOCIATED RECEPTOR KINASE 1)互作激活免疫反應(yīng)[32-33]。
細(xì)菌源MAMPs 包括鞭毛蛋白肽(flagellin peptide)、ax21、轉(zhuǎn)錄延伸因子(elongation factor Tu,EF?Tu)、肽聚糖(peptidoglycans, PGNs)、結(jié)瘤因子(nod factors)和脂多糖(lipopolysaccharide, LPS)等[3]。細(xì)菌鞭毛蛋白肽有多種類型,例如丁香假單胞菌(Pseudomonas syringae)來(lái)源的N 端含22 個(gè)氨基酸殘基的flg22,大腸桿菌(Escherichia coli)來(lái)源的含有15 個(gè)氨基酸殘基的flg15 以及flgII?28[34-38]。擬南芥FLS2(FLAGELLIN?SENSITIVE 2)是植物中研究較為透徹的LRR?RLK 類PRR。蛋白結(jié)構(gòu)分析表明,F(xiàn)LS2 螺旋結(jié)構(gòu)內(nèi)表面的保守位點(diǎn)和非保守位點(diǎn)分別識(shí)別flg22 的C?末端和N?末端片段并進(jìn)行結(jié)合,而共受體BAK1 除了與FLS2 直接結(jié)合,還通過(guò)識(shí)別FLS2 結(jié)合的flg22 的C 末端與FLS2 形成復(fù)合體,進(jìn)而激活下游免疫反應(yīng)[39]。在番茄中,F(xiàn)LS2 僅識(shí)別flg15,而FLS3 卻識(shí)別flgII?28[37-38]。這些結(jié)果表明植物對(duì)同一類型MAMPs 進(jìn)化出多個(gè)PRRs,有效地增強(qiáng)對(duì)同一病原物的識(shí)別和防御。有些細(xì)菌為了逃避宿主免疫受體的識(shí)別從而將鞭毛蛋白肽進(jìn)行了糖基化修飾,并高度聚集形成復(fù)雜的結(jié)構(gòu)來(lái)避免鞭毛蛋白肽直接暴露。本氏煙草(Nicotiana benthamiana)能合成分泌型β-半乳糖苷酶BGAL1(β-galactosidase 1)并促進(jìn)糖基化鞭毛蛋白的水解和釋放,進(jìn)而激發(fā)免疫反應(yīng)[40-41]。
在鞭毛蛋白受體基因FLS2突變的植物中,flg22處理沒(méi)有引發(fā)免疫反應(yīng),但用細(xì)菌粗提取物處理后植物依然具有免疫能力,表明細(xì)菌提取物中含有不同于鞭毛蛋白的MAMP。隨后的研究證明EF?Tu(elf18/elf26 epitope)就是此類MAMP。EF?Tu 在所有細(xì)菌中都是高度保守的,且在大腸桿菌中其N 端被乙酰化修飾。擬南芥能特異性地識(shí)別EF?Tu 的N端前18 個(gè)乙酰化氨基酸殘基組成的短肽elf18,并完全激活免疫反應(yīng)[42]。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),LRR?RLK型蛋白ERF(EF?Tu receptor)是elf18 的受體[43]。同flg22 類似,elf18 也被包裹在EF?Tu 復(fù)雜的蛋白結(jié)構(gòu)中,但植物是如何使elf18 從復(fù)雜蛋白結(jié)構(gòu)中暴露出來(lái)進(jìn)行識(shí)別,有待進(jìn)一步研究[43]。
水稻受體激酶Xa21 是最早在植物中克隆的受體激酶之一,它能使水稻對(duì)引起白葉枯病的病原菌X. oryzaepvoryzae(Xoo)產(chǎn)生抗性。Xa21基因在很長(zhǎng)一段時(shí)間內(nèi)被認(rèn)為是1 個(gè)抗性基因,但現(xiàn)在被證明是一種LRR?RLK 型PRR,該受體的配體是由Xoo分泌的硫酸化肽ax21,能夠激活Xa21 介導(dǎo)的免疫反應(yīng)[44]。
肽聚糖(PGNs)是植物中具有免疫刺激活性的細(xì)菌細(xì)胞壁的主要成分,由交替的β-1,4 糖苷鍵連接的N?乙酰葡糖胺(GlcNAc)和N?乙酰胞壁酸(MurNAc)殘基組成。在擬南芥中,PGNs 起PAMP的作用,由LysM?RLP 型受體蛋白LYM1 和LYM3識(shí)別。LYM1 和LYM3 缺少胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域,需要和CERK1 組成協(xié)同體系介導(dǎo)下游免疫反應(yīng),但CERK1不能直接識(shí)別PGNs,而LYM1 和LYM3 也不能識(shí)別幾丁質(zhì)[45-48]。在水稻中,LYM3 的同源蛋白LYP4和LYP6 不僅可以識(shí)別PGNs,也可以識(shí)別幾丁質(zhì)[19]。這些結(jié)果說(shuō)明不同植物中PRRs 的功能有差異,且其擁有的免疫識(shí)別系統(tǒng)具有物種差異性。
此外,結(jié)瘤因子作為主要的根瘤信號(hào)分子,能夠促使豆類發(fā)育新的植物器官根瘤。在豆科植物百脈根(Lotus japonicus)中,擁有LysM 結(jié)構(gòu)域的受體蛋白NFR1(nod factor receptor 1)和NFR5 通過(guò)識(shí)別根瘤菌分泌的結(jié)瘤因子使豆科植物與根瘤菌互惠共生[49-52]。
脂多糖是革蘭氏陰性菌細(xì)胞壁的主要成分,由脂質(zhì)A、核心寡糖和O?抗原組成。雖然人們?cè)缇椭繪PS 可以激活植物的免疫反應(yīng),但目前還沒(méi)有發(fā)現(xiàn)LPS 的受體。研究人員通過(guò)篩選對(duì)LPS 反應(yīng)有缺陷的擬南芥突變體發(fā)現(xiàn),G 型凝集素RLK LORE(lipooligosaccharide?specific reduced elicitation)是LPS 引發(fā)免疫反應(yīng)的必須因子。然而,最近的一項(xiàng)研究表明,在植物免疫過(guò)程中LORE 識(shí)別的配體為中鏈3?羥基脂肪酸(medium?chain 3?hydroxy fatty acids, mc?3?OH?FAs),而不是LPS。游離3?OH?C10:0 對(duì)LORE 外結(jié)構(gòu)域具有結(jié)合親和力,表明它是LORE 的配體[53]。
盡管當(dāng)前對(duì)破壞性卵菌病原,如馬鈴薯晚疫病病菌(Phytophthora infestans),進(jìn)行了深入的研究,但人們對(duì)植物中識(shí)別卵菌源MAMPs 受體的認(rèn)識(shí)依然有限。卵菌源MAMPs主要包括卵菌細(xì)胞壁成分β-1,3?和β-1,6?葡聚糖,葡聚糖-殼聚糖和纖維素結(jié)合激發(fā)子凝集素等。此外,轉(zhuǎn)谷氨酰胺酶GP42、疫霉菌絲體中的二十碳多烯酸和疫霉木葡聚糖特異性內(nèi)切葡聚糖酶XEG1,也被認(rèn)為是卵菌源MAMPs[3,54]。壞死和乙烯誘導(dǎo)肽(necrosis and ethylene?inducing peptide 1, Nep1)樣蛋白(Nep1?like proteins, NLPs)廣泛存在于卵菌、真菌和細(xì)菌中。大多數(shù)NLPs 在雙子葉植物中作為細(xì)胞毒素誘導(dǎo)壞死和乙烯(ethylene,ET)產(chǎn)生,其序列中相對(duì)保守的20-24 個(gè)氨基酸位點(diǎn), 即nlp20 和nlp24, 為相應(yīng)的MAMPs[55-56]。nlp20 在十字花科植物中觸發(fā)非壞死的防御反應(yīng)。擬南芥中LRR?RLP 型受體 RLP23 為nlp20 受體,該受體與SOBIR1 和BAK1 形成受體復(fù)合體激活免疫反應(yīng)[57]。近期的相關(guān)研究報(bào)道了本氏煙草中LRR?RLP型受體RXEG1 的晶體結(jié)構(gòu)。該受體可識(shí)別來(lái)自大豆疫霉菌(Phytophthora sojae)的XEG1。蛋白結(jié)構(gòu)分析顯示,XEG1 的特異識(shí)別主要由位于RXEG1 氨基端和羧基端環(huán)出區(qū)介導(dǎo)。這兩個(gè)環(huán)結(jié)合到XEG1 的活性位點(diǎn)凹槽上,抑制其酶活性,從而抑制煙草中疫霉菌感染。此外,XEG1 的結(jié)合促進(jìn)了RXEG1 與LRR 型共受體BAK1 的結(jié)合,從而引發(fā)RXEG1 介導(dǎo)的免疫反應(yīng)[58]。
卵菌病原菌分泌的激發(fā)素可誘導(dǎo)煙草壞死和病原菌抗性。在野生馬鈴薯(wild potato)中,LRR?RLP85(ELR)能夠廣泛識(shí)別一系列卵菌源激發(fā)素,如P. infestans分泌的INF1,但ELR 與激發(fā)素的結(jié)合尚缺乏直接證據(jù)[59]。ELR 能夠與BAK1/SERK3 結(jié)合,從而在栽培馬鈴薯(cultivated potato)中激活對(duì)P. infestans的抗性。在本氏煙草中,BAK1/SERK3 和SOBIR1 都是激發(fā)素觸發(fā)細(xì)胞死亡所必需的,表明ELR?BAK1?SOBIR1 復(fù)合物在激發(fā)素感知和信號(hào)傳導(dǎo)中具有重要作用[60]。
DAMPs 是植物受到生物或非生物脅迫后產(chǎn)生損傷而產(chǎn)生的自身性分子模式。對(duì)DAMPs 的識(shí)別能夠增強(qiáng)MAMPs 觸發(fā)的免疫反應(yīng),從而更加高效地實(shí)現(xiàn)植物對(duì)病原菌的防御[3,61]。高遷移率族蛋白(high?mobility group box protein, HMGB)對(duì)植物和動(dòng)物均具有免疫原性。在擬南芥中,HMGB3 在組織細(xì)胞受感染損傷時(shí)釋放,引發(fā)類PTI 反應(yīng),但其相應(yīng)的受體仍然不明確[62-63]。細(xì)胞外ATP(eATP)也能觸發(fā)植物免疫反應(yīng)。在擬南芥中,L 型凝集素類受體激酶 DORN1/LecRK?I.9 識(shí)別在損傷或病原體攻擊時(shí)釋放的eATP 從而誘導(dǎo)類PTI 反應(yīng)[64-65]。寡聚半乳糖醛酸(oligogalacturonides, OGs)是植物細(xì)胞壁果膠片段,在植物受到真菌或昆蟲(chóng)啃食后經(jīng)植物多聚半乳糖醛酸水解而來(lái)。OGs 由與細(xì)胞壁緊密相連的受體WAK1(CELL WALL?ASSOCIATED KINASE 1)和WAKL(WAK?like)識(shí)別[66-69]。研究發(fā)現(xiàn)PEPRs 也參與了OG 的感知和下游信號(hào)的激活[70]。此外,角質(zhì)單體和纖維素衍生低聚物(如纖維二糖)也具有免疫原性,但其相應(yīng)的受體尚未確定[71]。
目前,幾種內(nèi)源性肽也被視為DAMPs,其在昆蟲(chóng)啃食或抵抗病原體過(guò)程中由前體加工產(chǎn)生或由損傷細(xì)胞釋放[71]。在番茄中,18 氨基酸肽系統(tǒng)素觸發(fā)茉莉酸依賴的免疫信號(hào),使植物產(chǎn)生食草動(dòng)物抗性[72]。富羥基脯氨酸系統(tǒng)素(hydroxyproline?rich systemins, HypSys)是一種含18 個(gè)氨基酸的糖基化肽,也在茄科植物中介導(dǎo)了食草動(dòng)物的防御[73]。在擬南芥中,RLK7(receptor?like kinase 7)以依賴于BAK1 的方式識(shí)別PIP1 和PIP2 從而激活免疫防御[74]。RALF(RAPID ALKALINIZATION FACTOR)肽也是一種DAMP,包括免疫刺激和免疫抑制類型,能在PTI 信號(hào)傳導(dǎo)中調(diào)節(jié)不同的配體-受體復(fù)合物。FER(FERONIA)受體能夠識(shí)別RALF 肽[75]。
植物激發(fā)子肽(plant elicitor peptide, Peps)是植物中研究較為詳細(xì)的DAMPs。擬南芥中含有8 種不同的Peps(Pep1-Pep8)。Pep1-Pep8 的激發(fā)活性位點(diǎn)位于其前體蛋白PROPEP 的C 端,能夠被LRR?RLK 型受體PEPR1/PEPR2 識(shí)別,但需招募共受體蛋白BAK1 激活免疫反應(yīng)[76-79]。此外,玉米中含有5 種Peps。Pep1 調(diào)控玉米抗病原菌防御反應(yīng),引起JA 和ET 的合成和防御標(biāo)記(如PR 蛋白和苯并惡嗪類植物抗菌素)的積累[80]。
通過(guò)PRRs 對(duì)不同模式的感知,植物才能啟動(dòng)PTI。PTI 反應(yīng)的輸出由一些細(xì)胞的和生理的信號(hào)直接反映(圖2)。這些信號(hào)包括質(zhì)膜離子通量的變化,胞質(zhì)Ca2+濃度增加、胞外ROS 水平的增加、絲裂原活化蛋白激酶(mitogen?activated protein kinase,MAPK)激活,以及后續(xù)的ET 和水楊酸(salicylic acid, SA)等植物激素產(chǎn)生、氣孔關(guān)閉、胼胝質(zhì)沉積、轉(zhuǎn)錄和代謝重編程等[71]。

圖2 植物PTI 調(diào)控機(jī)制概覽Fig. 2 An overview of pattern-triggered immunity(PTI)in plants
在識(shí)別MAMPs 后,胞內(nèi)Ca2+濃度短時(shí)間內(nèi)快速上升,為植物PTI 激活后的典型特征。對(duì)于不同MAMPs 的刺激,胞內(nèi)Ca2+濃度和持續(xù)時(shí)間均有所差異,從而調(diào)控不同的下游信號(hào)途徑[81-83]。細(xì)胞內(nèi)Ca2+濃度升高依賴于Ca2+?ATPases 和Ca2+轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的主動(dòng)運(yùn)輸以及Ca2+通道的被動(dòng)運(yùn)輸。Ca2+通道蛋白CNGC2(cyclic nucleotide gated channel 2)、CNGC4 和CNGC9 被證明分別參與了擬南芥和水稻中MAMPs 識(shí)別引起的胞質(zhì)Ca2+爆發(fā)。此外,CNGC19 通過(guò)依賴Pep 受體PEPR 的方式參與擬南芥的先天免疫反應(yīng)[84]。擬南芥中另一種Ca2+通道OSCA1.3 在免疫過(guò)程中控制氣孔關(guān)閉。在感知到MAMP 時(shí),OSCA1.3 被BIK1 快速磷酸化[85]。Ca2+轉(zhuǎn)運(yùn)也需要能量依賴性Ca2+泵,如內(nèi)質(zhì)網(wǎng)型Ca2+?ATPase(ECAs) 和自我抑制型Ca2+?ATPase(ACAs)。 在擬南芥中,ACA4、ACA8、ACA10、ACA11、ACA12 和ACA13 參與PTI 介導(dǎo)的胞內(nèi)Ca2+的轉(zhuǎn)運(yùn)[86-88]。
除Ca2+的通量變化,H+內(nèi)流和K+、Cl-外流也是植物PTI 的早期反應(yīng)之一。這些反應(yīng)產(chǎn)生迅速,使植物細(xì)胞外堿化和細(xì)胞膜去極化[3,89-90]。H+?ATPases(AHAs)在靜息細(xì)胞中介導(dǎo)H+從細(xì)胞質(zhì)流出從而建立細(xì)胞膜電位,但模式誘導(dǎo)的AHA 失活允許H+沿電化學(xué)梯度流入胞內(nèi),同時(shí)Cl-和K+外排,導(dǎo)致細(xì)胞外堿化[90-91]。在擬南芥中,當(dāng)PTI 發(fā)生時(shí),AHA 的活性受特定位點(diǎn)的磷酸化和去磷酸化調(diào)控[92-93]。FER 對(duì)AHA 的磷酸化導(dǎo)致其失活從而造成細(xì)胞外堿化[92]。相反,PTI 中的AHA 激活能夠阻止細(xì)胞外堿化并使氣孔關(guān)閉[94-95]。
ROS 作為信號(hào)分子,其爆發(fā)是植物PTI 相應(yīng)的重要標(biāo)志[3]。模式誘導(dǎo)的胞外ROS 的產(chǎn)生需要細(xì)胞膜定位的NADPH 氧化酶RBOHD(respiratory burst oxidase homolog)和過(guò)氧化物酶PRX33(peroxidase 33) 及PRX34[96-99]。PRX33 和PRX34 受細(xì)胞分裂素受體ARR2 的調(diào)控, 促進(jìn)SA 或MAMP 介導(dǎo)的ROS 爆發(fā)[100]。RBOHD 一方面受到Ca2+依賴蛋白(Ca2+?dependent protein kinases, CDPKs)CPK5、CPK6、CPK11 和CPK4 的磷酸化修飾而激活,另一方面,也能由BIK1(botrytis?induced kinase 1)的磷酸化修飾而激活,且兩種激活方式在RBOHD 上的作用位點(diǎn)不同。BIK1 不僅能夠促使胞質(zhì)Ca2+爆發(fā),也能促進(jìn)RBOHD 與G 蛋白三聚體XLG2?AGB1?AGG1/AGG2 互作,從而確保RBOHD 激活。G 蛋白三聚體XLG2?AGB1?AGG1/AGG2 能夠介導(dǎo)BIK1的穩(wěn)定和積累[101-105]。這些發(fā)現(xiàn)表明Ca2+、ROS 和BIK1 之間存在一個(gè)正反饋的信號(hào)放大機(jī)制,從而增強(qiáng)PTI[3]。值得注意的是,CPK28 通過(guò)磷酸化BIK1導(dǎo)致其蛋白降解,且有研究發(fā)現(xiàn)PBL13(AvrPphB SUSCEPTIBLE1?LIKE 13)通過(guò)與RBOHD 的互作來(lái)負(fù)調(diào)控ROS 的積累,表明在PTI 中ROS 的水平受到精細(xì)調(diào)控[106-107]。在水稻中,磷酸化的RacGEF1(Rac GDP/GTP exchange factor 1)激活并與Rac1 共同發(fā)揮作用,通過(guò)與RBOHB 的直接互作誘導(dǎo)ROS 的產(chǎn)生,從而介導(dǎo)真菌的抗性[108-111]。
MAPK 級(jí)聯(lián)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)是PTI 響應(yīng)的早期反應(yīng)之一。植物通過(guò)MAPK 信號(hào)途徑中一系列順序磷酸化,將受體或受體復(fù)合體的磷酸化信號(hào)傳遞至特定底物,從而調(diào)控特定抗性基因表達(dá),使植物獲得免疫抗性[3]。在擬南芥中,幾丁質(zhì)誘導(dǎo)CERK1 磷酸化PBL27,進(jìn)而PBL27 磷酸化MAPKKK5,由此表明,LYK5/LYK4?CERK1 幾丁質(zhì)受體復(fù)合物,與由MAPKKK5?MKK4/MKK5?MPK3/MPK6 組 成 的MAPK 級(jí)聯(lián)存在直接聯(lián)系[112-113]。目前研究認(rèn)為,擬南芥中主要存在MEKK3/MEKK5?MKK4/MKK5?MPK3/MPK6 和MEKK1?MKK1/MKK2?MPK4 兩條信號(hào)途徑[3]。MPK3/MPK6 磷酸化的1? 氨基環(huán)丙烷?1?羧酸合成酶2(ACS2)和ACS6 促進(jìn)了植物對(duì)flg22 應(yīng)答時(shí)ET 的合成[114]。MPK3/MPK6 在PTI中也能磷酸化一些諸如BES1(BRASSINOSTEROID INSENSITIVE1?ETHYL METHANESULFONATE?SUPPRESSOR 1)、ERF104(ethylene response factor 104)、WRKY33、VIP1(VirE2?INTERACTING PROTEIN1)轉(zhuǎn)錄因子和VQ 蛋白(VQ?motif?containing proteins, VQPs)[115-120]。 細(xì)胞周期蛋白依賴性激 酶Cs(cyclin?dependent kinase Cs, CDKCs) 的MPK3/MPK6 磷酸化,以及隨后CDKC 對(duì)RNA 聚合酶IIc 末端結(jié)構(gòu)域的磷酸化,直接介導(dǎo)了防御相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄激活[121]。MPK3/MPK6 和MPK4 通過(guò)磷酸化mRNA 結(jié)合蛋白TZF9 和PAT1 來(lái)調(diào)控細(xì)胞質(zhì)加工體中mRNA 的質(zhì)量[122-123]。MPK3 對(duì)PTI 負(fù)調(diào)控因子PUB22(plant U?box(PUB)type E3 ligase 22)的磷酸化抑制了PUB22 自泛素化和降解[124]。flg22 誘導(dǎo)的MPK4 磷酸化轉(zhuǎn)錄抑制因子ASR 導(dǎo)致防御相關(guān)基因的抑制[125]。MAPKKK5 功能喪失導(dǎo)致MPK3/MPK6 在CERK1?PBL27 磷酸化傳遞(phospho?relay)中的激活,增強(qiáng)了flg22 誘導(dǎo)的MPK3/MPK6激活[113]。MAPKKK7 能夠與FLS2 結(jié)合,并通過(guò)未知途徑減弱flg22 誘導(dǎo)的防御[126]。此外,銅綠假單胞菌和綠膿桿菌分泌蛋白酶PrpL 和ArgC,分別誘導(dǎo)MAPK 以不同的模式激活[127]。進(jìn)一步的研究表 明,RLCK185?MAPKKK18/24?MKK4?MPK3/6 和RacGEF1?Rac1 是水稻中的兩條介導(dǎo)CERK1 依賴的幾丁質(zhì)信號(hào)[70,126-127]。
不同的非生物脅迫通常引起植物細(xì)胞膜和不同亞細(xì)胞膜結(jié)構(gòu)的流動(dòng)性、完整性和功能的改變,從而產(chǎn)生DAMPs。盡管精確的感知機(jī)制仍然不明確,但脅迫信號(hào)通常能夠引起與PTI 類似反應(yīng),從而使植物減輕非生物脅迫的破壞性影響[2]。
鹽脅迫是植物生長(zhǎng)發(fā)育面臨的重大挑戰(zhàn)之一。在高鹽度條件下,植物細(xì)胞壁往往發(fā)生軟化和重塑,其完整結(jié)構(gòu)遭到破壞[2]。RLKs 能夠感受細(xì)胞壁的完整性,并在細(xì)胞壁遭到破壞時(shí)引發(fā)類PTI 防御[128]。類受體激酶THE1(THESEUS1)能夠和MIK2/LRR?KISS 及FEI2 互作對(duì)擬南芥根的生長(zhǎng)和耐鹽性進(jìn)行調(diào)控[129-130]。FER 能夠抑制ABA 信號(hào)和鹽脅迫下對(duì)離子毒性的耐受性[131]。此外,F(xiàn)ER 在鹽脅迫誘導(dǎo)的細(xì)胞壁軟化恢復(fù)中也發(fā)揮重要作用[2]。
鹽脅迫誘導(dǎo)的損傷傳感和信號(hào)傳導(dǎo)涉及Pep?PEPR 通路。Peps 是前體蛋白PROPEP 的一部分,被認(rèn)為是一種損傷信號(hào),能夠結(jié)合并激活胞外Pep受體蛋白PEPRs,從而激活類PTI。PROPEP 在受到生物和非生物脅迫后釋放到細(xì)胞外,從而被PEPR1/PEPR2 識(shí)別并結(jié)合[2,132]。在擬南芥中,過(guò)表達(dá)鹽脅迫響應(yīng)基因PROPEP3及Pep3 處理都可以引發(fā)擬南芥對(duì)鹽脅迫的抗性,且二者都是通過(guò)受體蛋白PEPR1 發(fā)揮作用[133]。進(jìn)一步的研究表明,過(guò)表達(dá)PEPR1和PEPR2的植株對(duì)鹽脅迫的耐受性增強(qiáng),表明在沒(méi)有外源Pep 處理的情況下,內(nèi)源性PEPR途徑也能參與調(diào)控植物對(duì)鹽脅迫的耐受性[134]。
幾丁質(zhì)受體CERK1 的表達(dá)受到鹽脅迫誘導(dǎo)。cerk1突變體的耐鹽性降低,其比野生型更容易受到NaCl 的影響。在NaCl 處理后,cerk1突變體的胞質(zhì)Ca2+濃度增加,且CERK1 能夠與Ca2+通道蛋白ANN1(ANNEXIN 1)相互作用,共同介導(dǎo)NaCl 誘導(dǎo)的Ca2+依賴的胞內(nèi)信號(hào)。該結(jié)果表明,CERK1 可能參與鹽脅迫損傷感知和信號(hào)傳導(dǎo)[135]。
上述各個(gè)發(fā)現(xiàn)較早的PRR 受體的功能,經(jīng)過(guò)大量研究均取得了較大進(jìn)展(表1)。研究人員在新的PRR 受體鑒定方面一直進(jìn)行著不懈的努力。近年來(lái),植物中新的PRR 受體的鑒定研究也取得了一些進(jìn)展。

表1 植物模式識(shí)別受體Table 1 Plant pattern recognition receptors
植物PRRs 包括許多RLPs,但許多RLPs 的功能依然不明確。近期研究發(fā)現(xiàn)擬南芥RLP 蛋白R(shí)LP53 與PTI 有關(guān)。rlp53突變體對(duì)致病菌(包括真菌、卵菌和細(xì)菌)的易感性增強(qiáng)。RLP53 組成性地與SOBIR1 結(jié)合,并以病原體誘導(dǎo)的方式與共受體BAK1 相互作用。此外,糖基磷脂酰肌醇(GPI)錨定蛋白LLG1(LORELEI?LIKE GPI?ANCHORED PROTEIN1)與RLP53 相互作用,并介導(dǎo)RLP53 在質(zhì)膜中的積累[136]。
在番茄中,MRK1(multiple resistance?associated kinase 1)編碼一種新的LRR?RLK 型受體蛋白,其表達(dá)受溫度脅迫和病原體攻擊顯著誘導(dǎo)。敲除MRK1降低了植株對(duì)冷脅迫和熱脅迫的耐受性,并導(dǎo)致CBF1(C?repeat binding factor 1)和HsfA1a(heat shock transcription factor a?1a)的表達(dá)抑制[137]。
綜合上述研究結(jié)果不難發(fā)現(xiàn),研究者們?cè)贛AMPs/DAMPs 的細(xì)胞外受體識(shí)別和相應(yīng)的免疫信號(hào)調(diào)節(jié)過(guò)程,以及PRRs 具體功能方面均取得了實(shí)質(zhì)性進(jìn)展。同時(shí)可以明確的是,一系列具有不同特征和功能的PRRs 及共受體在特異性的免疫識(shí)別中不可或缺,而且在脅迫損傷引起的PTI 中也發(fā)揮極為重要的作用。相比各種病原菌引發(fā)的PTI 機(jī)制研究,對(duì)植物如何適應(yīng)有益或共生微生物,同時(shí)保持對(duì)致病微生物免疫力的機(jī)制仍然知之甚少。未來(lái),應(yīng)在植物識(shí)別有益和共生微生物并如何共存方面進(jìn)行大力研究。同時(shí),應(yīng)進(jìn)一步明確PTI 信號(hào)途徑的核心調(diào)控因子的作用,闡明不同PRRs 介導(dǎo)的PTI的共性環(huán)節(jié)和差異性環(huán)節(jié)。有些PRRs 在植物中以多成員的家族形式出現(xiàn),從數(shù)量上看,存在一定的冗余性。但目前僅對(duì)個(gè)別成員進(jìn)行了研究,其他成員的具體功能及是否存在功能上的冗余有待進(jìn)一步研究。目前,組學(xué)研究技術(shù)已經(jīng)取得了長(zhǎng)足的進(jìn)步,未來(lái)應(yīng)充分利用組學(xué)分析獲得植物更多的PRRs 受體信息并進(jìn)行鑒定,同時(shí)也要對(duì)免疫反應(yīng)發(fā)生時(shí)胞內(nèi)基因簇的變化進(jìn)行探究,進(jìn)一步豐富PTI 下游信號(hào)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。迄今,植物受體識(shí)別的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)研究不是十分透徹,其相應(yīng)的結(jié)合機(jī)制有待進(jìn)一步研究。未來(lái)可借助結(jié)構(gòu)生物學(xué)手段,進(jìn)一步解析受體及配體的結(jié)構(gòu),明確受體識(shí)別的生物學(xué)機(jī)制。此外,面對(duì)日益惡化的生存環(huán)境,由脅迫引起的植物免疫應(yīng)答機(jī)制也應(yīng)該進(jìn)行充分研究,這對(duì)深入理解植物適應(yīng)環(huán)境并與環(huán)境因子互作的機(jī)制有重要意義。因此,未來(lái)應(yīng)更加注重PRR 受體在抗病農(nóng)作物種植資源創(chuàng)制方面的實(shí)際應(yīng)用,借助基因工程手段進(jìn)行抗病、抗逆相關(guān)品種的創(chuàng)制和選育,這對(duì)于植物適應(yīng)環(huán)境和人類解決食物來(lái)源問(wèn)題具有重大意義。