134例新型冠狀病毒肺炎患者的細菌檢測結果分析*

楊陽，張靜，吳秋月，王長軍，賈雷立，夏欣一，4，王文兵

(1.江蘇大學醫學院，江蘇鎮江212000；2.東部戰區總醫院全軍檢驗醫學研究所，南京210000；3.解放軍疾病預防控制中心，北京100071；4.火神山醫院檢驗科，武漢430000)

新型冠狀病毒感染后繼發細菌感染是一個重要的死亡危險因素。據統計國內外多家醫院的合并感染情況的綜述報道，62/806(8%)新型冠狀病毒肺炎患者在住院期間發生細菌/真菌共感染[1]。同時有研究報道，136例新型冠狀病毒肺炎患者中有44例患者(32.4%)診斷為繼發細菌性肺炎[2]。本研究旨在比較細菌檢出陽性組和陰性組的臨床特征差異，統計新型冠狀病毒肺炎患者中疑似細菌感染者的菌群組成情況，為臨床抗菌藥物的使用包括經驗性治療提供指導。

1 資料與方法

1.1一般資料 選取2020年2月11日至2020年4月9日入住武漢火神山醫院134例新型冠狀病毒肺炎患者，所有患者均按照國家衛生健康委員會發布的新型冠狀病毒肺炎診斷和治療指南(第3版—第7版)中的診斷標準收治，并經實時熒光定量PCR檢測病毒核酸確認。其中，包括51例普通型患者，65例重型患者，18例危重型患者。

1.2主要試劑與儀器 3D全自動血培養儀、Vitek 2 Compact全自動微生物鑒定及藥敏分析系統和配套試劑(生物梅里埃公司)，呼吸道病原菌核酸檢測試劑盒(批號20180901)、Rtisochip-A恒溫擴增微流控芯片核酸分析儀(博奧晶典公司)。

1.3標本采集 在抗菌藥物使用前或停藥1周后進行標本采集。(1)痰液標本：經清水漱口后自呼吸道深部用力咳出的第一口痰，對于無法自行咳痰的患者可采用誘導法或吸出法，留取量要求大于1 mL，置于帶蓋的無菌容器中2 h內送檢，不能及時送檢的標本置2～8 ℃保存不超過72 h。涂片鏡檢觀察痰液標本質量，痰標本中鱗狀上皮細胞<10個/低倍視野、白細胞>25個/低倍視野為合格標本。(2)全血標本：采集后注入厭氧/需氧血培養瓶內，立即送檢。(3)咽拭子：用無菌棉拭子越過舌根擦拭咽后壁或腭弓兩側，取出后插入無菌試管，2 h內送檢。(4)肺泡灌洗液：通過纖維支氣管鏡采集，留取3 mL以上的標本，2 h內送檢。(5)肺組織標本：用外科手術方法取適量標本，2 h內送檢。

1.4方法 采用2種微生物檢測方法，包括傳統的細菌培養法和恒溫擴增芯片法，其中細菌培養法29例，基因芯片法104例，細菌培養法加基因芯片法1例。

1.4.1細菌培養 檢測標本類型包括痰液、全血。痰標本接種于血瓊脂平板、巧克力瓊脂平板、麥康凱瓊脂平板，置于5%CO2、35 ℃培養24 h，若無病菌生長，應繼續培養24 h。厭氧/需氧血培養瓶置于3D全自動血培養儀進行培養，陽性報警瓶卸載后需進行涂片染色與轉種。在培養后的細菌平板中挑取單菌落制備為0.5麥氏濃度單位的菌懸液，使用Vitek 2 Compact全自動微生物鑒定與藥敏分析儀及配套試劑進行鑒定與藥敏分析。

1.4.2恒溫擴增芯片法 檢測標本類型包括咽拭子、痰液、灌洗液及肺組織。采用恒溫擴增技術對病原菌特異性靶基因進行擴增，1.5～2.5 h內完成對呼吸道常見13種病原菌(肺炎鏈球菌、耐甲氧西林葡萄球菌、大腸埃希菌、金黃色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、肺炎支原體、肺炎衣原體、流感嗜血桿菌、銅綠假單胞菌、鮑曼不動桿菌、嗜麥芽窄食單胞菌、結核分枝桿菌復合群、嗜肺軍團菌)的檢測。按試劑盒說明書進行操作及結果判讀。

2 結果

2.1患者臨床基本資料 134例確診患者中，細菌檢測陽性者20例，陰性者114例。細菌檢測陽性組男9例，女11例；陰性組的男、女各57例。兩組患者的年齡差異無統計學意義(P>0.05)。細菌檢測陽性組的危重癥患者比例和接受機械通氣治療的比例高于陰性組，且平均住院天數較長(P>0.05)。細菌檢測陽性組患者入住ICU的比例高于陰性組患者(P<0.05)，且陽性組的死亡率達15.0%，也顯著高于陰性組患者(P<0.05)。見表1。

表1 細菌檢測陽性者與陰性者的臨床基礎資料

2.2菌群組成、標本類型 20例細菌檢測陽性患者中，16例患者均檢測到1種細菌，包括4例耐甲氧西林葡萄球菌、4例流感嗜血桿菌、3例肺炎克雷伯菌、2例鮑曼不動桿菌、2例嗜麥芽窄食單胞菌及1例金黃色葡萄球菌。4例患者檢測到2種細菌，包括2例肺炎克雷伯菌和鮑曼不動桿菌、1例肺炎克雷伯菌和大腸埃希菌、1例耐甲氧西林葡萄球菌和大腸埃希菌。以上20例檢出者的標本類型與檢測方法見表2。

表2 菌群組成、標本類型及檢測方法

3 討論

目前研究表明，新型冠狀病毒肺炎合并細菌感染的發生率各有差異，統計結果不同主要由于各研究納入的普通型、重型、危重型患者比例有所差別。危重癥患者繼發細菌感染比例可達到普通型患者繼發細菌感染比例的3倍之多[3]，且發生繼發性細菌感染患者的死亡率遠高于非危重癥患者[4]。本研究結果表明，約15%的患者存在疑似細菌感染，疑似細菌感染者的ICU入住率和病死率顯著高于非細菌感染者。總之，新型冠狀病毒肺炎合并疑似細菌感染的發生率多數集中在10%～20%，低于以往的中東呼吸綜合征冠狀病毒、非典型肺炎病毒等合并細菌感染的發生率[5-6]。

在菌群分布方面，新型冠狀病毒肺炎合并疑似細菌感染位列前三位的菌種依次是肺炎克雷伯菌、耐甲氧西林葡萄球菌及流感嗜血桿菌，與非典型肺炎病毒相比，耐甲氧西林葡萄球菌的感染率有所上升[7]。盡管臨床抗菌藥物治療在新型冠狀病毒肺炎患者中較為廣泛，但危重患者中疑似細菌感染的發生率及死亡率仍高居不下。一方面，非抗菌藥物相關危險因素，包括患者基礎疾病情況、糖皮質激素治療、有創機械通氣、留置血管導管、入住重癥醫學科等，均為引起繼發性細菌感染的危險因素。因此，對有上述危險因素的患者應格外注意動態監測和接觸保護，對疑似細菌感染者應結合臨床癥狀與實驗室指標(包括降鈣素原水平)進行綜合分析[8]。另一方面，抗菌藥物相關危險因素，包括使用碳青霉烯類、頭孢菌素類、喹諾酮類、糖肽類抗菌藥物，聯合使用β-內酰胺類抗菌藥物與β-內酰胺酶抑制劑，住院之前的抗菌藥物暴露，使用抗菌藥物的種類及時間等。第六版診療方案明確提出避免盲目或不恰當使用抗菌藥物，尤其是聯合使用廣譜抗菌藥物。除此之外，還應考慮抗菌藥物副作用與患者基礎疾病之間的關系，例如大環內酯類、四環素類和喹諾酮類中的一些藥物可以延長心臟QT間期，對患有心臟疾病的患者可能會增加其死亡風險，因此，抗菌藥物的治療效果與潛在風險必須仔細權衡。

本研究納入的樣本總量有限，標本多數為咽拭子，這可能低估或高估了新型冠狀病毒肺炎患者中疑似細菌感染的發生率，后續仍需多中心大樣本研究予以驗證。細菌培養法和基因芯片法的檢出結果只能說明樣本中存在相應細菌，該菌是否為真正致病菌首先需要結合患者的臨床指標和臨床表現進行綜合判斷，如白細胞計數、中性粒細胞計數、C反應蛋白及發熱類型等，而病毒感染與細菌感染在這幾項指標上均有不同甚至相反的表現，大大增加了確診細菌感染的難度。其次，要結合標本類型及菌種類型進行判斷，如咽拭子和痰液標本中常見的正常定植菌有甲型鏈球菌、卡他球菌、表皮葡萄球菌、乳桿菌等，若檢出肺炎鏈球菌、肺炎克雷伯菌、流感嗜血桿菌、金黃色葡萄球菌、大腸埃希菌等條件性致病菌且患者有細菌感染的癥狀，則可進行經驗性抗菌藥物治療；而無菌部位如血液、灌洗液、肺組織中若檢出細菌則可考慮為致病菌。繼續監測細菌檢出率及菌群分布變化將為臨床抗菌藥物的使用提供理論依據，對于提升危重癥患者的臨床救治率及進一步降低死亡率具有重要意義。