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豬Calsarcin-2基因遺傳多態性與胴體及肉質性狀相關性研究

2021-05-14 07:08:52
畜牧獸醫雜志 2021年5期

吳 眩

(西安市奶牛育種中心,陜西 西安 710000)

Calsarcin-2又名FATZ、MYOZ1,是Calsarcins(Calcineurin-associated sarcomeric protein)家族成員之一,Calsarcins家族通過去磷酸化,調控Ca2+信號途徑,進而影響肌肉相關基因的表達。Frey等人最早推斷Calsarcin-2為一種肌原節蛋白家族,并能影響肌肉收縮,Takada利用酵母雙雜交系統研究了calsarcin-2蛋白和骨骼肌Z線附近的r-細絲蛋白和a-輔肌動蛋白相互作用規律。骨骼肌的肌纖維的數量和組成對豬肉品質有很大影響,而Calsarcin-2作為Z-Disc中的結構蛋白存在,因此Calsarcin-2基因可能在肌纖維的分化和發育過程中發揮了重要的作用,從而對豬肉品質產生一定的影響。本研究以Calsarcin-2基因作為目標基因,采用測序,結合胴體及肉質性狀進行相關性分析,以期為豬從分子水平進行遺傳改良提供方法和思路。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

貴州白香豬(17頭)及雜交品種貴州白香豬×大約克(24頭)、貴州白香豬×長白(13頭)、貴州白香豬×杜洛克(11頭)、貴州白香豬×貴州白香豬×長白(23頭),均來自貴州大學香豬育種場,靜脈采血,提取DNA備用。

1.2 試驗方法

1.2.1 引物設計 根據豬Calsarcin-2基因序列(NCBI登錄號:DQl43042),設計了4對引物,由上海生工有限公司合成,具體見表1。

1.2.2 2)PCR擴增 PCR采用15 μL反應體系:PCR緩沖液1.5 μL;上游引物1 μL;下游引物1 μL;超純水9.1 μL;dNTPs 1.2 μL;聚合酶1 U;模板 1 μL。PCR程序:預變性94 ℃5 min;變性94 ℃30 s,退火X ℃30 s(詳見表1),延伸72 ℃30 s,30個循環;最后延伸72 ℃10 min;4 ℃保存。

表1 豬Calsarcin-2基因引物信息

1.2.3 PCR擴增產物回收測序 PCR擴增產物用2 %瓊脂糖凝膠電泳檢測,將合格擴增結果送交上海生工進行測序。

1.3 統計分析

利用SPSS軟件對SNPs位點基因型與豬胴體及肉質進行關聯分析。

2 結果分析

2.1 PCR擴增

豬Calsarcin-2基因擴增結果如圖1,4對引物擴增片段整齊清晰、特異性好,長度都與預期大小一致。……

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