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荊州市新型冠狀病毒肺炎時空分布特征分析

2020-07-06 01:55:20藺茂文田克卿曾旻敏雷若倩姚夢雷黃繼貴
上海交通大學學報(醫學版) 2020年5期
關鍵詞:分析

藺茂文,劉 天,田克卿,江 鴻,曾旻敏,王 麗,殷 俊,雷若倩,姚夢雷,黃繼貴

湖北省荊州市疾病預防控制中心,荊州 434000

新型冠狀病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)是由新型冠狀病毒SARS-CoV-2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2)感染引起的,以呼吸道飛沫、接觸傳播為主的急性呼吸道傳染病[1-3]。截至2020 年3 月12 日24 時,我國累計報告確診病例80 813 例,其中湖北省累計報告確診病例67 786 例[4]。荊州市位于湖北省中南部,地處長江中游,是江漢平原腹地,距武漢市約250 km。截至2020 年3 月12 日24 時,荊州市累計報告COVID-19 確診病例1 580 例,位居湖北省第4 位[5]。百度人口遷徙數據顯示,2020 年1 月1 日—23 日武漢市累計遷出總人口數中,遷出地為荊州市的人數居第3 位[6]。為探討COVID-19 在該市時空分布的特點,本研究利用地理信息技術對荊州市COVID-19 時空聚集性、聚集趨勢進行分析,以識別COVID-19 的高風險區域,評估荊州市的防控效果。

1 資料與方法

1.1 資料來源

荊州市COVID-19 病例信息來源于中國疾病監測信息報告管理系統,人口資料來源于網絡直報系統子系統基本信息系統。將現住址為荊州市、發病日期為2020 年1 月 1 日—3 月12 日的病例資料導出,病例類型包括確診病例、臨床診斷病例和核酸檢測陽性病例。荊州市1:1 800 000 矢量化縣(市、區)界、鄉鎮(街道)界地圖由荊州市疾病預防控制中心提供。

1.2 統計分析

運用ArcGIS 10.0 軟件繪制空間分布地圖,進行趨勢面分析、全局空間自相關分析、局部空間自相關分析。運用SaTScan 9.5 軟件進行時空掃描分析。采用Excel 2019軟件整理資料并進行統計分析,P<0.05 認為差異有統計學意義。

1.2.1 趨勢面分析 趨勢面分析是將采樣點Z 作為散點圖投影到XZ 和YZ 平面上,再根據投影平面上的散點圖,通過多項式擬合做出擬合線,以模擬Z 的空間趨勢[7-9]。其中X、Y、Z 分別表示經度、緯度和COVID-19 發病率,本研究選擇二次多項式進行擬合。

1.2.2 全局空間自相關分析 全局空間自相關(Global Moran's I)探測整個研究區域的空間模式,目的在于分析某種現象在空間上是否具有聚集的特性,Global Moran's I系數為常用指標。Moran's I 系數取值范圍為–1 ~1,取值越接近1,說明COVID-19 發病率與空間的正相關性越強(高發病率地區聚集在其他高發病率地區附近,低發病率地區聚集在其他低發病率地區附近);取值越接近–1,說明COVID-19 發病率與空間的負相關性越強(高發病率地區排斥其他高發病率地區,而傾向于靠近低發病率地區);取值為0,說明發病率與空間無相關性[7-8,10]。本研究運用反距離法定義空間關系的概念化,運用歐氏距離法測量距離。

1.2.3 局部空間自相關分析 全局空間自相關分析只能反映某種想象的總體空間聚集性,并不能反映某種現象的局部空間聚集特征。為了識別具體區域的聚集性,本研究采用局部Moran's I 和Getis-Ord Gi 2 種方法進行分析。局部Moran's I 分析根據局部Moran's I 值、Z 值可將局部空間關聯模式劃分為4 種類型(P<0.05):高值聚類(HH)、低值聚類(L-L)、高值由低值圍繞的異常值(H-L)、低值由高值圍繞的異常值(L-H),其中H-H、H-L、L-H提示有COVID-19 高發區。Getis-Ord Gi 分析即熱點分析,通過Gi 統計量Z 值來判斷聚集關系:其中Z>1.96,提示為高值聚集區,記為熱點;Z<-1.96,即為低值聚集區,記為冷點[10-12]。本研究為探討COVID-19 疫情在空間上隨時間變化的趨勢,以2020 年2 月10 日為界將荊州市疫情分為流行前期、流行后期。選擇2 月10 日為分割點主要基于2 點:①荊州市COVID-19 流行高峰為1 月23 日—28 日,隨著“離漢離荊通道關閉”“餐飲等服務行業停止營業”等防控措施的落實,人口流動性逐步減小,最大限度地減少了COVID-19 的傳播。理論上經過14 d(99% COVID-19 病例的潛伏期≤14 d)[13]至2 月10 日,疫情暴發趨勢應顯著下降。②2 月10 日,密切接觸者集中隔離措施正式啟動。

1.2.4 時空掃描分析 時空掃描分析的基本思想是首先采用一個以空間距離定義半徑、時間長度定義高度的圓柱體作為二維掃描窗口,掃描每一個時空事件,然后在每個窗口根據泊松分布,以人口數與總發病數計算理論發病數,通過窗口內外理論與實際發病人數構造統計量對數似然比(loglikelihood ratio,LLR),用LLR 來評價掃描窗口內發病數的異常程度。選取LLR 值較大的窗口為可能高發病聚集窗口,并計算該窗口的相對危險度(relative risk,RR)及檢驗有無統計學意義。LLR 的概率值通過蒙特卡羅隨機化法得到。最終選取LLR 值最大且有統計學意義的窗口為主聚集區,其他LLR 值較小且有統計學意義的窗口均為次聚集區[12,14]。本研究將有武漢旅行居住史的病例定義為輸入病例,無武漢旅行居住史的病例定義為本地病例,分別進行時空掃描,探討輸入病例和本地病例的聚集性差異。本研究以d 為時間單位,以15%風險人口數為最大空間尺度,并以50%時間周期為最大時間尺度[15]。

2 結果

2.1 COVID-19 發病率概況

荊州市累計報告COVID-19 病例1 623 例,發病率為29.03/10 萬,其中輸入病例804 例,本地感染819 例。在流行前期,以輸入病例為主(52.18%,765/1 466),流行后期以本地病例為主(75.16%,118/157)。在縣(市、區)層面,洪湖市發病率最高(54.12/10 萬),石首市發病率最低(14.35/10 萬);在鄉鎮(街道)層面,洪湖市新堤街道發病率最高,為176.51/10 萬(圖1)。

圖1 荊州市COVID-19 發病率地區分布Fig 1 Regional distribution on incidence rate of COVID-19 in Jingzhou City

2.2 趨勢面分析

趨勢面分析結果見圖2。其中XZ 平面上的曲線代表東西方向趨勢,YZ 平面上的曲線代表南北方向的趨勢,可以看出荊州市COVID-19 發病率自西向東呈輕微“U”形,且東部略高;自南向北呈倒“U”型,且南部略高。

圖2 荊州市COVID-19 發病率趨勢面分析Fig 2 Trend surface analysis on incidence rate of COVID-19 in Jingzhou City

2.3 全局空間自相關分析

荊州市COVID-19 全局空間自相關Moran's I 系數為0.410(P=0.000),提示COVID-19 發病率存在空間聚集性。

2.4 局部空間自相關分析

2.4.1 局部Moran's I 分析 Moran's I 分析共探測到2 個H-H 聚集區。一個聚集區包括沙市區、荊州區10 個鄉鎮(街道);另一個聚集區為洪湖市新堤街道。2 月10 日前H-H 聚集區主要集中在荊州市主城區(沙市區、荊州區)和洪湖市主城區(新堤街道),與整體數據掃描結果類似。2 月10 日后,H-H 聚集區主要為洪湖市中東部地區的 5 個鄉鎮(街道)(圖3)。

圖3 荊州市COVID-19 發病率局部空間自相關分析情況Fig 3 Local spatial autocorrelation analysis on incidence rate of COVID-19 in Jingzhou City

2.4.2 Getis-Ord Gi 分析 共探測到2 個熱點區域,一個熱點區域涵蓋沙市區、荊州區、公安縣共計17 個鄉鎮(街道);另一個熱點區域涵蓋洪湖市5 個鄉鎮(街道)。 2 月10 日前熱點區域與整體數據掃描結果基本一致;2 月10 日后,熱點區域主要集中在洪湖市中東部地區的13 個鄉鎮街道(圖4)。

圖4 荊州市COVID-19 發病率熱點分析情況Fig 4 Hot spot analysis on incidence rate of COVID-19 in Jingzhou City

2.5 時空掃描分析

2.5.1 輸入病例 共發現5 個時空聚集區(圖5,表1)。 主聚集區的聚集時間為1 月18 日—2 月3 日,聚集區域為聯合街道及周邊15 個鄉鎮(街道),半徑為13.42 km,該聚集區內COVID-19 發病風險是其他區域的7.395倍;次聚集區1 的聚集時間為1 月17 日—2 月2 日,聚集區域為黃家口鎮及周邊29 個鄉鎮(街道),半徑為33.55 km,該聚集區內COVID-19 發病風險是其他區域的6.842 倍。

2.5.2 本地病例 共發現5 個時空聚集區(圖5,表1)。主聚集區的聚集時間為1 月20 日—2 月24 日,聚集區域為新堤街道,該聚集區內COVID-19 發病風險是其他區域的16.133 倍;次聚集區1 的聚集時間為1 月22 日—2 月8 日,聚集區域為岑河原種場及周邊19 個鄉鎮(街道),半徑為18.28 km,該聚集區內COVID-19 發病風險是其他區域的8.378 倍。

圖5 荊州市COVID-19 時空掃描分布Fig 5 Spatial-temporal scanning distribution of COVID-19 in Jingzhou City

表1 荊州市COVID-19 時空掃描結果Tab 1 Spatial-temporal scanning distribution of COVID-19 in Jingzhou City

3 討論

目前,國內外對COVID-19 的研究主要集中在傳染性[16-19]、 疾病譜[20-21]等方面。本研究在鄉鎮(街道)級別上,采用趨勢面分析、全局空間自相關分析、局部空間自相關分析和時空掃描分析4 種方法,探討荊州市COVID-19 時空聚集性分布特點,識別高風險區域,評估防控效果。

總體上,荊州市COVID-19 發病率在空間上自西向東呈輕微“U”形,且東部略高;自南向北呈倒“U”型,且南部略高。全局空間自相關分析顯示,荊州市COVID-19發病率存在地區聚集性,與趨勢面分析結果一致。進一步以局部Moran's I 分析、Getis-Ord Gi 分析探討COVID-19空間聚集特點,2 種方法均顯示荊州市COVID-19 存在2個聚集區域,包括荊州市主城區(沙市區、荊州區)部分鄉鎮(街道)、洪湖市部分鄉鎮(街道),可能與荊州主城區人口密度大、武漢流入人口多,洪湖市與武漢市毗鄰有關。2020 年1 月1 日—2 月10 日,荊州市主城區為熱點區域。2 月11 日—3 月12 日,隨著“內防擴散、外防輸入”防控措施的落實,主城區不存在明顯聚集,疫情顯著下降。洪湖市在2 月10 日前后,聚集地區不斷擴大,疫情形勢嚴峻,防控措施未得到有效落實[22]。

輸入病例時空掃描結果顯示,5 個時空聚集區均與湖北省內其他地區接壤,聚集時間主要集中在1 月18 日—2 月 3 日,主聚集區位于荊州市主城區,次聚集區1 位于洪湖市,這與局部空間自相關分析結果相一致。武漢市自1 月23 日采取“離漢”通道交通管制后[23],經過14 d,有武漢暴露史的病例相繼發病,荊州市1 月底、2 月初迎來發病高峰,與時空掃描聚集時間一致,提示荊州市大部分病例均與武漢暴露史有關。

本地病例時空掃描結果顯示,2 個聚集區(新堤街道、府場鎮)聚集時間跨越了2 月10 日,提示洪湖市主城區、北部鄉鎮、監利縣北部鄉鎮防控措施未得到有效落實;其他3 個聚集區聚集時間均在2 月10 日以前,2 月10 日以后無聚集,提示大部分地區隨著1 月24 日“封城”,2 月2 日“交通管制”“社區封閉管理”后[23],傳染源管控嚴格、傳播途徑相繼被阻斷,疫情得到有效控制。

綜上所述,荊州市COVID-19 在空間上具有明顯空間聚集性。高值聚集區主要集中在荊州市主城區和洪湖市主城區,是COVID-19 防控的重點區域。除洪湖市、監利縣部分鄉鎮外,荊州市COVID-19 防控效果顯著。

致謝:感謝荊州市疾控中心、監利縣疾控中心、公安縣疾控中心、江陵縣疾控中心、洪湖市疾控中心、石首市疾控中心、松滋市疾控中心所有參與COVID-19 疫情防控的公共衛生工作者!

參·考·文·獻

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