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基于Web of Science 數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)新冠疫苗副作用相關(guān)文獻(xiàn)的計(jì)量學(xué)分析

2022-04-15 13:04:16牛亞芳
醫(yī)學(xué)信息 2022年7期
關(guān)鍵詞:可視化分析

種 萌,牛亞芳,馬 鑫,馬 莉

(1.蘭州大學(xué)第二醫(yī)院重癥醫(yī)學(xué)三科,甘肅 蘭州 730030;2.蘭州大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院,甘肅 蘭州 730030)

新型冠狀病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)是由新型冠狀病毒引起的一種高度傳染性的急性呼吸道疾病[1]。截止2021 年8 月,全球累計(jì)確診人數(shù)高達(dá)2 億多,累計(jì)死亡人數(shù)已達(dá)4 百多萬(wàn),COVID-19 給人類(lèi)健康和生存帶來(lái)了極大的威脅,造成了巨大的醫(yī)療壓力,其已成為21 世紀(jì)新的公共衛(wèi)生問(wèn)題[2]。目前,各國(guó)政府及醫(yī)院已鼓勵(lì)人們通過(guò)佩戴口罩和保持社交距離來(lái)減少疾病的傳播,并且已有相關(guān)研究表明佩戴口罩可有效阻斷COVID-19 傳播[3,4]。然而大部分國(guó)家及地區(qū)由于資源匱乏或國(guó)情等原因?qū)е驴谡值氖褂寐嗜暂^低,因此大多數(shù)人群及國(guó)家致力于COVID-19 疫苗的開(kāi)發(fā),希望通過(guò)接種疫苗減少疾病的傳播?,F(xiàn)已經(jīng)開(kāi)發(fā)出58 種針對(duì)性的疫苗并進(jìn)行臨床試驗(yàn),部分研究已取得預(yù)期結(jié)果[5],但仍有部分人群接種疫苗后會(huì)產(chǎn)生不同程度的過(guò)敏反應(yīng),甚至危及生命[6]。基于此,本研究對(duì)2020 年1 月-2021 年8 月發(fā)表的新冠疫苗副作用相關(guān)文獻(xiàn)進(jìn)行計(jì)量學(xué)分析,以期為臨床醫(yī)生提供相關(guān)科學(xué)研究依據(jù)與借鑒。

1 資料與方法

1.1 資料來(lái)源 計(jì)算機(jī)檢測(cè)Web of Science 核心合集數(shù)據(jù)庫(kù)(WOSCC),檢索時(shí)間設(shè)置為2020 年1 月-2021 年8月,以主題詞=(“COVID-19”O(jiān)R“2019 novel coronavirus disease”O(jiān)R “2019 -nCoV”O(jiān)R“SARS-CoV-2”)AND 主題=(“Vaccine”)AND 主題=(“side effect”O(jiān)R“adverse reaction”)為檢索策略,文獻(xiàn)類(lèi)型及語(yǔ)言不限。WOSCC 作為在線(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái),包含文獻(xiàn)信息和信息分析結(jié)果等資源,能夠評(píng)估和分析各類(lèi)研究成果及文獻(xiàn)。此外,該數(shù)據(jù)庫(kù)還提供了一系列分析工具,能夠進(jìn)行更為具體的搜索[7]。

1.2 方法 將WOSCC 中篩選的文獻(xiàn)導(dǎo)入新建文件夾“input”以download_XXX.txt 格式命名;采用CiteSpace5.8.R1 軟件,將文件格式轉(zhuǎn)化后導(dǎo)入軟件進(jìn)行分析,參數(shù)設(shè)置為:2020 年1 月-2021 年8 月,時(shí)間切片為1;節(jié)點(diǎn)類(lèi)型(Node Types):分別選取作者(Author)、機(jī)構(gòu)(Institution)、關(guān)鍵詞(Key words)、參考文獻(xiàn)(References)等,各自生成不同的可視化共現(xiàn)圖譜;閾值設(shè)置(Top N per slice)=100;修剪選項(xiàng)(Pruning);關(guān)鍵路徑(Pathfinder)、修剪圖形(Pruning Sliced Networks)[8]。其他參數(shù)均為默認(rèn)設(shè)置。對(duì)發(fā)表國(guó)家/地區(qū)、作者、期刊、機(jī)構(gòu)、關(guān)鍵詞、文獻(xiàn)引用情況、文獻(xiàn)被引頻次等進(jìn)行分析。

2 結(jié)果

2.1 檢索結(jié)果 共檢索出新冠疫苗副作用相關(guān)研究文獻(xiàn)489 篇,其中論著類(lèi)文獻(xiàn)346 篇,綜述類(lèi)文獻(xiàn)100 篇,提前報(bào)道79 篇,編輯素材23 篇,信件類(lèi)文獻(xiàn)13 篇,新聞?lì)^條6 篇,數(shù)據(jù)論文2 篇;被引頻次總計(jì)5055 次,h-index 計(jì)數(shù)26,每項(xiàng)平均引用次數(shù)10.34 次。

2.2 年度發(fā)文量 2020-2021 年該領(lǐng)域年度發(fā)文量呈增漲趨勢(shì),2020 年發(fā)文量為77 篇,2021 年截止8 月份發(fā)文量為406 篇,可見(jiàn)今后關(guān)于新冠疫苗副反應(yīng)相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)表數(shù)量仍然會(huì)呈現(xiàn)持續(xù)上升狀態(tài)。

2.3 國(guó)家發(fā)文量可視化分析 共111 個(gè)國(guó)家、地區(qū)參與新冠疫苗副作用相關(guān)文獻(xiàn)的發(fā)表,發(fā)文量居前10位的國(guó)家分別是:美國(guó)、意大利、中國(guó)、英國(guó)、印度、德國(guó)、沙特阿拉伯、加拿大、澳大利亞、法國(guó)。其中美國(guó)發(fā)文量最多,為199 篇,占總發(fā)文量的40.70%;其次為意大利,占15.54%;第3 位為中國(guó),占14.72%。歐美國(guó)家合作較中亞等國(guó)家合作密切,見(jiàn)圖1。

圖1 新冠疫苗副作用相關(guān)文獻(xiàn)國(guó)家發(fā)文量可視化圖譜

2.4 機(jī)構(gòu)發(fā)文量可視化分析 共140 個(gè)機(jī)構(gòu)發(fā)表了新冠疫苗副作用相關(guān)文獻(xiàn),發(fā)文量前10 的機(jī)構(gòu)分別為:Harvard Med Sch、Tel Aviv Univ、Stanford Univ、Emory Univ、Univ Jordan、Univ Bari、Univ Toronto、Natl Inst Food &Drug Control、Univ Michigan、Huazhong Univ Sci &Technol。其中Harvard Med Sch 發(fā)文量最多,為13 篇,發(fā)文量第2 的是Tel Aviv Univ,第3 為Stanford Univ,發(fā)文量前10 的機(jī)構(gòu)均為大學(xué),且有4 所位于美國(guó),且各個(gè)機(jī)構(gòu)之間合作緊密,以哈佛大學(xué)、以色列大學(xué)、斯坦福大學(xué)等為中心,散發(fā)出了較多合作關(guān)系網(wǎng),且各個(gè)機(jī)構(gòu)之間合作自稱(chēng)體系,見(jiàn)圖2。

圖2 新冠疫苗副作用相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)表機(jī)構(gòu)合作可視化圖譜

2.5 期刊共被引分析 共597 種期刊發(fā)表了新冠疫苗副作用相關(guān)研究的文獻(xiàn),被引用次數(shù)排名前10 的期刊為:NEW ENGL J MED、LANCET、JAMA-J AMMED ASSOC、NATURE、VACCINE、PLOS ONE、LANCET INFECT DIS、SCIENCE、BMJ-BRIT MED J和P NATL ACAD SCI U S A,其中NEW ENGL J MED被引用次數(shù)最多,為481 次,第2 為L(zhǎng)ANCET,第3 為JAMA-J AM MED ASSOC。排名前10 的期刊中6 種期刊影響因子>10 分,分別為NEW ENGL J MED、LANCET、JAMA-J AM MED ASSOC、NATURE、LANCET INFECT DIS、SCIENCE,前10 位期刊的平均影響因子為23.98 分。

2.6 期刊共引聚類(lèi)分析 期刊共引聚類(lèi)圖譜見(jiàn)圖3,共597 個(gè)節(jié)點(diǎn),2370 條連線(xiàn),密度為0.0133。經(jīng)過(guò)分析共產(chǎn)生109 個(gè)聚類(lèi),選取聚類(lèi)數(shù)最多的前8 個(gè)聚類(lèi)分析形成聚類(lèi)圖。不同的大小的模塊表示不同聚類(lèi)主題。聚類(lèi)標(biāo)簽序號(hào)越小,包含節(jié)點(diǎn)越多。前8 位聚類(lèi)標(biāo)簽分別為聚類(lèi)#0 regeneration therapeutics,聚類(lèi)#1 urgent need,聚類(lèi)#2 current covid-19 treatment strategies,聚類(lèi)#3 cross-secitonal study,聚類(lèi)#4 research update,聚類(lèi)#5 neuromyelitis optica,聚類(lèi)#6 covid-19 vaccine hesitancy,聚類(lèi)#7 risk factor。

圖3 新冠疫苗副作用相關(guān)文獻(xiàn)期刊合作聚類(lèi)圖譜

2.7 作者合作可視化分析 對(duì)489 篇新冠疫苗副作用相關(guān)文獻(xiàn)作者合作進(jìn)行可視化分析,共得到119個(gè)節(jié)點(diǎn),334 條連線(xiàn),密度為0.0476。發(fā)文量及文獻(xiàn)被引用次數(shù)排名前10 位作者見(jiàn)表1,其中JingXin Li 與FengCai Zhu 發(fā)文量最多,為6 篇,發(fā)文量較多的作者為L(zhǎng) Klimek、Antonio Vitiello 及Francesco Ferrara,單篇文獻(xiàn)被引用次數(shù)較多的作者為Polack FP、Huang CL、Hoffmann M、Chen NS 及Jackson LA。

表1 新冠疫苗副作用相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)文量及被引用次數(shù)排名前10 位作者

2.8 文獻(xiàn)共被引及聚類(lèi)分析 489 篇新冠疫苗副作用相關(guān)文獻(xiàn)共被引及聚類(lèi)分析見(jiàn)表2,共被引次數(shù)最多的3 篇文獻(xiàn)分別出自為Polack FP、Huang CL 與Hoffmann M,其中共被引次數(shù)最多的文獻(xiàn)是Polack FP 2020 年發(fā)表在NEW ENGL J MED的1 篇文獻(xiàn),其被引次數(shù)達(dá)152 次,該研究是一項(xiàng)納入43548 名參與者的多國(guó)家前瞻性研究,通過(guò)將參與者以1∶1 的比例隨機(jī)分為安慰劑組和接受疫苗組,最終通過(guò)研究得出新冠疫苗相關(guān)不良反應(yīng)包括注射部位的短期、輕度至中度疼痛、全身乏力和頭痛。嚴(yán)重不良事件的發(fā)生率很低,并且在疫苗組和安慰劑組中相似[9]。其次為Huang CL 的一篇文獻(xiàn),被引次數(shù)為106 次,其研究回顧性分析了我國(guó)武漢2019 年12 月16 日-2020 年1 月2 日確診為新冠肺炎的患者,并進(jìn)行流行病學(xué)、臨床特征、實(shí)驗(yàn)室和放射學(xué)特征以及治療和結(jié)果數(shù)據(jù)的收集,系統(tǒng)分析了新冠肺炎患者的臨床表現(xiàn)和特征,為疫苗的進(jìn)一步研制和改進(jìn)做出了貢獻(xiàn)[10]。文獻(xiàn)共被引次數(shù)排名前10 的文獻(xiàn)中,有5 篇來(lái)自L(fǎng)ANCET雜志,3 篇來(lái)自NEW ENGL J MED雜志。將共被引圖進(jìn)一步聚類(lèi)生成聚類(lèi)分析圖,得到Q=0.815,S 值=0.929。經(jīng)過(guò)分析得出為56 個(gè)聚類(lèi),其中以5-vectored covid-19 vaccine 為主題的新冠疫苗副作用相關(guān)文獻(xiàn)聚類(lèi)范圍最大,其次為current therapeutic 與allergic reaction。

表2 新冠疫苗副作用相關(guān)文獻(xiàn)共被引排名前10 的文獻(xiàn)

2.9 關(guān)鍵詞分析

2.9.1 關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖 將2020 年1 月-2021 年8 月發(fā)表新冠疫苗副作用相關(guān)文獻(xiàn)加載至CiteSpace 軟件進(jìn)行關(guān)鍵詞分析。首先對(duì)關(guān)鍵詞進(jìn)行共現(xiàn)分析,生成關(guān)鍵詞共現(xiàn)可視化圖,共計(jì)得到317 個(gè)關(guān)鍵詞節(jié)點(diǎn)、465 條關(guān)鍵詞連線(xiàn)。按照關(guān)鍵詞出現(xiàn)頻次進(jìn)一步分析顯示出現(xiàn)頻次排名前10 的新冠疫苗副作用相關(guān)文獻(xiàn)關(guān)鍵詞為Covid-19、Sars-cov-2、Vaccine、Coronavirus、Vaccination、Covid -19 vaccine、Covid 19、Infection、Pneumonia、Immune response,見(jiàn)表3。

表3 新冠疫苗副作用相關(guān)文獻(xiàn)出現(xiàn)頻次排名前10 的關(guān)鍵詞

2.9.2 關(guān)鍵詞聚類(lèi)分析 將關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖進(jìn)一步分析,得到關(guān)鍵詞聚類(lèi)圖譜,見(jiàn)圖4。關(guān)鍵詞可分為21個(gè)聚類(lèi),選取范圍最大的8 個(gè)聚類(lèi),其中coronavirus infection 聚類(lèi)范圍最大,為36,并以2019 冠狀病毒病、免疫反應(yīng)、藥物相關(guān)副作用、疫苗毒性、接種疫苗等為研究熱點(diǎn)。

圖4 新冠疫苗副作用相關(guān)文獻(xiàn)關(guān)鍵詞聚類(lèi)圖

3 討論

從2019 年新型冠狀病毒肺炎爆發(fā)至今,其高發(fā)病率及病死率給全球醫(yī)療衛(wèi)生帶來(lái)了巨大的負(fù)擔(dān),且即使是已經(jīng)治愈的患者仍然有較多的并發(fā)癥及復(fù)發(fā)的可能。因此,目前最主要的目標(biāo)為有效的預(yù)防該病,進(jìn)一步阻止其在人群中的傳播。截至到2020年8 月,全球已有30 種疫苗處于臨床試驗(yàn)階段,其中有200 多種處于不同的研發(fā)階段[11]。目前市面上已知用于人群的疫苗有6 類(lèi),包括減毒疫苗、滅活疫苗、亞單位疫苗、病毒載體疫苗、核酸疫苗、病毒樣顆粒疫苗。雖然疫苗種類(lèi)頗多,但其療效與副作用仍有很大差異。接種新冠疫苗后常見(jiàn)的副作用為注射部位(局部)反應(yīng),如疼痛、紅腫、皮炎和壞死等,全身性的表現(xiàn)如疲勞、頭痛、發(fā)冷、肌肉疼痛、關(guān)節(jié)痛、嘔吐和腹瀉等[12]。目前關(guān)于新冠疫苗安全性的相關(guān)研究層出不窮[13-15]。因此,降低新冠疫苗副作用,提高其預(yù)防效果至關(guān)重要,值得醫(yī)務(wù)人員進(jìn)一步研究。

文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)及可視化分析是通過(guò)軟件分析將文獻(xiàn)信息通過(guò)圖表方式表達(dá)出來(lái),使結(jié)果顯示更加具體化[16]。目前常用來(lái)分析文獻(xiàn)的工具即由美國(guó)德雷克塞爾大學(xué)陳超美教授開(kāi)發(fā)的一款可視化軟件CiteSpace,通過(guò)可視化手段呈現(xiàn)科學(xué)知識(shí)的結(jié)構(gòu)、規(guī)律和分布情況,可用于分析學(xué)科領(lǐng)域的演變脈絡(luò)以及發(fā)展前沿[17]。本文通過(guò)文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)與可視化分析方法,研究了自2020 年至今發(fā)表的新冠疫苗副作用相關(guān)文獻(xiàn)。通過(guò)上述分析可知,自新冠疫苗研發(fā)起,就有大量相關(guān)研究文獻(xiàn)發(fā)表,且呈持續(xù)增長(zhǎng)的趨勢(shì)。目前,隨著疫苗的普及,其相關(guān)研究文獻(xiàn)的發(fā)表數(shù)量呈持續(xù)增長(zhǎng)狀態(tài)。通過(guò)分析發(fā)表國(guó)家、地區(qū)、機(jī)構(gòu)、期刊、作者等節(jié)點(diǎn),發(fā)現(xiàn)美國(guó)為發(fā)文量最大的國(guó)家,截止目前共199 篇,占總發(fā)文量的40.70%,其次為意大利、中國(guó)。雖然我國(guó)為疫苗接種大國(guó),但相關(guān)研究仍有待進(jìn)一步提高。國(guó)家發(fā)文量的可視化圖中,圓點(diǎn)大小表示國(guó)家發(fā)文量多少,圓點(diǎn)直徑越大,表示該國(guó)發(fā)文量越多;節(jié)點(diǎn)間的連線(xiàn)表示國(guó)家之間的合作關(guān)系,一個(gè)圓點(diǎn)發(fā)出線(xiàn)條越多,表示該國(guó)與其他國(guó)家之間合作越多。外圈較粗的圓點(diǎn)是轉(zhuǎn)折節(jié)點(diǎn),如德國(guó)、約旦等國(guó)家,其具有高中心性;不同粗細(xì)的連線(xiàn)表示不同時(shí)間段各國(guó)合作緊密程度也不相同。本研究發(fā)現(xiàn),發(fā)文量最多的機(jī)構(gòu)為Harvard Med Sch,共19 篇,發(fā)文量排名前10 的機(jī)構(gòu)均為大學(xué),且有4所位于美國(guó),表明美國(guó)為該研究高產(chǎn)出國(guó)家,且各個(gè)機(jī)構(gòu)之間合作緊密。NEW ENGL J MED為文獻(xiàn)被引次數(shù)最多的期刊,作為醫(yī)學(xué)行業(yè)的頂級(jí)期刊,其關(guān)于新冠疫苗副作用相關(guān)研究文獻(xiàn)的產(chǎn)量最高,值得借鑒和參考。作者Polack FP 發(fā)表的文獻(xiàn)被引次數(shù)位居第1,其前期發(fā)表的相關(guān)研究說(shuō)明了注射新冠疫苗可能發(fā)生的副作用。作者李敬新和朱鳳才為發(fā)文量最多的作者,二者在新冠疫苗副作用研究領(lǐng)域做出了巨大貢獻(xiàn),并且其發(fā)表的文獻(xiàn)更進(jìn)一步研究了新冠疫苗相關(guān)副作用[18]。關(guān)鍵詞分析體現(xiàn)了新冠疫苗副作用的相關(guān)熱點(diǎn),目前主要關(guān)鍵詞為冠狀病毒、非典型性肺炎病毒、疫苗、接種疫苗、冠狀病毒疫苗、感染、肺炎、免疫反應(yīng)等;主要研究熱點(diǎn)為2019 冠狀病毒病、免疫反應(yīng)、藥物相關(guān)副作用、疫苗毒性、接種疫苗等。

綜上所述,目前新冠疫苗副作用的相關(guān)研究仍較少,有待進(jìn)一步提高,我國(guó)相關(guān)研究文獻(xiàn)發(fā)表雖位居前列,但總體研究較少,今后應(yīng)進(jìn)行更多的研究。

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