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百藥煎不同菌種發(fā)酵品特征性成分差異比較及潛在分子作用機(jī)制探討

2021-09-23 09:10:28王瑞生曹文文張江山張振凌陳祎甜
中草藥 2021年18期
關(guān)鍵詞:信號(hào)

王瑞生,曹文文,張江山,張振凌,3*,陳祎甜

1.河南中醫(yī)藥大學(xué),河南 鄭州 450008

2.河南省中藥特色炮制技術(shù)工程研究中心,河南 鄭州 450008

3.呼吸疾病中醫(yī)藥防治省部共建協(xié)同創(chuàng)新中心,河南 鄭州 450008

百藥煎為五倍子同茶葉、酵曲等經(jīng)發(fā)酵制成的塊狀物,有潤(rùn)肺化痰、止血止瀉、解熱生津的功效[1]。臨床記載了百藥煎在中成藥中的應(yīng)用,如其組成的金霜煎、結(jié)腸安膠囊、清咽丸等。李時(shí)珍曰[2]“百藥煎功與五倍子不異。但經(jīng)釀造,其體輕虛,其性浮收,且味帶余甘……含噙尤為相宜”。相較于條件有限且質(zhì)量波動(dòng)較大的傳統(tǒng)自然發(fā)酵,現(xiàn)代發(fā)酵法已經(jīng)針對(duì)影響百藥煎發(fā)酵質(zhì)量的相關(guān)因素,如菌種、基質(zhì)和溫濕度等進(jìn)行了研究和改良[3-8],使其炮制工藝和飲片質(zhì)量得到了較大改善。本課題組在前期研究中[9-11]利用微生物分離鑒定技術(shù)于傳統(tǒng)發(fā)酵過(guò)程中分離篩選出了五倍子發(fā)酵百藥煎的3種優(yōu)勢(shì)菌種/群:黑曲霉Aspergillus niger(BYJ.H-1)、米根霉Rhizopus oryzae(BYJ.G-1)和蠟樣芽孢桿菌Bacillus cereus(HMB2)、巨大芽孢桿菌菌株Bacillus megaterium(HMB5)、伯頓絲孢畢赤酵母Burton Pichia pastoris(HMY1)、克魯維酵母菌株Kluyveromyces(HMY2)4菌混合菌群,并在恒溫恒濕條件下分別進(jìn)行發(fā)酵,均可以得到五倍子的發(fā)酵品百藥煎,且主要指標(biāo)成分沒食子酸的含量都可以達(dá)到≥35%的要求[12]。但百藥煎在發(fā)酵過(guò)程中的物質(zhì)基礎(chǔ)變化涉及到酚類、酯類和兒茶素類等多種化學(xué)成分[13],不同菌種對(duì)其發(fā)酵質(zhì)量的影響是否存在較大差異尚不明確,僅依據(jù)現(xiàn)行標(biāo)準(zhǔn)中的單一指標(biāo)判斷上述發(fā)酵品間的差異性有所片面,有必要根據(jù)其發(fā)酵過(guò)程中的特征性成分的變化進(jìn)一步分析。

百藥煎對(duì)于呼吸及消化系統(tǒng)的治療和調(diào)理依賴于自身多種物質(zhì)基礎(chǔ)的協(xié)同作用[14-15],但目前有關(guān)百藥煎的物質(zhì)基礎(chǔ)和藥理作用研究較少,使其功效作用機(jī)制研究難以深入到細(xì)胞分子層面。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)[16]是一種基于大數(shù)據(jù)時(shí)代背景下融合系統(tǒng)生物學(xué)、分子生物學(xué)、藥理學(xué)以及多種網(wǎng)絡(luò)計(jì)算平臺(tái)的新興學(xué)科,可以在臨床研究前實(shí)現(xiàn)跨微觀(分子、生化網(wǎng)絡(luò))到宏觀(組織、器官)的多層次理論模擬和分析,從而系統(tǒng)、動(dòng)態(tài)地研究模型內(nèi)多個(gè)元素(藥物分子、靶標(biāo)、細(xì)胞、組織、器官等)之間的相互作用,從可視化角度闡釋中藥多分子、多靶點(diǎn)、多途徑的功效作用機(jī)制。

本實(shí)驗(yàn)在前期研究基礎(chǔ)上,以五倍子發(fā)酵百藥煎過(guò)程中2種新產(chǎn)生的成分2,4,6-三-O-沒食子酰-β-D-葡萄糖(2,4,6-tri-O-galloyl-β-D-glucose,TGβG)和2,4,6-三-O-沒食子酰-α-D-葡萄糖(2,4,6-tri-O-galloyl-α-D-glucose,TGαG)及2種升高成分沒食子酸和表沒食子兒茶素(epigallocatechin,EGC)的HPLC峰面積為指標(biāo),采用主成分分析-聚類分析(principal component analysis-cluster analysis,PCA- CA)法對(duì)比3種不同菌種/群發(fā)酵品的差異;同時(shí)結(jié)合實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)和網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法對(duì)百藥煎“清熱化痰、止血止瀉、解熱生津”功效的潛在分子作用機(jī)制進(jìn)行探究,為百藥煎的發(fā)酵炮制、質(zhì)量控制、臨床應(yīng)用和飲片開發(fā)提供參考。

1 儀器和材料

1.1 儀器

2487型高效液相色譜儀,上海通微分析技術(shù)有限公司;HWS-250型恒溫恒濕培養(yǎng)箱,天津市萊玻特瑞儀器設(shè)備有限公司;SPL-250型生化培養(yǎng)箱,天津市萊玻特瑞儀器設(shè)備有限公司;LDZX-75KBS型立式壓力蒸汽滅菌器,上海申安醫(yī)療器械廠;SW- CJ-1F型單人雙面凈化工作臺(tái),上海蘇凈實(shí)業(yè)有限公司;BSA224S-CW型電子天平和BT25S型電子天平,賽多利斯科學(xué)儀器北京有限公司;400Y型高速多功能粉碎機(jī),永康市鉑歐五金制品有限公司;GZX-9070 MBE型數(shù)顯鼓風(fēng)干燥箱,上海博訊實(shí)業(yè)有限公司;KQ-500DV型數(shù)控超聲波清洗器,昆山市超聲儀器有限公司;W22型電陶爐,佛山市順德區(qū)啟偉電器有限公司。

1.2 材料及試劑

五倍子購(gòu)于安徽石田中藥飲片有限公司,批號(hào)160429,經(jīng)河南中醫(yī)藥大學(xué)張振凌教授鑒定為漆樹科植物鹽膚木Rhus chinensisMill.葉上的蟲癭,符合《中國(guó)藥典》2020年版五倍子項(xiàng)下的各項(xiàng)規(guī)定,百藥煎均為實(shí)驗(yàn)室自制,制備方法見“2.1”項(xiàng)。茶葉,綠茶,河南信陽(yáng)茶葉專業(yè)市場(chǎng),批號(hào)20160810;BYJ.G-1,實(shí)驗(yàn)室保藏,批號(hào)20180118;BYJ.H-1,實(shí)驗(yàn)室保藏,批號(hào)20190119;HMB2,實(shí)驗(yàn)室保藏,批號(hào)20180702;HMB5,實(shí)驗(yàn)室保藏,批號(hào)20180705;HMY1,實(shí)驗(yàn)室保藏,批號(hào)20180711;HMY2,實(shí)驗(yàn)室保藏,批號(hào)20180712;PDA/LB培養(yǎng)基,自制,批號(hào)20190809;沒食子酸、EGC對(duì)照品,成都普斯生物科技有限公司,批號(hào)分別為PS000688、PS0230- 0025,質(zhì)量分?jǐn)?shù)均≥99%;2,4,6-三-O-沒食子酰-D-葡萄糖(TGG,由于TGG結(jié)構(gòu)具有半縮醛,始終有α和β 2個(gè)互變異構(gòu)體存在,因此對(duì)照品是1個(gè),但是在色譜圖上有2個(gè)峰)對(duì)照品,批號(hào)20150824,自制,質(zhì)量分?jǐn)?shù)≥98.0%;三氟乙酸,上海麥克林生化科技有限公司,批號(hào)202007015,分析純;乙腈,美國(guó)Thermo公司,批號(hào)20201016,色譜純;甲醇,天津富宇精細(xì)化工有限公司,批號(hào)20200713,分析純。

1.3 數(shù)據(jù)庫(kù)及平臺(tái)

有機(jī)小分子生物活性數(shù)據(jù)庫(kù)(PubChem,https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/),中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)與分析平臺(tái)(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP,http://tcmspw.com/ tcmsp.php),蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)(UniversalProtein,Uniprot,https://www.uniprot.org/),人類基因數(shù)據(jù)庫(kù)(GeneCards-Human Genes,https://www.genecards.org/),交互式韋恩圖平臺(tái)(jvenn,http://jvenn.toulouse.inra.fr/app/example.html),功能蛋白關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)(STRING,https://string-db.org/),高通量基因組數(shù)據(jù)分析工具平臺(tái)(Bioconductor,https:// bioconductor.org/)。

2 方法與結(jié)果

2.1 百藥煎樣品制備

取茶葉,分次加水煎煮,濾過(guò),合并濾液,濃縮至適量,放涼,與五倍子細(xì)粉混合,制成軟材,于115 ℃高壓蒸汽滅菌鍋中滅菌30 min,放至室溫。分別接種BYJ.H-1、BYJ.G-1和HMB2、HMB5、HMY1、HMY2 4菌混合菌群,置溫度35 ℃,濕度85%條件下發(fā)酵,待藥塊表面遍布白色“霉衣”時(shí),取出,切成小方塊,低溫干燥。3種菌種各發(fā)酵9批,批號(hào)分別為BM1~BM9、BH1~BH9、BA1~BA9。

2.2 不同菌種發(fā)酵品特征性成分差異對(duì)比

2.2.1 供試品溶液的制備 取各批樣品粉碎,過(guò)4號(hào)篩,取0.2 g,精密稱定,加入甲醇50 mL,稱質(zhì)量后靜置2 h,超聲提取40 min,放冷至室溫,用甲醇補(bǔ)足減失的質(zhì)量,取續(xù)濾液,過(guò)0.22 μm濾膜,即得供試品溶液。

2.2.2 對(duì)照品溶液的制備 分別取沒食子酸、EGC、TGG對(duì)照品適量,精密稱定后加甲醇溶解,配制成含沒食子酸0.1 mg/mL、EGC 0.3 mg/mL、TGG 0.02 mg/mL的混合對(duì)照品溶液。

2.2.3 樣品測(cè)定 參照本課題組前期建立的HPLC法[12]測(cè)定27批百藥煎樣品,含量以干燥品計(jì),色譜圖見圖1,測(cè)定結(jié)果見表1。

2.2.4 不同菌種發(fā)酵品PCA-CA分析

(1)特征性成分降維分析:采用SPSS 20.0軟件將原始數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化后進(jìn)行降維,根據(jù)特征值>1和累積方差貢獻(xiàn)率>80%,選取前2個(gè)成分作為降 維后的主成分(表2),并將主成分載荷轉(zhuǎn)換為對(duì)應(yīng)的特征向量(得分系數(shù))后計(jì)算主成分得分,結(jié)果見表3、4。

圖1 混合對(duì)照品 (A) 和百藥煎樣品 (B) 的HPLC圖Fig.1 HPLC of mixed reference substances (A) and Baiyaojian sample (B)

(2)不同菌種發(fā)酵品聚類分析:以主成分得分為指標(biāo),采用SPSS 20.0軟件對(duì)不同菌種發(fā)酵品進(jìn)行k-均值聚類分析,將群集數(shù)設(shè)置為3后輸出聚類結(jié)果并進(jìn)行可視化。結(jié)果顯示,各聚類群集中的發(fā)酵品并非單一種類,不同菌種發(fā)酵品的聚類結(jié)果存在交叉現(xiàn)象,群集聚類趨勢(shì)無(wú)規(guī)律且與菌種類別無(wú)關(guān)聯(lián),見圖2。

2.3 百藥煎潛在分子作用機(jī)制探究

2.3.1 活性成分靶標(biāo)及功效相關(guān)靶標(biāo)篩選

(1)活性成分靶標(biāo)篩選:鑒于百藥煎基礎(chǔ)研究過(guò)少,TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)并未收錄相關(guān)信息,本實(shí)驗(yàn)在前期研究基礎(chǔ)上[17]借助PubChem數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)百藥煎的活性成分進(jìn)行整理(表5),然后以各成分名稱為關(guān)鍵詞通過(guò)TCMSP和Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)獲取相關(guān)靶標(biāo)的標(biāo)準(zhǔn)名稱,結(jié)果共得到158個(gè)靶點(diǎn),采用Cytoscape軟件構(gòu)建“成分-靶點(diǎn)”可視化網(wǎng)絡(luò),見圖3。

表1 百藥煎不同菌種發(fā)酵品中4種特征成分峰面積Table 1 Peak area of four characteristic components in different strains fermented products of Baiyaojian

表2 主成分特征值及解釋的總方差Table 2 Principal component eigenvalues and explained total variance

表3 主成分載荷及特征向量Table 3 Principal component loads and eigenvectors

(2)百藥煎功效靶標(biāo)篩選:依據(jù)中醫(yī)藥基礎(chǔ)理論從“病、癥、證”角度對(duì)百藥煎的功效應(yīng)用進(jìn)行分析后整理出可供數(shù)據(jù)庫(kù)檢索的方向——呼吸道疾病(respiratory disease,RD)、水液代謝失調(diào)(water metabolism imbalance,WI)和消化道出血(alimentary tract hemorrhage,AH)并提取其中的主要關(guān)鍵詞(圖4),然后通過(guò)GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索,剔除重復(fù)及相關(guān)得分過(guò)低者,共得到1916個(gè)相關(guān)靶標(biāo),主要涉及多表皮生長(zhǎng)因子結(jié)構(gòu)樣域10(multiple epidermal growth factor-like domains protein 10)、抗肌萎縮蛋白(dystrophin)、骨成型蛋白受體1A(bone morphogenetic protein receptor type 1A)、C-X-C趨化因子基序配體8(C-X-C motif chemokine ligand 8,CXCL8)等。

表4 特征成分的標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)及主成分得分Table 4 Standardized data of feature components and scores of principal components

圖2 不同菌種發(fā)酵品k-均值聚類散點(diǎn)圖Fig.2 K-mean cluster scatter plot of different strains fermentation products

2.3.2 中藥成分-功效靶點(diǎn)交集 基于Jvenn平臺(tái)對(duì)百藥煎及其功效相關(guān)靶點(diǎn)進(jìn)行取交集處理,得到99個(gè)共有靶點(diǎn),在3種病證中互有交集(圖5),這些靶點(diǎn)即為百藥煎發(fā)揮功效的潛在作用靶點(diǎn),包括絲氨酸/蘇氨酸激酶1(serine/threonine kinase 1,AKT1)、前列腺素G/H合成酶1/2(prostaglandin- endoperoxide synthase 1/2,PTGS1/2)、信號(hào)傳導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)等。

2.3.3 百藥煎功效調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及可視化 在明確百藥煎治療RD/WI/AH的潛在作用靶點(diǎn)后,采用Cytoscape軟件分別以“百藥煎、活性成分、相關(guān)靶點(diǎn)、RD/WI/AH”為節(jié)點(diǎn),4者間的微觀聯(lián)系為網(wǎng)絡(luò)屬性,構(gòu)建“藥物-成分-靶點(diǎn)-疾病”調(diào)控網(wǎng)絡(luò)(圖6),可明顯看出百藥煎是以多組分協(xié)同干預(yù)多個(gè)靶點(diǎn)起到治療RT/DS/HS的作用。

2.3.4 共有靶點(diǎn)的蛋白互作及PPI網(wǎng)路拓?fù)浞治?為進(jìn)一步探究百藥煎治療RD/WI/AH的分子作用機(jī)制,將共有靶點(diǎn)上傳至STRING平臺(tái)查詢靶點(diǎn)間的互作關(guān)系(置信度≥0.7),篩選后初步得到核心靶點(diǎn)的PPI網(wǎng)絡(luò)圖。剔除重復(fù)者及PPI網(wǎng)絡(luò)外的離散靶點(diǎn)后,RD相關(guān)網(wǎng)絡(luò)具有79個(gè)節(jié)點(diǎn)、652條邊,WI相關(guān)網(wǎng)絡(luò)具有78個(gè)節(jié)點(diǎn)、619條邊,AH相關(guān)網(wǎng)絡(luò)具有13個(gè)節(jié)點(diǎn)、41條邊,共計(jì)98個(gè)核心靶點(diǎn)。在此基礎(chǔ)上利用Cytoscape軟件中的Network Analyzer對(duì)3個(gè)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行拓?fù)浞治觯⒁罁?jù)節(jié)點(diǎn)度和邊中心性將網(wǎng)絡(luò)按順時(shí)針降序布局,見圖7。

表5 百藥煎活性成分基本信息Table 5 Basic information of active ingredients of Baiyaojian

圖3 百藥煎“成分-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖Fig.3 “Component-target” network diagram of Baiyaojian

2.3.5 核心靶點(diǎn)的GO及KEGG富集分析 利用Bioconductor平臺(tái)和R語(yǔ)言對(duì)上述具備互作關(guān)系的核心靶點(diǎn)進(jìn)行GO及KEGG富集分析,得到112個(gè)GO條目和154條KEGG信號(hào)通路,在錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率(FDR)<0.05的前提下依據(jù)P值降序排列后分別選取前20個(gè)進(jìn)行分析并做可視化處理。結(jié)果發(fā)現(xiàn),上述GO條目均與分子生物學(xué)功能相關(guān),主要包括蛋白絲氨酸/蘇氨酸激酶活性(protein serine/ threonine kinase activity)、泛素樣蛋白連接酶結(jié)合(ubiquitin-like protein ligase binding)、磷酸酶結(jié)合(phosphatase binding)、泛素蛋白連接酶結(jié)合(ubiquitin protein ligase binding)、細(xì)胞因子受體結(jié)合(cytokine receptor binding)等,見圖8;上述KEGG信號(hào)通路主要包括PI3K-Akt信號(hào)通路(PI3K-Akt signaling pathway)、卡波西肉瘤皰疹病毒感染通路(Kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection pathway)、人類巨細(xì)胞病毒感染通路(human cytomegalovirus infection pathway)、乙型肝炎通路(hepatitis B pathway)、癌蛋白聚糖通路(proteoglycans in cancer pathway)等,見圖9。對(duì)最為顯著的PI3K-Akt信號(hào)通路的作用機(jī)制進(jìn)行深入探究,發(fā)現(xiàn)藥物可通過(guò)多個(gè)靶點(diǎn)作用在通路中的節(jié)點(diǎn)上,圖10為其代謝通路圖,圖中標(biāo)紅的節(jié)點(diǎn)即為藥物靶點(diǎn)主要作用節(jié)點(diǎn)。

圖4 百藥煎功效檢索關(guān)鍵詞分析Fig.4 Analysis of efficacy search key words of Baiyaojian

3 討論

圖5 “藥物靶點(diǎn)-疾病靶點(diǎn)”韋恩圖Fig.5 Venn diagram of “drug target-disease target”

圖6 百藥煎功效調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖Fig.6 Efficacy control network diagram of Baiyaojian

目前,對(duì)于百藥煎成分變化與功效變化的內(nèi)在 聯(lián)系,尚無(wú)文獻(xiàn)報(bào)到。本課題組前期主要對(duì)百藥煎成分變化進(jìn)行了深入研究,其中TGG為百藥煎中首次發(fā)現(xiàn)的化合物,該化合物結(jié)構(gòu)由于具有半縮醛,因此始終有α和β 2個(gè)互變異構(gòu)體存在[12],因此本研究將發(fā)酵后,百藥煎中含量升高的成分沒食子酸、EGC以及TGβG、TGαG和等特征性成分作為指標(biāo)進(jìn)行研究。由于TGG為本課題組首次從百藥煎中分離得到,得率較低;且不同菌種發(fā)酵百藥煎中該成分含量差異較大,在使用標(biāo)品制作標(biāo)準(zhǔn)曲線時(shí)誤差較大,計(jì)算出的含量不準(zhǔn)確,而峰面積作為指標(biāo)更加準(zhǔn)確,因此,在選擇指標(biāo)時(shí)選用峰面積為指標(biāo)。

圖7 共有靶點(diǎn)的拓?fù)浞治鯢ig.7 Topological analysis of shared targets

圖8 百藥煎治療RD/WI/AH核心靶點(diǎn)的GO富集分析Fig.8 Analysis of GO enrichment of Baiyaojian in treatment of RD/WI/AH core targets

本研究以特征性成分為指標(biāo)的PCA-CA分析結(jié)果顯示3種關(guān)鍵優(yōu)勢(shì)菌種在五倍子發(fā)酵百藥煎的化學(xué)成分變化過(guò)程中均可產(chǎn)生類似的特征性變化。有學(xué)者研究發(fā)現(xiàn)[17-18],這種特征性變化可能是百藥煎發(fā)酵后增效減毒作用機(jī)制產(chǎn)生的關(guān)鍵過(guò)程,即降低 鞣質(zhì)含量減少其口腔澀味、胃腸道收斂刺激性和肝臟毒性的同時(shí)大量生成沒食子酸、EGC等相對(duì)分子質(zhì)量小、易吸收的藥效活性成分。結(jié)果顯示上述3種優(yōu)勢(shì)菌種均可以完成這段關(guān)鍵的物質(zhì)基礎(chǔ)轉(zhuǎn)化且結(jié)果基本一致,表明3種不同菌種發(fā)酵品間不存在明顯差異性。此外,現(xiàn)行國(guó)家藥典中尚未收錄本品,相關(guān)省市的標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范也僅以沒食子酸為質(zhì)控指標(biāo),不利于其臨床療效及用藥安全性的保障,針對(duì)此現(xiàn)狀,可利用一測(cè)多評(píng)或指紋圖譜等多成分評(píng)價(jià)體系探究上述特征性成分作為質(zhì)控指標(biāo)的可行性。

網(wǎng)絡(luò)藥理分析結(jié)果顯示,百藥煎中的沒食子酸、EGC、沒食子酸甲酯、沒食子酸乙酯和EGC沒食子酸酯5種活性成分對(duì)其適應(yīng)病證存在潛在干預(yù)作用,可能是通過(guò)AKT1、STAT3、EGF、MAPK1、MAPK3、CXCL8、血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子A(vascular endothelial growth factor A,AVEGFA)、前列腺素氧化環(huán)化酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)等核心靶點(diǎn)的協(xié)同作用達(dá)到治療RD/WI/ AH的目的。其中,AKT1可以調(diào)節(jié)包括細(xì)胞增殖、凋亡、代謝和血管生成在內(nèi)的多種生物過(guò)程,STAT3作為急性期響應(yīng)因子在多種炎癥反應(yīng)、免疫反應(yīng)和基礎(chǔ)能量代謝中具有重要作用,表皮生長(zhǎng)因子(epidermal growth factor,EGF)則在體內(nèi)外刺激各種表皮和上皮組織的生長(zhǎng),MAPK作為MAP激酶信號(hào)傳導(dǎo)途徑的重要組成部分與呼吸及消化系統(tǒng)疾病(肝炎、百日咳等)密切相關(guān),CXCL8作為炎癥刺激響應(yīng)因子在呼吸道及消化道炎癥(支氣管炎、口腔炎、肺炎、胃炎等)發(fā)生中占據(jù)重要地位,上述各靶點(diǎn)所參與的生物過(guò)程要么涉及到呼吸系統(tǒng)和消化系統(tǒng)的炎癥反應(yīng),要么涉及到循環(huán)系統(tǒng)的調(diào)節(jié)和破損組織的生長(zhǎng),而RD/WI/AH的產(chǎn)生恰好與此相關(guān),證明百藥煎很有可能是通過(guò)上述靶點(diǎn)間的協(xié)同作用達(dá)到相應(yīng)功效。GO分析結(jié)果顯示,核心靶點(diǎn)的表達(dá)主要涉及到激酶活性、連接酶及受體蛋白結(jié)合等分子功能;KEGG通路分析結(jié)果顯示,百藥煎的功效發(fā)揮主要涉及病毒感染、癌變和細(xì)胞因子調(diào)節(jié)等信號(hào)通路,其中PI3K-Akt信號(hào)通路的基因富集率和差異性表達(dá)最為顯著,該通路不僅參與多種生長(zhǎng)因子、細(xì)胞因子和細(xì)胞外基質(zhì)等的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),還參與細(xì)胞增殖、分化、凋亡和葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)等多種細(xì)胞功能的調(diào)節(jié)[20]。

圖9 百藥煎治療RD/WI/AH的KEGG通路富集分析Fig.9 Analysis of KEGG path enrichment of Baiyaojian in treatment of RD/WI/AH

圖10 百藥煎治療RD/WI/AH的KEGG信號(hào)通路之一 (PI3K-Akt)Fig.10 One of KEGG signaling pathways of Baiyaojian in treatment of RD/WI/AH (PI3K-Akt)

在PI3K-Akt信號(hào)通路傳導(dǎo)過(guò)程中,相關(guān)生長(zhǎng)因子與其受體酪氨酸激酶結(jié)合或G蛋白偶聯(lián)受體結(jié)合,分別激活I(lǐng)A型和IB型PI3K基因,PI3K可以催化磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸(PIP3)的生產(chǎn),PIP3可以作為第2個(gè)信使激活A(yù)kt,Akt經(jīng)過(guò)一系列磷酸化反應(yīng)后,可作用于多靶點(diǎn),從而調(diào)控蛋白質(zhì)合成、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞周期、細(xì)胞增殖和DNA修復(fù)等過(guò)程[19-20]。“Reference Network”是直接從KEGG信號(hào)通路中提取的分支信號(hào)通路,體現(xiàn)了其中部分基因之間的相互作用信息,在PI3K-Akt信號(hào)通路中有5條這樣的通路,本研究中的靶點(diǎn)主要富集在其中的EGF-EGFR-PI3K信號(hào)通路、EGF-EGFR-RAS- PI3K信號(hào)通路、IGF-IGF1R-PI3K信號(hào)通路及EGF- EGFR-PI3K-NF-κB信號(hào)通路上。在上述前2條分支信號(hào)通路中,基因主要分布在GF、RTK、AKT及BAD 4個(gè)節(jié)點(diǎn)上[21-22]。富集在GF節(jié)點(diǎn)上的基因有EGF、FGF2、FGF10、PDGFB及VEGFA,主要負(fù)責(zé)編碼一些活性因子。EGF負(fù)責(zé)編碼表皮生長(zhǎng)因子超家族的成員,可刺激體內(nèi)外各種表皮和上皮組織的生長(zhǎng)。FGF2和FGF10基因編碼的蛋白是成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子(fibroblast growth factor,F(xiàn)GF)家族的成員,F(xiàn)GF可參與各種生物過(guò)程,包括胚胎發(fā)育,細(xì)胞生長(zhǎng),形態(tài)發(fā)生,組織修復(fù),腫瘤生長(zhǎng)和侵襲等[23]。

PDGFB基因編碼的蛋白包括血小板衍生生長(zhǎng)因子(platelet derived growth factor,PDGF)和血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子(vascular endothelial growth factor,VEGF),為中樞神經(jīng)系統(tǒng)、肺、皮膚及血管平滑肌細(xì)胞的正常增殖以及血管和腎小球的正常發(fā)育所需,在傷口愈合中具有重要作用,可在多種發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮作用[24]。VEGFA也是PDGF/VEGF生長(zhǎng)因子家族的一員,編碼肝素結(jié)合蛋白,可誘發(fā)血管內(nèi)皮細(xì)胞的增殖和遷移,對(duì)生理和病理性的血管生成都至關(guān)重要。富集在RTK節(jié)點(diǎn)上的基因有EGFR、FGFR1、FLT1、KDR、PDGFRB、IGF1R、EPHA2及ERBB2,主要負(fù)責(zé)編碼一些受體蛋白。EGFR編碼一種跨膜蛋白,是表皮生長(zhǎng)因子的受體[25]。FGFR1是FGF2和FGF10等纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子的受體。FLT1和KDR基因編碼的蛋白為VEGF的受體(VEGFR)。PDGFRB是PDGF的酪氨酸激酶受體。IGF1R編碼胰島素樣生長(zhǎng)因子1受體,也是一種酪氨酸激酶。EPHA2及ERBB2編碼的蛋白也是一種酪氨酸激酶,前者編碼的是一種腎素受體,后者則是EGF的受體。Akt節(jié)點(diǎn)是PI3K通路中的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn),對(duì)應(yīng)基因?yàn)锳kt,Akt是一種蛋白激酶,依賴于PI3K通路激活。富集在BAD節(jié)點(diǎn)上的基因?yàn)锽AD,BAD是Bcl-X/Bcl-2結(jié)合蛋白,主要參與調(diào)控細(xì)胞的存活及細(xì)胞的凋亡。

在IGF-IGF1R-PI3K上富集有研究基因的節(jié)點(diǎn)主要有GF、RTK及Akt,通過(guò)此信號(hào)通路可參與蛋白質(zhì)合成生物功能并調(diào)控mTOR信號(hào)通路[26-27]。在EGF-EGFR-PI3K-NF-κB信號(hào)通路上除GF、RTK及Akt 3個(gè)節(jié)點(diǎn)外,還有TKK及NF-κB 2個(gè)節(jié)點(diǎn)。TKK節(jié)點(diǎn)對(duì)應(yīng)的基因?yàn)镮KBKB,負(fù)責(zé)編碼的蛋白是一種血清激酶,在NF-κB信號(hào)通路中起著重要作用。NF-κB節(jié)點(diǎn)對(duì)應(yīng)的基因?yàn)镽ELA,它負(fù)責(zé)編碼的蛋白為NF-κB家族的一員,NF-κB是一種全細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子,幾乎存在于所有細(xì)胞類型中,是一系列信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的終點(diǎn)。綜上所述,百藥煎是通過(guò)EGF、FGF2、EGFR、FLT1及AKT等多種基因來(lái)調(diào)控PI3K-Akt通路中的多種信號(hào)傳導(dǎo),從而參與蛋白質(zhì)合成、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞周期進(jìn)程等多種生物功能,或參與調(diào)控JAT/STAT信號(hào)通路、NF-κB信號(hào)通路及mTOR信號(hào)通路等旁支信號(hào)通路來(lái)發(fā)揮藥物的功效,達(dá)到治療RD/WI/AH的目的。百藥煎是通過(guò)多個(gè)活性成分協(xié)同作用于多個(gè)信號(hào)通路中的多個(gè)靶點(diǎn)來(lái)實(shí)現(xiàn)“潤(rùn)肺化痰、止血止瀉、解熱生津”功效的。

利益沖突所有作者均聲明不存在利益沖突

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