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雙重?zé)晒釸T-ERA技術(shù)快速檢測貝類食品中諾如病毒

2023-10-21 03:10:38吳占文李紅娜楊艷歌
食品科學(xué) 2023年18期
關(guān)鍵詞:檢測

吳占文,王 帥,康 婕,李 濤,李紅娜,蔡 杰,張 昊,楊艷歌,*,袁 飛,*

(1.中國檢驗檢疫科學(xué)研究院,國家市場監(jiān)管重點實驗室(食品質(zhì)量與安全),北京 100176;2.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院,黑龍江 大慶 163000;3.陜西省產(chǎn)品質(zhì)量監(jiān)督檢驗研究院,陜西 西安 710048)

以食物和水作為傳播基質(zhì)的諾如病毒(norovirus,NoV)是世界范圍內(nèi)導(dǎo)致急性胃腸炎爆發(fā)及散發(fā)的主要病原體[1]。這是由于NoV具有極強的感染性,1 個NoV顆粒引發(fā)的感染率可達50%,通常只要10 個病毒顆粒就可以使人致病,超過了已報道的任何一種食源性病毒[2-5]。據(jù)世界衛(wèi)生組織(World Health Organization,WHO)報道,NoV每年可造成6.85億腹瀉病例,21.25萬 人死亡[6-9],其中99%發(fā)生于發(fā)展中國家[10-12]。由于WHO已開展大規(guī)模輪狀病毒疫苗接種,使NoV成為了當(dāng)前兒童急性胃腸炎的主要病因[13-14]。例如秘魯?shù)囊豁椦芯堪l(fā)現(xiàn),當(dāng)?shù)?6%的嬰兒成長至2 歲時,都會經(jīng)歷5 次以上的NoV感染[15],這無疑為當(dāng)?shù)厥称钒踩珯z測行業(yè)敲響了警鐘。近幾年我國兒童急性胃腸炎病例爆發(fā)的頻率不斷增加[16-17],NoV的防治也變得尤為重要。但遺憾的是,目前仍未研發(fā)出有效的NoV疫苗[18]。因此,如何快速檢測食物與飲用水中的NoV,并由此阻斷NoV的傳播,仍然是研究人員不斷探索的問題。

NoV傳播與食品污染密切相關(guān),尤其是海洋中的貝類生物,海產(chǎn)貝類因其底棲和濾食性特性,可在海洋環(huán)境中不斷對NoV進行富集[19-20]。有研究表明,以牡蠣為代表的貝類生物體內(nèi)存在著與NoV結(jié)合的特定受體[21],這使NoV一旦進入其體內(nèi),很難通過自身代謝與凈化作用排出體外,導(dǎo)致一些貝類生物體內(nèi)的病毒濃度比周圍環(huán)境高幾十甚至幾千倍[22-23]。而人們有時會直接生食貝類生物,這無疑大大增加了NoV感染的風(fēng)險[24-25]。因此,加強貝類生物中NoV快速檢測方法的研究,對于保障食品安全與民眾健康具有重要意義[26]。

逆轉(zhuǎn)錄-酶促重組等溫擴增技術(shù)(r e v e r s e transcription-enzymatic recombinase amplification,RTERA)是近些年新研發(fā)的一種等溫核酸擴增技術(shù)[27],RT-ERA可以在37~42 ℃恒溫條件下,將微量RNA的特異性區(qū)段在數(shù)分鐘內(nèi)擴增數(shù)十億倍,具有優(yōu)秀的應(yīng)用前景。與逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(reverse transcriptionpolymerase chain reaction,RT-PCR)相比,無論在檢測時間還是儀器限制方面都具有顯著的優(yōu)勢。而MS2噬菌體與NoV大小結(jié)構(gòu)相似,且兩者均為單鏈RNA病毒,可以作為過程控制模式病毒添加到貝類生物樣品中[28]?;诖?,本研究以MS2噬菌體作為過程控制病毒,建立NoV雙重?zé)晒釸T-ERA快速檢測方法,并實現(xiàn)了對MS2、GI和GII NoV RNA的便攜式、可視化、無熱循環(huán)的快速檢測,檢測時間僅需10 min,靈敏度可達102個拷貝,方案詳見圖1(使用Figdraw繪制)。

圖1 NoV檢測方案Fig.1 Scheme of NoV detection

1 材料與方法

1.1 材料與試劑

MS2噬菌體標(biāo)準(zhǔn)樣品由中國食品藥品檢定研究院惠贈,GI和GII諾如病毒糞便樣本由中國檢驗檢疫科學(xué)研究院衛(wèi)生檢驗與檢疫研究所提供,輪狀病毒與甲型肝炎病毒RNA樣品由中國海關(guān)科學(xué)技術(shù)研究中心惠贈。貝類市售樣品采集于北京、天津、遼寧大連水產(chǎn)市場。

RT-熒光型核酸擴增試劑盒(ERA法) 蘇州先達基因科技有限公司;HiScriptII One Step qRT-PCR Probe Kit、T7 High Yield RNA Transcription Kit、FastPure Cell/Tissue Total RNA Isolation Kit V2 諾唯贊生物科技有限公司;MS2過程控制試劑盒(RT-PCR探針法-50 ℃)美正生物科技有限公司;PureLink? RNA Mini Kit、UltraPureTM無DNase/RNase蒸餾水 美國Invitrogen公司;E.Z.N.A.?Viral RNA Kit 北京冬歌博業(yè)生物科技有限公司;Qiagen RNeasy Mini Kit 凱杰企業(yè)管理(上海)有限公司;蛋白酶K 德國默克公司;NdeI/XhoI限制性內(nèi)切酶NEB(北京)有限公司;GI和GII NoV靶基因合成 北京六合華大基因科技有限公司。

1.2 儀器與設(shè)備

ABI 7500實時熒光PCR儀 美國Applied Biosystems公司;Pico17離心機 美國Thermo Scientific 公司;迷你qPCR儀 上海翊輝生物科技有限公司;智能化超微量核酸檢測儀 日本島津公司;移液器、混勻儀 德國Eppendorf公司;生物安全柜 美國NuAire公司。

1.3 方法

1.3.1 RNA標(biāo)準(zhǔn)品的構(gòu)建與鑒定

分別選取GenBank數(shù)據(jù)庫中GI NoV——諾瓦克病毒(Norwalk virus)(GenBank: M87661.2)和GII NoV——Lordsdale病毒(GenBank: X86557.1)位于ORF1-ORF2連接區(qū)域處的基因序列,并在序列的5’端加入酶切位點NdeI,3’端加入酶切位點XhoI,委托北京六合華大基因科技有限公司進行人工合成,并將合成片段克隆到含有T7啟動子的pET28-a+載體中。挑選單克隆進行質(zhì)粒提取,采用測序的方法對陽性質(zhì)粒進行鑒定。將測序結(jié)果均符合預(yù)期的質(zhì)粒分別命名為pET-NoV GI與pET-NoV GII。

使用酶切的方法對質(zhì)粒進行線性化處理,酶切體系:陽性質(zhì)粒20 μL、XhoI 1 μL、10×NEBuffer 5 μL、焦碳酸二乙酯(diethyl pyrocarbonate,DEPC)處理過的無菌ddH2O 24 μL;酶切條件:37 ℃,15 min。產(chǎn)物采用1%膠進行瓊脂糖凝膠電泳鑒定,確定質(zhì)粒是否酶切成功。用T7 High Yield RNA Transcription Kit對2 種線性質(zhì)粒樣品進行體外轉(zhuǎn)錄,并對轉(zhuǎn)錄成功的RNA產(chǎn)物采用DNase處理。下一步使用FastPure Cell/Tissue Total RNA Isolation Kit V2對RNA產(chǎn)物純化,-80 ℃冰箱貯存。

重復(fù)測定5 次病毒參考樣品的核酸濃度,取平均值,根據(jù)單鏈核糖核酸拷貝濃度計算公式,計算標(biāo)準(zhǔn)品pET-NoV GI與pET-NoV GII核酸拷貝濃度[29]。

1.3.2 引物探針設(shè)計與篩選

以MS2噬菌體(GenBank: JF719743.1)Replicase區(qū)域基因序列為靶序列,通過NCBI在線工具進行序列分析和比對,根據(jù)ERA引物和探針的設(shè)計原理,在特異性區(qū)域設(shè)計MS2噬菌體特異性ERA引物和探針(表1),并進行擴增效率分析。并以GI和GII NoV、輪狀病毒、甲型肝炎病毒4 種病毒RNA作為陰性對照、ddH2O為空白對照進行RT-ERA擴增,分析其特異性,每個反應(yīng)設(shè)置2 個平行,并重復(fù)實驗3 次。篩選的引物探針組合詳見表2,其中GI與GII NoV引物探針為實驗室前期實驗篩選,所有引物和探針均在北京六合華大基因科技有限公司合成。

表1 MS2噬菌體RT-ERA引物及探針Table 1 Primers and probes used for RT-ERA of MS2 phage

表2 GI、GII NoV與MS2噬菌體RT-ERA引物及探針序列Table 2 Primer and probe sequences used for RT-ERA of GI, GII NoV and MS2 phage

1.3.3 雙重?zé)晒釸T-ERA檢測體系構(gòu)建

分別將GI、GII NoV與MS2噬菌體ERA引物和探針(濃度均為10 μmol/L)等體積混合,參照RT-熒光型核酸擴增試劑盒(ERA法)說明書制備每份樣本的預(yù)混液(GI NoV+MS2或GII NoV+MS2):溶解劑20 μL,正向引物(GI/GII NoV+MS2)各2.1 μL,反向引物(GI/GII NoV+MS2)各2.1 μL,熒光探針(GI/GII NoV+MS2)各0.6 μL,RNA模板(濃度為106拷貝/μL)5 μL,DEPC處理過的無菌ddH2O 13.4 μL。取48 μL上述預(yù)混液轉(zhuǎn)移至酶粉PCR管中溶解,振蕩混勻并短暫離心。在管蓋上加入2 μL的激活劑,小心蓋好管蓋,瞬時離心使激活劑進入預(yù)混液中,振蕩混勻并再次瞬時離心,放入迷你qPCR儀中反應(yīng)。

反應(yīng)程序為:42 ℃、1 s;42 ℃、20 s,40 個循環(huán)。在第2反應(yīng)階段收集FAM/HEX/ROX熒光信號,其中FAM熒光(藍色)通道檢測對象為GI NoV,HEX熒光(綠色)通道檢測對象為GII NoV,ROX熒光(橙色)通道檢測對象為MS2過程控制病毒,同時以無菌ddH2O為空白對照,每個反應(yīng)設(shè)置2 個平行,并重復(fù)實驗3 次。

1.3.4 雙重?zé)晒釸T-ERA擴增體系優(yōu)化

1.3.4.1 引物體系優(yōu)化

將上述體系中的正反向GI NoV+MS2或GII NoV+MS2混合引物(濃度均為10 μmol/L)體積分別調(diào)整至2.1、3.1、4.1、5.1 μL,其他組分不變,并相應(yīng)減少ddH2O含量,使反應(yīng)體系總體積保持不變,進行RT-ERA反應(yīng)。

1.3.4.2 探針體系優(yōu)化

采用1.3.4.1節(jié)確定的最佳引物體積,將該體系中的熒光探針(濃度均為10 μmol/L)體積分別調(diào)整至0.8、1.0、1.2、1.4、1.6、1.8 μL,其他保持組分不變,并相應(yīng)減少ddH2O含量,使反應(yīng)體系總體積保持不變,進行RTERA反應(yīng)。

1.3.5 雙重?zé)晒釸T-ERA擴增程序優(yōu)化

為滿足快速檢測需求,在1.3.4節(jié)確定的最佳反應(yīng)體系的基礎(chǔ)上對反應(yīng)程序進行優(yōu)化,即反應(yīng)程序第2階段控制在42 ℃條件下,擴增程序分別調(diào)整為:15 s、40 個循環(huán);10 s、40 個循環(huán);5 s、40 個循環(huán);5 s、35 個循環(huán),分別放入迷你qPCR儀中反應(yīng),在第2反應(yīng)階段收集FAM/HEX/ROX熒光信號,同時以無菌ddH2O為空白對照,根據(jù)熒光擴增曲線結(jié)果確定最短反應(yīng)時間,每個反應(yīng)設(shè)置2 個平行,并重復(fù)實驗3 次。

1.3.6 雙重?zé)晒釸T-ERA擴增靈敏度實驗

將GI NoV+MS2和GII NoV+MS2混合RNA分別進行10 倍梯度稀釋,使GI和GII NoV的濃度分別為106、105、104、103、102拷貝/μL,采用1.3.4節(jié)中建立的熒光型RT-ERA快速檢測程序?qū)Y選出的最佳引物探針體積進行靈敏度分析,同時以無菌ddH2O為空白對照,每個反應(yīng)設(shè)置2 個平行,并重復(fù)實驗3 次。

1.3.7 真實樣品中NoV RNA提取方法確定與提取效率分析

為提高貝類樣品NoV RNA的提取效果,研究比較FastPure Cell/Tissue Total RNA Isolation Kit V2、PureLinkTMRNA Mini Kit、E.Z.N.A.?Viral RNA Kit、Qiagen RNeasy Mini Kit 4 種提取試劑盒對病毒RNA的提取效率。按照GB 4789.42—2016《食品微生物學(xué)檢驗 諾如病毒檢驗》[30]的規(guī)定,可通過對MS2過程控制病毒RNA的提取效率表示NoV RNA的提取效率,將10 μL MS2過程控制病毒添加到2.0 g貝類樣品的消化腺中,計算4 種提取試劑盒對病毒RNA的提取效率。

首先采用MS2過程控制試劑盒制備MS2過程控制病毒RNA,并對所得RNA按照1∶3的比例使用標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)稀釋液進行梯度稀釋,共稀釋5 個濃度,進行實時熒光RT-qPCR擴增。以未稀釋和梯度稀釋的過程控制病毒的濃度為X軸(設(shè)過程控制病毒原液濃度為參照,記為1(即提取效率為100%)),以其Ct值為Y軸,繪制過程控制標(biāo)準(zhǔn)曲線。實際樣本檢測時MS2的Ct值在標(biāo)準(zhǔn)曲線上對應(yīng)的濃度為C,則MS2過程控制病毒提取效率如下:

4 種提取試劑盒提取的RNA均使用50 μL的DEPC處理過的無菌ddH2O進行洗脫,采用智能化超微量核酸檢測儀測定濃度,-80 ℃保存?zhèn)溆?。將不同試劑盒提取的樣品RNA作為擴增模板,參照MS2過程控制試劑盒說明書,進行實時熒光RT-qPCR擴增,分析提取效率選出最適合貝類樣品RNA提取的試劑盒。根據(jù)GB 4789.42—2016[30],NoV提取效率/%=經(jīng)病毒提取等步驟后的過程控制病毒RNA濃度×100,即Ct值對應(yīng)濃度×100%。

1.3.8 雙重?zé)晒釸T-ERA真實樣品檢測

真實樣本共計29 份,其中2 份含NoV的糞便樣本作為方法確證的陽性樣本,27 份市售貝類作為方法適用性驗證的市售樣品。貝類樣品參照GB 4789.42—2016[30]中NoV檢測方法進行前處理,并采用1.3.7節(jié)確定的最適RNA提取的試劑盒進行提取和提取效率分析。最后以GB 4789.42—2016為參比方法,采用本研究建立的雙重?zé)晒釸T-ERA方法與GB 4789.42—2016規(guī)定的熒光定量RT-qPCR方法[30]同時對29 份樣品進行GI、GII NoV檢測,并對2 種方法的符合性進行比較,確定本研究方法的適用性和可行性。

2 結(jié)果與分析

2.1 GI與GII NoV RNA參考樣品的制備

重組質(zhì)粒pET-NoV GI全長5 788 bp,質(zhì)粒構(gòu)建示意圖見圖2A。重組質(zhì)粒pET-NoV GII全長5 640 bp,質(zhì)粒構(gòu)建示意圖見圖2B。測序結(jié)果表明人工合成片段正確克隆到pET28-a+載體中,證實重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。使用XhoI酶對pET-NoV GI與pET-NoV GII進行線性化處理,電泳檢測條帶大小與預(yù)期一致(圖3)。體外轉(zhuǎn)錄后,測定RNA平均質(zhì)量濃度分別為5.73 μg/mL與5.5 μg/mL,經(jīng)計算,GI NoV參考樣品拷貝數(shù)為1.326×109拷貝/μL,GII NoV參考樣品拷貝數(shù)為1.289×109拷貝/μL。采用GB 4789.42—2016熒光定量RT-qPCR方法[30]對RNA標(biāo)準(zhǔn)品進行GI和GII靶標(biāo)成分的檢測,可以獲得良好的S型擴增曲線(圖4),證實成功獲取了GI與GII NoV RNA,可作為RNA參考樣品進行后續(xù)實驗。

圖2 重組質(zhì)粒pET-NoV GI(A)與pET-NoV GII(B)構(gòu)建示意圖Fig.2 Schematic diagram of pET-NoV GI (A) and pET-NoV GII (B) recombinant plasmids

圖3 pET-NoV GI(A)與pET-NoV GII(B)重組質(zhì)粒酶切電泳圖Fig.3 Electrophoresis of pET-NoV GI (A) and pET-NoV GII (B)recombinant plasmids

圖4 GI和GII靶標(biāo)基因RT-qPCR檢測結(jié)果Fig.4 RT-qPCR for GI and GII target genes

2.2 NoV雙重?zé)晒釸T-ERA檢測方法的建立

首先篩選了MS2噬菌體ERA檢測引物探針,篩選到一組MS2引物探針的擴增效果良好,特異性良好(圖5A)。然后將其與前期實驗室篩選的GI、GII NoV ERA引物探針分別組合,對GI、GII NoV RNA與MS2噬菌體RNA混合模板進行擴增,結(jié)果顯示,GI、GII NoV均可以與MS2噬菌體組合進行雙重RT-ERA熒光反應(yīng)(圖5B、C),但擴增效率稍低,因此需要對反應(yīng)體系進行優(yōu)化。

2.3 雙重?zé)晒釸T-ERA擴增體系引物探針優(yōu)化結(jié)果

為提高建立的雙重?zé)晒釸T-ERA法的擴增效率,本研究分別對體系中引物和探針的濃度進行了優(yōu)化。其中引物優(yōu)化結(jié)果分別如圖6A、B所示,可以看出隨著引物濃度的增加熒光強度均呈逐漸增強趨勢,當(dāng)引物量提高到4.1 μL時,熒光強度最高,GI、GII NoV的擴增曲線與MS2噬菌體以及陰性對照能明顯區(qū)分。

以4.1 μL作為最佳引物量進行探針濃度優(yōu)化,結(jié)果分別如圖6C、D所示,同樣地,擴增曲線熒光強度也隨著探針濃度的增加不斷增強,但當(dāng)探針量達到1.6 μL時,濃度的增加對曲線的擴增效果影響不大,說明已達到反應(yīng)體系的閾值。因此,綜合擴增效率與成本考慮,將1.8 μL作為最佳探針添加量。通過優(yōu)化,確定雙重?zé)晒釸T-ERA擴增體系中引物及探針的最佳用量分別為4.1 μL與1.8 μL。

2.4 雙重?zé)晒釸T-ERA反應(yīng)程序優(yōu)化結(jié)果

為實現(xiàn)快速檢測,本研究進一步對反應(yīng)程序進行優(yōu)化,結(jié)果如圖7所示,可以看出當(dāng)?shù)?步反應(yīng)程序為15 s、40 個循環(huán)時擴增效率最好(圖7A),此時檢測時間為17 min 10 s,相對于原始擴增程序的20 min 30 s,可以節(jié)省3 min 20 s。隨著擴增時間的縮短,擴增效率雖有逐漸下降趨勢(圖7),但仍具有良好的擴增曲線,可以滿足檢測需求。其中當(dāng)?shù)?步反應(yīng)程序為5 s、35 個循環(huán)時,檢測時間僅需9 min 6 s(圖7D),相對于原始擴增程序可以節(jié)省11 min 24 s。

圖7 雙重?zé)晒釸T-ERA反應(yīng)時間優(yōu)化結(jié)果Fig.7 Optimization of dual RT-ERA reaction time

2.5 雙重?zé)晒釸T-ERA檢測靈敏度分析

將10 倍梯度稀釋的GI NoV+MS2和GII NoV+MS2混合RNA進行雙重?zé)晒釸T-ERA檢測靈敏度分析。如圖8所示,建立的方法對GI與GII NoV檢出限均為102拷貝/μL,具有較高的靈敏度,可以滿足檢測需求。

圖8 雙重?zé)晒釸T-ERA靈敏度分析結(jié)果Fig.8 Sensitivity of dual RT-ERA

2.6 真實樣品檢測結(jié)果

如圖9A所示,MS2過程控制病毒RNA濃度與樣品Ct值線性關(guān)系良好(R2=0.983 3),符合GB 4789.42—2016[30]規(guī)定。圖9B為4 種試劑盒對真實樣品中MS2 RNA的擴增效果,根據(jù)提取效率公式,PureLinkTMRNA Mini Kit對貝類樣品中MS2過程控制病毒RNA的提取效率最高,約1.94%,因此后續(xù)均采用此試劑盒進行貝類樣品RNA提取。

圖9 不同試劑盒對貝類樣品RNA的提取效率Fig.9 Extraction efficiency of RNA in shellfish samples by different kits

應(yīng)用本研究建立的雙重?zé)晒釸T-ERA方法與參比方法GB 4789.42—2016中的熒光RT-qPCR方法對29 份真實樣品進行檢測,結(jié)果顯示(表3),2 份真實糞便樣本可以正確檢出,說明本研究建立的雙重?zé)晒釸T-ERA快檢方法對真實樣本檢測的準(zhǔn)確性。27 份貝類樣品有3 份檢出GII NoV,未檢出GI NoV,結(jié)果與GB 4789.42—2016一致,證實了本研究建立的方法在貝類樣品中檢測的適用性。

表3 真實樣品檢測結(jié)果Table 3 Results of detection of real samples by RT-PCR and dual TR-ERA

3 討 論

近年來,由NoV感染引起的急性胃腸炎爆發(fā)事件已屢見不鮮,這可能與全國范圍的NoV急性胃腸炎暴發(fā)監(jiān)測工作起步較晚,大多數(shù)地區(qū)不具備完整的檢測體系或缺乏相應(yīng)的檢測能力有關(guān)[31]。本研究建立的雙重?zé)晒釸TERA檢測方法,檢測速度快、操作簡單、易于推廣。且可以在一個反應(yīng)單元中同時檢測出2 種病毒,可降低檢測成本,同時也能節(jié)約檢測時間。此外還通過T7 RNA聚合酶體外轉(zhuǎn)錄的方式獲得了高純度的RNA,研制了pET-NoV GI與pET-NoV GII兩種RNA標(biāo)準(zhǔn)參考樣品,可以作為檢測體系中的陽性對照品,解決了因NoV無法體外培養(yǎng)導(dǎo)致的陽性樣品缺乏,檢測無法進行的瓶頸問題。從而為提升我國NoV早期篩查和風(fēng)險防控水平,預(yù)防NoV中毒事件,保障人民身體健康提供重要的技術(shù)支撐。

本研究采用的RT-ERA技術(shù)是通過模擬生物體遺傳物質(zhì)自身擴增復(fù)制的原理,利用抗體制藥領(lǐng)域先進的Molecular Design、Directed Evolution、Affinity Maturation等技術(shù)手段,將來源于細菌、病毒和噬菌體的特定工具酶進行改造突變并篩選其功能,以此建立的最優(yōu)反應(yīng)體系。與傳統(tǒng)的恒溫擴增技術(shù)LAMP相比,ERA技術(shù)無需設(shè)計多對引物,反應(yīng)溫度更低,且擴增產(chǎn)物可直接用于克隆測序,在靈敏度和特異性上也有了一定的提高。與目前的檢測“金標(biāo)準(zhǔn)”PCR技術(shù)相比,RT-ERA技術(shù)可擺脫大型儀器的束縛,且在特異性、靈敏度良好的基礎(chǔ)上表現(xiàn)出更短的檢測時長。另外,RT-ERA技術(shù)的優(yōu)勢不僅體現(xiàn)在其檢測時間與恒溫特性上,還在于其具備現(xiàn)場檢測的潛力,結(jié)果讀取方式多種多樣,如:1)與側(cè)向流動試紙條聯(lián)合,2)與顯色劑結(jié)合,3)使用熒光PCR儀,均可達到可視化檢測的目的。項目組前期與公司合作開發(fā)了迷你qPCR儀,機身質(zhì)量為1.38 kg,尺寸為247 mm×188 mm×133 mm可同時對4 種熒光通道進行信號采集,且升降溫速度快(8~10 ℃/s),無運動光學(xué)部件,移動運輸無需矯正,自帶人機交互和外接人機交互設(shè)計,并具有遠程可控組件,可自動出具檢測結(jié)果或遠程出具結(jié)果,具有遠程數(shù)據(jù)傳輸功能。本研究將研制的NoV RNA標(biāo)準(zhǔn)參考樣品,建立NoV雙重?zé)晒釸T-PCR技術(shù),與迷你qPCR儀結(jié)合,以期為NoV病毒現(xiàn)場可視化多重快速檢測和監(jiān)測提供了技術(shù)與裝備,對切斷NoV傳播,筑牢食品“防護墻”,控制NoV爆發(fā),保障人民健康具有重要意義。

4 結(jié) 論

本研究首先通過將NoV靶序列構(gòu)建到含T7啟動子的載體中,通過體外轉(zhuǎn)錄的方式獲得了高純度的RNA,研制了pET-NoV GI與pET-NoV GII RNA標(biāo)準(zhǔn)參考樣品。然后以MS2噬菌體作為過程控制病毒,建立了一種高效快速的GI與GII NoV雙重?zé)晒釸T-ERA檢測方法,最低可以檢測出102個拷貝數(shù)量級的NoV核酸樣品,檢測時間最短可以縮減至10 min左右。最后將建立的方法應(yīng)用于真實樣品中,通過國標(biāo)規(guī)定的熒光RT-qPCR比較,證實了本研究方法在真實樣品中檢測的準(zhǔn)確性和適用性。同時依托合作開發(fā)的迷你qPCR儀,為NoV監(jiān)測檢測和現(xiàn)場執(zhí)法提供強有力的科技支撐。

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