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AvrLr19 突變菌株誘導(dǎo)TcLr19 小麥中 差異表達基因分析

2020-10-30 03:01:08崔鐘池武文月王婉晴胡鐵猛王海燕劉大群
關(guān)鍵詞:差異分析

崔鐘池,武文月,王婉晴,胡鐵猛,王海燕,劉大群,2

(1.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 植物保護學(xué)院/河北省農(nóng)作物病蟲害生物防治技術(shù)創(chuàng)新中心,河北 保定 071000; 2.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 研究生院,北京100081)

小麥葉銹菌(Puccinia triticina, Pt)引起的小麥葉銹病是世界范圍內(nèi)發(fā)生最普遍,對經(jīng)濟影響最嚴重的小麥病害之一,引入抗病基因是應(yīng)對小麥葉銹病的根本所在。然而,單一的抗病品種導(dǎo)致寄主選擇壓力,葉銹菌毒性變異頻繁,新的毒性小種不斷出現(xiàn),往往導(dǎo)致小麥抗葉銹病品種抗性喪失。于是,深入探究小麥抗病相關(guān)基因,并明確它們的功能及其參與的抗病信號通路,對于發(fā)掘新的抗病基因及揭示寄主—病原物的互作機制具有重要的理論和 實踐意義。

轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)RNA-seq 已成為基因表達分析的首選工具[1],該技術(shù)被廣泛應(yīng)用于鑒定小麥對生物脅迫的響應(yīng)基因及其代謝通路,通過分析寄主—病原物間親和與非親和互作反應(yīng)中的差異表達基因,評估病原物是如何調(diào)節(jié)致病基因的表達以及如何影響寄主植物的防御反應(yīng)[2],為發(fā)掘抗病相關(guān)基因或致病因子提供了更加快捷的途徑。張艷俊等[3]對接種葉銹菌PHNT 后的小麥材料‘TcLr19’進行轉(zhuǎn)錄組測序,篩選到了4 個與抗病相關(guān)的候選基因(NAC 類轉(zhuǎn)錄因子、bZIP 型轉(zhuǎn)錄因子、絲氨酸/蘇氨酸激酶和酪氨酸蛋白激酶);武文月等[4]基于PHNT 接種‘TcLr19’轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)篩選到24 個葉銹菌PHNT 候選效應(yīng)蛋白;Wu 等[5]對攜帶Lr47 的小麥品種“Lr47-Yecora Rojo-BC6F5”、“Lr47-UC1037”和“Lr47-White Yecora”進行RNA-seq分析,發(fā)現(xiàn)了863 個顯著上調(diào)基因和418 個顯著下調(diào)基因,發(fā)現(xiàn)Ca2+通道基因(CNGCs、CDPK、Rboh、CaM)、FLS2、RPM1、PR1 及HSP90 等 多個抗病基因富集顯著。……

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