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廣藿香百秋李醇分子調(diào)控及合成生物學(xué)研究進(jìn)展

2021-09-14 04:36:28張嬋姚廣龍張軍鋒于靖楊東梅陳萍吳友根
生物技術(shù)通報(bào) 2021年8期
關(guān)鍵詞:途徑產(chǎn)量

張嬋 姚廣龍 張軍鋒 于靖 楊東梅 陳萍 吳友根

(海南大學(xué)園藝學(xué)院,海口 571100)

廣藿香(Pogostemon cablin)是一種藥用芳香類草本植物,為首批“嶺南地道藥材保護(hù)品種”之一。其主要在印度尼西亞、新加坡、越南、馬來(lái)西亞、中國(guó)等地區(qū)種植[1]。廣藿香油是以廣藿香干燥地上部分經(jīng)蒸餾等方式加工而成[2]。廣藿香油的作用主要有兩類,一是其具備抑菌、消炎、止痛、抗抑郁、抗血小板、抗胃潰瘍、抗光老化等17種藥理功 效[3-6],可入藥;二是其香味獨(dú)特且定香功能顯著,可作為香料和食品添加劑[7]。得益于其效用,廣藿香油在日化用品、藥品和食品等行業(yè)中被廣泛應(yīng)用,市場(chǎng)前景廣闊[7-8]。優(yōu)質(zhì)的廣藿香油價(jià)格可高達(dá)1 300元/kg,就零售價(jià)而言,其可在全球重要精油中排名第十,經(jīng)濟(jì)效益明顯[9-10]。

百秋李醇(patchoulol)是一種倍半萜,為廣藿香油中的含量最多的組分之一,于1869年以白色晶體形式被分離鑒定[7,11-12]。百秋李醇是《中國(guó)藥典》中評(píng)價(jià)廣藿香及其精油質(zhì)量的重要指標(biāo),也被認(rèn)為是廣藿香油藥理功效和香味的主要貢獻(xiàn)成分[6]。目前,全球百秋李醇及其混合精油年產(chǎn)量約1 300 t,但年需求量可達(dá)2 000 t,供不應(yīng)求。其中90%的產(chǎn)量由印度尼西亞供應(yīng),而中國(guó)的產(chǎn)量不到10%,上升空間極大[10,13]。提高百秋李醇的產(chǎn)量成為廣藿香研究中的重點(diǎn)。為此,本文將從百秋李醇的合成途徑、分子調(diào)控機(jī)制和合成生物學(xué)工程三方面綜述近年來(lái)的相關(guān)研究進(jìn)展。

1 百秋李醇生物合成途徑及相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子

1.1 生物合成途徑

在廣藿香中,與百秋李醇合成相關(guān)的途徑主要有兩條,一是定位于細(xì)胞質(zhì)的甲羥戊酸(mevalonate,MVA)途徑,二是定位于葉綠體的甲基赤蘚糖-4-磷酸(methylerythritol-4-phosphate,MEP)途徑,兩者均可產(chǎn)生異戊烯基焦磷酸(isopentenyl diphosphate,IPP)及其異構(gòu)體二甲基烯丙基焦磷酸(dimethylallyl diphosphate,DMAPP),IPP可與DMAPP反應(yīng)生成法呢基焦磷酸(farnesyl diphosphate,F(xiàn)PP)、牻牛兒基焦磷酸(geranyl diphosphate,GPP)和牻牛兒基焦磷酸(geranylgeranyl diphosphate,GGPP)等合成萜類化合物的直接前體物質(zhì)[14]。一般情況下,百秋李醇主要是由MVA途徑產(chǎn)生的FPP為前體合成的(圖1)[15]。百秋李醇合成后有兩條去路,一是以混合精油形式在廣藿香花、根、莖、葉的特定細(xì)胞中存儲(chǔ)[16];二是以揮發(fā)物形式釋放到外界環(huán)境。

在百秋李醇的合成中有6個(gè)關(guān)鍵酶(圖1),分別為乙酰CoA酰基轉(zhuǎn)移酶(PatAACT)、3-羥基-3-甲基戊二酰CoA合成酶(PatHMGS)、3-羥基-3-甲基戊二酰CoA還原酶(PatHMGR)、異戊烯基焦磷酸異構(gòu)酶(PatIPI)、法呢基焦磷酸合酶(PatFPS)和百秋李醇合酶(PatPTS)等,其中后4個(gè)酶已被克隆并進(jìn)行了功能驗(yàn)證(表1)。唐云等[17]和盧昌化等[18]構(gòu)建了pCAMBIA1304-PatFPS和pR101-PatPTS的雙元表達(dá)載體發(fā)現(xiàn),過(guò)表達(dá)PatFPS和PatPTS可促進(jìn)百秋李醇的合成;Yan等[19]和Zhang等[20]分別構(gòu)建了基因沉默載體pTRV2-PatIPI和過(guò)表達(dá)載體pCAMBIA1300-35S-PatHMGR發(fā)現(xiàn),沉默PatIPI會(huì)顯著降低百秋李醇含量,而過(guò)表達(dá)PatHMGR則使百秋李醇含量顯著增多;以上研究表明PatHMGR、PatIPI、PatFPS和PatPTS參與百秋李醇的生物合成。

表1 廣藿香百秋李醇合成途徑中已經(jīng)克隆的酶Table 1 Enzymes cloned in the synthetic pathway of patchoulol in P. cablin

1.2 相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子

轉(zhuǎn)錄因子可影響酶基因表達(dá)的特異性、時(shí)空性和高效性,故其在百秋李醇的合成中也具有重要作用。轉(zhuǎn)錄因子是一種DNA結(jié)合蛋白,常與順式元件結(jié)合以調(diào)控基因的表達(dá)。迄今,與百秋李醇生物合成調(diào)控相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子有6類,包括MYB家族(1個(gè))、bHLH家族(2個(gè))、SPL家族(1個(gè))和TH家族(1個(gè))。

MYB是植物中最大的轉(zhuǎn)錄因子家族,參與次生代謝產(chǎn)物合成調(diào)控;Chen等[27]發(fā)現(xiàn)定位于細(xì)胞核PatMYB46(PatSWC4),可與PatJAZ4結(jié)合調(diào)控PatPTS的表達(dá),過(guò)表達(dá)PatMYB46可顯著上調(diào)百秋李醇生物合成途徑中所有酶基因的表達(dá)水平,從而提高百秋李醇的含量。MYC轉(zhuǎn)錄因子是bHLH家族中的一個(gè)亞類;Wang等[28]發(fā)現(xiàn)PatMYC2b1和PatMYC2b2均可與PatJAZ6結(jié)合影響PatPTS的表達(dá)水平,但該研究更側(cè)重對(duì)PatJAZ6的研究,并沒有對(duì)PatMYC2b1和PatMYC2b2的生物學(xué)特征進(jìn)行系統(tǒng)分析。TH家族是與光反應(yīng)調(diào)控相關(guān)一類轉(zhuǎn)錄因子;Li等[29]發(fā)現(xiàn)廣藿香中的16個(gè)PatTH的組織表達(dá)模式有所不同,PaTH1,4,7,8,9,15在葉中表達(dá)最高,PatTH3和PatTH6則分別主要在莖和根中表達(dá);進(jìn)一步分析表明PatGT-1可與PatHMGR的啟動(dòng)子結(jié)合,抑制其表達(dá);且在廣藿香中過(guò)表達(dá)PatGT-1會(huì)抑制百秋李醇合成途徑所有酶的表達(dá),從而抑制百秋李醇的合成[29]。SPL是植物特有轉(zhuǎn)錄因子家族,其最大的特征是具備miRNA156/157識(shí)別位點(diǎn),miRNA156/157可通過(guò)mRNA剪切或翻譯抑制等作用,調(diào)控SPL基因的表達(dá)水平;Yu等[30]發(fā)現(xiàn)SPL10可調(diào)控廣藿香中PatPTS的表達(dá),以促進(jìn)百秋李醇的合成,驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)過(guò)表達(dá)SPL10(At1g27370)可顯著提高百秋李醇的含量。此外,與廣藿香相關(guān)還有WRKY家族;唐云等[31]克隆了PatWRKY40和PatWRKY53兩個(gè)基因;其中PatWRKY40在廣藿香中的表達(dá)具有組織表達(dá)差異性,在葉中表達(dá)量最高,其次為花和莖;但對(duì)于兩者是否參與百秋李醇的合成調(diào)控還不清楚。

轉(zhuǎn)錄因子可激活特定代謝通路中多個(gè)基因的協(xié)同表達(dá),改造轉(zhuǎn)錄因子提高藥用植物中活性物質(zhì)產(chǎn)量的方法,可彌補(bǔ)單個(gè)基因或多個(gè)基因改造后出現(xiàn)的效果不足、甚至致死的現(xiàn)象[32]。系統(tǒng)了解與百秋李醇生物合成相關(guān)酶及轉(zhuǎn)錄因子的作用,對(duì)提高廣藿香中百秋李醇含量具有重要意義。

2 百秋李醇分子調(diào)控機(jī)制

百秋李醇本質(zhì)上是一種倍半萜,其合成主要受兩方面因素的調(diào)控,一是生物因素,包括發(fā)育階段、組織特異性等;二是非生物因素,如外源植物激素、晝夜節(jié)律、溫度和礦質(zhì)因子等。本部分將重點(diǎn)介紹外源植物激素、發(fā)育階段與晝夜節(jié)律等調(diào)控百秋李醇合成的分子機(jī)制。

2.1 外源植物激素調(diào)控百秋李醇合成

外源植物激素是人為施加,可在一定范圍內(nèi)促進(jìn)或抑制植物生長(zhǎng)發(fā)育等過(guò)程的有機(jī)化合物。在廣藿香研究中涉及過(guò)5種植物激素[27],包括茉莉酸類、脫落酸、乙烯、水楊酸和赤霉素,其中以茉莉酸類的研究最為深入。茉莉酸類物質(zhì)(jasmonates,JAs)主要包括茉莉酸和茉莉酸甲酯(methyl-jasmonate,MeJA)等,在茉莉酸信號(hào)通路中作為信號(hào)分子發(fā)揮作用[33]。當(dāng)外界脅迫發(fā)生后,JAs可迅速合成并轉(zhuǎn)運(yùn)至細(xì)胞核,與抑制子JAZ(jasmonate ZIM domain protein)和E3泛素化酶SCFCOI1組成的共接受子結(jié)合,引起JAZ蛋白的泛素化降解,釋放與之結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子,從而激活或抑制次生代謝產(chǎn)物合成途徑關(guān)鍵酶基因的表達(dá)[34]。

多項(xiàng)研究表明JAs可調(diào)控廣藿香百秋李醇的生物合成。何夢(mèng)玲等[35]率先發(fā)現(xiàn)MeJA可促進(jìn)廣藿香中百秋李醇的合成。Chen等[36]發(fā)現(xiàn)MeJA可上調(diào)PatHMGR1和PatHMGR2(MAV途徑)、PatDXS和PatHDR(MEP途徑)以及PatPTS等基因的表達(dá)。Tang等[14]發(fā)現(xiàn)以MeJA處理6 h,可顯著上調(diào)PatATCC、PatHMGR、PatMVD、PatFPS等4個(gè)基因的表達(dá)水平,且百秋李醇的含量顯著增多。但要注意,不同的處理時(shí)間產(chǎn)生的結(jié)果有差異。如Li等[30]以MeJA處理12 h后,會(huì)上調(diào)PatGT-1的表達(dá)水平。

JAZ蛋白通常作為茉莉酸信號(hào)通路中的抑制子,在JAs調(diào)控的百秋李醇合成中具有重要作用。Chen等[36]發(fā)現(xiàn)MeJA可顯著上調(diào)PatJAZ2,3,4,6,11等5個(gè)基因的表達(dá),或與百秋李醇的含量增多相關(guān)。Wang等[29]在廣藿香中過(guò)表達(dá)PatJAZ6,可抑制PatPTS、PatMYC2b1、PatMYC2b2的表達(dá);深入分析發(fā)現(xiàn)PatJAZ6可與PatMYC2b1或PatMYC2b2結(jié)合,負(fù)調(diào)控PatPTS的表達(dá),而MeJA可與PatJAZ6結(jié)合,使其在SCFCOI1的作用下泛素化,隨后被26S蛋白酶體降解,釋放PatMYC2b1和PatMYC2b2,激活PatPTS的表達(dá)(圖1)。近期,Chen等[27]發(fā)現(xiàn)PatJAZ4可與PatMYB46結(jié)合,負(fù)調(diào)控PatPTS的表達(dá),而MeJA也可逆轉(zhuǎn)其負(fù)調(diào)控效果(圖1)。鄧靜文等[37]研究表明PatJAZ2是響應(yīng)MeJA誘導(dǎo)百秋李醇合成的主要順式元件,其可激活倍半萜合成途徑PatFPS基因的協(xié)同表達(dá),影響百秋李醇的合成情況。

圖1 廣藿香百秋李醇合成途徑與分子調(diào)控模式圖[27-30]Fig. 1 Synthetic pathway and molecular regulation model of patchoulo in P. cablin[27-30]

綜上可知,植物激素MeJA調(diào)控百秋李醇的機(jī)制主要有兩方面:一是調(diào)控百秋李醇合成途徑PatHMGR、PatFPS、PatIPI等基因的表達(dá),促進(jìn)前體物質(zhì)的合成,間接影響百秋李醇的合成;二是通過(guò)影響相應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子與抑制子的結(jié)合情況,調(diào)控PatPTS的表達(dá),直接影響百秋李醇的合成。但以上研究中均以葉片中存儲(chǔ)的百秋李醇作為實(shí)驗(yàn)指標(biāo),忽略了釋放到環(huán)境中的百秋李醇,這或?qū)σ延薪Y(jié)果造成一定的影響。

2.2 晝夜節(jié)律與發(fā)育階段調(diào)控百秋李醇合成

廣藿香百秋李醇的合成具有時(shí)間特異性,主要在兩方面展現(xiàn),一是晝夜節(jié)律性(短期),即在同一天的不同時(shí)刻產(chǎn)生的規(guī)律變化;二是發(fā)育階段性(長(zhǎng)期),即隨不同生長(zhǎng)時(shí)期而產(chǎn)生規(guī)律的變化。劉璐等[38]發(fā)現(xiàn)百秋李醇的合成受晝夜變化的影響,廣藿香中百秋李醇的含量分別于00:00和12:00達(dá)到最低和最高;從00:00到06:00點(diǎn),其含量先急劇上升后下降;從12:00到21:00點(diǎn)則相反。羅集鵬等[39]和Yu等[28]檢測(cè)到廣藿香葉片和莖中的百秋李醇含量會(huì)隨著生長(zhǎng)期推進(jìn)而增加。

百秋李醇合成受發(fā)育階段調(diào)控的現(xiàn)象,在不同組織中保守程度也有所差異。Quyang等[40]發(fā)現(xiàn)葉片中百秋李醇合成受發(fā)育階段調(diào)控的現(xiàn)象,在中國(guó)和印度尼西亞兩個(gè)品種之間是相對(duì)保守的,而莖中該現(xiàn)象在兩個(gè)品種之間卻有所變化,表明發(fā)育階段調(diào)控的百秋李醇合成受品種和組織特異性的影響。SPL是調(diào)控植物生長(zhǎng)轉(zhuǎn)變的一類重要轉(zhuǎn)錄因子,Yu等[28]發(fā)現(xiàn)在廣藿香中過(guò)表達(dá)SPL10(At1g27370)可顯著提高百秋李醇的含量,而過(guò)表達(dá)miRNA156則相反(圖1),這表明miRNA156與SPL轉(zhuǎn)錄因子參與百秋李醇的合成調(diào)控。miRNA156可抑制SPL的表達(dá),這可能是出現(xiàn)過(guò)表達(dá)miRNA156和SPL10效果不同的原因。

綜上,發(fā)育階段和晝夜節(jié)律可調(diào)控廣藿香百秋李醇的生物合成,且受栽培品種和組織特異性的影響,而miRNA156靶標(biāo)的SPL10在發(fā)育階段調(diào)控百秋李醇的生物合成中具有重要作用。但該研究中使用的SPL10是擬南芥At1g27370,對(duì)于廣藿香中SPL轉(zhuǎn)錄因子在百秋李醇合成調(diào)控中的作用仍不清楚。

3 百秋李醇的合成生物學(xué)工程

百秋李醇的獲取主要有兩種方式,一是從廣藿香中天然萃取,二是以合成生物學(xué)工程生產(chǎn)。植物提取法效率低、產(chǎn)量少、穩(wěn)定性差,不能滿足市場(chǎng)需求,合成生物學(xué)工程生產(chǎn)萜類化合物效率高、經(jīng)濟(jì)環(huán)保且供應(yīng)穩(wěn)定性好,成為了獲取百秋李醇的熱門手段。本部分將從以下3方面介紹近年來(lái)百秋李醇合成生物學(xué)的相關(guān)進(jìn)展。

3.1 不同來(lái)源底盤細(xì)胞的構(gòu)建

底盤細(xì)胞的構(gòu)建是異源合成百秋李醇的第一步。底盤細(xì)胞是參照工程學(xué)理念置入特定功能的人工生物系統(tǒng)。迄今,可用于合成百秋李醇的底盤細(xì)胞有7種,包括微生物(釀酒酵母、谷氨酸棒桿菌、莢膜紅螺菌)和植物(煙草、萊茵衣藻、小立碗蘚、地錢)(表2)。

表2 用于合成百秋李醇的7種生物底盤Table 2 Seven biological chassis used to synthesize patchoulol

3.1.1 微生物來(lái)源的底盤細(xì)胞構(gòu)建 釀酒酵母是最早用來(lái)生產(chǎn)百秋李醇的底盤細(xì)胞,其構(gòu)建策略主要可分為以下4方面[51]:一是過(guò)表達(dá)MVA途徑關(guān)鍵酶,增加前體物質(zhì)FPP的供應(yīng);二是替換基因元件的啟動(dòng)子,下調(diào)其他競(jìng)爭(zhēng)通路;三是敲除負(fù)調(diào)控因子,抑制非目標(biāo)產(chǎn)物;四是過(guò)表達(dá)百秋李醇合酶(PatPTS)。已有報(bào)道中,常同時(shí)采用上述多個(gè)策略構(gòu)建底盤生產(chǎn)百秋李醇。Asadollahi等[44]將MET3替換角鯊烯合酶(ERG9)的啟動(dòng)子,減少FPP流向其他通路,卻使法尼醇合成增多,以致百秋李醇產(chǎn)量提高不明顯。Gruchattka等[42]敲除釀酒酵母丙酮酸脫氫酶旁路中的α-酮戊二酸脫氫酶,增加檸檬酸循環(huán)轉(zhuǎn)向萜類的代謝通量,過(guò)表達(dá)FPS(ERG20)和tHMGR(源自酵母)后,百秋李醇產(chǎn)量提高明顯,達(dá)41.6 mg/L。Ma等[9]首先將tHMGR、IPI和upc2-1整合到酵母基因組,增強(qiáng)MVA代謝通路;然后以HXT1弱化角鯊烯合酶(ERG9)的表達(dá),敲除編碼焦磷酸酶的DPP1和LPP1;并調(diào)整葡萄糖濃度以控制百秋李醇和角鯊烯代謝流,使百秋李醇產(chǎn)量達(dá)466.8 mg/L,是已有報(bào)道中最高的。

莢膜紅螺菌和谷氨酸棒桿菌是合成百秋李醇的新型細(xì)菌底盤,二者沒有MVA途徑,因此必須重構(gòu)法尼基焦磷酸合成模塊,才能合成百秋李醇。Troost等[45]在Rhodobacter capsulatus SB1003中加入nifHDK操縱子的Pnif啟動(dòng)子,使重組表達(dá)模塊僅在光照和銨耗竭的情況下被誘導(dǎo);后構(gòu)建包含1-脫氧-D-木酮糖5-磷酸(DXP)模塊,甲羥戊酸通路(MVA)模 塊(源 自Paracoccus zeaxanthinifaciens)和異戊二烯基磷酸酯(IDI)模塊(源自Rhodobacter sphaeroides)的工程菌Rhodobacter capsulatus SB1003-MAV,過(guò)表達(dá)3個(gè)模塊中的限速酶DXS、IDI、IspA基因后,百秋李醇的產(chǎn)量被提高了126倍,該研究首次在細(xì)菌中建立可嚴(yán)格控制的光反應(yīng)平臺(tái)。crtE和idsA是谷氨酸棒桿菌GGPP的編碼基因,Henke等[2]構(gòu)建了ΔcrtEΔidsA谷氨酸棒桿菌,并重構(gòu)法尼基焦磷酸合成模塊,異源表達(dá)大腸桿菌的法尼基焦磷酸合酶基因(ispAEc)和PatPTS,百秋李醇產(chǎn)量達(dá)60 mg/L。谷氨酸棒桿菌和莢膜紅螺菌主要是通過(guò)質(zhì)粒驅(qū)動(dòng)異源表達(dá),尚未見將反應(yīng)元件整合至DNA中的報(bào)道。

3.1.2 植物來(lái)源的底盤細(xì)胞構(gòu)建 煙草是最早用于合成百秋李醇的植物底盤,而萊茵衣藻、小立碗蘚和地錢3種低等植物是合成百秋李醇的新型底盤,四者特點(diǎn)見表2。Wu等[46]將PatPTS和FPS在煙草葉綠體中靶向表達(dá),率先實(shí)現(xiàn)以煙草合成百秋李醇,但該研究側(cè)重的是提高煙草抗蟲性,對(duì)以其生產(chǎn)百秋李醇方面并未深入研究。Lauersen等[47]使用核基因改造的新策略,在潮霉素抗性載體轉(zhuǎn)基因的萊茵衣藻基礎(chǔ)上,將3個(gè)拷貝(3X)PatPTS基因整合至DNA上,百秋李醇的產(chǎn)率是1XPatPTS核轉(zhuǎn)基因底盤的4倍。Zhan等[49]率先在小立碗蘚中非靶向表達(dá)PatPTS,過(guò)表達(dá)tHMGR(源自小立碗蘚),百秋李醇產(chǎn)量達(dá) 59 μg/g CDW;小立碗蘚僅含兩個(gè)二萜合酶編碼基因CPS/KS,但Zhan等[49]發(fā)現(xiàn)敲除CPS/KS并不能提高百秋李醇的合成。周璐等[50]分別將強(qiáng)啟動(dòng)子35S和CVM與FPS(源自地錢)和PatPTS連接,在地錢中共表達(dá)兩個(gè)基因后,百秋李醇產(chǎn)量為655.21 μg/g CDW,是植物底盤中報(bào)道最高的。

植物底盤細(xì)胞具有調(diào)控系統(tǒng)精密、經(jīng)濟(jì)環(huán)保等特點(diǎn),但以其為底盤生產(chǎn)百秋李醇的產(chǎn)量較低且提高幅度慢。目前,在微生物底盤中,釀酒酵母已可生產(chǎn)商用的百秋李醇,但該產(chǎn)品為瑞士Firmenich公司所擁有[52];而在植物底盤中,地錢的潛力最大,但其產(chǎn)量仍未達(dá)到商業(yè)化的要求。

3.2 合成元件的設(shè)計(jì)和組裝

合成元件的設(shè)計(jì)和組裝是實(shí)現(xiàn)百秋李醇異源合成的第二步,該部分的研究?jī)?nèi)容可分為兩方面:一是合成元件的設(shè)計(jì),即基因元件密碼子的優(yōu)化。如Henke等[2]、Troost等[45]和Asadollahi等[44]均 對(duì)PatPTS的密碼子進(jìn)行優(yōu)化,使其能在谷氨酸棒桿菌、莢膜紅螺菌和釀酒酵母中異源表達(dá)。Zhan等[49]在小立碗蘚中,以35S啟動(dòng)子控制HMGR的表達(dá)。Mitsui等[41]以S. cerevisiae和Hansenula polymorpha中15個(gè)啟動(dòng)子等對(duì)MVA途徑中的6個(gè)關(guān)鍵酶的啟動(dòng)子進(jìn)行優(yōu)化。二是設(shè)計(jì)合成元件組合模式,即優(yōu)化不同基因元件的組合方式。如Lauersen等[47]在萊茵衣藻中共表達(dá)PatPTS和FPP、PatPTS和ispAEc、PatPTS和FPP,以PatPTS和ispAEc的表達(dá)效果最好。Wu等[46]比較了2tpPatPTS、2tpFPSPatPTS、2tpPatPTS-tpFPS靶向煙草葉綠體后百秋李醇的合成情況,效果最好的是2tpPatPTStpFPS。Troost等[45]評(píng) 估 了PatPTS-IspA、PatPTSDXS、PatPTS-idi、PatPTS-MVA、PatPTS-ispA-dxs、PatPTS-ispA-dxs-idi、PatPTS-ispA-dxs-idi-MVA等不同組合生產(chǎn)百秋李醇的效果,其中雙基因組合PatPTSIspA和多基因組合PatPTS-ispA-dxs-idi的產(chǎn)量分別是對(duì)照的96倍和115倍,效果最佳。

3.3 合成反應(yīng)的優(yōu)化和提升

合成反應(yīng)的優(yōu)化和提升是實(shí)現(xiàn)百秋李醇異源生產(chǎn)的最后一步。目前,百秋李醇合成生物學(xué)工程中主要采用了4種優(yōu)化策略。

3.3.1 關(guān)鍵酶基因元件的優(yōu)化 百秋李醇合成通路中具有多個(gè)關(guān)鍵酶基因,這些元件可通過(guò)基因替換、基因元件擴(kuò)增、基因融合表達(dá)、基因簇整合及與耐藥元件組合等方式進(jìn)行優(yōu)化。如Lauersen等[47]構(gòu)建了PatPTS-CFP(mCerulean3抗性基因)和PatPTS-YFP(黃色熒光蛋白)的雙重表達(dá)系統(tǒng),使百秋李醇產(chǎn)量增加了3倍;此外,其還在萊茵衣藻中表達(dá)了3XPatPTS的融合載體,使產(chǎn)量提高4倍[47]。

3.3.2 增加前體底物FPP的供應(yīng)量 FPP可合成百秋李醇、角鯊烯或法呢醇,抑制FPP的其他代謝通路,可增加其流向百秋李醇的總量。Asadollahi等[44]抑制角鯊烯合酶編碼基因ERG9的表達(dá)后,百秋李醇的產(chǎn)量增多。Henke等[2]敲除idsA和crtE,減少DMAPP合成GGPP,促進(jìn)百秋李醇的合成。

3.3.3 引入亞細(xì)胞靶向表達(dá) MVA和MEP途徑分別在細(xì)胞質(zhì)和葉綠體形成不同的萜類前體池,對(duì)基因元件的靶向表達(dá),可提高FPP的利用效率。如周璐等[50]分別在FPS和PatPTS的5'端加入RUBISCO蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)肽信號(hào)序列,使其在地錢葉綠體中靶向表達(dá),百秋李醇的產(chǎn)量顯著增加。Peramuna等[48]在小碗立蘚中,構(gòu)建了3種細(xì)胞質(zhì)脂質(zhì)滴蛋白基因與PatPTS共表達(dá)的底盤,發(fā)現(xiàn)脂質(zhì)定位表達(dá)的細(xì)胞中百秋李醇的保留量得到顯著提高,但百秋李醇的產(chǎn)量并未增加。目前,靶向表達(dá)的策略主要針植物底盤,在微生物底盤中開展較少。

3.3.4 培養(yǎng)條件優(yōu)化 優(yōu)化發(fā)酵方式和培養(yǎng)基組成,均可提升百秋李醇的產(chǎn)量。Henke等[2]發(fā)現(xiàn)分批補(bǔ)料發(fā)酵比的震蕩培養(yǎng)效果更好。Lauersen等[47]發(fā)現(xiàn)萊茵衣藻利用不同碳源生產(chǎn)百秋李醇效果不同,以CO2、乙酸鹽、CO2加乙酸鹽為唯一碳源時(shí),百秋李醇濃度分別為351 μg/L、363 μg/L以及435 μg/L,同時(shí)添加CO2和乙酸鹽的效果最佳。

4 展望

廣藿香中百秋李醇含量低,是限制其規(guī)?;_發(fā)與利用的關(guān)鍵。利用合成生物學(xué)工程生產(chǎn)百秋李醇,不受環(huán)境和土地面積的制約,可穩(wěn)定百秋李醇的價(jià)格及供應(yīng)情況,農(nóng)業(yè)應(yīng)用價(jià)值高;而了解百秋李醇合成途徑及分子調(diào)控機(jī)制,可為合成生物學(xué)工程的開展奠定基礎(chǔ);雙管齊下,才有望解決百秋李醇供不應(yīng)求的問題。結(jié)合當(dāng)前研究現(xiàn)狀,對(duì)未來(lái)研究方向提出以下幾點(diǎn)建議。

4.1 系統(tǒng)分析百秋李醇生物合成相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子

目前,廣藿香中已鑒定的轉(zhuǎn)錄因子僅針對(duì)PatPTS、PatHMGR兩個(gè)酶,與其他關(guān)鍵酶互作的轉(zhuǎn)錄因子仍然未知;轉(zhuǎn)錄因子的活性可受磷酸化、乙酰化修飾及互作蛋白的影響,但在該方面尚未見的相關(guān)報(bào)道;深入了解轉(zhuǎn)錄因子,有助于解析百秋李醇的分子調(diào)控機(jī)制,促進(jìn)其合成生物學(xué)工程的開展。

4.2 解析激素信號(hào)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)在百秋李醇合成中的作用

百秋李醇的合成與上游信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的密不可分。百秋李醇受茉莉酸信號(hào)的調(diào)控,其他激素信號(hào)(如乙烯、脫落酸、水楊酸等)在百秋李醇生物合成中的作用仍不清楚,這些信號(hào)可否交叉調(diào)控百秋李醇的生物合成。萜類物質(zhì)的合成受多種因素的影響,因此,有必要揭示其復(fù)雜的調(diào)控機(jī)制。

4.3 建立百秋李醇合成的可控人工生物系統(tǒng)

利用環(huán)境信號(hào)(光、溫度)與內(nèi)源信號(hào)(群體感應(yīng)、壓力)建立可嚴(yán)格控制的人工生物系統(tǒng),是未來(lái)發(fā)展的趨勢(shì);尋找更高產(chǎn)的底盤細(xì)胞,設(shè)計(jì)更高效反應(yīng)元件裝配組合,提高元件、裝置、和底盤之間的適配性有助于提高百秋李醇產(chǎn)量;可結(jié)合兩方面內(nèi)容深入研究。

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