黃河 李成長 彭燕 姜洪波
(1新鄉市中心醫院(新鄉醫學院第四臨床學院)呼吸與危重癥醫學科一,河南 新鄉 453000;新鄉醫學院 2基礎醫學院生理學與疾理生理系;3第三附屬醫院營養科)
肺癌是腫瘤相關死亡的主要病因之一。導致肺癌的因素很多,吸煙是引起肺癌重要的因素之一〔1〕,可以導致多種類型的肺癌發生,如小細胞肺癌和鱗狀細胞肺癌〔2,3〕,該方面的研究也較多,但相當一部分肺癌患者從不吸煙〔4〕,他們易罹患非小細胞肺癌(NSCLC)且大部分屬于肺腺癌(ADC),這方面的研究較少,發病原因及其分子機制尚不明確〔5〕,此外,對于相同的治療方案,吸煙人群和非吸煙人群NSCLC的治療效果并不一致〔6〕,提示兩者發病機制并不相同。目前幾乎所有肺癌治療的靶向藥物在治療過程中都會出現繼發耐藥現象〔7〕,目前尚未發現有關NSCLC患者中NCAPG基因的相關研究報道。本研究通過檢索美國國立衛生研究院GEO數據庫的基因表達譜數據,探討非吸煙肺癌患者NSCLC發病的分子生物學機制。
1.1基因表達譜數據的獲取 檢索GEO數據庫(Gene Expression Omnibus),選取GSE19804和GSE31210兩個基因表達譜數據集作為研究對象,其中,GSE19804包含來自非吸煙人群的60例腫瘤組織樣本和60例正常組織樣本。GSE31210數據集同時包含吸煙與非吸煙人群的標本,僅從該數據集中選取不吸煙人群作為研究對象,包括含115例腫瘤組織樣本和8例正常組織樣本。
1.2差異基因的篩選 基于R語言的差異基因在線分析工具GEO2R對兩個基因表達譜數據集分別進行差異表達分析,獲得差異表達基因(DEGs),差異表達基因的篩選條件為校正后P<0.05和|log2FC(fold change)|>1。……