中央紅軍主力長征后,在中共蘇區中央分局書記項英和中央政府辦事處主任陳毅等領導下,江西、福建、閩贛、贛南、閩浙贛5 個軍區(含閩北軍分區)及各直屬的地方獨立部隊與紅24 師和紅10 軍繼續堅持斗爭。
1934 年秋至1935 年春,國民黨軍以20 多個師共20 余萬人的兵力繼續向中央蘇區進攻,紅軍和游擊隊在陣地防御作戰中損失很大,蘇區內的全部縣城和大部分鄉村被占領。1935 年2 月,根據中國共產黨中央委員會關于徹底轉變組織方式與斗爭方式的指示,蘇區中央局決定所屬機關和部隊分九路突圍。在突圍中部隊大部損失,余部分別到達閩西、閩贛、贛粵邊和湘南地區。項英和陳毅幾經周折于3 月底到達贛粵邊游擊區的中心油山。5 月,原中央蘇區全部失陷。與此同時,其他各地區的中共黨組織和紅軍游擊隊,也都遭受了很大損失,并先后與中共中央和中央分局失掉聯系,形成各游擊區各自為戰、獨立堅持的局面。各游擊區的紅軍游擊隊在當地共產黨組織的領導下,緊緊依靠人民群眾,利用各種有利地形,與國民黨軍和地方保安團隊的持續清剿進行斗爭。
從1934 年秋至1937 年冬,各游擊區盡管情況各異,但大體上都經歷了以下三個階段:
1934 年秋至1935 年春,是實現由正規戰向游擊戰、由蘇區斗爭方式向游擊區斗爭方式的戰略轉變階段。在這個階段,原中央蘇區和閩浙贛、閩北、閩東、湘鄂贛、湘贛和鄂豫皖等蘇區,均先后變成了游擊區,其所屬紅軍和游擊隊在國民黨軍的重兵圍剿下,遭受到嚴重損失。但經過艱苦曲折的斗爭,最終都堅持了下來,或根據中共中央指示完成了戰略轉變或在實際斗爭中逐漸認識并實現了這一轉變。
1935 年春至1936 年冬,是以分散的游擊戰與國民黨的清剿相對抗的最艱苦的階段。在這個階段,各游擊區遭到嚴重摧殘,但游擊隊在當地中共黨組織的領導下,依托高山密林,在人民群眾支援與掩護下, 與國民黨軍和地方當局實行的軍事清剿、政治清剿、經濟清剿進行斗爭。由于采取相應的斗爭策略和運用靈活機動的戰略戰術,加上廣大游擊戰士的英勇奮斗從而渡過了種種難關,使紅軍游擊隊得以保存,并有所發展。
1936 年冬至1937 年冬,是各游擊區的黨組織和紅軍游擊隊執行中共中央抗日民族統一戰線新政策,實現由國內戰爭向抗日民族戰爭的戰略轉變階段。在這個階段,紅軍游擊隊一方面和國民黨推行的“北和南剿”作斗爭,不斷粉碎了國民黨軍和保安團隊的清剿,一方面又以民族利益為重,同當地國民黨軍政當局進行停止內戰、共同抗日的和平談判。
1937 年10 月,根據中國共產黨和中國國民黨兩黨中央達成的協議,除瓊崖紅軍游擊隊外,其他14 個游擊區的紅軍游擊隊先后下山,改編為國民革命軍新編第四軍(簡稱“新四軍”),葉挺任軍長,項英任副軍長,張云逸任參謀長,袁國平任政治部主任,下轄4 個支隊,共計10300 人。瓊崖游擊區的紅軍游擊隊于1938年12 月改編為廣東省民眾抗日自衛團第14 區獨立隊。
在這三年的游擊戰中,大部分的蘇區被占領、被截斷,使得游擊隊不得不各自獨立作戰,陷于各個孤立奮斗的狀態下,并且又是以最劣等武裝的游擊隊來與挾有優良武器、數量超過我們30 倍至50 倍不等的正規軍作戰,可以說是在非常困難和最惡劣的條件下長期苦斗著,克服了無數的艱險和困苦,取得了重要的成績:一是保持了南方的許多游擊戰的支點這些支點成為抗日戰爭中的主要戰略支點;二是保持了經10 年血戰所鍛煉的武裝力量,這種力量在抗日的民族革命戰爭中成為一個堅強的力量;三是以百折不回的精神,堅持為實現共產黨抗日救國的主張而奮斗;四是紅軍主力二萬五千里的長征,創造了空前的偉大的事業,游擊隊配合主力紅軍,堅持了三年的游擊戰爭,對于中國革命在新階段的開展中,起了推動機的作用。