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川崎病患兒差異表達基因篩選及相應(yīng)蛋白表達觀察

2021-01-11 02:24:03崔曉鳴劉力張博
山東醫(yī)藥 2021年18期
關(guān)鍵詞:兒童研究

崔曉鳴,劉力,張博

1天津市兒童醫(yī)院天津大學兒童醫(yī)院檢驗科,天津 300074;2天津市兒童醫(yī)院天津大學兒童醫(yī)院風濕免疫科;3天津醫(yī)科大學基礎(chǔ)醫(yī)學院免疫學系;4天津市細胞與分子免疫重點實驗室

川崎病(Kawasaki disease,KD)是由日本學者Tomisaku Kawasaki首次報道發(fā)現(xiàn)的一種皮膚黏膜淋巴結(jié)綜合征[1]。KD好發(fā)于5歲以下兒童,主要臨床表現(xiàn)為急性發(fā)熱、皮疹、黏膜血管炎、肝脾淋巴結(jié)腫大等[2]。KD被列為急性兒童血管性疾病,可導致兒童獲得性心臟冠狀動脈病變(Coronary artery lesion,CAL),主要包括冠狀動脈擴張、冠狀動脈瘤、冠狀動脈狹窄、冠狀動脈瘺形成等,癥狀嚴重者可出現(xiàn)心肌梗死及缺血性心肌病,甚至猝死。KD目前已經(jīng)是發(fā)達、發(fā)展中國家兒童最常見的獲得性心臟病的病因[3-4]。目前KD的治療方法為早期大劑量靜脈注射免疫球蛋白(Intravenous Immunoglobulin,IVIG)聯(lián)合阿司匹林[5]。KD的病因目前尚不明確,具有感染、環(huán)境污染及過敏等多個假設(shè)[6]。早診斷、早期干預是KD治療的關(guān)鍵,但目前臨床尚缺少KD診斷的“金標準”。我們運用生物信息學方法分析川崎病(KD)患兒差異表達基因(differentially expressed genes,DEGs),并觀察KD患兒血清中相應(yīng)DEGs蛋白的表達變化,現(xiàn)將結(jié)果報告如下:

1 資料與方法

1.1 KD患兒及健康兒童DEGs篩選

1.1.1 數(shù)據(jù)來源 KD基因測序數(shù)據(jù)來源于Yu Rang Park創(chuàng)建的KD數(shù)據(jù)庫(Kawasaki Disease Database,KDD)[7]。作為首個公共數(shù)據(jù)庫,KDD包括了亞洲范圍內(nèi)1 283例兒童病例的1 292個標本臨床數(shù)據(jù)和相應(yīng)基因組數(shù)據(jù)。

1.1.2 KD患兒及健康兒童DEGs篩選 通過R軟件中edgeR軟件包在納入基因組中篩選KD患兒及健康兒童DEGs以對數(shù)轉(zhuǎn)換的差異表達倍數(shù)(Log2FC)的絕對值>1和P<0.05為條件進行篩選[8]。繪制DEGs的火山圖譜,一個點代表一個基因,紅色點代表基因表達上調(diào),綠色點代表基因表達下調(diào),黑色小方塊表示基因沒有顯著差異變化;橫軸表示差異表達的倍數(shù),縱軸表示-Log10(錯誤發(fā)現(xiàn)率)。

1.2 KD患兒及健康兒童外周血中基質(zhì)金屬蛋白酶8(MMP-8)、嗅介蛋白-4蛋白(OLFM4)蛋白水平檢測

1.2.1 臨床資料 選擇我院2017年7月—2020年7月間收治的典型KD患兒40例。根據(jù)2017年美國心臟協(xié)會新版《科學聲明》,具備以下6項臨床表現(xiàn)中的至少5項:①持續(xù)發(fā)熱≥5 d;②多形性皮疹;③口腔黏膜彌漫充血,楊莓舌,口唇充血皸裂;④急性非化膿性頸部淋巴結(jié)腫大,通常直徑>1.5 cm;⑤非滲出性雙眼球結(jié)膜充血;⑥肢端變化,急性期掌趾紅斑,手足硬性水腫,恢復期膜狀脫皮。如果患者僅具備上述主要癥狀中的4項,但超聲心動圖或冠狀動脈血管造影證實有CAA或擴張時,也可診斷為典型KD。根據(jù)此標準,最終入組40例。另選擇15例健康兒童為對照,排除血液疾病、免疫系統(tǒng)疾病及感染性疾病者。本研究經(jīng)本院倫理委員會批準同意,納入者家屬均知情同意。。

1.2.2 KD患兒及健康兒童外周血MMP-8、OLFM4蛋白水平檢測 因“1.1”得到的DEGs中MMP-8、OLFM4基因差異最為明顯,最終采用ELISA雙抗體夾心法檢測KD患兒及健康兒童外周血MMP-8、OLFM4,具體操作嚴格按照試劑盒說明書進行(試劑盒選自Abcam公司)。為了減少待測人群凍存后細胞數(shù)量和檢測因子受損嚴重情況,影響指標檢測,本項目樣本采用新鮮提取的外周血,分批次對待測人群進行檢驗,最終的數(shù)據(jù)進行統(tǒng)一整理。標準品的稀釋與加樣:在酶標包被板上設(shè)標準品孔10孔,在第一、第二孔中分別加標準品100 mL,然后在第一、第二孔中加標準品稀釋液(PBS)50μL,混勻;以此類推,逐步稀釋,最終稀釋后各孔加樣量都為50μL,濃度分別為24、16、8、4和2μg/L;加樣:分別設(shè)空白孔(空白對照孔不加樣品及酶標試劑,其余各步操作相同)、待測樣品孔。在酶標包被板上待測樣品孔中先加樣品稀釋液40μL,然后再加待測樣品10μL(樣品最終稀釋度為5倍)。將樣品加于酶標板孔底部,盡量不觸及孔壁,輕輕晃動混勻。溫育:用封板膜封板后置37℃溫育30min。配液:將30(48T的20倍)倍濃縮洗滌液用蒸餾水30(48T的20倍)倍稀釋后備用。洗滌:小心揭掉封板膜,棄去液體,甩干,每孔加滿洗滌液,靜置30 s后棄去,如此重復5次,拍干。加酶:每孔加入酶標試劑50μL,空白孔除外。進一步溫育和洗滌。顯色:每孔先加入50μL顯色劑A,再加入50μL顯色劑B,輕輕震蕩混勻,37℃避光顯色15 min。終止:每孔加終止液50μL,終止反應(yīng)(此時藍色立轉(zhuǎn)黃色)。測定。以空白空調(diào)零,450 nm波長依序測量各孔的光密度OD值。測定應(yīng)在加終止液后15 min以內(nèi)進行。實驗獨立重復3次,取平均值。

1.3 統(tǒng)計學方法 采用Excel 2013軟件建立數(shù)據(jù)庫,SAS 9.4和SPSS 19.0統(tǒng)計軟件進行數(shù)據(jù)分析。對連續(xù)性變量進行正態(tài)分布檢驗,符合正態(tài)分布的變量以±s表示,采用SAS 9.4中的T test方法用于數(shù)據(jù)比較。P<0.05為差異具有統(tǒng)計學意義。

2 結(jié)果

2.1 KD患兒及健康兒童DEGs篩選結(jié)果 與健康兒 童 相 比,KD患 兒 有MMP-8、OLFM4、OLAH、CD177、RETN、CEACAM8、LCN、LTF、ARG1以及HP基因等288個DEGs,其中表達上調(diào)186個、表達下調(diào)102個。在此其中,MMP-8和OLFM4差異最為明顯(P均<0.05)。

2.2 KD患兒及健康兒童外周血MMP-8、OLFM4表達蛋白水平比較 KD患兒外周血MMP-8、OLFM4表達水平分別為(73.21±13.66)、(26.37±5.88)ng/mL,健康兒童分別為(46.32±9.38)、(9.37±5.23)ng/mL,二者比較,P均<0.05。

3 討論

KD,是一種不明原因的急性自限性發(fā)熱性疾病。目前關(guān)于KD的病因及發(fā)病機制尚不明確,包括肺炎支原體、化膿性鏈球菌、皰疹病毒、輪狀病毒在內(nèi)的多種感染均有可能引發(fā)此類疾病[9]。與此同時,近期發(fā)現(xiàn)遺傳因素在KD形成中也可能發(fā)揮重要作用。一些研究[10]結(jié)果表明,KD存在某些易感性的遺傳因素,其中包括:同卵雙胞胎患KD的風險在13%左右;有KD病史的父母后代KD發(fā)生率增加,以及受影響患者的兄弟姐妹中KD的發(fā)生率增加。全基因組分析發(fā)現(xiàn)多個基因的多態(tài)性與KD發(fā)生和發(fā)展密切相關(guān)。在家族連鎖和基因組關(guān)聯(lián)研究中,不同基因和基因區(qū)域的多個單核苷酸多態(tài)性(single-nucleotide polymorphism,SNP)已被證實,這其中包括:Caspase-3(CASP3)、肌醇1,4,5-三磷酸激酶c(ITPKC)、CD40、FCGR2a和b以及細胞淋巴激酶(BLK)[11,12]。許多與KD相關(guān)的SNPs在其他炎癥性疾病如類風濕性關(guān)節(jié)炎、潰瘍性結(jié)腸炎、紅斑性狼瘡和系統(tǒng)性硬化癥中也有發(fā)現(xiàn)。以上研究結(jié)果均證實炎癥免疫反應(yīng)在這些疾病的發(fā)生發(fā)展中可發(fā)揮重要作用。

盡早發(fā)現(xiàn)和及時干預是KD臨床治療的關(guān)鍵。未經(jīng)及時治療的KD患者發(fā)生冠狀動脈病變的概率在25%左右,也是兒童獲得性心臟病最常見的病因[13,14]。KD與自身免疫系統(tǒng)密切相關(guān),但具體機制尚不清楚。迄今為止,盡管對細菌毒素、超級抗原、真菌有機體和病毒性病原體進行了許多研究,但還沒有發(fā)現(xiàn)任何潛在的感染原因。然而,主流學派仍然堅持:未知的刺激引發(fā)了炎癥級聯(lián)反應(yīng),激活了免疫系統(tǒng)固有的和適應(yīng)性的免疫應(yīng)答,最終導致KD的發(fā)生。與此同時,KD最終形成還需要先天免疫系統(tǒng)通過檢測病原體相關(guān)分子模式(PAMPs)或損傷相關(guān)分子模式(DAMPs)來激活[15]。

在KD的急性期,循環(huán)促炎性和調(diào)節(jié)性T細胞的數(shù)量似乎有所增加。研究表明,KD患者的組織和冠狀動脈血管壁中產(chǎn)生IgA的漿細胞數(shù)量有顯著的增加。本研究中也發(fā)現(xiàn),Macrophages M1和T cells CD8兩類細胞在KD患者組中存在顯著差異性。Macrophages異常表達普遍發(fā)生于KD患者。巨噬細胞活化綜合征(Macrophage activation syndrome,MAS)相關(guān)聯(lián)的KD患者近年來也逐漸見諸報道[16,17]。T cells CD8與KD的研究尚未全面展開,值得進一步深入研究。IVIG是針對KD患者目前臨床推薦的主要治療方式。施用IVIG后,患者體內(nèi)的調(diào)節(jié)性T細胞群和B細胞激活因子的正常化。所有上述發(fā)現(xiàn)都支持適應(yīng)性免疫系統(tǒng)在KD中的重要作用。但具體那個免疫分子發(fā)揮更重要的作用,尚需進一步研究。

目前針對KD缺乏有效的臨床標志物。本研究發(fā)現(xiàn),MMP-8和OLFM4在KD患者存在顯著性高表達,并且可以在臨床檢驗中得到證實。MMP是一種鋅依賴性明膠酶。MMP蛋白家族參與自身免疫功能調(diào)節(jié),可以降低細胞外基質(zhì)蛋白的表達進而影響免疫細胞的轉(zhuǎn)移[18]。MMP-9(MMP家族中另一個重要蛋白成員)可以作為兒童嚴重膿毒癥(一種免疫系統(tǒng)相關(guān)常見疾病)的潛在臨床標志物[19,20]。在該研究中,與健康對照相比,嚴重膿毒癥患者的血漿MMP-9水平在第1天顯著升高。但是值得注意的是,成人膿毒癥和兒童膿毒癥患者中測量MMP-9的水平不盡相同。MMP-9在膿毒癥和KD中的作用可能與其在基底膜中裂解膠原蛋白的功能密切相關(guān)有關(guān)。該過程可以促進白細胞和淋巴細胞能夠進出外周循環(huán)。OLFM4是一種分泌型糖蛋白,標志著中性粒細胞的一個子集。

OLFM4異常表達證實與兒童膿毒癥惡化相關(guān)[21]。基于一項單中心、前瞻性隊列研究,OLFM4可能是兒童膿毒癥預后不良的獨立危險因素。OLFM4陽性的中性粒細胞百分比的增加與病死率相關(guān)。OLFM4陽性的升高(≥37.6%)的膿毒癥患者中,56%死亡,而OLFM4陽性的<37.6%的膿毒癥患者病死率為18%。OLFM4陽性的與病死率之間的關(guān)聯(lián)經(jīng)得起年齡、性別、絕對中性粒細胞計數(shù)、合并癥和疾病嚴重程度的標準測量(SOFA評分,APACHEⅢ)的調(diào)整。OLFM4陽性的中性粒細胞百分比與膿毒癥的60天病死率獨立相關(guān),并且可能代表了宿主對膿毒癥反應(yīng)異質(zhì)性的新衡量標準。一項以小鼠為動物模型的研究[22]發(fā)現(xiàn),OLFM4基因缺失的小鼠可以顯著的擺脫膿毒癥影響。當在小鼠中誘導膿毒癥時,OLFM4-null小鼠的存活率顯著增加。膿毒癥誘導后24 h的免疫組織化學表明腎臟中OLFM4的表達增加,其定位于Loop of Henle。與OLFM4-null小鼠相比,野生型小鼠的腎細胞凋亡和血漿肌酐顯著增加。最后,骨髓移植表明腎臟中增加的OLFM4反映了局部產(chǎn)生而不是從血漿中過濾出來。以上研究證實MMP-8和OLFM4與兒童免疫系統(tǒng)疾病的發(fā)生和發(fā)展密切相關(guān)。

本項目從多角度全面比較了KD患者的差異性基因和特異性免疫細胞表達,并提出2個潛在的臨床標志物。然而,本研究為單中心研究,樣本量有限,尚存在一定的局限性。為了使這些標志物更有效的進行臨床推廣,未來還需要進行多中心、大樣本量研究。

綜上所述,KD患兒主要有MMP-8、OLFM4等288個DEGs。KD患兒外周血中MMP-8、OLFM4蛋白表達水平升高,存在顯著性差異。MMP-8、OLFM4可能作為KD檢測的潛在臨床標志物。

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