2018年貴州省南北部地區(qū)艾滋病感染者抗病毒治療前HIV-1基因亞型和耐藥情況研究

方星 張信輝 邢輝 楊曉慧 趙明伍 柳興鳳

(1.貴州省疾病預(yù)防控制中心/實驗中心，貴州 貴陽 550004；2.中國疾病預(yù)防控制中心/性病艾滋病預(yù)防控制中心，北京 102206；3.黔南州疾病預(yù)防控制中心，貴州 都勻 558000；4.遵義市疾病預(yù)防控制中心，貴州 遵義 563000；5.遵義醫(yī)科大學(xué)/貴州省普通高等學(xué)校腦科學(xué)特色重點實驗室，貴州 遵義 563000)

全球擴大抗逆轉(zhuǎn)錄病毒治療(antiretroviral therapy，ART)通過有效抑制 HIV 感染者體內(nèi)病毒的復(fù)制導(dǎo)致HIV-1 發(fā)病率和病死率大幅下降，使艾滋病成為慢性可治療的疾病[1-2]。隨著我國艾滋病ART工作的快速推廣和ART人數(shù)的增長，以及藥物的有限選擇下，HIV耐藥株的問題已經(jīng)日益凸顯，特別是在貴州省長期實施ART后，ART前的原發(fā)耐藥值得關(guān)注。而我省之前主要關(guān)注治療后的獲得性耐藥，所以本研究對2018年1—12月貴州省南北部地區(qū)(黔南州、遵義市)ART前388名新發(fā)現(xiàn)的HIV感染者進(jìn)行耐藥檢測，對其HIV-1耐藥基因型和耐藥株的流行水平進(jìn)行分析，為控制HIV耐藥株的流行提供參考依據(jù)。

1 對象與方法

1.1研究對象 2018年貴州省南北部地區(qū)(黔南州、遵義市)1—12月開始抗病毒治療前、年齡≥18歲的新發(fā)現(xiàn)HIV感染者，在提供書面知情同意書后，按初始的ART時間先后順序入組，收集流行病學(xué)資料，并采集ART前的抗凝靜脈血并分離血漿，運送到貴州省艾滋病確證中心實驗室。

1.2檢測方法 采用in-house方法進(jìn)行耐藥檢測。使用 MagNA Pure LC 全自動核酸提取儀和 MagNA Pure LC Total Nucleic Acid Isolation Kit(德國，Roche)提取血漿RNA。用 One Step RNA PCR Kit(AMV)(日本，Takara)和引物 MAW26、RT21(北京，天一輝遠(yuǎn))進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄和巢式PCR 擴增pol基因區(qū)，引物序列見表1。瓊脂糖凝膠電泳鑒定目的片段1.3kb后，送北京天一輝遠(yuǎn)生物科技有限公司進(jìn)行PCR 產(chǎn)物純化、測序、序列拼接和校對。

表1 耐藥基因檢測引物序列

1.3基因型、耐藥程度分析 將得到包括蛋白酶區(qū)1～99氨基酸和逆轉(zhuǎn)錄酶區(qū)1～300氨基酸的pol基因區(qū)序列，提交美國斯坦福大學(xué)的網(wǎng)絡(luò)HIV數(shù)據(jù)庫進(jìn)行基因型分析、耐藥性突變位點分析和對各種抗病毒藥物的耐受程度分析，對任何一種藥物出現(xiàn)低度及以上耐藥即判斷為基因型耐藥。

2 結(jié) 果

2.1調(diào)查對象的基本特征 共調(diào)查2018年1—12月貴州省南北部黔南州和遵義市抗病毒治療前、年齡≥18歲的新發(fā)現(xiàn)HIV感染者388例，并采集抗凝血樣。經(jīng)提取、擴增和測序，獲得341例pol區(qū)基因片段。其中，納入對象性別比為234/107(男/女)，年齡18～83歲，平均(48.94±14.96)歲，漢族與少數(shù)民族比例為 237/104。調(diào)查時CD4+T淋巴細(xì)胞≤200個/μL占30.5%(104/341)，201～350個/μL占25.81%(88/341)，351～500個/μL占15.54%(53/341)，>500個/μL占6.61%(21/341)，缺失CD4+T淋巴細(xì)胞的占21.99%(75/341)。病毒載量檢測比例為61.58%(210/341)，病毒載量≤1 000 copies/mL占1.17%(4/341)，1 001～100 000 copies/mL占31.09%(106/341)，>100 000 copies/mL占29.33%(100/341)。婚姻狀況，未婚者占16.42%(56/341)，已婚或同居者占50.15%(171/341),離婚或喪偶者占31.67%(108/341)。傳播途徑以異性傳播為主(94.43%，322/388)，同性傳播占3.81%(13/341)。見表2。

表2 341例獲得pol區(qū)基因片段HIV感染者的基本情況[n(%)]

2.2研究對象HIV-1基因亞型的分布情況 在得到的341份pol區(qū)基因片段中，發(fā)現(xiàn)8種HIV-1基因型,其中占比最多的基因型是CRF01_AE(54.55%,186/341)，其次為CRF07_BC(27.57%,94/341)和CRF08_BC (12.90%,44/341)，其他亞型還包括CRF55_01B以及A、B、C、D亞型。

2.3研究對象HIV-1耐藥發(fā)生情況 發(fā)現(xiàn)耐藥突變的比例為12.02%(41/341)，包括NRTIs耐藥突變1.76%(6/341)，ABC、FTC、3TC耐藥分別達(dá)0.88%(3/341)，HIV耐藥突變位點；NNRTIs相關(guān)耐藥突變9.68%(33/341)，其中，EFV耐藥占7.33%(25/341)、NVP耐藥占9.09%(31/341)；PIs耐藥突變占1.17%(4/341)，HIV耐藥突變位點。發(fā)生NRTIs和NNRTIs、NNRTIs和PIs交叉耐藥分別占0.29%(1/341)。耐藥基因突變主要與非核苷反轉(zhuǎn)錄酶抑制劑 (NNRTIs)(33/341，9.68%)有關(guān)。V179(18/341，5.28%)是其中較突出的突變位點，其次為V106(7/341，2.05%)、E138(6/341,1.76%)。見表3。

表3 41例HIV-1感染者耐藥特征分析

3 討 論

HIV耐藥株的出現(xiàn)使感染者ART的效果下降，同時耐藥株在未治療人群中的傳播和流行也給ART的長期實施增加障礙。本研究對2018年1—12月貴州省南北部地區(qū)(黔南州、遵義市)ART前388名新發(fā)現(xiàn)的HIV感染者進(jìn)行耐藥檢測，對得到的341份pol區(qū)基因片段的HIV-1耐藥基因型和耐藥突變的流行水平進(jìn)行分析研究。

在亞型的分布上，貴州省HIV以CRF01_AE為主，占54.55%，其次為CRF07_BC和CRF08_BC，也有多種其他亞型(CRF55_01B以及A、B、C、D亞型并存)，這與柳興鳳等人的2013-2017年貴州省艾滋病患者HIV亞型分布研究[3]結(jié)果一致，也與我省以性傳播流行毒株亞型相符合[3-4]。

貴州省2009年及2015年的HIV耐藥警戒線調(diào)查顯示耐藥率分別為0、3.5%，均小于5%，為低流行水平[5-6]。而此次調(diào)查發(fā)現(xiàn)HIV耐藥株的比例為12.02%，根據(jù)WHO耐藥監(jiān)測指南的標(biāo)準(zhǔn)，已達(dá)到中度耐藥水平，耐藥為單重耐藥與多重耐藥并存，并且已發(fā)現(xiàn)有PI類藥物的原發(fā)耐藥，類型復(fù)雜多樣，因此應(yīng)重點關(guān)注當(dāng)?shù)豀IV耐藥株的流行，這可能與擴大ART的覆蓋面積產(chǎn)生的耐藥株有關(guān)。耐藥基因突變主要與非核苷反轉(zhuǎn)錄酶抑制劑(NNRTIs)有關(guān)，V179是NNRTIs出現(xiàn)最多的突變位點，其次為V106、E138，這與目前使用一線的ART方案實施情況相符。

綜上所述，HIV耐藥株在貴州省南北部地區(qū)新發(fā)現(xiàn)的艾滋病感染者中出現(xiàn)中度流行，類型復(fù)雜，因此應(yīng)適時在省內(nèi)全面開展治療前的耐藥監(jiān)測，以減少原發(fā)耐藥毒株的產(chǎn)生和傳播。