劉獻輝,張歆明,申翰欽,班艷芳,劉艷玲,張樂宜,宋長緒*
(1.華南農業大學動物科學學院/國家生豬種業工程技術研究中心,廣東 廣州 510642;2.溫氏食品集團股份有限公司,廣東 新興 527400)
豬圓環病毒(porcine circovirus,PCV)屬于圓環病毒科,目前為止已報道了3種基因型。豬圓環病毒2型(PCV2)感染引起的疾病稱為豬圓環病毒相關疾病(PCVAD),主要包括斷奶仔豬多系統衰竭綜合征(postweaning multisystemic weasting syndrome,PMWS)、豬皮炎與腎病綜合征(porcine dermatitis and nephropathy sysndrome,PDNS)與生殖系統疾病[1-2],給全球養豬業造成了巨大的經濟損失。PCV2是一種單股無囊膜DNA病毒,基因組全長1 777 bp左右,主要包括兩個開放性閱讀框(ORFs):編碼復制蛋白(Rep)的ORF1和編碼衣殼蛋白(CAP)的ORF2[3]。有研究表明,PCV2感染PK15細胞后能激活RIG-I/MDA5、cGAS/STING、NF-κB通路促進IFN-β的生成,IFN-β又能促進病毒的復制[4-5]。
先天免疫是機體防御病毒的第一道防線,模式識別受體(PRRs)是先天免疫系統中重要的免疫受體,它能夠識別病原微生物存在保守的病原結構——病毒相關分子模式(PAMPs),進而誘導天然免疫的應答,激活信號級聯反應,介導Ⅰ型干擾素(IFN)、細胞因子和趨化因子的產生。PRRs包括Toll樣受體(TLRs)、視黃酸樣受體(RLRs)、NOD受體(NLRs)和細胞質DNA受體[6]。先天免疫在防御病毒入侵過程中Ⅰ型IFN起著非常重要的作用,它能通過結合細胞表面的IFN受體,進而激活JAK-STAT信號通路,介導幾百種干擾素刺激基因(ISGs)轉錄表達,使細胞抵御病毒的感染[7]。
宿主蛋白G3BP1(GTPase-activating protein SH3domain-binding protein 1)是應激顆粒(stress granules,SGs)重要組成分子,也是SGs的檢測標志。在細胞受到環境、病毒感染等壓力下,SGs形成蛋白-mRNA聚合物,導致翻譯停止[8]。SGs能通過隔絕人類免疫缺陷病毒(HIV)的RNA抑制其復制[9]。SGs還是RIG-I和MDA5的定居場所,G3BP1可促進識別病毒的RNA,促進干擾素的產生并抑制病毒的復制[10-11]。最近報道G3BP1通過調控SGs進而抑制豬流行性腹瀉病毒(PEDV)的復制[12],另外G3BP1可以調控IFN誘導的ISG表達,在干擾素信號通路中有著重要作用[13],G3BP1還可以招募PKR促進先天性抗病毒應答[14]。最近報道G3BP1可以促進cGAS識別DNA及催化cGAMP的產生,促進IFN-β的產生,表明G3BP1在宿主抵抗DNA病毒的感染過程中起著重要作用[15]。也有研究闡述了G3BP1可以通過正調控RIG-I介導的IFN-β表達,進而抑制RNA病毒的復制[16]。
盡管G3BP1在許多病毒感染過程中起著重要的調控作用,但未有報道其在PCV2感染過程中的功能。本文通過PCV2感染PK15細胞,研究豬的宿主蛋白G3BP1與PCV2感染過程的聯系,以更好地了解PCV2的免疫機制。
PK15細胞、HEK293T細胞、真核表達質粒pCMV-HA和PCV2毒株(PCV2d)均為實驗室保存。
兔源抗HA單抗、HRP標記山羊抗兔IgG均來自Sigma公司。
DMEM高糖細胞培養基、1%的鏈霉素和青霉素溶液、0.25%EDTA的胰酶購自Gibco公司;胎牛血清(FBS)購自Biological industries公司;高濃度質粒提取試劑盒、病毒核酸提取試劑盒、組織細胞RNA提取試劑盒、膠回收試劑盒購自美基公司,反轉錄試劑、Eastep qPCR Master Mix購自Promega公司。脂質體轉染試劑Lipofectamine 3000、RNAiMAX購自Invitrogen公司。干擾素刺激DNA(interferon stimulatory DNA,ISD)購自Invivogen公司。凝膠成像儀為天能公司產品。
G3BP1序列是從豬細胞中提取RNA并反轉錄成cDNA后,經PCR擴增得到的。參考NCBI上豬G3BP1(GenBank登錄號為XR_002339497.1)的序列,在G3BP1序列上分別引進EcoRⅠ和KpnⅠ兩個酶切位點,然后連接在pCMV-HA載體上,經測序鑒定,獲得pCMV-HA-G3BP1真核表達載體。
將PK15細胞接種到12孔板中,當細胞融合度達到60%左右時,將空載體與G3BP1載體按Lipofectamine 3000 Transfection Reagent 說明書每孔轉染1.2 μg,轉染 24 h后,分別以感染比(MOI)為0.1和1感染細胞。
根據豬G3BP1 mRNA序列設計了3條siRNA,如表1所示,由上海生工生物有限公司合成。按照合成說明書用二乙基焦碳酸酯(DEPC)水將siRNA稀釋至20 pmol/L,保存于-20 ℃備用。將PK15細胞接種于12孔板中,待細胞融合度達到50%左右時,按Lipofectamine RNAiMAX Transfection Reagent說明書操作每孔轉染10 pmol,轉染24 h后提取細胞核酸用于定量分析敲低效果,或者用于接毒試驗。

表1 G3BP1 siRNA oligo序列
對于G3BP1過表達或敲低的PK15細胞,分別以感染比(MOI)為0.1和1接毒,在37 ℃培養箱孵育1 h,然后用PBS清洗2遍,加入含2%FBS的DMEM培養基繼續培養。分別在感染后12 h、24 h、48 h收毒,放-20 ℃冰箱。反復凍融3次后,提取病毒核酸,并用熒光定量PCR分析病毒的拷貝數。
采用試劑盒提病毒核酸。將12孔板里的病毒細胞液,反復凍融3次。病毒液混勻后,吸取200 μL病毒液加入20 μL蛋白酶K,然后加500 μL GRP溶液震蕩混勻,靜置10 min后,轉移到2 mL收集管的濾柱中,12 000g離心1 min,然后加500 μL RW1溶液后,離心1 min,再加入650 μL RW2溶液,離心1 min,最后12 000g離心2 min,甩干并通過濾柱后,把過濾柱放進干凈無菌的1.5 mL離心管中,加入DEPC水靜置2 min,離心收集病毒核酸。核酸放-20 ℃保存,方便用于后續試驗。
熒光定量PCR引物如表2。定量引物通過Prime 3.0設計,PCV2定量引物參考文獻[17]。熒光定量PCR反應體系如表3。

表2 熒光定量PCR引物

表3 熒光定量PCR反應體系
反應程序為:94 ℃預變性1 min ;94 ℃變性10 s,60 ℃退火30 s,40個循環。用絕對定量檢測PCV2病毒核酸并換算成拷貝數。用相對定量測定目的基因的相對表達水平,以β-actin基因表達為內參,用2-ΔΔCT計算。
用GraphPad Prism 5.0 軟件對試驗數據進行統計分析,使用Two-way ANOVA 對數據進行比對分析。
PCR擴增豬G3BP1基因目的片段(1 700 bp),利用T4連接酶方法將片段連接在pCMV-HA真核表達載體上。質粒上有EcoRⅠ和kpnⅠ酶切位點,雙酶切鑒定和DNA測序后,確定為目的片段的正確克隆(圖1)。

M.DL5000 Marker;1.質粒pCMV-HA G3BP1的酶切圖1 G3BP1真核表達載體的鑒定
將2 μg pCMV-HA空載質粒和2 μg質粒pCMV-HA-G3BP1質粒轉染到6孔板的293T細胞中,24 h后收取細胞,并用裂解液將細胞裂解。利用HA單抗進行Western blot檢測后,在60 kDa處可見特異性條帶(圖2),與預期大小符合,表明G3BP1蛋白成功表達。

圖2 蛋白質印跡法檢測G3BP1的表達
PK15細胞轉染空質粒和pCMV-HA-G3BP1,轉染 24 h后,用PCV2以MOI=0.1 和MOI=1 分別感染細胞。分別在感染12 h、24 h和48 h后,采用熒光定量PCR分析病毒的拷貝數,見圖3、圖4。

圖4 PCV2感染過表達G3BP1的PK15細胞Cap拷貝數(MOI=1)
過表達G3BP1試驗組與對照組相比,PCV2感染24 h后,病毒復制增強且差異顯著(P<0.05),感染48 h后較感染24 h后病毒復制的差異更為顯著(P<0.01)。在MOI=0.1和MOI=1的感染細胞上,可觀察到一致的結果。

*P<0.05,***P<0.001。下同圖3 PCV2感染過表達G3BP1的PK15細胞Cap拷貝數(MOI=0.1)
為研究敲低G3BP1對PCV2復制的影響,本研究設計了3條siRNA,分別作用于G3BP1 mRNA的不同靶點。PK15細胞轉染siRNA 24 h后,提取細胞RNA進行RT-PCR檢測,結果見圖5。檢測發現3條siRNA均能降低G3BP1 mRNA的表達,其中siRNA-187干擾效果最顯著。
當PK15細胞轉染對照siRNA和G3BP1-siRNA 24 h后,用PCV2 MOI=0.1和MOI=1分別感染細胞。敲低G3BP1試驗組與對照組相比,PCV2感染24 h 后病毒復制顯著減弱(P<0.05),感染48 h后比感染24 h后病毒復制的基因拷貝數降低,差異極顯著(P<0.001)。用MOI=0.1和MOI=1可觀察到一致的結果,見圖6、圖7。

與NC-siRNA組比較,**P<0.01圖5 熒光定量 PCR 檢測siRNA 干擾G3BP1 mRNA表達水平

圖6 PCV2感染G3BP1敲低的PK15細胞Cap基因拷貝數(MOI=0.1)

圖7 PCV2感染G3BP1敲低的PK15細胞Cap基因拷貝數(MOI=1)
細胞過表達G3BP1 24 h后,轉染2 μg/mL ISD刺激12 h,熒光定量PCR檢測IFN轉錄水平見圖8,可觀察到過表達G3BP1促進ISD誘導IFN-β的表達。用PCV2 MOI=1感染細胞,12 h可觀察到IFN-β轉錄水平增加,PCV2感染12 h,病毒復制沒有顯著差異,所以,選取感染12 h后的細胞,檢測其中的IFN-β轉錄水平。結果顯示,過表達G3BP1顯著促進了IFN-β的表達(圖9)。

圖8 ISD刺激12 h后的IFN-β mRNA的表達

圖9 PCV2感染12 h后的IFN-β的表達
2 μg/μL ISD刺激敲低G3BP1后的細胞,用熒光定量PCR檢測IFN轉錄水平。與對照組相比,敲低G3BP1,能抑制ISD誘導的IFN-β mRNA的轉錄(圖10);用PCV2 MOI=1感染細胞,感染12 h后檢測IFN-β轉錄水平(圖11),敲低G3BP1組能抑制IFN-β mRNA的轉錄。

圖10 ISD刺激后的IFN-β mRNA的表達

圖11 PCV2感染12 h后的IFN-β mRNA的表達
有研究報道,G3BP1能促進環鳥苷酸-胺苷酸合酶(cGAS)識別DNA及催化環二核苷酸(cGAMP)的產生,進而介導IFN-β的表達,U937細胞敲掉G3BP1后,用ISD和HT-DNA刺激,缺失G3BP1的細胞IFN-β水平降低,感染人皰疹病毒1型(HSV-1)24 h后,缺失組IFN-β的表達明顯降低,進而病毒的復制與正常細胞組相比明顯提高[18]。最近也有研究表明,G3BP1能結合病毒的雙鏈RNA和RIG-I促進IFN-β的表達,進而調控抗病毒免疫來抑制RNA病毒的復制,用Poly I:C處理,或用仙臺病毒(SeV)感染G3BP1敲低(或敲除)的HEK293T細胞,都能抑制IFN-β的產生,用SeV和水皰型口炎病毒(VSV)感染敲除G3BP1的HEK293T細胞,與正常細胞組相比病毒復制顯著增強[10,16]。雖然應激顆粒主要是調控RNA病毒,但也有報道DNA病毒例如人乳頭瘤病毒(HSV)能影響應激顆粒SG[19]。過去的研究表明,PCV2可以激活 cGAS/STING、RIG-I/MDA5與NF-κB信號通路,上調IFN-β的表達,IFN-β進而能促進PCV2的復制[4-5,20],但是IFN-β促進PCV2的復制機制尚未研究清楚。
本研究發現,G3BP1能正調控PCV2的復制,G3BP1能促進ISD刺激IFN-β的表達,也能促進PCV2感染初期的IFN-β 產生,所以G3BP1很可能是通過上調IFN-β,從而促進PCV2的復制。然而G3BP1是否調控RIG-I/MDA5通路,或者通過調控cGAS/STING通路增強宿主天然免疫,促進IFN-β的上調,進而增強PCV2的復制,這一問題有待探究,此外,PCV2感染是否能影響應激顆粒SG的形成,進而調控病毒的復制,這一問題也有待研究。本文章的局限是未清晰的解釋G3BP1是否通過促進IFN-β 的表達促進PCV2的復制,需要進一步研究IFN-β 促進PCV2復制的機制。
綜上所述,在PK15細胞上,宿主蛋白G3BP1顯著促進PCV2的復制,很可能是通過上調IFN-β表達引起的。