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非小細胞肺癌患者癌組織及血清中circRNA的表達水平及臨床意義

2020-09-05 02:43:54楊桄權張千仕范習剛吳飛
分子診斷與治療雜志 2020年8期
關鍵詞:肺癌血清差異

楊桄權 張千仕 范習剛 吳飛

肺癌作為一種惡性程度較高、發病率高居世界第一位的腫瘤疾病,在世界范圍內均為較嚴重的公共衛生問題,其中非小細胞肺癌(Non small cell lung cancer,NSCLC)占比最高[1]。肺癌在我國的發病率較高的原因在于未受控制的煙草消費、日益嚴重的環境污染和生活習慣改變,雖然疾病診斷和治療都有較大進步,但其發生、發展、轉移機制尚未明確,且早期診斷較為困難,因此患者5年生存率仍較低[2]。若能在肺癌患者早期予以確診并實施有效的治療方式,則可顯著延長患者生存期,提高生存質量[3]。組織病理學作為診斷金標準一般需通過手術或穿刺獲取靶組織,對患者有一定的生理、心理創傷,而臨床常見的血清腫瘤標記物在早期診斷方面缺乏足夠的靈敏度[4]。因此尋找創傷小、穩定性好、靈敏度高的新型生物標志物對NSCLC 的診斷和治療有積極意義。本研究旨在探討NSCLC 患者癌組織及血清中環狀RNA(circRNA)的臨床意義,為疾病診斷提供科學依據,現報道如下。

1 資料和方法

1.1 一般資料

選擇2019年1月至2019年12月于本院進行手術治療的56 例NSCLC 患者為研究對象。收集其中10 例患者的病理組織標本,要求癌組織經冰凍切片后組織HE 染色顯示癌細胞比例≧70%;取癌組織外緣5 cm 處的癌旁組織為對照組,要求染色后顯示不含癌細胞,且經免疫組化ABC 法染色為陰性。10 例患者中男性7 例,女性3 例;年齡(62.13±8.24)歲;肺鱗癌6 例,肺腺癌4 例;TNM 分期Ⅰ期4 例,Ⅱ期5 例,Ⅲ期1 例;低度分化7 例,中度分化3 例;吸煙或戒煙者6 例,未吸煙者4例。余下46 例NSCLC 患者進行血清circRNA 檢測,其中男性32 例,女性14 例;年齡(60.48±9.15)歲,收集病理類型、臨床分期、分化程度、吸煙狀態等資料。按照1∶1 進行匹配,選擇46 例健康志愿者為對照組進行血清circRNA 檢測,均無惡性腫瘤疾病家族史,既往無放化療史,其中男性30 例,女性16 例;年齡(61.57±8.85)歲。NSCLC 組和對照組性別、年齡比較差異無統計學意義(P>0.05),具有可比性。本研究經我院醫學倫理委員會批準。

入組標準①年齡≧18 歲,性別不限;②經病理組織檢查確診為NSCLC;③術前血常規、心電圖、肝腎功能等檢查均達治療要求;④術前無嚴重合并癥,無手術禁忌癥;⑤患者自愿簽署知情同意書。排除標準①病理資料不全,TNM 分期不詳者;②合并其他惡性腫瘤者;③術前接受放化療治療者;④患者依從性差,不能配合研究者。

1.2 方法

1.2.1 癌組織和癌旁組織檢測

①使用TRIzol 試劑盒(美國Invitrogen 公司提供)分別提取10 例患者的癌組織和癌旁組織中的總RNA,測定RNA 在260、280、230 nm 處的吸光度值,計算濃度并估算純度,用甲醛變性瓊脂糖凝膠電泳法檢測RNA 的純度和完整性。②使用RNaseR(美國Epicentre 公司提供)除去標本總RNA 中的線性RNA,采用Super RNA Labeling(美國Arraystar 公司提供)對RNA 進行cDNA 擴增和熒光標記。③將標記后的樣本和Human circRNA Array V2(8×15K)芯片(美國Arraystar 公司提供)進行排列雜交,用清洗液試劑盒(美國Agilent 公司提供)進行清洗。④上海康成生物公司提供circRNA 芯片檢測、圖像采集、數據分析等。

1.2.2 血清檢測

采集肺癌患者和對照組對象清晨空腹肘靜脈血5 mL,離心分離血清保存,用TRIzol LS 試劑(美國Invitrogen 公司提供)提取血清總RNA,分光光度計測定RNA 濃度,將RNA 反轉錄為cDNA,以cDNA 為模板進行實時熒光定量PCR,以2-ΔΔCt值表示目的circRNA 的相對表達水平。

1.3 統計學處理

采用SPSS 21.0 軟件進行數據分析,計數資料以n(%)表示,組間比較采用χ2檢驗;符合正態分布的計量資料以(±s)表示,組間比較采用獨立樣本t檢驗;采取受試者工作曲線(ROC)分析血清circRNA 對NSCLC 的診斷價值,記錄曲線下面積(AUC);應用G2505C 基因芯片掃描儀(美國Agilent 公司提供)掃描組織標本Cy3 熒光強度,采用Agilent Feature Extraction software 進行數據分析,使用R 平臺對數據進行歸一化處理,對篩選出的差異表達circRNA 繪制火山圖,進行聚類分析,以P<0.05 表示差異有統計學意義。

2 結果

2.1 NSCLC 患者組織中circRNA 差異表達分析

R 平臺DESeq2 軟件篩選出癌組織和癌旁組織中差異表達顯著的circRNA 共181 個(Fold change≧2 或≦-2),差異有統計學意義(P<0.05),繪制火山圖,其中117 個表達上調(紅色區域),64 個表達下調(藍色區域),見圖1。

圖1 circRNA 差異表達火山圖Figure 1 Volcano plot of circRNA differential expression

2.2 circRNA 聚類分析

根據各組標本circRNA 表達量的高低不同繪制聚類分析圖,圖中紅色表示circRNA 表達量相對高,綠色表示表達量相對低,差異表達的circRNA可明顯區分癌組織和癌旁組織,見圖2。

圖2 circRNA 差異表達聚類分析圖Figure 2 Cluster analysis of circRNA differential expression

2.3 NSCLC 患者血清circRNA 表達水平與臨床特征的關系

NSCLC 患者血清circRNA 表達水平與性別、年齡、吸煙狀態、分化程度、病理類型、臨床分期均無顯著相關性(P>0.05),見表1。

表1 NSCLC 患者血清circRNA 表達水平與臨床特征的關系(±s)Table 1 Relationship between serum circRNA expression and clinical features in patients with NSCLC(±s)

表1 NSCLC 患者血清circRNA 表達水平與臨床特征的關系(±s)Table 1 Relationship between serum circRNA expression and clinical features in patients with NSCLC(±s)

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2.4 血清circRNA 對NSCLC 的診斷價值分析

NSCLC 組患者血清circRNA 表達水平明顯高于對照組(t=5.052,P<0.05)。繪制ROC 曲線,結果顯示,血清circRNA 診斷NSCLC 的敏感度為80.43%,特異度為58.70%,AUC 值為0.752(95%CI:0.651~0.836),見圖3。

圖3 血清circRNA 診斷NSCLC 的ROC 曲線Figure 3 ROC curve of serum circRNA for NSCLC diagnosis

3 討論

肺癌是較為嚴重的公共衛生問題,臨床上十分重視對肺癌發生機制及診斷治療措施的研究,目前認為基因的表達和調控直接參與到惡性腫瘤的發生發展過程中[5]。人類基因組中超過90%的基因不具有編碼蛋白質的能力,可被轉錄成非編碼RNA(ncRNA),既往已有研究表明ncRNA 的異常表達能夠影響肺癌的發生和發展[6]。隨著高通量測序技術和生物信息學的不斷發展,哺乳動物體內發現大量內源性的circRNA,不僅擴充了ncRNA 家族的范疇,也被發現具備特定的生物學功能,可參與多種疾病的發生發展過程中,在多種類別腫瘤細胞(包括直腸癌、肺癌等)的克隆形成、增值、凋亡、侵襲、轉移過程中發揮重要作用[7-8]。

circRNA 作為一種具有特殊結構耐受核酸外切酶降解的內源性ncRNA,在人體細胞中表達廣泛、豐度高,多數在進化上存在高度序列保守性,結構穩定,具有組織特異性表達和時序特異性表達的特征[9]。ncRNA 多由外顯子環化形成,主要位于細胞質中,具備微小RNA(miRNA)反應元件,可與miRNA 結合阻礙其與mRNA 的靶點結合,抑制miRNA 功能,或參與調節miRNA 降低活性,從而在疾病中發揮重要作用[10]。火山圖分析發現差異表達顯著的circRNA 中有117 個表達上調,64 個表達下調,據此推測差異表達的circRNA多數在NSCLC 的發生發展過程中可能起到促癌作用。聚類分析結果顯示表達差異的circRNA 在癌組織和正常組織中表達有顯著差異,可用于區分NSCLC 癌組織和癌旁組織,對火山圖分析的結果有較好的補充作用。但本研究篩選的樣本數量較少,存在一定局限性,尚需進行大樣本的臨床研究和基礎研究加以證實,并進一步探討circRNA 在肺癌發生發展中的作用機制。

本研究結果推測circRNA 在疾病進展中有一定促進作用,與癌組織檢測結果相互印證,具有較高的可靠性。組織細胞壞死凋亡后的碎片通過囊泡釋放至血液中形成的循環游離RNA 被認為是血清circRNA 的主要來源,血清中囊泡存在circRNA 的富集[11],分析認為circRNA 在癌組織和血清中的表達水平存在一定相關性,今后可針對血清circRNA 的來源問題進行進一步的研究。采取ROC 曲線結果顯示,該血清指標診斷NSCLC 的效能較高。分析認為,血清circRNA 具備作為NSCLC 無創性診斷標志物的潛質,結合癌組織檢測結果作出綜合判斷,可為未來NSCLC 的臨床診斷和靶向治療提供一定的參考。本研究對NSCLC患者血清circRNA 表達水平與臨床特征的關系進行了分析,結果表明,血清circRNA 水平與性別、年齡、吸煙狀態、分化程度、病理類型、臨床分期均無顯著相關性,可能與入組病例數過少有關,或與病例選擇存在偏倚有關。

綜上所述,NSCLC 癌組織和癌旁組織的circRNA 表達存在顯著差異,血清circRNA 對NSCLC有較好的診斷價值,circRNA 可能與疾病進展存在一定關聯。臨床應進一步深入研究circRNA 參與NSCLC 的發生發展過程及作用機制,為該疾病的早期診斷、靶向治療及預后評估提供新思路。

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