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東亞飛蝗pSMC重組抗原表達及多克隆抗體制備

2021-11-06 12:04:28王麒霖夏玉先
重慶理工大學學報(自然科學) 2021年10期
關鍵詞:小鼠分析

王麒霖,邱 佳,余 瑛,夏玉先

(1.重慶理工大學 藥學與生物工程學院,重慶 400054;2.重慶大學 生命科學學院,重慶 400030)

染色體結構維持蛋白(structural maintenance of chromosome,SMC)廣泛存在于從細菌到人類的生物中,是一類結構高度保守的ATP酶家族成員蛋白。SMC蛋白呈V形結構,有2條長臂,每一長臂末端都有一個ATP結合的頭部結構域,其分子結構中包括5種可識別的結構域:NH2-末端核苷三磷酸(NTP)結合結構域、鉸鏈區、2個由鉸鏈分隔的螺旋線圈和一個COOH-末端結構域[1]。

在真核細胞中,目前發現的SMC蛋白有6個(SMC1-6)[2],這些蛋白質以SMC1與SMC3、SMC2與SMC4、SMC5與SMC6的異二聚體形式與非SMC成員(Kleisin和HEAT亞基)結合行使功能[3]。 SMC與非SMC形成了3種復合物:黏著素(SMC1/3),對染色單體的黏著起關鍵作用;凝聚素(SMC2/4),促進姐妹染色單體的壓縮和后期分離;SMC5/6復合物,促進DNA修復并影響未受損細胞的染色體穩定性[4-5]。

SMC的功能絕不僅僅是維持染色體結構的完整性,它很可能還參與了多種基因的表達調控及免疫調節。Smc家族成員(包括Smc2/3/4/5)可促進LPS誘導的IL-6生成,提示Smc家族成員在促進先天免疫中的作用。其中,Smc4是炎癥固有反應的積極調節因子。Smc4通過向nemo啟動子招募H4K5ac促進NF-κB和IRF3的固有激活,通過表觀遺傳方式增強nemo的轉錄,隨后誘導促炎性細胞因子和IL的激活[6]。Smc5/6是抑制乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)轉錄的限制因子,當定位于核結構域10(ND10)時抑制HBV轉錄。HBV通過表達HBV X蛋白(HBx)來對抗這種限制,Smc5/6被降解時,HBV和HBx陰性病毒在PHH細胞中建立高水平感染,而不誘導干擾素或其他細胞因子的產生[7]。

Smc與腫瘤的發生有關。臨床病理研究表明:SMC在乳腺癌、結腸癌、肝癌等多種腫瘤組織表達[8-10],參與了癌細胞增殖、遷移、侵襲過程[11],但詳細的機制仍不清楚。與正常組織相比,肝癌組織中Smc4 mRNA和蛋白高表達。SMC4表達下調則能降低肝癌細胞的增殖[12]。與此類似,在異種移植裸鼠中,SMC2缺失抑制膀胱癌細胞增殖,促進凋亡,減少集落形成,減少腫瘤生長。SMC2的過度表達則恢復TUG1缺失細胞的生長,提示:SMC2是膀胱癌的原癌基因。因此,SMC的抑制或缺失可能對癌癥治療有潛在的意義[13]。此外,染色體結構畸變的誘發也可能與Smc直接相關。SMC蛋白在細胞周期中的重要性可以通過Smc基因在人類癌細胞系中經常發生突變這一事實進一步證實[14]。

近期的文獻報道提示:SMC也在一些炎癥性疾病中高表達,在T細胞中SMC可能參與了激活TLR和病毒引發的先天性免疫反應[6]。但人們對于SMC在免疫調節中的作用機制仍然知之甚少。本團隊最近研究發現了一種SMC在東亞飛蝗血淋巴吞噬細胞中高表達(命名為pSMC),該SMC在吞噬細胞中的功能和天然免疫中的作用有待研究。

本研究以東亞飛蝗為材料,從其血細胞中克隆了含有SMC保守結構域的pSMC249-383抗原片段,經重組表達、純化獲得了重組抗原,以該重組抗原免疫小鼠獲得了多克隆抗體,為下一步進行pSMC相關功能研究奠定了工作基礎。

1 材料和方法

1.1 材料

1.1.1試劑

Taq DNA聚合酶、dNTP、EcoR Ⅰ、Hind III、DNA連接酶均購自TaKaRa公司,Ultrapure RNA Kit(DNase I)、HiFiScript cDNA Synthesis Kit購自康為世紀公司,質粒提取試劑盒、DNA快速純化/回收試劑盒購自OMEGA試劑公司,熒光磁珠購自德國Chemicell公司,其他試劑均為國產分析純。

蛋白質純化試劑及配方:細胞裂解液:25 mmol/L NaH2PO4(pH值為8.0),0.4 mol/L NaCl,0.1%tween20,0.1 mmol/L PMSF。 平衡溶液:25 mmol/L Tris-HCl (pH值為8.0),0.4 mol/L NaCl,20 mmol/L咪唑。100 mmol/L咪唑洗脫液:25 mmol/L Tris-HCl (pH值為8.0),0.4 mol/L NaCl,100 mmol/L咪唑。400 mmol/L咪唑洗脫液:25 mmol/L Tris-HCl (pH值為8.0),0.4 mol/L NaCl,400 mmol/L咪唑。

1.1.2動物、質粒及菌株

東亞飛蝗由重慶大學基因中心提供。BALB/c小鼠購自重慶醫科大學動物中心。質粒pET30a(+)、大腸桿菌DH5α、BL21(DE3)細胞為本實驗室保存。

1.1.3pSMC序列

該序列數據來源于東亞飛蝗血淋巴轉錄組測序結果,具體的氨基酸序列如下:

DGRRPSAPAAASLPRYNSFSSDDEGQREERKT

LPEENGFLTGENSQRQRDKKKPLLEENGFTPADTS

YRQRDNKKPVIEENGFTPADTSYTSGSGSVMGRDV

GPPPPPPPRAASAMSLHLQPPPDKPDRHASTTAPE

EAGLHVSAGELLGRTHEELVLLLIQLRRQSAAVCK

AMETCHMEIEAQARFVELETPKRLEHLKKLEDLK

RHLLDLEKQYEKGKPLVNLVDNMVKLGSLYRGPS

ARERLEFNQKVQEKRLLAEERRDWDRLSPDRTQL

QAKVQQLYRLDRLLQEESSTLQSLQQDKELLERAL

AGLRHKLQNNSHFSPLEVEHFRKQQRALERELSRV

RLLLAHNSKKLEETVAENARLEQELVILRQKLQQPI

TEPGGGTAALEAELRRVQRLVGDLTRQRKQLSLQV

QQLTQQRPGAAGVSSSRGSSSMPSRKRHHSTWLVT

DLDTLETQDLGVETAVSPASSQATTATSPASTLRSP

MYTSREAGGGMEMESEVPPPLPAPPEIPPEYPPPPP

PPPPPSEEALLGPGEQYCPHVDINEADDRMKRFYG

IIPKEKQQEIKTVRIVKRESERRQRDRDRSGNIGIPL

TNGGVSTGKRPSAADESEIANSTSEVQGFQKQQLG

PVEEEVSESSRPFSETLLSASVDDDEEDDDPAIDLQ

FQRSLSLPRGFGKRERLSGAPPPPPIRSASPRGEGM

GTGTNSRQQRVRFKDGDYTSVSSSPSPSPSPSQLSP

VFKSQAARAIVQEVSQSPRKRAVPKEKRRHHTVSS

SKPLLDMESSASRMGSARSRDDLDMERALRPRRIN

APDVVRSTMSHKDFKYNENTIDSILGTPSKIIIPERYI

PEQAPELSAEEQLHRLKKAEAIRKMLSETSAISASE

GIEEEHQTATLKKKVAAEKRQREHLLQLNQLLAR

QQVMEKSKVVAGSTCAPTME

1.2 pSMC基因的生信分析

采用NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)的BLASTp進行pSMC序列結構分析,亞細胞定位采用Euk-mPLoc 2.0(http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/euk-multi-2/#)分析,抗原表位采用(http://imed.med.ucm.es/Tools/antigenic.pl)網站工具進行分析。

1.3 pSMC抗原擴增引物設計

采用Primer Premier5設計引物,序列分別為,F引物:5′-GCAGAATTCCAGAAGGTCCAGGAGAAACG-3′;R引物:5′-CTCAAGCTTTCATGGCTCTGTTATTGGCTGT-3′。

1.4 蝗蟲血淋巴總RNA的提取與pSMC基因的擴增

用RNA試劑盒提取東亞飛蝗成蟲血淋巴總RNA,按試劑盒說明進行反轉錄獲得cDNA。

pSMC249-383PCR擴增條件:94 ℃預變性5 min;94 ℃ 30 s,56 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,35個循環;72 ℃ 7 min。擴增結束后用瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產物。

1.5 pET30a(+)-pSMC249-383原核表達載體的構建

將得到的PCR產物回收純化,純化的PCR產物和pET30a(+)質粒分別用EcoR Ⅰ、Hind III進行雙酶切處理。酶切后的PCR產物和pET30a(+)質粒用T4DNA連接酶連接,轉化DH5α感受態細胞。用含卡拉霉素的LB轉化平板篩選轉化子。挑取單克隆進行菌落PCR鑒定、質粒酶切鑒定、DNA測序分析,篩選鑒定pET30a(+)-pSMC249-383重組質粒。

1.6 重組pSMC249-383的原核表達及純化

將鑒定序列正確的重組質粒,轉入大腸桿菌BL21(DE3)中,在37℃下誘導培養,待OD600至0.6~0.8時,加入IPTG(1 mmol/L)誘導表達5 h,SDS-PAGE確定重組蛋白的表達形式,超聲破碎法破胞。從1L發酵液中收獲菌體,用PBS(含1mmol/L PMSF)10 mL制備菌懸液,超聲條件為80 Hz,超聲5 s,間隔5 s,總時間30 min。超聲至溶液透明,高速離心收集上清液,用Ni-NTA柱對上清液中的目的蛋白進行純化,SDS-PAGE檢測目的蛋白純度,BCA試劑盒測定蛋白濃度。

1.7 Anti-SMC抗體制備及pSMC的細胞定位

對純化后的重組pSMC249-383蛋白進行SDS-PAGE電泳,用1 mol/L氯化鉀染色,切下含有目的蛋白的膠條,然后用超純水洗滌脫色,在膠條透明無色后,加入液氮研磨,用PBS重懸,注射BALB/C小鼠腹腔進行免疫,免疫劑量為每只小鼠每次100 ug pSMC249-383蛋白,免疫周期為2周1次,3次免疫后對小鼠進行尾部采血測定血清效價,當效價大于5 000時,收獲血清。

pSMC的細胞定位采用免疫熒光法檢測。向東亞飛蝗體內注射紅色熒光標記的納米磁珠,3 h后采血,制作血涂片。血涂片于37 ℃干燥1 h,PBS洗5 min,重復3次;用4%多聚甲醛固定30 min,PBS洗3次;0.3% Triton X-100處理5 min,PBS洗3次;加封閉液(PBS含3%BSA), 37 ℃,封閉1 h,PBS洗3次;加PBS稀釋的血清(1∶1 000),4 ℃孵育過夜,PBS洗3次;加FITC標記的兔抗鼠二抗,37 ℃孵育1 h,PBS洗3次;加入10倍稀釋后的DAPI處理2 min,PBS洗3次。熒光顯微鏡觀察并拍照,采集圖像軟件為OLYMPUS CellSens Standard 1.14。

2 結果與分析

2.1 pSMC基因的生物信息學分析

2.1.1結構域分析

在NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov)中對SMC蛋白質結構進行分析。結果(圖1)顯示:pSMC蛋白由933個氨基酸殘基組成,SMC保守結構域主要分布在第200-422區段。

圖1 pSMC結構域分析示意圖

2.1.2蛋白質的亞細胞定位

對pSMC氨基酸序列進行在線分析(http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/euk-multi-2/#),結果顯示pSMC蛋白定位于細胞質和細胞核。

2.1.3抗原表位分析

在線分析(http://imed.med.ucm.es/Tools/antigenic.pl) pSMC蛋白的抗原表位。

結果(圖2)顯示:pSMC蛋白在N端50-450肽段的抗原表位最為豐富。本研究選擇pSMC的249-383肽段作為pSMC抗原區段進行克隆,將該片段命名為pSMC249-383。

圖2 pSMC蛋白抗原表位分析曲線

2.2 蝗蟲血淋巴總RNA的提取和pSMC249-383片段的擴增

用RNA提取試劑盒提取蝗蟲血淋巴總RNA,瓊脂糖凝膠電泳(圖3(a))顯示RNA條帶完整,無降解,且RNA的OD260/OD230值和OD260/OD280值均大于1.8,表明提取的RNA純度較高,適合作為擴增模板。

將提取的總RNA用反轉錄試劑盒合成cDNA第一鏈,以此為模板對pSMC249-383片段進行擴增,電泳檢測結果表明擴增產物大小約為405bp(圖3(b)),與預期的片段長度符合。

a.蝗蟲血淋巴總RNA提取.M:DL2000 DNA marker;1-2:蝗蟲血淋巴總RNA;b.pSMC249-383的PCR.M:DL2000 DNA marker;1:pSMC249-383的PCR產物圖3 pSMC249-383片段擴增圖

2.3 pET30a(+)-pSMC249-383原核表達質粒的構建

擴增的pSMC249-383和pET30a(+)質粒分別用EcoRI和HindIII進行雙酶切,然后回收純化、連接。將連接產物轉化DH5α感受態細胞,對轉化子進行菌落PCR鑒定,得到陽性菌落的電泳條帶大小約405bp(圖4(a))。

對菌落PCR鑒定為陽性的克隆進行過夜培養,提取其質粒,用EcoR I和 Hind III酶切處理。結果顯示該質粒含有目的條帶(圖4(b)),為重組質粒。對此重組質粒的DNA測序結果顯示:插入片段為pSMC249-383,表明pET30a(+)-pSMC249-383重組表達載體構建成功。

a.轉化子的菌落PCR鑒定.M:DL2000 DNA marker;1-2:轉化子PCR產物; b.重組質粒pET30a(+)-pSMC249-383的酶切鑒定.M:DL2000 DNA marker;1:EcoR I 和 Hind III 酶切重組pET30a(+)-pSMC249-383;N:DL10000 DNA marker圖4 pET30a(+)-pSMC249-383重組質粒鑒定圖

2.4 pSMC249-383重組蛋白表達形式分析

將構建成功的pET30a(+)-pSMC249-383重組質粒轉化BL21(DE3),在LB培養基中進行發酵培養,經IPTG誘導后分離發酵液中的菌體。菌體經超聲破碎后,分離上清與沉淀,進行SDS-PAGE電泳。電泳結果(圖5)顯示:pSMC249-383重組蛋白大量存在于裂解上清中,在沉淀中較少。說明pSMC249-383重組蛋白在BL21(DE3)中主要為可溶性表達。用電泳法測定的pSMC249-383重組蛋白分子量大小為21.8KD,與預期一致。

2.5 pSMC249-383重組蛋白的純化

培養1L pET30a(+)-pSMC249-383/BL21(DE3)發酵液,取誘導培養后菌體的裂解上清,用Ni親和層析技術[11-12]純化pSMC249-383重組蛋白,對純化過程中的洗脫樣品用SDS-PAGE電泳進行檢測(圖6)。

M:蛋白質分子量marker;1:pET30a(+)-pSMC249-383/BL21裂解上清;2:穿柱液;3-4:20mM/L咪唑洗脫液;5-7:100mM/L咪唑洗脫液;8:400mM/L咪唑洗脫液圖6 SDS-PAGE檢測pSMC249-383蛋白純化圖

結果顯示pSMC249-383重組蛋白能較好地被Ni柱吸附,用100 mmol/L咪唑溶液洗去非特異性結合蛋白,再用400 mmol/L咪唑溶液洗脫目的蛋白,可獲得純度較高的重組pSMC249-383蛋白。image J軟件分析顯示pSMC249-383重組蛋白純度為80%,濃度為1.98 μg/μL,1 L發酵液可獲得純化后pSMC249-383重組蛋白約20 mg。

2.6 pSMC的抗血清制備與pSMC249-383的亞細胞定位

用SDS-PAGE分離純化后的pSMC249-383蛋白,切取含有pSMC249-383蛋白條帶的膠條,粉碎膠條制成懸液免疫小鼠,ELISA法檢測顯示獲得的pSMC249-383抗血清效價大于1∶64 000。

采用免疫熒光技術檢測pSMC在東亞飛蝗血淋巴細胞中的定位。結果(圖7)顯示:pSMC主要分布于細胞核,且吞噬了紅色熒光磁珠的吞噬細胞細胞核中pSMC信號較其他細胞更強,表明pSMC定位于細胞核,在吞噬細胞中高表達。

FITC:FITC標記的羊抗鼠二抗;Magnetic beads:紅色熒光標記的納米磁珠;Merge:紅綠通道疊加圖7 pSMC在蝗蟲血淋巴細胞中的定位分析圖

3 多克隆抗體制備

本研究采用原核pET系統成功克隆并表達了pSMC249-383抗原,用該重組表達的抗原免疫小鼠獲得了高效價的抗血清。一般來說,制備多克隆抗體比單克隆抗體過程簡單,周期更短,多克隆抗體靈敏度更高,但特異性通常不如單克隆抗體好[15]。本研究通過對pSMC的核酸、蛋白序列進行生物信息學分析,選取其抗原表位豐富且特異性較好的區段進行克隆,獲得了免疫原性及特異性均較好的重組抗原pSMC249-383。該重組抗原在大腸桿菌中以包含體形式表達,不僅表達量高,且因帶有6×His標簽純化方便[16]。為了獲得高純度抗原,本研究對Ni親和層析純化的目的蛋白進行SDS-PAGE電泳,從凝膠中切取含目的蛋白條帶的凝膠膠條,用于免疫小鼠。該方法不僅簡化了獲得高純度目的蛋白的純化步驟,而且凝膠在免疫過程中充當了佐劑的作用[17-18],能有效增強小鼠的免疫應答。本實驗使用該方法在3次免疫后SMC多克隆抗體血清效價達1∶64 000,表明該方法便捷且省時高效。

4 結論

對pSMC的序列分析顯示,pSMC中含有核定位信號序列;免疫熒光檢測結果顯示,pSMC在東亞飛蝗血淋巴吞噬細胞高表達,且定位于細胞核。由于吞噬細胞為天然免疫細胞,SMC在DNA復制、基因表達調控中至關重要,pSMC在吞噬細胞中如何維持DNA穩態,影響或調控天然免疫相關過程值得關注。

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