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基于萬方數(shù)據(jù)庫對Mimics 醫(yī)學(xué)影像軟件應(yīng)用的文獻計量與熱點可視化分析

2021-05-13 14:03:00鮮恩英童慶華
醫(yī)學(xué)信息 2021年9期
關(guān)鍵詞:有限元研究

王 穎,楊 杰,鮮恩英,童慶華,鐘 鏵,5

(1.西藏大學(xué)醫(yī)學(xué)院人體解剖學(xué)教研室,西藏 拉薩 850000;2.解放軍西藏軍區(qū)總醫(yī)院影像科,西藏 拉薩 850000;3.西藏大學(xué)醫(yī)學(xué)院婦產(chǎn)科教研室,西藏 拉薩 850000;4.解放軍西藏軍區(qū)總醫(yī)院婦產(chǎn)科,西藏 拉薩 850000;5.成都中醫(yī)藥大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院人體解剖學(xué)教研室,四川 成都 611137)

隨著醫(yī)療設(shè)備性能的提高以及計算機處理能力的提升,三維重建技術(shù)現(xiàn)已進入穩(wěn)步增長期[1]。目前三維重建軟件種類多、應(yīng)用范圍廣。Mimics 生成的三維圖像可進一步運用于計算機輔助設(shè)計、快速成型與虛擬仿真技術(shù)和有限元分析[2],涉及的生命科學(xué)領(lǐng)域包括基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)[3]、臨床醫(yī)學(xué)[4]、口腔醫(yī)學(xué)[5]和生物醫(yī)學(xué)工程[6]等,是連接CT 或MRI 圖像的橋梁。文獻計量學(xué)是借助文獻來研究學(xué)科發(fā)展狀況,分層探索現(xiàn)有信息和已發(fā)表數(shù)據(jù)的意義和相關(guān)性,把握文獻中發(fā)現(xiàn)的模式和趨勢存在[7]。文獻計量分析軟件Citespace 基于JAVA 語言不僅能對文獻進行可視化,而且能對研究領(lǐng)域現(xiàn)狀及前沿發(fā)展趨勢進行分析預(yù)測[8]。本文旨在運用Citespace 軟件對Mimics 軟件近27 年來的應(yīng)用的中文期刊文獻進行分析,梳理出軟件應(yīng)用領(lǐng)域前沿?zé)狳c及應(yīng)用機構(gòu)分布情況,旨在為國內(nèi)應(yīng)用Mimics 軟件的研究人員提供研究方向指導(dǎo)和研究前景的預(yù)測。

1 資料與方法

1.1 文獻來源及檢索方式 文獻來源:萬方數(shù)據(jù)庫。檢索方式:在高級檢索中,文獻類型選擇“期刊論文”,制定檢索式SU=(mimics OR SU=mimics 軟件OR SU=materialise's interactive medical image control system and SU=應(yīng)用)。檢索條件為模糊,主題詞擴展。檢索時段為1992 年1 月1 日~2019 年12 月31 日。語言種類:中文。

1.2 研究方法 人工刪除不符合主題的文獻后,共檢索出有效文獻2654 篇,將所有文獻導(dǎo)入NoteExpress 中進行去重處理,結(jié)果轉(zhuǎn)化為refworks 格式后導(dǎo)入citespaceV5.2.R2 分析軟件中進行圖譜制作。關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析時的參數(shù)設(shè)置:Time slicing:From 2003 to 2019、Years per slice=3,Term sourse 默認全選,Node type=keyword,TopN=50,Thresholding 中c,cc,ccv 默認選 擇,Pruning 中選擇Pathfinder、Pruning Sliced networks、Pruning the merged networks,余默認選擇。機構(gòu)合作的參數(shù)設(shè)定:From 2003 to 2019,Years per slice=3,Node type=instuition,TopN=50,Thresholding 中c,cc,ccv 分別選擇為(1,1,20)、(4,3,20)、(4、4,20),其余默認選擇。運用Citespace 軟件進行關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析時,通過生成共詞網(wǎng)絡(luò)來描繪學(xué)科領(lǐng)域。網(wǎng)絡(luò)中節(jié)點代表關(guān)鍵詞,整個網(wǎng)絡(luò)由多個節(jié)點構(gòu)成,節(jié)點大小不一,顏色不同,意味著關(guān)鍵詞出現(xiàn)次數(shù)不同、出現(xiàn)時間不同。節(jié)點間連線代表關(guān)鍵詞間關(guān)系,各個連線顏色不同,顏色越淺,年份越近。運用Citespace 軟件進行機構(gòu)合作分析時,每一個節(jié)點代表機構(gòu)出現(xiàn)的頻次、節(jié)點間連線代表機構(gòu)間合作,連線越粗,合作越頻繁。

1.3 數(shù)據(jù)處理 采用NoteExpress V3.2 進行文獻管理、格式轉(zhuǎn)換;利用Microsoft office 2019 專業(yè)增強版進行數(shù)據(jù)處理;在JAVA 環(huán)境下通過Citespace V5.2.R2 軟件對檢索的文獻進行分析并繪制圖譜。

2 結(jié)果

2.1 發(fā)文量 1992 年~2002 年國內(nèi)無Mimics 軟件應(yīng)用研究。2003 年~2019 年Mimics 軟件應(yīng)用的文獻量不斷增加。最早年份發(fā)文量為1 篇,即《建立數(shù)字化虛擬中國男性一號膝關(guān)節(jié)的有限元模型》;作者:張蔓超,趙衛(wèi)東,原林,李鍪軼,唐雷,鐘世鎮(zhèn);作者單位:第一軍醫(yī)大學(xué)中國人民解放軍醫(yī)學(xué)生物力學(xué)重點實驗室(現(xiàn)南方醫(yī)科大學(xué)),見圖1。

2.2 關(guān)鍵詞 三維重建作為關(guān)鍵詞出現(xiàn)在421 篇文章中,其次有限元分析390 篇、生物力學(xué)為293 篇、三維有限元為165 篇、有限元為158 篇;中心性前5名分別為腰椎、骨質(zhì)疏松、x 線計算機、計算機輔助、圖像處理;Sigma 大于1 的重點詞匯前5 名分別為骨科植入物、有限元模型、模型、骨質(zhì)疏松、腰椎,見表1。

圖1 Mimics 軟件年度發(fā)文量折線圖

表1 Mimics 軟件應(yīng)用領(lǐng)域關(guān)鍵詞TOP10

2.3 凸現(xiàn)詞 凸現(xiàn)詞(熱點)指近期有大的變化的詞匯,文中借用熱點進行描述。對熱點進行探索,得到25 個熱點,由高到低排列熱點值,前10 名分別:3D打印、骨科植入物、3D 打印技術(shù)、有限元模型、植入物、CT 圖像、模型、數(shù)字化骨科、國家自然科學(xué)基金、顳下頜關(guān)節(jié)。結(jié)合表2 與圖2,聚類6 為研究前沿,在前沿中進行熱點探索,分別為3D 打印、骨科植入物、植入物、數(shù)字化骨科、國家自然科學(xué)基金、數(shù)字化設(shè)計、脊柱植入物、CT 掃描。其中國家自然科學(xué)基金這一關(guān)鍵詞出現(xiàn)于25 篇文章中,收錄期刊均為《中國組織工程研究》,收錄時間段為2015 年~2019 年,見圖3、表3。

表2 第6 聚類burst 信息

圖2 Mimics 軟件應(yīng)用文獻中關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析

圖3 mimics 軟件應(yīng)用領(lǐng)域前沿?zé)狳c分析

表3 Mimics 軟件應(yīng)用領(lǐng)域突現(xiàn)詞TOP10

2.4 機構(gòu) 發(fā)文量前10 名的機構(gòu)分別為:南方醫(yī)科大學(xué)189 篇、南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院130 篇、上海交通大學(xué)89 篇、第四軍醫(yī)大學(xué)83 篇、南方醫(yī)科大學(xué)珠江醫(yī)院/南方醫(yī)科大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院48 篇、解放軍總醫(yī)院(北京301 醫(yī)院)&軍醫(yī)進修學(xué)院47 篇、內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)36 篇、廣州軍區(qū)廣州總醫(yī)院32 篇、西安交通大學(xué)27 篇、河北醫(yī)科大學(xué)23 篇;按高校發(fā)文量倒序排序,依次為:南方醫(yī)科大學(xué)、上海交通大學(xué)、第四軍醫(yī)大學(xué)、軍醫(yī)進修學(xué)院、內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)、西安交通大學(xué)、河北醫(yī)科大學(xué)。按醫(yī)院發(fā)文量倒序排序,依次為:南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院、南方醫(yī)科大學(xué)珠江醫(yī)院/南方醫(yī)科大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院、解放軍總醫(yī)院(北京301 醫(yī)院)、廣州軍區(qū)廣州總醫(yī)院。按照中心性進行排序,中心性大于0.1 的機構(gòu)為南方醫(yī)科大學(xué),中心性0.16,見圖4、表4。

圖4 Mimics 軟件應(yīng)用領(lǐng)域機構(gòu)合作圖譜

表4 Mimics 軟件應(yīng)用領(lǐng)域機構(gòu)數(shù)量及中心度TOP10 統(tǒng)計情況

表4(續(xù))

3 討論

3.1 發(fā)文量 發(fā)文量的變化可以反映某學(xué)科的研究熱度變化情況,對分析研究動態(tài)和預(yù)測研究發(fā)展趨勢有重要的意義[9]。本研究顯示,Mimics 軟件應(yīng)用的文獻量隨時間不斷增長,發(fā)文量在2013 年達高峰292 篇,盡管在2015 年和2019 年該軟件發(fā)文量有所下降,但據(jù)線性預(yù)測Mimics 軟件的應(yīng)用呈總體上升趨勢。據(jù)科學(xué)發(fā)展的模式來觀察科學(xué)文獻增長的規(guī)律,Mimics 軟件正處于發(fā)展時期。Mimics 軟件于1992 年誕生于比利時,最初旨在快速制造領(lǐng)域的應(yīng)用。通過對PubMed 數(shù)據(jù)庫進行檢索,該軟件從1997 年開始應(yīng)用于醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,隨后6 年,應(yīng)用領(lǐng)域均為骨科,2002 年后該軟件應(yīng)用領(lǐng)域逐漸擴展。發(fā)文量于2006 年開始驟增,這與Materalise 公司2005年正式進入中國市場有關(guān)。

2013 年~2015 年發(fā)文量小幅度下降,2015 年后發(fā)文量再次增加,探其原因如下:①在原有技術(shù)及應(yīng)用領(lǐng)域上難以有新的突破;②在從2014 開始,該公司進行產(chǎn)品更新,以滿足更多需求;③應(yīng)用領(lǐng)域的拓展[10],3D 打印產(chǎn)業(yè)成為潛力股。2019 年發(fā)文量稍有減少,但整體發(fā)文量持續(xù)高水平,筆者認為這與醫(yī)療領(lǐng)域3D 打印的材料學(xué)限制有關(guān)[11],隨著對打印材料的不斷探索,Mimics 軟件在醫(yī)療領(lǐng)域?qū)行碌膽?yīng)用高峰。

3.2 關(guān)鍵詞 關(guān)鍵詞出現(xiàn)頻率前3 名為三維重建、有限元分析、生物力學(xué)。三維重建作為Mimics 的基礎(chǔ)模塊,在醫(yī)學(xué)教育、醫(yī)學(xué)研究中廣泛運用。在醫(yī)學(xué)教育方面,Mimics 軟件主要應(yīng)用于口腔頜面部[12]、骨科[13]、人體解剖學(xué)[14]等教學(xué)中;在醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域,Mimics 軟件最主要的應(yīng)用是處理斷層掃描后的數(shù)據(jù),重建人體骨骼的三維網(wǎng)格數(shù)據(jù),或是結(jié)合快速成型機來復(fù)制人體骨骼,找出需要修補的位置[15]。由于力學(xué)實驗無法直接研究人體力學(xué)結(jié)構(gòu),因此有限元成為有效手段。有限元分析法作為生物力學(xué)的新興研究方法,研究方向由心血管流體力學(xué),逐步擴展到骨科生物力學(xué)[16],現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于人體脊柱、牙齒及附屬結(jié)構(gòu)、肌肉血管等研究。構(gòu)建有限元模型,并對該模型進行力學(xué)仿真實驗,彌補了普通線性模型難以精確構(gòu)建人體結(jié)構(gòu)的弊端,對人體不規(guī)則區(qū)域進行非線性三維模型的構(gòu)建,完整再現(xiàn)解剖結(jié)構(gòu)和動態(tài)功能結(jié)構(gòu)。

3.3 凸現(xiàn)詞 凸現(xiàn)詞是從關(guān)鍵詞中提取的能探索某一學(xué)科領(lǐng)域發(fā)展趨勢和突變的詞匯,在一定程度上可揭示具有潛在價值的研究方向[17]。本研究顯示,熱點值排名前3 的為3D 打印、骨科植入物和3D 打印技術(shù)。在研究前沿中探索研究熱點,結(jié)果顯示3D打印為最新最熱點。3D 打印最初應(yīng)用于工業(yè),隨后逐漸應(yīng)用于醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域。史云濤[18]認為在醫(yī)療領(lǐng)域,3D 打印技術(shù)主要運用于骨科、口腔領(lǐng)域、胚胎模型、器官移植和老年退變性腰椎側(cè)彎手術(shù)中。陳艷玫等[19]研究表明,2015 年~2050 年我國老年人口總量呈遞增趨勢,其中2020 年~2030 年為老齡化高速發(fā)展期,老年慢性疾病例如骨質(zhì)疏松、脊柱退化等日益增多。結(jié)合以上觀點,3D 打印技術(shù)在老年退行性變的應(yīng)用比例將會增加,預(yù)測未來Mimics 軟件在老年性病變中的應(yīng)用會急劇增加。

在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,3D 打印植入物起著重要的作用,尤其在骨科和脊柱外科顯示出特殊的價值[20]。骨科植入物與脊柱植入物在最近年份研究力度強,隨著材料學(xué)不斷發(fā)展及各學(xué)科不斷交叉,未來3D打印技術(shù)在骨科及脊柱外科的運用將會是研究重點。國家自然科學(xué)基金作為我國基礎(chǔ)研究領(lǐng)域的主要經(jīng)費之一,具有權(quán)威性和科學(xué)性。國家自然科學(xué)基金作為關(guān)鍵詞出現(xiàn)在文獻中并不恰當(dāng)。國家自然科學(xué)基金對生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域論文的數(shù)量和增長率具有促進作用[21],而非關(guān)鍵性決定作用。研究表明[22],被SCI、EI、ISTP 檢索收錄的科技論文能夠代表基金資助論文的總體水平和質(zhì)量高低,但是基金資助論文仍有大量未被SCI、E1、ISTP 檢索收錄,即使被SCI、EI、ISTP 檢索收錄也未必都得到自科基金資助,故不能僅因為有無被國家自然科學(xué)基金資助而作為評判文章質(zhì)量的依據(jù)。研究基金資助效果時,年份、學(xué)科或文獻類型等均為混淆因素,僅依據(jù)關(guān)鍵詞在文獻中出現(xiàn)的頻數(shù)不能簡單地說明問題。

3.4 機構(gòu) 在Mimcs 軟件應(yīng)用領(lǐng)域中,南方醫(yī)科大學(xué)的發(fā)文量和影響力均為國內(nèi)領(lǐng)先。結(jié)合可視化圖譜,發(fā)文量機構(gòu)所在地分布情況揭示了經(jīng)濟發(fā)展與科學(xué)研究發(fā)展呈正相關(guān)性[23]。本研究顯示,主要合作機構(gòu)為南方醫(yī)科大學(xué)及其附屬南方醫(yī)院、上海交通大學(xué)。新興合作機構(gòu)為內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)及其附屬醫(yī)院、第二附屬醫(yī)院。其余機構(gòu)間合作較少,大致呈現(xiàn)鄰近地區(qū)相互合作。從各機構(gòu)之間合作來看,同一經(jīng)濟區(qū)域合作更加頻繁,隨著市場化的深入,各區(qū)域間發(fā)展依賴程度提高,加強各區(qū)域間合作是大勢所趨[24]。

綜上所述,數(shù)字化醫(yī)學(xué)在當(dāng)今醫(yī)療體系中占據(jù)日益重要的地位,呼吁醫(yī)療領(lǐng)域?qū)嵺`者進行數(shù)字化實踐,加強全國范圍內(nèi)的數(shù)字化教學(xué)推廣迫在眉睫。

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