T細(xì)胞受體(TCR)通過識(shí)別主要組織相容性復(fù)合物傳遞的肽來監(jiān)視細(xì)胞環(huán)境。特定的TCR克隆可用作癌癥和自身免疫性疾病的治療劑。TCR通過V、D、J區(qū)段的體細(xì)胞重組最多可產(chǎn)生1 015個(gè)獨(dú)特序列,因而需要高靈敏度和特異性的技術(shù)來分離和鑒定對(duì)目標(biāo)抗原有反應(yīng)的TCR序列。
當(dāng)T細(xì)胞遇到抗原時(shí),TCR就會(huì)識(shí)別并起作用,從而產(chǎn)生大量自身復(fù)制并指示免疫系統(tǒng)的其他部分攻擊攜帶該抗原的細(xì)胞。在此過程中,一些不能對(duì)引起免疫反應(yīng)的抗原起反應(yīng)的細(xì)胞也會(huì)被周圍細(xì)胞的免疫活動(dòng)所激發(fā)。采用傳統(tǒng)方法分離T細(xì)胞時(shí)會(huì)捕獲許多上述細(xì)胞,因此需要對(duì)收集到的細(xì)胞進(jìn)行分離,接著采用液滴的mRNA測(cè)序法(Drop?seq)對(duì)分離后細(xì)胞進(jìn)行分析。然而,分離具有特定受體的T細(xì)胞的過程會(huì)用到交聯(lián)技術(shù),交聯(lián)會(huì)降解T細(xì)胞的RNA,這給Drop?seq分析帶來了極大的挑戰(zhàn)性。
近日,美國(guó)加州大學(xué)等高校的研究人員采用化學(xué)可裂解的伯胺交聯(lián)劑,構(gòu)建了一種通過交聯(lián)劑調(diào)控的mRNA測(cè)序的方法——CLInt?Seq,該方法利用了可逆的交聯(lián)方式保留了T細(xì)胞的RNA的完整性,可有效回收細(xì)胞中與細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)(如細(xì)胞因子或轉(zhuǎn)錄因子)相關(guān)的抗原特異性TCR。該方法可以高通量分離和鑒定對(duì)任何抗原具有特異反應(yīng)的低頻TCR。該方法或可用于確定對(duì)SARS?CoV?2病毒起反應(yīng)的T細(xì)胞受體、開發(fā)針對(duì)前列腺癌的T細(xì)胞療法等。
研究的相關(guān)結(jié)果于2021年1月19日發(fā)表在《PNAS》期刊上。