李張暉,尚禹行,呂巧怡,王薈,趙楊靜,邵啟祥,2(.江蘇大學(xué)醫(yī)學(xué)院,江蘇鎮(zhèn)江 2203;2.江蘇護理職業(yè)學(xué)院,江蘇淮安 223005)
近年來泌尿生殖系統(tǒng)腫瘤的發(fā)病率逐年攀升,已成為研究關(guān)注的熱點問題。信使RNA(mRNA)內(nèi)部修飾包括腺苷甲基化、胞嘧啶修飾和核糖修飾等,其中N-甲基腺苷(m6A)是真核mRNA中最常見的修飾[1]。m6A的修飾依賴于一系列酶,包括催化mRNA的m6A修飾的甲基轉(zhuǎn)移酶即寫入蛋白(Writers)、去除m6A修飾的去甲基化酶即擦除蛋白(Erasers)和識別m6A修飾位點m6A結(jié)合蛋白即閱讀蛋白(Readers)[2]。它們在腫瘤發(fā)生、發(fā)展中各自發(fā)揮重要作用(圖1)。

圖1 m6A修飾相關(guān)分子組成示意圖
非編碼RNA(non-coding RNA,ncRNA)存在眾多種類,且具有不同功能。目前研究最多的有微小RNA(microRNA,miRNA)、長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,LncRNA)、環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)和PIWI相互作用RNA(PIWI-interacting RNA,piRNA)等[3]。既往m6A修飾的研究多集中在mRNA領(lǐng)域,而ncRNAs和mRNA均為轉(zhuǎn)錄后產(chǎn)物,存在相似的修飾方式。近年來的研究表明,m6A修飾調(diào)控ncRNA參與了個體發(fā)育,且在多種腫瘤進展中發(fā)揮重要作用。本文重點闡述了m6A修飾調(diào)控ncRNA在泌尿生殖系統(tǒng)腫瘤中的診斷價值,并簡要概述應(yīng)用于m6A甲基化檢測的新技術(shù)及生物信息學(xué)統(tǒng)計方法。
1.1宮頸癌(cervical cancer,CCA) 通常CCA的早期篩查有巴氏涂片(pap smear)與人乳頭瘤病毒(human papilloma virus,HPV)檢查。雖然HPV的感染被認為是CCA的主要致病因素,但許多研究發(fā)現(xiàn)HPV感染本身并不足以導(dǎo)致癌癥,約60%的HPV感染在1年內(nèi)自發(fā)消退,約90%在2年內(nèi)消退[4]。截至目前,CCA的致病因素仍然不明確。
近年來,隨著測序技術(shù)發(fā)展和表觀遺傳研究的深入,有研究發(fā)現(xiàn)在CCA中m6A修飾的甲基轉(zhuǎn)移酶(METTL3)高表達增強了HK2mRNA的穩(wěn)定性,加速糖酵解或有氧糖酵解(Warburg效應(yīng)),從而促進CCA細胞的增殖。……