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廣州地區(qū)318例擬應(yīng)用伏立康唑治療的疑似侵襲性真菌感染患者CYP2C19*2/*3/*17等位基因檢測分析

2023-05-22 03:22:12楊建良蘇鐸華李祥周曉雯植嘉玲邢貞建鐘洪蘭
關(guān)鍵詞:檢測

楊建良 蘇鐸華 李祥 周曉雯 植嘉玲 邢貞建 鐘洪蘭

廣州市胸科醫(yī)院藥劑科,廣州 510095

在臨床診療實(shí)踐中,藥物基因組學(xué)的應(yīng)用已成為個(gè)體化用藥和精準(zhǔn)醫(yī)療模式的核心組成部分,相關(guān)基因信息通常被用來指導(dǎo)藥物和劑量選擇,從而提高疾病治療效果[1-2]。目前,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)許多基因與藥物在體內(nèi)的生物轉(zhuǎn)化密切相關(guān),如CYP2D6、CYP2C19、DPYD、UGT1A1、TPMT、G6PD、SLCO1B1、HLA-B、IFNL3、CYP2C9、VKORC1等[3]。抗真菌藥物伏立康唑具有抗真菌活性強(qiáng)、抗真菌譜廣等特點(diǎn),在臨床中得到廣泛應(yīng)用[4]。人們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)伏立康唑藥代動(dòng)力學(xué)個(gè)體間差異較大,且與細(xì)胞色素P450CYP2C19基因多態(tài)性有關(guān)[5-6]。林明瑞等[7]研究表明,伏立康唑在快代謝與中代謝患者中療效較佳、在慢代謝患者中療效較差,但鮮見廣州地區(qū)同類報(bào)道。考慮到基因多態(tài)性具有種族、地域性的差異以及群體藥代動(dòng)力學(xué)分析在臨床診療中的作用[8],我們對廣州地區(qū)318例擬應(yīng)用伏立康唑治療的疑似侵襲性真菌感染患者CYP2C19*2/*3/*17等位基因進(jìn)行檢測分析,現(xiàn)將結(jié)果報(bào)道如下。

資料與方法

1.一般資料

選取2022年1月至2023年2月在廣州市胸科醫(yī)院就診、擬應(yīng)用伏立康唑治療且進(jìn)行CYP2C19*2/*3/*17等位基因的318例疑似侵襲性真菌感染患者納入分析,其中男249例、女69例,年齡19~94歲,平均58歲。

2.儀器與試劑

相關(guān)基因檢測采用數(shù)字熒光分子雜交測序技術(shù)(digital fluorescence molecular hybridization,DFMH)進(jìn)行,微量熒光檢測儀Fluotec 48E以及測序反應(yīng)試劑盒北京華夏時(shí)代基因科技有限公司產(chǎn)品,亦購自該公司。

3.實(shí)驗(yàn)方法

(1)方法學(xué)原理。應(yīng)用特異性位置探針,將熒光素直接與探針核苷酸或磷酸戊糖骨架共價(jià)結(jié)合,基于熒光原位雜交(fluorescence in situ hybridization,F(xiàn)ISH)原理,探針與目的基因檢測位點(diǎn)完全互補(bǔ)時(shí)Tm值較高,不完全互補(bǔ)時(shí)Tm值較低,微量熒光檢測儀通過重復(fù)采集40~50次雜交信號的數(shù)值,通過設(shè)定閾值以區(qū)別本底或假陽性信號,從而精確完成數(shù)字化熒光分子雜交測序及單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNP)分型。(2)實(shí)驗(yàn)步驟。主要包括外周血單個(gè)核細(xì)胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)富集、增加細(xì)胞膜通透性處理、探針與目的基因片段[CYP2C19*2(9154G>A) 、CYP2C19*3(7948G>A) 、CYP2C19*17(806C>T)]雜交、儀器參數(shù)設(shè)置和檢測結(jié)果判讀等,具體操作嚴(yán)格按儀器和試劑說明書進(jìn)行。

4.數(shù)據(jù)處理

應(yīng)用XLS工作表進(jìn)行資料收集和整理,描述性分析伏立康唑快、中、慢代謝型患者的基因型、單倍型分布頻率。

結(jié) 果

1.CYP2C19*2(9154G>A)、CYP2C19*3(7948G>A)、CYP2C19*17(806C>T)位點(diǎn)的多態(tài)性(表1)

表1 318例擬應(yīng)用伏立康唑治療的疑似侵襲性真菌感染患者CYP2C19 3個(gè)基因位點(diǎn)的多態(tài)性(例)

檢測到GG、AA、CC 3種純合子和AG、CT 2種雜合子:在CYP2C19*2(9154G>A)位點(diǎn)上檢測到GG、AG、AA 3種基因 型 ,分 布 頻 率 分 別 為 47.80%、42.45%、9.75%;在CYP2C19*3(7948G>A)位點(diǎn)上檢測到GG、GA、AA 3種基因型,分布頻率分別為90.88%、8.81%、0.31%;在CYP2C19*17(806C>T)位點(diǎn)上檢測到CC、CT 2種基因型,分布頻率分別為99.37%、0.63%。

2.CYP2C19 3個(gè)基因位點(diǎn)單倍型情況(表2)

表2 318例擬應(yīng)用伏立康唑治療的疑似侵襲性真菌感染患者CYP2C19 3個(gè)基因位點(diǎn)單倍型情況

依據(jù)CYP2C19基因3個(gè)位點(diǎn)的基因型檢測結(jié)果,評估為伏立康唑快、中、慢代謝型的患者分別有135例(42.45%)、140例(44.03%)和43例(13.52%),3個(gè)基因位點(diǎn)單倍型情況為:GG-GG-GC、GG-GG-CT 2種快代謝單倍型,分布頻率分別為99.26%和0.74%;AG-GG-CC、GG-GA-CC、AG-GG-CT 3種中間代謝單倍型,分布頻率分別為 87.86%、11.43% 和 0.71%;AA-GG-CC、AG-GA-CC、AA-GA-CC、GG-AA-CC 4種中間代謝單倍型,分布頻率分別為69.77%、25.58%、2.33%和2.33%。

討 論

細(xì)胞色素P450由一群基因超家族編碼,迄今,人們已發(fā)現(xiàn)有功能意義的同工酶約50種,其中CYP2C、CYP2D、CYP2ETCYP3A亞家族參與了約90%的臨床藥物代謝,按其表型多態(tài)性可以將人群分為超快代謝者、快代謝者、中間代謝者和慢代謝者[9],在我們的分析病例中僅發(fā)現(xiàn)超快代謝類型1例(納入快代謝型計(jì)算),近90%為快代謝者與中間代謝者。目前,人們一般認(rèn)為細(xì)胞色素P450表型多態(tài)性主要源自其編碼基因的遺傳多態(tài)性,其中CYP2C19為S-美芬妥因羥化酶,存在多種等位基因如CYP2C19*2、CYP2C19*3、CYP2C19*17等位基因[9-11]。在這些等位基因中,人們也發(fā)現(xiàn)了多種基因突變,如降低酶活性的CYP2C19*2第五外顯子681G>A突變、使酶功能喪失的CYP2C19*3第四外顯子636G>A突變、增加酶活性的CYP2C19*17突變[9],我們則檢測到了CYP2C19*2的9154G>A突變、CYP2C19*3的7948G>A突變和CYP2C19*17的806C>T突變,檢測到GG、AA、CC 3種純合子和AG、CT 2種雜合子。現(xiàn)有研究提示:CYP2C19能代謝普萘洛爾、丙米嗪、奧美拉唑、泮托拉唑、甲苯磺丁脲、華法林等20多種常用藥物,這些藥物的代謝及其療效與CYP2C19基因多態(tài)性密切相關(guān)[9],如CYP2C19*2和*3基因攜帶者比CYP2C19*1基因攜帶者通過對氯吡格雷的藥代動(dòng)力學(xué)特性使腦卒中更易發(fā)生復(fù)發(fā)[12]、CYP2C19和CYP2D6不良和中間代謝狀態(tài)與抗抑郁藥和抗精神病藥的治療效果相關(guān)聯(lián)[13]、CYP2C19基因多態(tài)性對伏立康唑治療侵襲性真菌感染的重要影響[14]等。正因如此,國內(nèi)已有專業(yè)技術(shù)公司將CYP2C19基因納入伏立康唑、氯吡格雷、質(zhì)子泵抑制劑(PPI)代謝相關(guān)基因,并開發(fā)出相應(yīng)的檢測產(chǎn)品,我們的研究即基于此類技術(shù),如何利用好這些技術(shù)而提高對臨床診療的服務(wù)水平,將是我們長期的任務(wù)。

與此同時(shí),我們除了注意基因多態(tài)性的效應(yīng)SNP之外,還必須注意效應(yīng)單倍型,即位于染色體某一區(qū)域的一組相關(guān)聯(lián)的SNPs等位位點(diǎn)的組合[15]。Ahmed等[16]的報(bào)道提示對氯吡格雷的抗血小板反應(yīng)與CYP2C19基因單倍型有關(guān),伏立康唑治療侵襲性真菌感染患者的效果也與CYP2C19基因單倍型有關(guān)[14],這些研究結(jié)果表明,CYP2C19基因多態(tài)性可能通過其單倍型發(fā)生作用。本文的研究檢測到廣州地區(qū)人群CYP2C19基因3個(gè)基因位點(diǎn)相關(guān)聯(lián)的9個(gè)單倍型(表2),它們在藥物代謝中的作用如何,我們將會(huì)高度關(guān)注;同時(shí)也相信,隨著CYP2C19基因分型方法的不斷進(jìn)步[17-18],我們的研究質(zhì)量將會(huì)大大提高。

毋庸諱言,從人類遺傳學(xué)、藥物基因組學(xué)的嚴(yán)格意義上看,在分析中我們沒有考慮受檢者的民族(盡管可以肯定絕大多數(shù)為漢族),也沒有考量其上輩的生活地域與民族因素(可能大多數(shù)變化不大),本文的研究自然顯得粗糙與稚嫩,如何改進(jìn)與提高當(dāng)為我們的努力方向。總之,藥物基因組學(xué),無論是從目的基因的選擇,還是到技術(shù)方法的改進(jìn),抑或是檢測結(jié)果的解讀及其臨床應(yīng)用,在個(gè)體化用藥和藥學(xué)實(shí)踐中均為令人振奮且具有挑戰(zhàn)性的工作,值得人們廣泛參與其中,這也是我們在此分析研究中所獲得的深切感悟。

利益沖突所有作者均聲明不存在利益沖突

作者貢獻(xiàn)聲明楊建良:醞釀和設(shè)計(jì)試驗(yàn),分析/解釋數(shù)據(jù),起草文章;蘇鐸華、邢貞建、鐘洪蘭:對文章的知識性內(nèi)容作批評性審閱;李祥:統(tǒng)計(jì)分析;周曉雯:采集數(shù)據(jù);植嘉玲:實(shí)施研究

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