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基于網絡藥理學的疏風解毒膠囊抗病毒的活性化合物研究

2020-09-12 14:04:20周瑋欣張喚喚莊振杰鄧文慧洪志明
科技風 2020年23期

周瑋欣 張喚喚 莊振杰 鄧文慧 洪志明

摘 要: 目的:利用網絡藥理學研究疏風解毒膠囊防治病毒的活性化合物。方法:通過TCMSP檢索疏風解毒膠囊中8味中藥敗醬草、板藍根、柴胡、甘草、虎杖、連翹、蘆根、馬鞭草的化學成分與作用靶點。借助UniProt數據庫查找靶點對應基因,應用Cytoscape37.2軟件構造出藥材-化合物-靶點網絡,進而使用clusterProfiler R包對靶點進行GO功能分析和KEGG通路分析。結果:研究篩選得到151個化合物和相應靶點144個。GO功能分析得出1385個GO條目(P<0.01),包括1194個BP條目,66個CC條目,125個MF條目,分別占86%、5%、9%。KEGG通路分析獲得111條信號通路。結論:疏風解毒膠囊中的活性化合物對病毒有防治效果。

關鍵詞: 疏風解毒膠囊;病毒;網絡藥理學

中圖分類號:R285.5? 文獻標識碼:A

病毒感染歸于中醫“疫”病的范疇,認為“疫戾”之氣的侵襲為其致病因素。疏風解毒膠囊包括連翹、柴胡、板藍根、虎杖、馬鞭草、蘆根、敗醬草、甘草8味中藥,具有疏風解表、清熱解毒的作用,一項回顧性臨床研究表明疏風解毒膠囊對于治療COVID-19有著確切的療效,可促進COVID-19患者臨床癥狀的改善[1],但其作用機制研究仍處于較淺層面。

網絡藥理學是生物信息學和多向藥理學等多學科交融而成,可反映中藥復方多成分-多靶點間相互協同作用關系的一種綜合性研究方法,這與中醫藥的整體觀念、辨證論治等基本理論趨于一致[2]。本研究擬對疏風解毒膠囊中敗醬草、板藍根、柴胡、甘草、虎杖、連翹、蘆根、馬鞭草進行網絡藥理學分析,從而推測疏風解毒膠囊治療抗病毒的作用機制,為進一步探討疏風解毒膠囊抗病毒作用的物質基礎提供理論依據。

1 方法

1.1 疏風解毒膠囊中化合物及靶點的篩選

將各個中藥名稱敗醬草、板藍根、柴胡、甘草、虎杖、連翹、蘆根、馬鞭草作為關鍵詞輸入中藥系統藥理分析平臺(TCMSP,http://tcmspw.com)[3],從而獲得對應化學成分。以口服利用度(oral bioavailability,OB)與類藥性(drug-like,DL)作為篩選指標,其中OB≥30%,DL≥0.18為閾值,篩選出每味藥材的活性化合物及對應靶點。疏風解毒膠囊中敗醬草、板藍根、柴胡、甘草、虎杖、連翹、蘆根、馬鞭草等部分活性化合物基本內容見表1。

1.2 化合物-靶點網絡的構建及分析

運用Uniprot(https://www.uniprot.org/)數據庫[4],導入蛋白名稱并限定物種為人,并且將檢索得到的所有靶點改為UniprotID,從而得到靶點對應的基因名稱。通過Cytoscape3.7.2軟件構建出敗醬草、板藍根、柴胡、甘草、虎杖、連翹、蘆根、馬鞭草“藥材-化合物-靶點”網絡,進一步對化合物和靶點的網絡進行分析探究。

1.3 靶點通路分析

為進一步探析篩選出的基因靶點的分子功能及涉及的相關通路信息,使用R軟件包clusterProfiler[10]進行GO(Gene ontology)功能分析及KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析。在clusterProfiler中將研究物種設定為“homo sapiens”(人類),通過GO中進行GO富集分析,包括生物過程(BP)、細胞組成(CC)、分子功能(MF)3個部分;選擇Pathway分析中KEGG Pathway進行通路富集分析。以P<0.01為閾值篩選基因靶點所涉及的主要富集的基因本體功能和通路信息,并對富集分析結果進行繪圖可視化。

2 結果

2.1 疏風解毒膠囊活性化合物篩選結果

疏風解毒膠囊活性化合物篩選結果 通過TCMSP檢索到符合條件OB≥30%,DL≥0.18的敗醬草、板藍根、柴胡、甘草、虎杖、連翹、蘆根、馬鞭草活性化合物共有179個,其中11個來源于敗醬草,31個來源于板藍根,11個來源于柴胡,88個來源于甘草,8個來源于虎杖,18個來源于連翹,1個來源于蘆根,11個來源于馬鞭草。去掉重復值后,疏風解毒膠囊活性化合物共有151個,靶點共有144個。

2.2 藥材-化合物-靶點相互作用網絡

藥材-化合物-靶點網絡合計303個節點(8個藥材節點、151個化合物節點、144個靶點節點)與1200條邊,其中藥材用藍色六邊形表示,化合物用青綠色正方形表示,靶點用粉紅色圓形表示,每條邊則體現著藥材中所含化合物及化合物與靶點的相互作用關系,節點的大小與節點的度值呈正比(圖1)。其中MOL000098-槲皮素、MOL000422-山柰酚、MOL000006-木犀草素、MOL000173-漢黃芩素、MOL002773-β-胡蘿卜素、MOL004328-柚皮素、MOL000358-β-谷甾醇、MOL013287-毒扁豆次堿、MOL000354-異鼠李素、MOL000449-豆甾醇為關鍵化合物,能分別與90、38、35、23、22、22、21、20、18、18個靶點相互作用。靶點的度值由高到低排序為ESR1、AR、PTGS1、NCOA2、PRSS1、GSK3B、ESR2、CHEK1、ACHE、NCOA1,能分別與92、86、76、74、72、66、63、55、29、28個化合物相互作用。

2.3 GO生物過程分析

對疏風解毒膠囊敗醬草、板藍根、柴胡、甘草、虎杖、連翹、蘆根、馬鞭草144個作用靶點通過GO功能富集分析結果共有GO條目1385個(P<0.01),其中生物過程(BP)條目有1194個,細胞組成(CC)條目有66個,分子功能(MF)條目有125個,占比例分別為86%、5%、9%。見圖2。

2.4 KEGG信號通路富集分析

對疏風解毒膠囊敗醬草、板藍根、柴胡、甘草、虎杖、連翹、蘆根、馬鞭草144個作用靶點進行KEGG通路富集篩選得到了111條信號通路(P<0.01)。這包含PI3K-Akt信號通路(PI3K-Akt signaling pathway)、MAPK信號通路(MAPK signaling pathway)、前列腺癌(Prostate cancer)、乙型肝炎(Hepatitis B)、細胞凋亡(Apoptosis)等信號通路。前15條通路的可視化處理結果見圖3。

3 討論

中醫藥在辨證論治、未病先防方面具有其獨特的優勢,并可在患者康復階段進行整體調節[5]。疏風解毒膠囊在臨床上常應用于急性上呼吸道感染的治療,現代研究表明其可有效降低血清IgM、IgG、BK、MCP-1水平以及B淋巴細胞比例,并且升高NK細胞比例,有效調節免疫功能[6]。

由網絡藥理學分析結果可知,疏風解毒膠囊的關鍵化合物為漢黃芩素、槲皮素、豆甾醇、β-谷甾醇等10種,其中β-谷甾醇可有效降低炎性細胞因子的過表達、TNF-α和IL-6的含量、肺組織濕/干重比值和肺含水量,保護肺組織及其生理功能[7]。

KEGG信號通路富集涉及PI3K-Akt信號通路、MAPK信號通路、前列腺癌、乙型肝炎、細胞凋亡等信號通路。其中PI3K-Akt信號通路對細胞的增殖、凋亡、遷移等發揮重要作用,通過影響RACK1和rac1的表達,調控炎癥細胞活化和炎癥介質釋放,參與脂多糖介導的細胞損傷過程,從而損傷肺微血管[8,9]。MAPK信號通路可誘導P-選擇素、TGF-β、KC、C-Jun/AP-1等炎性和凋亡因子的表達,引起持續的炎癥刺激及氣道狹窄和重塑,影響急性肺損傷的炎癥反應[10]。PI3K-Akt信號通路和MAPK信號通路均涉及RRELA、IKBKB、EGFR、VEGFA基因,是山奈酚、木犀草素、槲皮素等疏風解毒膠囊關鍵化合物的作用靶點。因此,疏風解毒膠囊可通過多成分-多靶點-多途徑協同調節炎癥、免疫、細胞凋亡等相關通路,調節上呼吸道感染中的炎癥反應和免疫應答過程,以達到抗病毒的效果。

綜上所述,本研究利用網絡藥理學對疏風解毒膠囊抗病毒的活性成分、靶點和通路進行了研究分析,得出疏風解毒膠囊可有效抗病毒,但目前網絡藥理學具有一定局限性,本研究預測的結果還有待動物體內外實驗進行驗證,為后期藥物開發提供實驗依據。

參考文獻:

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基金項目: 深圳市中醫重點專科建設項目(2019-2023年);廣東省中醫藥局“十三五”中醫重點專科建設項目

作者簡介: 周瑋欣(1998—),女,漢族,廣東東莞人,本科,研究方向:中醫學;洪志明(1982—),男,漢族,湖南株洲人,博士,副主任醫師,研究方向:中醫學。

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