蔣潔瑩 郁韶明 劉瑾
石軍顆粒原名“清開顆?!被颉扒彘_沖劑”,由大黃、石菖蒲和敗醬草三味中藥組方而成,是上海中醫藥大學附屬曙光醫院院內制劑,能清熱解毒、豁痰開竅,主要用于治療肝炎后肝硬化引起的輕微型肝性腦病和肝性腦病?Ⅰ期及Ⅱ期[1]。方中大黃具有瀉下攻積,清熱瀉火,涼血解毒,逐瘀通經的功效,為君藥;石菖蒲具有開竅豁痰,醒神益智之效,為臣藥;敗醬草能清熱解毒、利濕排膿、活血化瘀,為佐藥[2]。三藥合用起到滌蕩胃腸、清熱解毒、豁痰開竅醒神的作用。實驗研究表明石軍顆粒具有降低血氨及內毒素[3]、抑制肝細胞凋亡壞死[4]、改善神經生理功能[5]、改善學習記憶能力[6]等作用,在治療肝性腦病方面臨床療效顯著[1,3]。
肝性腦?。╤epatic encephalopathy,HE)是由肝功能紊亂和/或門體分流異常引起的大腦功能失調綜合征[7],臨床表現為神經或精神異常[7?8]。中醫上屬于“神昏”、“郁證”等范疇,多是由外感、情志不暢、飲食不潔等方面導致的肝疏泄功能失常所致[1,5]。本研究運用公共數據平臺及生物信息學分析方式,從整體和分子層面探討石軍顆粒治療肝性腦病的作用機制及靶點,為后續研究提供基礎。
中藥系統藥理學數據庫和分析平臺(TCMSP,https://tcmspw.com/index.php);DrugBank 數據庫(https://go.drugbank.com/);GEO數據庫(GEO,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/);DAVID 數據庫(https://david.ncifcrf.gov/);Omicshare(http://www.Omicshare.com/);Cytoscape 3.7.1 軟件;四氯化碳(CCl4)購于宜興市洋溪徐瀆化工廠。
運用TCMSP 平臺,以“大黃”、“石菖蒲”、“敗醬草”為關鍵詞查找化學成分,同時限定參數OB≥30%和DL≥0.18 進行篩選[9],并選取來源于Drug?Bank 的成分靶點。
以“hepatic encephalopathy”為關鍵詞,在GEO數據庫中檢索,選取GSE57193 芯片,設定adjusted p?value<0.05 和|log 2(fold change)|>1 篩選得到的差異基因即為肝性腦病的相關靶點。
將篩選得到的石軍顆?;瘜W成分和靶點數據導入Cytoscape 3.7.1 軟件,構建石軍顆粒成分?靶點網絡圖。網絡圖中的節點(node)代表成分和靶點,邊(edge)代表成分和靶點之間的聯系。將石軍顆粒成分靶點和肝性腦病相關差異基因數據分別導入Cytoscape 3.7.1 軟件,利用Bisogenet 插件構建石軍顆粒和肝性腦病蛋白?蛋白相互作用(PPI)網絡圖。對PPI 網絡圖進行融合,通過設置Degree、Closeness、Betweenness、Network、Eigenvector、Local Average Connectivity?based method(LAC)等參數篩選石軍顆粒治療肝性腦病的靶點。
將石軍顆粒PPI 網絡和肝性腦病PPI 網絡Merge 后,選其交集進行網絡圖構建。依據文獻方法[10],以degree centrality >68 篩選。然后進行拓撲分析,得到石軍顆粒治療肝性腦病的靶點。
將篩選得到的候選靶點導入DAVID 數據庫,進行Pathway 分析,并設置FDR<0.01 作為篩選條件。利用omicshare 繪制KEGG 通路結果氣泡圖。
體重250~300 g 的雌性和雄性SD 大鼠,由上海中醫藥大學實驗動物中心提供及飼養。飼養環境為室溫20℃,14 h 照明和10 h 黑暗。除正常組外,實驗大鼠都按0.5 mL/kg 腹腔注射CCl4,三天后按相同劑量腹腔注射30%CCl4石蠟油混合液,接下來每周注射3 次,連續3 周,造模周期一共為4 周。給藥組在造模完成后開始給藥,每日1 次灌胃給藥,連續給藥2 周。對照組給予乳果糖,正常組給予同等體積生理鹽水。
PC12 細胞用含10%胎牛血清、5%馬血清和1%青霉素?鏈霉素的DMEM 高糖培養基培養于37℃含95%空氣和5%CO2的培養箱中。按2×106cells/孔的濃度將PC12 細胞接種于10 cm 規格的培養皿中,培養24 h。用濃度為200 μg/mL 的石軍顆粒80%甲醇提取物對細胞進行處理0.5 h,然后用4 mM 的MPP+處理24 h。用細胞裂解液提取總蛋白,加入1%的蛋白酶抑制劑和1%的磷酸酶抑制劑。用BCA 法對蛋白濃度進行測定,按蛋白定量試劑盒說明書操作。以每個點樣孔40 μg 蛋白的量進行上樣,并加入7 μL 的蛋白marker,然后進行跑膠,并轉移到聚偏二氟乙烯轉移膜上。接下來在5%的脫脂牛奶進行封閉2 h,然后在4℃環境下用β?actin(45 kDa)、Akt(60 kDa)、p?Akt(60 kDa)、JNK(46、54 kDa)、p?JNK(46、54 kDa)抗體進行過夜孵育,隨后用非特異性二抗孵育1 h。使用eECL 曝光試劑盒對膜進行曝光,最后使用熒光及化學發光成像系統測定各個蛋白的表達。
腹主動脈取血并分離血清,用全自動生化儀測定血清中谷丙轉氨酶(Alanine transaminase,ALT)、谷草轉氨酶(Aspartate Transaminase,AST)、堿性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)、谷氨酰轉移酶(gamma?glutamyltransferase,GGT)、白蛋白(Albumin,ALB)和球蛋白(globulin,G)含量,用血氨檢測儀檢測血氨濃度。
采用SPSS 20 軟件進行統計分析;正態分布、方差齊性的計量資料以()表示,兩組間比較采用t檢驗;P<0.05 為差異有統計學意義。
去除無靶點和重復的化合物后,共篩選得到20 個石軍顆粒成分,見表1。共獲得99 個靶點。

表1 石軍顆?;瘜W成分信息Table 1 The chemical compositions of Shijun Granules
共得到肝性腦病相關靶點305 個。
20個化學成分的degree中位數是8.5。其中degree較高的成分為quercetin、kaempferol、stigmasterol、lute?olin、beta?sitosterol;靶點包括PTGS2、NCOA2、PTGS1、AR、PRSS1。石軍顆粒成分?靶點網絡圖見圖1。

圖1 石軍顆粒成分?靶點網絡圖Figure 1 The composition?target network of Shijun Granules
石軍顆粒PPI 網絡和肝性腦病PPI 網絡Merge后的網絡圖,見圖2A。以degree centrality>68 篩選后的網絡圖,見圖2B。經拓撲分析后,得到石軍顆粒治療肝性腦病的207 個靶點,見圖2C。

圖2 石軍顆粒治療肝性腦病的候選作用靶點網絡圖Figure 2 Identification of candidate targets of Shijun Granules against HE
KEGG 分析結果中包含16 條疾病通路和4 條信號通路,主要是Viral carcinogenesis、Alcoholism、Cell cycle 和MAPK signaling pathway 等,見 圖3。建立石軍顆粒治療肝性腦病靶點?通路網絡圖,見圖4。MAPK1、AKT1、NFKB1、RELA、TP53、GRB2、EGFR 等節點也具有較大的degree 值,構建石軍顆粒治療肝性腦病關鍵靶點?成分網絡圖,見圖5。

圖3 石軍顆粒治療肝性腦病預測靶點的KEGG 分析Figire 3 The KEGG analysis of Shijun Granules against HE

圖4 石軍顆粒治療肝性腦病靶點?通路網絡圖Figure 4 The target?pathway network of Shijun Granules against HE

圖5 石軍顆粒治療肝性腦病關鍵靶點?成分網絡圖Figure 5 The key target?composition network of Shijun Granules against HE
MPP+刺激的細胞p?JNK 蛋白表達與對照組比較顯著升高,而對JNK 蛋白的表達無明顯影響,當細胞用石軍顆粒提取物預處理后,細胞p?JNK 蛋白表達與MPP+組比較明顯降低,MPP+刺激的細胞p?AKT 蛋白表達顯著降低,而當細胞用石軍顆粒提取物預處理后,細胞p?AKT 蛋白表達明顯升高。見圖6。

圖6 石軍顆粒對MPP+誘導損傷PC12細胞蛋白表達的影響Figure 6 Effect of Shijun granules on protein expression of MPP+induced damaged PC12 cells
與正常組相比,模型組動脈血氨濃度顯著升高,差異有統計學意義(P<0.05)。當給予乳果糖和石軍顆粒后,血氨濃度顯著下降,其中給藥組具有更低的血氨水平。與正常組相比,模型組ALT、AST、ALP、GGT 和G 含量升高,當給予乳果糖后ALT、AST、ALP 和GGT 含量下降,但G 含量與模型組相比并沒有顯著降低。當模型大鼠給予石軍顆粒后,ALT、AST、ALP、GGT 以及G 含量與模型組相比都顯著降低,差異有統計學意義(P<0.05),其中G 含量降低到正常水平。見表2。

表2 血氨濃度和ALT、AST、ALP、GGT、ALB、G 含量比較Table 2 Comparison of blood ammonia concentration and ALT,AST,ALP,GGT,A,G content
國內外文獻顯示肝硬化患者出現輕微肝性腦病的比率為39.9%至75%,而患輕微肝性腦病的患者病情會進展為肝性腦?。?1]。肝性腦病是肝硬化常見并發癥,也是導致肝病死亡的常見原因。肝性腦病發病機制復雜,目前尚未完全確定其發病機制,常見的機制有氨中毒、炎癥損傷、神經遞質功能損傷、錳中毒、膽汁酸升高、氧化/亞硝化應激、腸道微生物失衡、氨基酸失衡、低鈉血癥、鋅缺乏、腦能量代謝失衡、腦干網狀系統損傷等[11?14]。因此肝性腦病相關的治療策略主要是從祛除誘因著手,如:降氨、抗感染、飲食調節、肝移植等[15]。中醫學研究認為肝性腦病的病機是熱、毒、痰、瘀互結,導致腑氣不通,腦竅蒙蔽,治療應以清熱解毒、涼血化瘀為主。
石軍顆粒由大黃、石菖蒲和敗醬草組方而成,在治療肝性腦病方面具有較好的臨床療效。自2000年在臨床應用以來,前后進行了多次臨床研究,探討了石軍顆粒經口服或灌腸給藥后在治療輕微肝性腦病、肝性腦病、肝硬化合并肝性腦病、代償期肝硬化輕微肝性腦病、慢性肝病后肝硬化并發輕微型肝性腦病等疾病方面的臨床療效,但其治療肝性腦病的作用機制仍未明確。本研究應用公共數據平臺及生物信息學分析方法,基于分子層面和整體角度探究石軍顆粒治療肝性腦病的作用機制,將成分和疾病相關靶點進行關聯,運用多靶點,多成分的研究模式,對化合物對疾病的作用機制及藥理作用進行分析。研究結果顯示石軍顆??赡苁峭ㄟ^調控MAPK、PI3K?Akt、ErbB、HIF?1等信號通路發揮作用;MAPK1是石軍顆粒治療肝性腦病的核心靶點,AKT1、NFKB1、RELA、TP53、GRB2、EGFR等為關鍵靶點;石軍顆粒通過調控MAPK1、AKT1、NFKB1等基因的表達和轉錄以及通過對相關靶點的作用,調控相關信號通路。網絡藥理學的研究對于探究石軍顆粒治療肝性腦病的作用機制、重要靶點以及活性成分等有一定幫助。但是由于數據庫涵蓋信息的局限、篩選條件的限定以及成分和靶點的復雜性,使得研究結果具有一定的片面性。本研究通過分子生物學的實驗進行驗證,明確了MAPK 和PI3K?Akt 信號通路是石軍顆粒發揮作用的機制。同時,動物實驗表明,石軍顆??捎行Ц纳艸E 大鼠肝功能,降低動脈血氨濃度。因此,推斷石軍顆粒可能通過調控MAPK 和PI3K?Akt 信號通路改善肝性腦病患者的肝功能,降低由氨誘導的腦細胞腫脹和氧化應激,發揮治療肝性腦病的作用。