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百香果內(nèi)生細(xì)菌多樣性及促生長(zhǎng)特性

2022-03-07 00:55:36唐嘉城梁毅珉馬葭思彭桂香譚志遠(yuǎn)
生物技術(shù)通報(bào) 2022年1期
關(guān)鍵詞:植物能力

唐嘉城 梁毅珉 馬葭思 彭桂香 譚志遠(yuǎn)

(1.華南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,廣州 510642;2.華南農(nóng)業(yè)大學(xué)資源環(huán)境學(xué)院,廣州 510642)

植物內(nèi)生菌(endophyte)是指在健康植物的細(xì)胞間或細(xì)胞內(nèi)存活且可在不同時(shí)期或不同組織間存在的各種微生物[1]。雖然進(jìn)入植物體內(nèi)的方法和時(shí)間不盡相同,但其一旦定植于植物體內(nèi)的便可以與植物形成穩(wěn)定地共生關(guān)系[2-3]。大部分植物體內(nèi)均有植物內(nèi)生菌存在,雖然其定植于植物體內(nèi)的方式不盡相同,但是其在植物體內(nèi)對(duì)寄主植物都具有多種作用,一些具有生防作用的有益內(nèi)生細(xì)菌不僅能夠起到與化學(xué)農(nóng)藥相似的作用,還能減少農(nóng)藥濫用對(duì)環(huán)境和人類(lèi)健康的危害,在植物保護(hù)方面有很大的應(yīng)用價(jià)值[4]。植物內(nèi)生菌的研究與生物肥料及相關(guān)菌劑制造息息相關(guān),通過(guò)生物肥料和菌劑改善土壤條件有利于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)可持續(xù)發(fā)展,并可改善長(zhǎng)期施用化肥而帶來(lái)的土壤酸化、重金屬污染等負(fù)面影響。因此,了解百香果內(nèi)生菌的種群特點(diǎn)和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,并對(duì)其內(nèi)生菌的生物學(xué)功能與促生特性進(jìn)行研究,挖掘菌種資源,從而將其應(yīng)用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn),對(duì)農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展做出貢獻(xiàn)。

百香果(Passiflora edulia Sims)屬于西番蓮科西番蓮屬,主要生長(zhǎng)于熱帶和亞熱帶地區(qū),常見(jiàn)品種有黃金、滿天星等。在種植1到2年后開(kāi)始結(jié)果,花期較長(zhǎng)一年多季,可種植10年左右。百香果具有食用、藥用和觀賞等多種經(jīng)濟(jì)價(jià)值。果瓤?jī)?nèi)含大量汁液,加入糖和其他添加劑,可制成芳香可口的飲料,現(xiàn)多用于添加在各種飲品中以提供酸甜爽口的味覺(jué)體驗(yàn)和富含維生素C與多種微量元素的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值。百香果花的花瓣多且柱頭有3個(gè)分裂水平分開(kāi),顏色多為白色和紫色,作為藤本植物可種植于庭園中以作觀賞,具有很大的市場(chǎng)潛力。我們從百香果根莖葉中分離純化內(nèi)生細(xì)菌,并對(duì)其進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,之后進(jìn)行生理生化試驗(yàn)和相關(guān)功能性試驗(yàn)以期望找到對(duì)植物生長(zhǎng)具有促生作用,可在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)領(lǐng)域應(yīng)用且具有多種促生特性于一體的微生物種質(zhì)資源,從而更好地服務(wù)于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 實(shí)驗(yàn)材料 百香果(Passiflora edulia Sims)取自華南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)場(chǎng),選用百香果的根、莖、葉作為分離內(nèi)生細(xì)菌的主要部位。

1.1.2 主要培養(yǎng)基 使用NFB無(wú)氮培養(yǎng)基[5]、DN無(wú)氮培養(yǎng)基[6]和LB培養(yǎng)基對(duì)百香果內(nèi)生菌株分離純化。PKO培養(yǎng)基、鉀細(xì)菌篩選培養(yǎng)基和MSA-CAS培養(yǎng)基等[6]進(jìn)行促生試驗(yàn)。

1.1.3 主要試劑和儀器 氣象色譜儀,北京北分天普儀器技術(shù)有限公司;分光光度計(jì),PCR儀、凝膠成像系統(tǒng),Bio-Rad公司;3-吲哚乙酸,合肥博美生物公司;2×Taq PCR Mix、DNA Marker,北京擎科生物技術(shù)有限公司。

1.2 方法

1.2.1 菌株的分離純化 參考譚志遠(yuǎn)等[7]的方法。將采集到的健康百香果植株用清水洗去表面灰塵和泥土,根、莖取2-3 cm左右的小段若干,葉取3 cm×3 cm左右的葉片若干放入滅過(guò)菌的培養(yǎng)皿內(nèi)置于超凈臺(tái)中進(jìn)行表面滅菌,先用75%的酒精浸泡植物組織塊2-3 min,期間可用滅菌鑷子晃動(dòng)組織塊使表面滅菌更充分,重復(fù)兩次,之后用無(wú)菌水洗滌2-3 min,重復(fù)兩次,將組織塊用4%次氯酸鈉浸泡4-7 min(根、莖浸泡時(shí)間偏長(zhǎng),葉浸泡時(shí)間偏短),之后再次用無(wú)菌水洗滌2-3 min,重復(fù)3次,保留最后一次洗滌的無(wú)菌水涂布在LB平板上作為對(duì)照,以確定植物組織塊外表面是否消毒徹底。將表面消毒完成的根、莖用滅菌的剪刀剪去兩端各約0.5 cm,保留1-2 cm的中間部分,同樣對(duì)葉片組織周?chē)鷾p去約0.5 cm寬的葉片,保留2 cm×2 cm的中間部分,目的是將根、莖兩端及葉片周?chē)^(guò)度消毒的部分去除。之后將組織塊放入滅好菌的研缽中,加入無(wú)菌水,用研磨棒充分研磨,吸取0.1 mL研磨液于1.5 mL EP管中,加入0.9 mL無(wú)菌水充分混勻,然后將其濃度梯度稀釋為10-3、10-4、10-5,分別取50 μL稀釋液用涂布平板法涂布于NFB、LB、DN固體培養(yǎng)基上,倒置裝袋置于37℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng),24 h后觀察培養(yǎng)基中菌落的生長(zhǎng)情況,挑取生長(zhǎng)狀況良好的單菌落以平板劃線法培養(yǎng)多代,直至獲得表型特征一致的純化菌株。

1.2.2 IS-PCR插入序列指紋圖譜聚類(lèi) 以各菌株的全基因組DNA為模板,通過(guò)指紋圖譜(IS-PCR)方法[8],使用通用引物J3進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR反應(yīng)體系(25 μL):2×Taq PCR Mix 12.5 μL,50 μmol/L J3 1.0 μL,模板 DNA(40 ng/μL)0.5 μL,ddH2O 11 μL。PCR反應(yīng)條件為 :95℃ 5 min;95℃ 50 s,56℃50 s,72℃ 1 min,35個(gè)循環(huán);72℃ 5 min。參照劉麗輝等[6]的方法。之后使用GIS與TREECONW軟件對(duì)所得電泳圖譜進(jìn)行聚類(lèi)[9]。

1.2.3 16S rRNA基因系統(tǒng)發(fā)育學(xué)分析 16S rRNA基因擴(kuò)增使用通用引物27F 和1492R。PCR反應(yīng)體系 為(25.0 μL):ddH2O 10.5 μL,2×Taq PCR Mix 12.5 μL,27F 0.5 μL,1492R 0.5 μL,DNA 模板(40 ng/μL)1 μL,PCR 反應(yīng)程序:95℃ 5 min;95℃ 50 s,56℃ 50 s,72℃ 50 s,32 個(gè)循環(huán) ;72℃ 5 min。由廣州天一輝遠(yuǎn)公司對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序。在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中對(duì)所得序列進(jìn)行16S rRNA BLASTN比對(duì),將同源性最高的模式菌株與代表菌株用MEGA X軟件進(jìn)行多序列比對(duì),用Neighbor Joining法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。

1.2.4 百香果內(nèi)生菌生理生化鑒定 革蘭氏染色、甲基紅測(cè)定、產(chǎn)氨實(shí)驗(yàn)、乙酰甲基甲醇實(shí)驗(yàn)、脲酶測(cè)定、明膠液化測(cè)定、H2O2酶測(cè)定、NO3-還原實(shí)驗(yàn)等均參照《微生物學(xué)實(shí)驗(yàn)教程》[10]進(jìn)行。

1.2.5 菌株固氮酶活測(cè)定及nifH基因擴(kuò)增與分析 固氮能力的測(cè)定:將各類(lèi)群代表菌株分別置于LB液體培養(yǎng)基中,置于37℃恒溫?fù)u床中,120 r/min培養(yǎng)24 h,用無(wú)菌水稀釋成OD600為1的菌液,取10 μL接種于有3 mL半固體DN培養(yǎng)基的10 mL試管中,用經(jīng)H2O2滅菌的膠塞密封,并用封口膜封住膠塞與試管連接處,置于37℃恒溫箱培養(yǎng)24 h,確定菌株定植于試管中后,用乙炔還原法(ARA)對(duì)其進(jìn)行固氮酶活性測(cè)定,先抽取剩余空氣1/100體積的試管內(nèi)氣體,之后向試管中注入等體積的100%乙炔氣體以確保氣壓一致。在37℃恒溫箱培養(yǎng)48 h后,用1 mL注射器從試管中抽取0.5 mL氣體注入氣相色譜,用氣相色譜儀測(cè)定乙烯與乙炔峰面積,進(jìn)行3次重復(fù),取平均值。

nifH基因的擴(kuò)增參照Z(yǔ)ehr等[11]的方法,引物使 用 Zehr-F(5′-TGYGAYCCNAARGCNGA-3′) 和Zehr-R(5′-NDGCCATCATYTCNCC-3′)(D:A,G 或 T;N:A,C,G或 T;Y:C或 T;R:A或 G)。PCR反應(yīng)程序 :97℃ 3 min ;97℃ 60 s,55℃ 50 s,72℃35 s,32個(gè)循環(huán);72℃ 5 min。擴(kuò)增后的PCR產(chǎn)物用1.5%的瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè)。

1.2.6 菌株的促生特性 溶磷試驗(yàn):將菌株活化后用過(guò)滅菌的牙簽點(diǎn)種到PKO培養(yǎng)基上,置于37℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)2-5 d,通過(guò)觀察菌落周?chē)欠裥纬赏该魅Γ袛嗑晔欠窬哂腥芰啄芰Γ型该魅t說(shuō)明菌株具有溶磷能力。采用鉬銻抗比色法對(duì)各菌株溶磷能力大小進(jìn)行測(cè)量[12]。

解鉀試驗(yàn):將菌株活化后用過(guò)滅菌的牙簽點(diǎn)種到鉀細(xì)菌固體培養(yǎng)基上,置于37℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)2-5 d,通過(guò)觀察菌落周?chē)欠裼型该魅Γ袛嗑晔欠窬哂薪忖浤芰Γ型该魅t說(shuō)明菌株具有解鉀能力。采用四苯和硼酸鈉法對(duì)各菌株溶磷能力大小進(jìn)行測(cè)量[13]。

分泌生長(zhǎng)素試驗(yàn):定性分析:將菌株活化后接種至King液體培養(yǎng)試管中,每個(gè)菌株設(shè)3個(gè)重復(fù),置于搖床中28℃、120 r/min培養(yǎng)2 d。吸取50 μL菌懸液于陶瓷比色板上,加入等量比色液,設(shè)陰性對(duì)照和陽(yáng)性對(duì)照,陰性對(duì)照加入50 μL未接菌的King液體培養(yǎng)基,陽(yáng)性對(duì)照中加入50 μL濃度為10 mg/L的植物生長(zhǎng)激素(IAA),之后在黑暗條件下靜置半個(gè)小時(shí),觀察顏色變化,能產(chǎn)生生長(zhǎng)素的菌株其混合液在靜置后會(huì)變?yōu)榉奂t或紅色;定量分析:使用純的3-吲哚乙酸(3-IAA)制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,采用Salkowski比色法[6],對(duì)代表菌株分泌生長(zhǎng)素的能力進(jìn)行測(cè)定。

產(chǎn)鐵載體試驗(yàn):將菌株接種于MSA-CAS液體培養(yǎng)基中,置于37℃恒溫?fù)u床,120 r/min培養(yǎng)3-5 d,觀察培養(yǎng)基變色情況,未變色則菌株不具有產(chǎn)鐵載體能力,如果培養(yǎng)基顏色變?yōu)榉奂t色則菌株具有分泌鐵載體的能力。

產(chǎn)蛋白酶實(shí)驗(yàn):用脫脂奶粉瓊脂固體培養(yǎng)基對(duì)菌株進(jìn)行產(chǎn)蛋白酶能力測(cè)定。A組分:Skimmed milk powder 35.0 g,500 mL H2O,B組分:Agar 20.0 g,500 mL H2O,A與B組分在高壓蒸汽滅菌鍋中121℃滅菌30 min,A與B組分分開(kāi)滅菌以防止結(jié)塊,滅菌完成后待其溫度降至60℃左右時(shí)快速混勻后制備產(chǎn)蛋白酶檢測(cè)平板。用滅過(guò)菌的牙簽將菌株點(diǎn)種在培養(yǎng)基中央,置于37℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)5 d后,觀察菌落周?chē)欠裼型该魅π纬桑型该魅Τ霈F(xiàn)則說(shuō)明菌株具有產(chǎn)蛋白酶能力,通過(guò)計(jì)算透明圈直徑與菌落直徑的比值確定菌株產(chǎn)蛋白酶能力大小。

2 結(jié)果

2.1 百香果內(nèi)生細(xì)菌的分離和純化

經(jīng)分離純化后共得到51株百香果內(nèi)生細(xì)菌。具體結(jié)果如表1所列。51株內(nèi)生菌是從不同組織中分離得到的,其中根中分離到31株,莖中分離到13株,葉中分離到7株。

表1 百香果內(nèi)生細(xì)菌菌株統(tǒng)計(jì)表Table 1 Strains isolated from P. edulia Sims

2.2 分離菌株IS-PCR指紋圖譜聚類(lèi)分析

根據(jù)IS-PCR指紋圖譜的結(jié)果(圖1),使用TREECONW軟件將51株細(xì)菌聚為12類(lèi)(圖2)。不同類(lèi)群菌株指紋圖譜的條帶位置及數(shù)量之間存在明顯區(qū)別,顯示出各類(lèi)群之間分子水平上的差異。

圖1 百香果51株內(nèi)生菌IS-PCR指紋圖譜電泳圖Fig.1 IS-PCR fingerprinting patterns of 51 endophytes in P. edulia Sims

圖2 百香果51株內(nèi)生菌的IS-PCR指紋圖譜聚類(lèi)(UPGMA)Fig.2 Dendrogram of IS-PCR fingerprinting patterns(UPGMA method)of 51 endophytes in P. edulia Sims

2.3 菌株16S rRNA基因序列分析

對(duì)12個(gè)類(lèi)群的代表菌株進(jìn)行16S rRNA基因序列測(cè)定,測(cè)定結(jié)果在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中用BLASTN進(jìn)行相似度比對(duì),結(jié)果見(jiàn)表2,使用MEGA X將相似性最高的模式菌株與代表菌株的基因序列用鄰接法進(jìn)行聚類(lèi)分析并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(圖3)。

圖3 各類(lèi)群代表菌株16S rRNA基因序列系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(鄰接法)Fig.3 Phylogenetic dendrogram of 16S rRNA gene sequences for representative strains(Neighbor-joining method)

表2 百香果各類(lèi)群代表菌株16S rRNA基因序列相似性比對(duì)結(jié)果Table 2 Comparison results of 16S rRNA gene sequence similarity of representative strains of various groups of P. edulia Sims

2.4 代表菌株生理生化鑒定

通過(guò)對(duì)各類(lèi)群代表菌株所做的生理生化試驗(yàn)得到結(jié)果如下(表3)。具有固氮酶活性的代表菌株有 BXG81、BXG212、BXG201、BXJ71、BXG53,其中BXJ71具有最高的固氮酶活性,達(dá)到447.93 nmol C2H4/(mL·h)。固氮酶nifH基因電泳圖見(jiàn)圖4,可見(jiàn)菌株BXG81、BXG212、BXG201、BXJ71和BXG53在約360 bp處擴(kuò)增出的nifH基因條帶。

圖4 代表菌株nifH基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖Fig.4 PCR products of the nifH gene in representative strains

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2.5 代表菌株的促生長(zhǎng)特性

對(duì)各類(lèi)群代表菌株進(jìn)行可溶性磷定量測(cè)定,可溶性鉀定量測(cè)定,產(chǎn)蛋白酶定性試驗(yàn),產(chǎn)鐵載體能力試驗(yàn),產(chǎn)生長(zhǎng)素定量試驗(yàn),結(jié)果見(jiàn)表4。菌株 BXG111、BXY92、BXG212、BXG101、BXJ71、BXG53具有溶磷能力,菌株BXG129、BXY92、BXJ201、BXG81、BXG212、BXJ71、BXG53 具有解鉀能力,菌株 BXG95、BXG129、BXG92、BXY92、BXG81、BXG212、BXG101、BXG201、BXJ71、BXG53具有產(chǎn)生長(zhǎng)素能力,菌株BXG81、BXJ71、BXG53具有產(chǎn)鐵載體能力,菌株BXG95、BXG129、BXY92、BXG201、BXJ71具有產(chǎn)蛋白酶能力。其中BXJ71具有各試驗(yàn)測(cè)試的促生能力,BXG53、BXY92和BXG212也具有多種促生能力(圖5)。

圖5 部分代表菌株促生特性Fig.5 Growth-promoting characteristics of some representative strains

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3 討論

本研究以百香果為材料從中分離純化出了51株菌株。這51株內(nèi)生菌系統(tǒng)發(fā)育分析聚類(lèi)為12類(lèi),10個(gè)屬12個(gè)種,分離部位是從百香果植株不同部位獲得的,體現(xiàn)了百香果內(nèi)生菌的遺傳多樣性,同時(shí)具有多種促生長(zhǎng)特性,內(nèi)生菌的固氮酶活性隨分離部位及其種屬不同而顯示出一定的差異,分布在21.11-477.93 nmol C2H2/(mL·h)之間。Farhana等[14]對(duì)小麥內(nèi)生菌進(jìn)行分離純化,得到了7個(gè)屬15種不同的內(nèi)生菌,對(duì)其進(jìn)行了植物促生和促進(jìn)植物抗逆性的試驗(yàn),得出小麥內(nèi)生菌可通過(guò)分泌大量有益的促生代謝物促進(jìn)植物生長(zhǎng)并幫助寄主植物在逆境下生存;Bram等[15]對(duì)楊樹(shù)根際細(xì)菌和植株內(nèi)生菌群落的結(jié)構(gòu)變異及生態(tài)位分化的研究表明,楊樹(shù)內(nèi)生菌在屬及以上的OUT水平顯示,根中以Rhizobiales、Rhizobium屬為主,莖中主要以Pseudomonas、Methylobacterium、Deinococcus屬為主,葉中以Pseudomonas、Sphingomonas、Methylobacterium屬為主,同時(shí)證明了田間生長(zhǎng)的楊樹(shù)內(nèi)生微生物組的結(jié)構(gòu)變異性遠(yuǎn)高于根際微生物組,這種更高的變異性可能與植物不同組織部位的生理環(huán)境差異和植物因外界環(huán)境變化而導(dǎo)致的體內(nèi)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)、水分、激素等的變化有關(guān)。本研究的百香果屬于藤本植物,我們從其中分離得到了10屬12個(gè)種的內(nèi)生菌,證明百香果內(nèi)生菌具有豐富的遺傳多樣性,上述研究表明在草本和木本植物中也都有豐富的內(nèi)生菌存在,這些不同種屬的內(nèi)生菌有著多樣的生物學(xué)功能,可通過(guò)自身代謝和生長(zhǎng)對(duì)植物產(chǎn)生促生及抗逆境脅迫等多種影響,對(duì)微生物多樣性研究和具有特異性功能菌株的開(kāi)發(fā)有著重要的意義,同時(shí)更高的變異性也意味著植物內(nèi)生菌對(duì)拓展微生物種質(zhì)資源和研究不同微生物群落間相互作用有著極高的價(jià)值。進(jìn)一步可將百香果功能菌株回接作物進(jìn)行盆栽實(shí)驗(yàn)和大田實(shí)驗(yàn),研究功能菌株對(duì)作物促生、抗病等功能的效果,進(jìn)而使其能服務(wù)于農(nóng)業(yè),為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)做出貢獻(xiàn)。

本文分離純化得到的Ⅰ類(lèi)群Bacillus altitudinis細(xì)菌最早是從收集高海拔空氣樣品的低溫管中分離得到的[16],與類(lèi)群Ⅱ的Bacillus circulans位于同一個(gè)屬,其都有產(chǎn)生長(zhǎng)素的能力且在12個(gè)類(lèi)群中最強(qiáng),說(shuō)明它們?cè)诖龠M(jìn)植物生長(zhǎng)發(fā)育方面優(yōu)勢(shì)更加明顯,且類(lèi)群Ⅰ的代表菌株BXG95產(chǎn)蛋白酶能力在12個(gè)類(lèi)群中最強(qiáng),而類(lèi)群Ⅱ的BXG129又具有解鉀能力。Baliyan等[17]在對(duì)可促進(jìn)鷹嘴豆生長(zhǎng)的菌株研究中發(fā)現(xiàn),從鷹嘴豆根際土壤分離出的MRN16同Bacillus altitudinis有99%的相似性,而此菌株在最優(yōu)環(huán)境下的產(chǎn)生長(zhǎng)素能力在2 d時(shí)約為30-40 mg/L,同本研究得出的24.32 mg/L較為接近,本試驗(yàn)結(jié)果偏低的原因可能為菌株生長(zhǎng)環(huán)境并非為最優(yōu)導(dǎo)致的,同時(shí)MRN16菌株對(duì)鷹嘴豆種子發(fā)芽的促進(jìn)作用明顯,我們推斷類(lèi)群Ⅰ的代表菌株BXG95也具有良好的促生作用。

類(lèi)群Ⅴ的Paenibacillus illinoisensis細(xì)菌是由F. E.Clark[18]從土壤中發(fā)現(xiàn)的,Paenibacillus屬和Bacillus屬最早在分類(lèi)學(xué)上同屬于一個(gè)屬,后來(lái)于1993年由Ash等[19]提議將部分菌劃分為Paenibacillus屬。本試驗(yàn)類(lèi)群Ⅴ代表菌株BXY92具有溶磷、解鉀、產(chǎn)生長(zhǎng)素和產(chǎn)蛋白酶多種能力,且解鉀和產(chǎn)蛋白酶能力較強(qiáng)。Liu等[20]對(duì)Paenibacillus illinoisensis細(xì)菌促進(jìn)花生生長(zhǎng)的能力進(jìn)行了田間試驗(yàn),結(jié)果表明接種Paenibacillus illinoisensis細(xì)菌的植株莢果產(chǎn)量比對(duì)照提高了37.05%,對(duì)植株全氮、磷、鉀的積累具有促進(jìn)作用,這同本研究對(duì)類(lèi)群Ⅴ代表菌株BXY92進(jìn)行的促生特性試驗(yàn)結(jié)果相符合。

類(lèi)群Ⅶ的Rhizobium pusense細(xì)菌是由Digvijay等[21]于2011年從鷹嘴豆的根際分離并命名的,其屬于根瘤菌屬,雖然大眾會(huì)有根瘤菌是同豆科植物根莖共生的印象,但是其共生特性在遺傳上是不穩(wěn)定的,這增加了非共生根瘤菌在其他植物根莖、土壤中發(fā)現(xiàn)的可能性,因此一些從其他植物根莖、土壤中發(fā)現(xiàn)根瘤菌的現(xiàn)象有被報(bào)道,Soberon-Chavez,Quigley等[22-23]在土壤中發(fā)現(xiàn)過(guò)根瘤菌,Segovia,Yanni和Mónica等[24-26]在根際土壤和其他植物根莖中發(fā)現(xiàn)過(guò)根瘤菌。本試驗(yàn)類(lèi)群Ⅶ的代表菌株BXG81分離部位是百香果植株的根系,這也驗(yàn)證了根瘤菌可在豆科植物根瘤以外的植物組織存在,其具有生物固氮、解鉀、產(chǎn)生長(zhǎng)素和分泌鐵載體能力,微生物通過(guò)合成分泌自身生存需要的鐵載體使其能在低鐵環(huán)境中螯合環(huán)境或宿主細(xì)胞中的鐵,為其生長(zhǎng)提供了鐵元素,有研究表明具有產(chǎn)鐵載體能力的細(xì)菌可以降低土壤重金屬含量[27],還對(duì)植物具有促生能力[28],并能增強(qiáng)植物抵抗病原菌的能力[29]。

類(lèi)群Ⅷ的Beijerinckia fluminensis細(xì)菌最早是從巴西不同地區(qū)收集的土壤樣品中分離得到的[30]。本試驗(yàn)類(lèi)群Ⅷ的代表菌株BXG212具有生物固氮、溶磷、解鉀和產(chǎn)生長(zhǎng)素的能力。Krupali等[31]對(duì)多種藥用植物進(jìn)行內(nèi)生菌分離和純化后得到了5株具有促生作用的菌株,其中從姜黃根莖中分離出的C-1菌株經(jīng)鑒定為Beijerinckia fluminensis細(xì)菌,促生功能試驗(yàn)結(jié)果同本研究結(jié)果一致,同時(shí)其對(duì)C-1菌株也擴(kuò)增出了nifH基因,再次從基因?qū)用孀C明了其具有生物固氮的功能。

類(lèi)群Ⅺ的Klebsiella michiganensis細(xì)菌最初報(bào)道是從美國(guó)密歇根州一個(gè)家庭的牙刷架上分離得到的,后來(lái)也有從植物組織中分離出來(lái)的報(bào)道[32],與類(lèi)群Ⅻ的Klebsiella pneumoniae細(xì)菌同屬Klebsiella屬,K.pneumoniae有從多種植物中分離出的報(bào)道[33-35]。付思遠(yuǎn)等[36]對(duì)泓森槐內(nèi)生固氮菌的分離中得到了和K. michiganensis細(xì)菌相似度為100%的菌株,其分離部位是植株的莖稈部分,具有固氮酶活性和多種促生作用,本實(shí)驗(yàn)類(lèi)群Ⅺ也主要由莖中分離同樣具有固氮酶活性且所具有的促生作用相似,而本試驗(yàn)類(lèi)群Ⅺ中有一株菌為根系中分離,可能表明K.michiganensis細(xì)菌主要分布于植物莖中但也有少數(shù)情況可在植物根系中定植。龔鳳娟等[37]對(duì)杜仲內(nèi)生細(xì)菌進(jìn)行分離得到了5株內(nèi)生細(xì)菌,其中分離出了和K. pneumoniae細(xì)菌相似度為99%的菌株,其具有ACC脫氨酶活性和抑菌作用,具有ACC脫氨酶活性的植物根際和內(nèi)生細(xì)菌對(duì)提高植物抗逆境脅迫中有重要作用,而其抑菌作用可能與其具有分泌鐵載體能力有關(guān)。本試驗(yàn)這兩個(gè)類(lèi)群的代表菌株BXJ71和BXG53都具有生物固氮、溶磷、解鉀、產(chǎn)生長(zhǎng)素和分泌鐵載體的能力,BXJ71又具有產(chǎn)蛋白酶能力且生物固氮能力在12個(gè)類(lèi)群中最強(qiáng),說(shuō)明其對(duì)植物氮素的提供上有較強(qiáng)的促進(jìn)作用,而B(niǎo)XG53的溶磷和解鉀能力在12個(gè)類(lèi)群中最強(qiáng),說(shuō)明其對(duì)植物磷、鉀元素的提供上有較強(qiáng)的促進(jìn)作用。

4 結(jié)論

本研究分離得到百香果內(nèi)生菌51株分屬于12個(gè)類(lèi)群,為10個(gè)屬的12個(gè)種,其中從根中分離得到31株,莖中分離得到13株,葉中分離得到7株,通過(guò)各促生特性試驗(yàn)結(jié)果表明從百香果中分離得到的內(nèi)生菌不但具有種群多樣性,而且具有功能多樣性,百香果內(nèi)生菌除了具有溶磷、解鉀、分泌生長(zhǎng)素功能,還有具有生物固氮和產(chǎn)鐵載體等促生功能于一體的菌株,其中菌株K. michiganensis BXJ71有最高的固氮酶活性,與K. pneumonia BXG53、Beijerinckia fluminensis BXG212在各方面的促生能力都很強(qiáng),是集多種功能于一體的微生物種質(zhì)資源,在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)方面具有廣闊的應(yīng)用前景。

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