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3 種非洲豬瘟病毒核酸檢測試劑盒的比較

2020-05-21 08:02:48王金良于新友陳金龍沈志強
今日畜牧獸醫 2020年4期
關鍵詞:檢測

王金良,于新友,陳金龍,沈志強,

(1.山東省濱州畜牧獸醫研究院 256600;2.山東綠都生物科技有限公司 256600)

非洲豬瘟于1921 年首次發生于非洲肯尼亞, 是由非洲豬瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)引起的一種烈性傳染病,其主要臨床癥狀表現為高熱、急性和高死亡率,剖檢主要變化為脾增大、淋巴組織壞死和出血、凝血不良等;在1957 年以前,該病一直在非洲中部和南部國家流行, 之后傳入歐洲的葡萄牙等國家,1970 年開始呈世界多地區流行, 包括意大利、 西班牙、巴西、 古巴等國家, 給世界各國的養豬業造成了巨大經濟損失。2018 年非洲豬瘟呈現全球大爆發、大流行態勢,新增疫情國家數同比上升30%,同年8 月ASF 傳入我國,截止2019 年7 月共發生疫情143 起,撲殺生豬116 萬頭,給我國的養豬業帶來沉重打擊。

目前,ASF 尚無有效疫苗用于預防,防控主要依靠嚴格的生物安全措施, 輔以準確、 快速的病原檢測技術。 ASFV 為雙鏈DNA 病毒,也是蟲媒DNA 病毒,病毒直徑約200nm,正六邊形,依據病毒主要衣殼蛋白p72 基因序列,ASFV 可分為24 個不同基因型,同時p72 蛋白也是ASF 血清學檢測的主要應用抗原。為了更好防控非洲豬瘟的發生, 國內外學者開展了非洲抗原抗體快速檢測技術的研究,包括免疫熒光、ELISA、免疫層析試紙條、PCR、熒光定量PCR、環介導等溫擴增等方法[1-3]。 本文選取了商品化的基于熒光定量PCR、 環介導等溫擴增技術的試劑盒進行了初步比較,旨在為產品的選擇使用提供參考。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

3 種商品化ASFV 核酸檢測試劑盒,ASFV 熒光PCR 檢測試劑盒 (試劑盒反應液為液體制劑) 為A 廠家產品、ASFV 熒光PCR 檢測試劑盒(反應液為凍干制劑)為B 廠家產品、非洲豬瘟病毒可視化DNA 檢測試劑盒(反應液為液體制劑)為C 廠家產品,檢測樣品為非洲豬瘟病毒B646L 基因質粒標準物質(標準物質編號GBW(E) 091034);所用儀器為英國MyGo pro 熒光PCR儀。

1.2 試驗方法

將非洲豬瘟病毒B646L 基因質粒標準物質進行10 倍比稀釋(1 號樣品為6×102拷貝/μL、2 號樣品為6×101拷貝/μL、3 號樣品為6×100拷貝/μL、4 號樣品為6×10-1拷貝/μL、5 號樣品為6×10-2拷貝/μL、6 號樣品為6×10-3拷貝/μL、7 號樣品為6×10-4拷貝/μL),確定可檢出限并計算PCR 加樣體系中基因拷貝濃度;通過重復檢測3 次最低拷貝數的樣品,確定3 種商品化ASFV 核酸檢測試劑盒的批內重復性。

ASFV 熒光定量PCR 檢測試劑盒的加樣體系和反應程序:加樣體系均為20μL (反應液10μL、 引物混合物7.5μL、 模板2.5μL);反應程序:95℃、30 sec,95℃、5 sec,60℃、20 sec,35 個循環。

ASFV 可視化DNA 檢測試劑盒的加樣體系和反應程序:加樣體系 (恒溫擴增反應液18μL、Bst DNA 聚合酶1μL、 模板1μL);反應程序:64℃反應50min。

2 結果與分析

2.1 三種試劑盒敏感性比較

從圖1 中可知,3 種試劑盒均具有較高的敏感性,試劑盒A敏感性最高,試劑盒B 敏感性次之,試劑盒C 的敏感性為最低,反應終體系模板拷貝數分別為0.75 拷貝/μL、7.5 拷貝/μL 和30拷貝/μL;試劑盒C 為目測法進行結果判定,而試劑盒A 和B 均借助儀器進行結果判讀, 判定方式的差異是試劑盒C 敏感性低的原因之一。

圖1 三種試劑盒敏感性比較

表1 3 種試劑盒批內檢測穩定性比較

2.2 三種試劑盒重復性比較

選取三種試劑盒的同一批次的3 個試劑盒, 分別進行試劑盒最低檢出量的樣品的檢測(試劑盒A 檢測3 號樣品、試劑盒B檢測2 號樣品、試劑盒C 檢測1 號樣品),結果表明這三種試劑盒重復試驗的結果均較好, 其中試劑盒A 和B 的批內變異系數均小于1%,試劑盒C 均可通過肉眼進行陽性結果的判定。

3 討論

非洲豬瘟對養豬業的危害巨大,一旦發病,死亡率極高,嚴重影響世界各國的社會經濟發展。 我國自非洲豬瘟暴發以來,各級政府高度重視疫情的防控工作, 希望在疫情發生的初期加以控制,最終推動非洲豬瘟的根除計劃。 目前,還沒有非常有效的非洲豬瘟疫苗,嚴格的生物安全防控,并結合快速、敏感的病毒檢測技術是控制非洲豬瘟發生、流行的主要方式[4,5]。

依據本文比較研究結果,3 種商品化的試劑盒均有很好的可重復性,可用于非洲豬瘟病毒的核酸檢測。 三種試劑盒的設計各有不同,也導致了試劑盒的敏感性的略有差異,如果檢測樣品來源于具有臨床癥狀的豬, 由于被檢測樣本含有較高的病毒含量,3 種試劑盒檢測結果不會有差異,若是無臨床癥狀的豬,或病毒含量低的檢測樣品, 可視化的試劑盒C 則有可能出現假陰性的結果;目前,基于凍干技術的非洲豬瘟檢測試劑類的產品(如試劑盒B),生產工藝上得到很大的改進,由于預分裝并凍干,這在一定程度上減少了檢測用時,降低了運輸、儲藏條件,凍干過程對檢測用酶制劑有如何影響還未見有相關研究報道; 可視化DNA 檢測試劑盒因其對實驗室條件、 檢測人員技術水平要求相對不高,可以對臨床樣本進行快速診斷,得到越來越多的應用,如能結合儀器進行結果判斷,不但可以降低人為因素的誤判,也在一定程度上會提高檢測試劑盒的敏感性。 因此,隨著非洲豬瘟防控的不斷深入,將會有更多的新技術、新方法應用于非瘟病毒核酸的檢測,哪種產品或方法更為適合,最終要依據檢測的目標樣品。

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