基于生物信息學預測迷迭香酸治療子宮內膜癌的靶點和通路

曹禮慧，劉麗娟，袁中文，高珊珊，馮森玲

（廣州醫科大學附屬第三醫院藥學部廣東省產科重大疾病重點實驗室，廣州 510150）

子宮內膜癌是女性常見的惡性腫瘤之一。近年來其發生率和病死率不斷升高，發病原因尚未完全明確，治療方法主要是手術和放化療[1]。迷迭香酸是一種天然多功能酚酸類化合物，因1958年首次從迷迭香植物中分離提取而得名[2]。研究[3-4]表明，迷迭香酸具有多種藥理活性，如抗腫瘤、抗氧化、抗炎和抗菌等，對肝癌、卵巢癌、宮頸癌等均表現出明顯的抑制作用。本研究通過數據庫篩選出迷迭香酸的作用靶點，探索迷迭香酸治療子宮內膜癌的作用靶點及其可能的作用機制，為后續開展分子生物學研究及動物實驗提供理論基礎。

1 材料與方法

1.1 迷迭香酸靶點的篩選

檢索中藥系統藥理學數據庫和分析平臺（TCMSP，http://tcmspw.com/tcmsp.php）、比較毒理學數據庫（CTD，https://ctdbase.org/）獲取迷迭香酸的預測靶點信息，利用UniProt數據庫（https://www.uniprot.org/）對靶點進行標準化處理。去除重復后篩選得到迷迭香酸的靶點。

1.2 子宮內膜癌相關靶點的檢索

以“endometrial carcinoma”“endometrial cancer”為檢索詞，通過GeneCards數據庫（https://www.genecards.org/）和DisGeNET數據庫（http://www.disgenet.org/）獲取子宮內膜癌的作用靶點。將所有靶點去重后得到子宮內膜癌的靶點。

1.3 迷迭香酸治療子宮內膜癌的關鍵靶點網絡構建

將“1.1”中迷迭香酸的預測靶點與“1.2”中子宮內膜癌的相關靶點取交集，得到迷迭香酸治療子宮內膜癌的交集靶點。將交集靶點輸入STRING 11.5在線數據庫（https://string-db.org/cgi/input.pl）對靶點間蛋白相互作用（protein-protein interaction，PPI）進行分析。物種選擇“Homo sapiens”，其他參數保持默認設置，從而得到PPI可視化網絡圖。……