基于Web of science文獻(xiàn)計(jì)量分析的青枯病研究進(jìn)展

謝鵬昊 張 超 文 濤 牛國慶 洪文丹 袁 軍* 沈其榮

(1.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 資源與環(huán)境科學(xué)學(xué)院，南京 210095；2.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 江蘇省固體有機(jī)廢棄物資源化高技術(shù)研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，南京 210095；3.江蘇省有機(jī)固體廢棄物資源化協(xié)同創(chuàng)新中心，南京 210095)

青枯病是由茄科勞爾氏菌(Ralstoniasolanacearum)所引發(fā)的植物土傳病害，素有植物“癌癥”之稱。其廣泛分布于熱帶、亞熱帶及溫帶地區(qū)的國家，具有發(fā)病率高、危害大等特點(diǎn)。青枯菌的宿主種類繁多，包括馬鈴薯、番茄、辣椒和煙草等在內(nèi)的53 個(gè)科、300 多種植物[1-2]。目前與青枯病相關(guān)文獻(xiàn)大多集中于病害的發(fā)生、傳播和防治[3]，而對(duì)青枯病研究領(lǐng)域演進(jìn)歷程、發(fā)展概況介紹較少。

面對(duì)海量的文獻(xiàn)，以傳統(tǒng)閱讀方式對(duì)文獻(xiàn)進(jìn)行歸類與總結(jié)往往存在著一定局限性。近年來隨著計(jì)算機(jī)水平與文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的日益完善，通過使用軟件對(duì)文獻(xiàn)信息進(jìn)行可視化處理進(jìn)而進(jìn)行科學(xué)圖譜的繪制和分析，逐漸引起關(guān)注。科學(xué)知識(shí)圖譜是指利用可視化技術(shù)，通過數(shù)據(jù)挖掘、信息分析、圖形繪制等一系列方法展示科學(xué)知識(shí)的發(fā)展結(jié)構(gòu)與進(jìn)程，為學(xué)科研究提供切實(shí)、有價(jià)值的參考[4]。CiteSpace是由美國德雷塞爾大學(xué)的陳超美[5-6]教授開發(fā)，通過其可實(shí)現(xiàn)文獻(xiàn)之間的合作網(wǎng)絡(luò)[7]、關(guān)鍵詞突發(fā)性[8]、作者共被引[9]、文獻(xiàn)共被引[10]等分析。本研究擬采用文獻(xiàn)計(jì)量法，通過對(duì)1985—2019年與青枯病相關(guān)的文獻(xiàn)進(jìn)行梳理，闡明青枯病研究領(lǐng)域的基礎(chǔ)背景，以及領(lǐng)域的研究現(xiàn)狀與發(fā)展趨勢(shì)，以期為后續(xù)青枯菌的相關(guān)研究提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 供試材料

為客觀描述青枯病研究領(lǐng)域概況，本研究以南京農(nóng)業(yè)大學(xué)訂購的Web of Science(WoS)數(shù)據(jù)庫核心數(shù)據(jù)合集作為文獻(xiàn)來源，以“Ralstoniasolanacearum” or “Pseudomonassolanacearum”為主題詞進(jìn)行數(shù)據(jù)檢索，檢索跨度為1985—2019年，截止日期為2019年9月，共計(jì)3 002 篇，去重后得到2 987 篇作為本研究的分析樣本。

1.2 研究方法

通過CiteSpaceV軟件工具對(duì)下載數(shù)據(jù)進(jìn)行去重后，得到軟件所需數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)格式，將其數(shù)據(jù)保存為軟件可識(shí)別的download-x.txt。將所需數(shù)據(jù)導(dǎo)入CitesSpace后，timeslicing(時(shí)間段)設(shè)置為1985—2019年，依次勾選Title、Abstract、Author Keywords，并按照所作合作特征、共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)分析、共被引分析等圖形，分別勾選Author、Institution、Term、Keyword、Category、Reference，按照不同需求設(shè)置Top N(年被引排名)與Years Per Slice(跨度)，點(diǎn)擊Go實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)可視化。

2 結(jié)果與分析

2.1 年發(fā)文數(shù)量分析

通過對(duì)文獻(xiàn)發(fā)表數(shù)量年份間的統(tǒng)計(jì)，可在一定程度上了解青枯菌的研究歷程。如圖1所示，在1985—1992年期間青枯菌相關(guān)研究文獻(xiàn)數(shù)量呈緩慢增長趨勢(shì)，隨后在1993年與1998年發(fā)文量先后出現(xiàn)較大的增長，單年發(fā)文量增加超過40 篇，但對(duì)青枯病的關(guān)注并未持續(xù)，隨后幾年發(fā)文數(shù)量均有下降，表明研究進(jìn)入瓶頸期。在2001年后，青枯病成為研究熱點(diǎn)發(fā)文數(shù)量持續(xù)穩(wěn)定增加，在2018年發(fā)文量已達(dá)到225篇。

圖1 Web of science核心數(shù)據(jù)庫中青枯病年發(fā)文量統(tǒng)計(jì)Fig.1 Annual published papers statistics of bacterial wilt in Web of science core database

2.2 發(fā)文國家、機(jī)構(gòu)和作者合作特征分析

CiteSpace可以實(shí)現(xiàn)作者合作網(wǎng)絡(luò)、機(jī)構(gòu)合作網(wǎng)絡(luò)和國家地區(qū)合作網(wǎng)絡(luò)圖形的繪制，通過對(duì)圖形進(jìn)行解讀可以了解到青枯病研究領(lǐng)域中不同水平的合作關(guān)系，進(jìn)而發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域內(nèi)領(lǐng)先的國家、機(jī)構(gòu)和個(gè)人[11]。圖2為不同國家之間合作圖譜，共66 個(gè)節(jié)點(diǎn)，280 條連線，直觀表現(xiàn)出多個(gè)國家研究者對(duì)青枯病的重視，并且國家之間合作較多。由于青枯病發(fā)病區(qū)域的特點(diǎn)，對(duì)青枯病研究較為深入的國家基本集中于熱帶、亞熱帶及溫帶地區(qū)。其中美國不僅對(duì)青枯病研究開始最早(1985年)，同時(shí)發(fā)文量(642 篇)遠(yuǎn)高于除中國外其他國家(表1)。另外，其中介中心性為0.59，表明美國在青枯病領(lǐng)域居于龍頭地位，其所發(fā)文獻(xiàn)共被引次數(shù)遠(yuǎn)超其余國家，文獻(xiàn)總體質(zhì)量較高。中國對(duì)青枯病研究起始于20世紀(jì)末，雖開始較晚但發(fā)展迅速，在20年間發(fā)文數(shù)量高達(dá)600 篇，僅次于美國，但中介中心性為0.12，表明中國文獻(xiàn)數(shù)量較多，但是缺少高被引文章(表1)。此外，法國、日本、印度和德國等也均在青枯病領(lǐng)域發(fā)表許多優(yōu)秀論文，近年來多個(gè)國家年輪厚度迅速增加，代表其發(fā)文數(shù)量均迅速增長。

圖形大小與文獻(xiàn)數(shù)量成正比，紫色外圈代表中介中心性，年輪顏色代表發(fā)表時(shí)間，顏色越深發(fā)表時(shí)間越遠(yuǎn)，厚度與文獻(xiàn)頻率成正相關(guān)，節(jié)點(diǎn)間的連線代表兩者共現(xiàn)或共被引關(guān)系。下同。The size of the round node is in direct proportion to the number of papers published. The purple outer circle represents the centrality. Color of the ring represents year of the publication； The darker the color is the earlier is the time to publication of study; Thickness of the ring is positively related to the number of papers. Lines between the nodes represent the co-occurrence or co-citation relationship between the two literatures. The same below.圖2 青枯病國家合作網(wǎng)絡(luò)Fig.2 Cooperative network of bacterial wilt among countries

表1 統(tǒng)計(jì)青枯病發(fā)文數(shù)量前10的國家Table 1 Top 10 countries with the highest number of papers on bacterial wilt

表2展示中介中心性前10機(jī)構(gòu)的發(fā)文數(shù)量與首發(fā)年份，其中中國擁有4 所，美國3 所，法國2所，日本1 所。中介中心性排名第一的機(jī)構(gòu)來自美國威斯康星大學(xué)，其首發(fā)年份為1998年且主要為獨(dú)立研究，與其他機(jī)構(gòu)合作較少。法國國家農(nóng)業(yè)研究院發(fā)文190 篇，為本領(lǐng)域發(fā)表數(shù)量最多的機(jī)構(gòu)。我國位于前10的研究機(jī)構(gòu)分別為南京農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國科學(xué)院、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院與福建農(nóng)林大學(xué)。其中，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)中介中心性位列全球機(jī)構(gòu)第五，研究集中于生物防控與根際生態(tài)調(diào)控。生物防控主要通過篩選植物根際拮抗菌如：木霉、解淀粉芽孢桿菌等，將其制成生物有機(jī)肥施入土壤同時(shí)結(jié)合土壤熏蒸技術(shù)，可以有效殺死病原菌改良土壤[12]。根際中病原菌與有益微生物的相互作用影響植物的生長狀況，通過對(duì)根際微生物組的研究與調(diào)控可以實(shí)現(xiàn)良好的防控[13]。中國農(nóng)科院研究更傾向于對(duì)青枯菌的相關(guān)功能基因與多種植物對(duì)病原菌的分子應(yīng)答機(jī)制進(jìn)行解讀[14]。福建農(nóng)林大學(xué)在前10的機(jī)構(gòu)中首次發(fā)文最晚(2013)，截至2019年WoS核心數(shù)據(jù)庫已收錄相關(guān)論文45篇。

表2 青枯病研究中介中心性較高的前10機(jī)構(gòu)Table 2 Top 10 institutions with the high centrality of bacterial wilt research

圖3為青枯菌研究領(lǐng)域的作者合作網(wǎng)絡(luò)圖，共917 個(gè)節(jié)點(diǎn)，2 443 條連線，代表著有917位科研人員關(guān)注青枯病，彼此間進(jìn)行2 443 次合作。早期(1990年以前)的研究者大多以個(gè)人為主，合作僅在個(gè)體間展開，代表人物為Timothy P. Denny，其主要文獻(xiàn)為 Pathogenomics of theRalstoniasolanacearumspecies complex[15]。現(xiàn)代研究往往由少數(shù)負(fù)責(zé)人領(lǐng)導(dǎo)，團(tuán)隊(duì)內(nèi)形成復(fù)雜、密切的合作網(wǎng)絡(luò)，跨團(tuán)隊(duì)交流較少，并且研究團(tuán)隊(duì)往往由同一機(jī)構(gòu)的科研人員組成。Philippe Prior、Caitilyn Allen、Stephane Genin為青枯病領(lǐng)域中介中心性前3的作者。Philippe Prior中介中心性0.1排名第一，其對(duì)青枯病的研究始于1989年，其最新研究為致病菌中efpR基因的突變?cè)鰪?qiáng)了其對(duì)植物的適應(yīng)能力[16]。其中Alberto P. Macho與青枯病相關(guān)的文獻(xiàn)首發(fā)年份為2017年，發(fā)文數(shù)量也僅為8篇，但其中介中心性為0.05，排名第5，表明他的研究成果在近幾年青枯病領(lǐng)域具有重要意義。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)其研究集中于病原體侵染以及植物抵抗侵染的機(jī)制：以T3Es功能為切入點(diǎn)，以模式植物擬南芥、煙草和番茄作為研究對(duì)象，整合多種生物學(xué)手段，通過組織特異性的方式對(duì)植物各個(gè)進(jìn)程進(jìn)行分類，并研究特定的細(xì)菌在不同植物器官和不同侵染階段的毒力因子，解讀細(xì)菌病原體侵染植物的分子機(jī)制、植物應(yīng)答機(jī)制以及相關(guān)的植物信號(hào)通路[17]。本領(lǐng)域發(fā)文最多為Caitilyn Allen，首發(fā)年份為1997年，發(fā)文104 篇，在近幾年仍有論文產(chǎn)出。我國沈其榮教授領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)發(fā)文量為43篇，排名第三。近年來在其周圍形成了數(shù)個(gè)研究青枯病的小團(tuán)體，如徐陽春[18]，其研究方向集中于根際有益微生物防控土傳病害、根際微生態(tài)等。

圖3 青枯病作者合作網(wǎng)絡(luò)Fig.3 Cooperative network of authors on bacterial wilt research

2.3 文獻(xiàn)學(xué)科分布與關(guān)鍵詞共現(xiàn)特征分析

對(duì)學(xué)科的領(lǐng)域進(jìn)行共現(xiàn)分析，可構(gòu)建不同學(xué)科間的關(guān)系網(wǎng)絡(luò)，揭示青枯病領(lǐng)域中學(xué)科間的相互聯(lián)系。青枯病學(xué)科共現(xiàn)分析網(wǎng)絡(luò)中(圖4)共有57 個(gè)節(jié)點(diǎn)，表明青枯病領(lǐng)域中有57 個(gè)學(xué)科相互交叉滲透，294 條代表學(xué)科領(lǐng)域間相互聯(lián)系的連線，表明青枯病研究涉及領(lǐng)域十分復(fù)雜。青枯病領(lǐng)域研究主要與植物科學(xué)、農(nóng)學(xué)和微生物學(xué)交叉。除此之外，和生物化學(xué)與分子生物學(xué)、生物技術(shù)與應(yīng)用微生物學(xué)等領(lǐng)域有較多的交叉研究，說明對(duì)青枯病的研究從宏觀到微觀均有涉獵，多學(xué)科領(lǐng)域的交叉對(duì)當(dāng)前研究人員的知識(shí)儲(chǔ)備提出了更高要求。其中，環(huán)境科學(xué)、生物技術(shù)與應(yīng)用微生物學(xué)農(nóng)學(xué)中介中心性較高分別為0.35、0.27和0.25，表明青枯病在這些學(xué)科中有重要的研究價(jià)值，相關(guān)程度也較高。

圖4 青枯病學(xué)科領(lǐng)域共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)Fig.4 Co-occurrence network of bacterial wilt disciplines

文獻(xiàn)關(guān)鍵詞是文章內(nèi)容的核心主題，通過對(duì)相關(guān)文獻(xiàn)的關(guān)鍵詞進(jìn)行梳理能夠發(fā)現(xiàn)該領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)方向(圖5)。出現(xiàn)頻次前5關(guān)鍵詞代表了所發(fā)文獻(xiàn)普遍關(guān)注的重點(diǎn)：分別是“青枯勞爾氏菌”(R.solanacearum)、“青枯假單胞菌”(P.solanacearum)、“細(xì)菌枯萎病”(bacterial wilt)、“番茄”(tomato)和“抗性”(resistance)。本研究檢索詞條為“Pseudomonassolanacearum”或“Ralstoniasolanacearum”，將其作為青枯病學(xué)科演化路徑的起點(diǎn)可識(shí)別出2個(gè)主要方向：1)多種病原菌的鑒別，毒性以及致病機(jī)理的研究；2)植物對(duì)病原菌的應(yīng)答機(jī)制，相關(guān)功能基因的確定，以及病害的防控措施。通過對(duì)出現(xiàn)頻次和中介中心性較高的關(guān)鍵詞進(jìn)行解讀發(fā)現(xiàn)，青枯病屬于細(xì)菌枯萎病，因此對(duì)于災(zāi)害的防治和致病菌的鑒別是青枯病研究課題的重要內(nèi)容，其中番茄作為茄科代表作物，同時(shí)也為易感青枯病的重要作物，始終受到科研人員關(guān)注。

圖5 青枯病關(guān)鍵詞共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)Fig.5 Keywords co-occurrence network of bacterial wilt

關(guān)鍵詞的突發(fā)性描述某一關(guān)鍵詞在一段時(shí)間內(nèi)的頻次突然增加，反映一段時(shí)間內(nèi)的研究熱點(diǎn)和發(fā)展趨勢(shì)。由表3可知，青枯病領(lǐng)域研究熱點(diǎn)關(guān)鍵詞基本出現(xiàn)在20世紀(jì)90年代早期且持續(xù)時(shí)間較長，前10的突發(fā)性關(guān)鍵詞的熱點(diǎn)中90%持續(xù)時(shí)間超過6年。1985—2019年，不同作物致病菌出現(xiàn)5 次且持續(xù)時(shí)間較長，致病菌與作物產(chǎn)量相關(guān)，因此其始終為研究熱點(diǎn)，對(duì)致病菌的研究從抗病到其機(jī)理均有涉及。多糖作為突發(fā)關(guān)鍵詞出現(xiàn)3 次，可能原因?yàn)樘钦T導(dǎo)并激活植物的免疫系統(tǒng)提高抗病能力。其中持續(xù)時(shí)間最長的關(guān)鍵詞熱點(diǎn)為tobacco(煙草)，1991—2008年共18年，煙草為經(jīng)濟(jì)作物且易遭受青枯病害，感病后產(chǎn)量嚴(yán)重下降[19]，研究煙草如何應(yīng)對(duì)青枯病與減輕病害，引起科研人員持久關(guān)注。

表3 統(tǒng)計(jì)突發(fā)度前20關(guān)鍵詞Table 3 Top 20 keywords for statistical burst

表4展示了2009—2019年的熱點(diǎn)關(guān)鍵詞轉(zhuǎn)移，通過對(duì)突發(fā)性關(guān)鍵詞的分析，了解研究熱點(diǎn)的變化。除致病菌與易感作物始終為研究熱點(diǎn)外，與土壤相關(guān)研究逐步引起關(guān)注。土壤為植物與病原菌的生長提供基礎(chǔ)條件，其理化性質(zhì)與病原菌的關(guān)系仍未明確揭示，但隨著高通量測序技術(shù)的進(jìn)步，土壤中微生物的組成與功能的面紗將逐漸揭開。由于病原菌在土中的大量繁殖必然造成土壤生態(tài)位的改變，因此如何調(diào)控植物根際生態(tài)來減害、防害為研究重點(diǎn)與熱點(diǎn)。由關(guān)鍵詞“sequence”、“genetic diversity”、“pathogen”、“gene expression”可識(shí)別出當(dāng)前研究人員更關(guān)注病原菌遺傳與致病多樣性，其中“III secretion system”則反映了對(duì)青枯菌致病機(jī)理的關(guān)注，“Genome sequence of the plant pathogenRalstoniasolanacearum”[20]為其代表性文獻(xiàn)被引頻次高達(dá)936 次，主要描述了菌株GM1000的全基因組序列，并對(duì)菌株的III型分泌系統(tǒng)進(jìn)行解讀，進(jìn)而對(duì)致病基因進(jìn)行預(yù)測。

表4 2009—2019年關(guān)鍵詞突發(fā)性檢測Table 4 Keywords burst detection from 2009 to 2019

2.4 文獻(xiàn)交叉引用分析

文獻(xiàn)共被引表示2篇文獻(xiàn)同時(shí)被第三篇文獻(xiàn)所引，通過對(duì)共被引圖譜中的聚類和特殊節(jié)點(diǎn)進(jìn)行分析，可以了解該領(lǐng)域的知識(shí)脈絡(luò)[21]。其中被引文獻(xiàn)組成了領(lǐng)域的研究基礎(chǔ)，相應(yīng)的引文對(duì)應(yīng)該研究領(lǐng)域的前沿方向[22]。圖6的文獻(xiàn)共被引圖譜由286 個(gè)節(jié)點(diǎn)和392 條連線形成了8 個(gè)較大的群組，其Q值為0.81。7個(gè)聚類群組標(biāo)簽代表了青枯病的7 個(gè)研究前沿方向，其中前三聚類標(biāo)簽為#0 putative bacterial wilt resistance gene(青枯病抗性基因推測)、#1Ralstoniasolanacearumtype Ⅲ(青枯菌三型分泌系統(tǒng))、#3 transposon mutagenesis(轉(zhuǎn)座子突變)，這3個(gè)聚類標(biāo)簽代表當(dāng)前青枯病領(lǐng)域中3個(gè)研究熱點(diǎn)，表明對(duì)青枯病的研究已經(jīng)深入到分子層面，更傾向于對(duì)其機(jī)理的研究，而不僅僅是作物產(chǎn)量等表觀現(xiàn)象。#0 putative bacterial wilt resistance gene中主要關(guān)鍵詞為avrbs protein、several cDNA clone、plant defense，主要描述特定基因?qū)χ参锟剐缘墓δ堋４硇晕恼聻镾téphane Genin 2012年發(fā)表的“Pathogenomics of theRalstoniasolanacearumspecies complex”，對(duì)多種代表性菌株進(jìn)行基因組測序，了解病原菌的進(jìn)化與形成過程，探索了菌株致病性與宿主特異性的決定因素，總結(jié)了他們的致病機(jī)理與調(diào)控機(jī)制[15]。#1Ralstoniasolanacearumtype Ⅲ中關(guān)鍵詞包括pollen polygalacturonase、plant defense、bacterial disease，主要內(nèi)容為III型分泌系統(tǒng)與植物抗病關(guān)系。代表性文章為Stéphane Genin 2010年發(fā)表的“Molecular traits controlling host range and adaptation to plants inRalstoniasolanacearum”，通過研究Ⅲ型分泌系統(tǒng)來限制青枯病宿主范圍，通過對(duì)宿主與細(xì)菌通道中基因的協(xié)調(diào)表達(dá)機(jī)制變化的研究，來確定其他分子決定因素，包括次級(jí)代謝途徑、抗菌化合物的合成基因、控制植物激素合成的相關(guān)基因[23]。#3 transposon mutagenesis中包括關(guān)鍵詞為molecular dialogue、plant cell、avrbs protein，其主要研究內(nèi)容為細(xì)菌相關(guān)致病基因。代表性文章為Belen Brito在2002年發(fā)表的“prhJandhrpG, two new components of the plant signal-dependent regulatory cascade controlled by PrhA inRalstoniasolanacearum”，GM1000中hrp基因的表達(dá)依賴于hrpB調(diào)節(jié)，外膜蛋白PrhA參與hrp基因的激活，被認(rèn)為是植物信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的受體，hrpG和prhJ是完全致病所需，其位于hrp基因右側(cè)。推斷PrhA感知到的植物細(xì)胞信號(hào)被傳遞到prhJ基因，prhJ表達(dá)產(chǎn)物控制hrpG基因的表達(dá)，隨后在一定的誘導(dǎo)條件下激活hrpB的調(diào)節(jié)基因，并在誘導(dǎo)條件下激活剩余的hrp轉(zhuǎn)錄單位[24]。

圖6 青枯病文獻(xiàn)共被引圖譜Fig.6 Co-cited publications on bacterial wilt

Sigma值與文獻(xiàn)結(jié)構(gòu)性與突現(xiàn)性成正相關(guān)，其數(shù)值越大，文獻(xiàn)越可代表學(xué)科領(lǐng)域的重點(diǎn)知識(shí)。統(tǒng)計(jì)Sigma值前10的青枯病相關(guān)文獻(xiàn)(表5)發(fā)現(xiàn)，所有文章均從分子層面入手對(duì)青枯病致病菌進(jìn)行了不同角度的研究，其中4 篇文獻(xiàn)研究主要內(nèi)容為hrp基因的相關(guān)作用，2 篇文獻(xiàn)與青枯菌Ⅲ型分泌系統(tǒng)相關(guān)。hrp基因與III型分泌系統(tǒng)與病原菌致病能力相關(guān)，對(duì)二者的深入研究有助于了解病原菌對(duì)不同宿主植物的適應(yīng)機(jī)理，為限制病原菌的發(fā)展提供新思路。

表5 統(tǒng)計(jì)青枯病相關(guān)文獻(xiàn)Sigma值Table 5 Sigma values of bacterial wilt literature

3 討論與結(jié)論

本研究通過使用CiteSpace對(duì)WoS核心數(shù)據(jù)庫中相關(guān)文獻(xiàn)進(jìn)行分析，進(jìn)而對(duì)青枯病領(lǐng)域研究的起始，發(fā)展等進(jìn)行總結(jié)。結(jié)果表明：美國與法國在本領(lǐng)域處于領(lǐng)先地位，其擁有學(xué)科內(nèi)頂尖的研究機(jī)構(gòu)與科研人員。其中：美國威斯康星大學(xué)的Tans-Kersten等[25]在2001年所發(fā)表的文章揭示了青枯菌在早期入侵作物的動(dòng)力機(jī)制；法國農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院中的Remenant等[26]在2010年所發(fā)表的文章介紹了3株番茄致病菌的遺傳與致病基因多樣性二者均為領(lǐng)域中高被引文獻(xiàn)。美國與法國在該研究領(lǐng)域的領(lǐng)先地位，可能是因?yàn)閮蓢加星芽谱魑锓N植的悠久歷史，多種茄科作物為其重要的蔬菜產(chǎn)品，為適應(yīng)農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展需求，促進(jìn)了青枯病及其相關(guān)抗病研究的發(fā)展。早在1969年，已有青枯病對(duì)農(nóng)作物造成的巨大危害的報(bào)道，并對(duì)如何減輕病害的發(fā)生提出相關(guān)農(nóng)業(yè)措施[27]；1960年發(fā)表在Nature上的關(guān)于青枯病的研究試圖通過對(duì)比番茄與香蕉青枯菌的分泌物來闡明其寄主的特異性[28]。我國自1984年來，經(jīng)濟(jì)迅速發(fā)展，對(duì)土地需求不斷增強(qiáng)，常年的連作使土壤易爆發(fā)病蟲害等問題，相關(guān)研究得到迅速發(fā)展。代表性院校有南京農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院等。由于我國青枯病研究起步較晚，早期研究更偏重實(shí)際運(yùn)用。蔡燕飛等[29]在2003年所發(fā)表文章研究不同用量有機(jī)肥對(duì)番茄青枯病抑制效果和土壤微生物的變化，而對(duì)致病機(jī)理的研究尚未深入。本研究的分析沒有涵蓋中文數(shù)據(jù)庫，可能會(huì)對(duì)我國青枯病的研究現(xiàn)狀產(chǎn)生誤判，但不影響其在國際上的研究地位分析。

沿時(shí)間軸的分析發(fā)現(xiàn)，青枯病領(lǐng)域的研究進(jìn)展與科技發(fā)展水平密切相關(guān)。學(xué)科交叉起始于植物學(xué)、農(nóng)學(xué)、微生物學(xué)，集中于提高多種易感病作物的抗病性、改善產(chǎn)量等方向。隨著近年來高通量測序技術(shù)的不斷完善，測序深度與精度的逐步提升，研究熱點(diǎn)逐步轉(zhuǎn)變到分子層面的研究。包括青枯菌的致病機(jī)理[30]、根際微生物生態(tài)[31]、植物-病原菌互作機(jī)制[32]、植物響應(yīng)病原菌的分子機(jī)制[33]以及植物多種基因的表達(dá)對(duì)病原菌的影響[34]等研究方向。可以預(yù)測，未來植物方面的研究將會(huì)繼續(xù)集中挖掘抗病基因與抗病品種；微生物方面的研究會(huì)涉及青枯菌在全球尺度下的遺傳多樣性與致病多樣性，并對(duì)病原菌的致病機(jī)理進(jìn)行更詳盡的解釋。隨著微生物組學(xué)的快速發(fā)展，植物同微生物之間的相互作用的關(guān)系越來越明了，在土壤微生物尤其是根際微生物生態(tài)方面的研究會(huì)得到長足的發(fā)展，并通過多組學(xué)研究深入解釋植物-病原菌互作和調(diào)控機(jī)制。另外，隨著多光譜等技術(shù)的發(fā)展，植物表型研究進(jìn)一步成熟，以及在分子領(lǐng)域的研究不斷深入，將宏觀表型性狀和基因組、微生物組等建立關(guān)聯(lián)，有助于及時(shí)探測和預(yù)防青枯病，實(shí)現(xiàn)感染青枯病作物早發(fā)現(xiàn)、早預(yù)防和精確診治。

本研究也存在一定的局限性，首先受限于數(shù)據(jù)庫資源，僅選擇Web of Science核心數(shù)據(jù)庫，難免造成相關(guān)文獻(xiàn)的缺失，使統(tǒng)計(jì)結(jié)果不夠準(zhǔn)確，進(jìn)而造成分析偏差；其次，CiteSpace軟件可提供多種算法，不同算法產(chǎn)生的結(jié)果存在差異，而軟件缺少對(duì)相關(guān)算法的解釋造成使用者很難選擇最優(yōu)解進(jìn)行圖形繪制[35]，在后續(xù)研究中將加深對(duì)算法的理解，以期對(duì)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行更深入的挖掘。