劉昱彤
摘?要:BCCIP是一個與BRCA2和p21相互作用的蛋白質,在眾多細胞進程中具有重要作用。p53是一種重要的腫瘤抑制基因,也是迄今發現與人類腫瘤相關性最高的基因。本文通過引入P53基因來研究BCCIP抑制腫瘤的生物學功能,驗證BCCIP與P53之間的蛋白相互作用關系。
關鍵詞:轉錄調控;BCCIP;P53;抑癌基因;蛋白質與蛋白質相互作用;表觀遺傳學
BCCIP是一個與BRCA2和p21相互作用的蛋白質。作為一種新近克隆成功的抑癌基因,BCCIP是細胞生存、基因穩定不可缺少的基因,該蛋白在胚胎發育、細胞周期調控、細胞有絲分裂、DNA同源重組(HR)以及保持基因組穩定性等眾多細胞進程中都具有重要作用[1]。截至到目前的研究,在Bio GRID數據庫記錄的BCCIP相互作用蛋白有50多種,功能涉及多種細胞生物學過程,預示著BCCIP蛋白在更多方面的功能還有待進一步研究。有研究表明,BCCIP基因在乳腺癌、腦神經膠質瘤、喉癌、肺癌、黑色素瘤、腎癌、前列腺癌等組織中的表達量均有降低或不表達[2],提示BCCIP與這些腫瘤的發生相關,也進一步證實了BCCIP可能為一個重要的抑癌基因。
為了進一步探討BCCIP的功能和作用機制,我們將研究BCCIP與P53之間相互作用的關鍵性結構域以揭示BCCIP在腫瘤中發揮的功能。因此,我們引入P53基因來研究BCCIP抑制腫瘤的生物學功能。已有研究證實,BCCIP通過調節p53的轉錄活性,減少p53四聚體的形成,阻止p53與它的靶基因p21和HDM2的增強子結合。目前P53對P21的調控作用已有充分的研究,我們將著重研究BCCIP對P53的調控作用。在前期數據的基礎上,為了進一步闡明BCCIP與P53之間的蛋白相互作用位點,本文擬設計實驗:構建BCCIP的真核和原核的表達載體,通過Co-IP和GST pull down等技術找出BCCIP與P53相結合的具體結構域。
1 材料與設備
1.1 實驗材料
1.1.1 主要化學試劑
乙二胺四乙酸二鈉(EDTA)、質粒小提試劑盒、瓊脂糖凝膠回DNA收試劑盒、丙烯酰胺、Tris、甘氨酸、十二烷基磺酸鈉(SDS)、D2000 plus DNA ladder、DL500 DNA marker、預染蛋白Marker SM0671、胎牛血清。
1.1.2 常用試劑成分
(1)LB液體培養基(1L):10g NaCl,5g酵母提取物,10g胰蛋白胨,調pH至7.4,高壓蒸汽滅菌。
(2)LB固體培養基(1L):LB液體培養基中加入15g瓊脂粉。
(3)SOC培養基(1L):20g胰蛋白胨,5g酵母提取物,2ml 5M NaCl,2.5ml 1M KCl,10ml 1M MgCl2,10ml 1M MgSO4,20ml 1M葡萄糖。
(4)Amp抗生素:1克Amp,10ml蒸餾水,濃度100mg/ml。
(5)DMEM培養基(1L):一包粉末DMEM培養基,800ml水,2g NaHCO3,10%血清。
(6)磷酸緩沖體系(PBS)(1L):NaCl 137mmol/L,KCl 27mmol/L,Na2HPO4 10mmol/L,KH2PO4 2mmol/L。用濃鹽酸調pH為7.4。
(7)胰酶:0.25g胰酶,100mlPBS,調PH為7.4。
(8)50×TAE buffer(1L):Tris 242g,冰乙酸57.1ml,0.5mol/L EDTA(pH 8.0)100ml。
(9)6×loading buffer(DNA電泳):30mM EDTA,36%(V/V)甘油。
(10)10×濕轉transfer buffer(1L):Tris 14.4g、甘氨酸3.02g、甲醇100ml。
(11)4×SDS-PAGE Loading Buffer(1L):量取1M Tris-HCl 10ml,稱取4g SDS,200mgBPB,20ml甘油。
(12)PBS(1L):1ml雙抗+999ml PBS。
1.2 實驗設備
低溫保存箱、藥品保存箱、-80℃冰箱、-40℃冰箱、PCR儀、恒溫臥式搖床、紫外分光光度計、超聲破碎儀、凝膠成像系統、電泳儀電源、水平電泳槽、迷你離心機、超凈工作臺、垂直混合器、低速離心機、可見光分析燈箱、恒溫培養箱、雙垂直蛋白電泳儀、臺式離心機、電子天平、渦旋混勻器、瓊脂糖凝膠電泳儀、洗片機、超純水機、制冰機、磁力攪拌器、脫色搖床。
2 實驗思路與方法
2.1 實驗研究思路
首先我們根據BCCIP和P53的蛋白結構域特征,分別構建了BCCIP和P53的不同截短真核表達質粒,然后在HCT116細胞中共轉BCCIP和P53的不同截短質粒,通過COIP實驗和免疫印跡檢測技術,確定BCCIP與P53相互作用的具體結構域。而后在HCT116細胞中瞬轉一定量的P53全長表達質粒和梯度劑量的BCCIP全長表達質粒,通過Western blot檢測BCCIP對P53蛋白的穩定性的影響;再用同樣的方法瞬轉不同的截短表達質粒,檢測BCCIP對P53相互作用結構域的穩定性影響,進而揭示BCCIP對P53的調控以及在癌癥中的生物學功能。
2.2 實驗研究方法
2.2.1 質粒構建
(1)設計BCCIP和P53的截短質粒引物,PCR選擇最佳退火溫度。(2)DNA電泳并做膠回收。(3)目的片段連接T載體。(4)大腸桿菌轉化,藍白斑篩選,挑菌。(5)PCR檢測,選擇電泳條帶正確的菌株進行小提。(6)送公司進行測序。(7)將連T的Insert和載體分別進行大切膠回收(先小切進行驗證)。(8)Insert與Vector連接。(9)質粒轉化,挑菌。(10)菌液PCR選取條帶位置正確的菌液進行小提。(11)送公司進行測序。
2.2.2 真核表達質粒Co-IP實驗
(1)在HCT116細胞中共轉BCCIP和P53的表達質粒。(2)瞬轉48小時后收細胞,RIPA裂解液4度裂解6小時。(3)12000rpm,4度,離心1小時,收集裂解后上清。(4)平衡beads,beads與細胞裂解液孵育過夜進行結合。(5)洗脫非特異蛋白,做樣,western blot檢測。
3 實驗結果分析
在細胞周期調控中,目前發現BCCIP通過3個途徑調節p21蛋白;在同源重組修復中,BCCIP除了通過BRCA2-RAD51蛋白通路外,還可能通過p21蛋白參與細胞周期和細胞周期檢查點的調節進而影響同源重組修復[3];在維持基因組穩定性方面,BCCIP下調引起細胞分裂中期染色體斷裂和姐妹染色單體交聯,從而影響細胞的有絲分裂,抑制細胞的增值。
One等[4]發現BCCIPα的161-259氨基酸區域與p21的C端149~164氨基酸和CDK2結合后形成三聚體。BCCIPα的過表達通過增強p21抑制CDK2組蛋白H1激酶活性的能力以達到抑制細胞增殖的目的。Meng等[5]發現在細胞內BCCIPβ與p21相互作用可以抑制細胞的生長,并且p21蛋白下調的細胞阻斷部分其抑制細胞生長的功能。用RNA干擾技術抑制BCCIP基因表達可引起p21蛋白水平下調,并且使HT1080細胞G1/S周期檢查點對電離輻射應答的功能受損。而過表達BCCIPα或BCCIPβ引起p21mRNA水平和蛋白表達的升高,延遲細胞的G1/S期。而增加p21蛋白的穩定性并不會引起BCCIP過表達對P21的影響。p21是p53下游的靶基因,p53是迄今發現與人類腫瘤相關性最高的基腫瘤抑制基因。在所有惡性腫瘤中,該基因有一半以上的概率發生突變。研究者推測p53可能與BCCIP對p21的調節相關,接下來的研究發現沉默p53基因表達后,BCCIP過表達不再引起p21水平升高,說明p53是BCCIP誘導p21表達的關鍵因素[6]。進一步研究發現,BCCIP對p53的轉錄活性起著關鍵的作用,在p53野生型細胞,p53蛋白水平不會因BCCIP蛋白的下調而變化,但是會引起p53轉錄活性的降低,減少p53四聚體的形成,阻止p53與它的靶基因p21和HDM2的增強子結合[7]。
本實驗根據BCCIP和P53的蛋白結構域特征,分別構建了BCCIP和P53的不同截短真核表達質粒;先用帶GFP熒光質粒瞬轉以測其瞬轉效率,證明其瞬轉效率沒有問題,然后在HCT116細胞中,通過瞬轉本實驗構建的質粒。我們檢測到質粒在HCT116細胞中瞬轉均表達,構建成功;再通過CO-IP實驗和免疫印跡檢測技術,驗證了BCCIP與P53之間的蛋白相互作用關系,進一步論證了BCCIP蛋白會影響DNA損傷的重組修復,G1/S細胞周期調控,細胞有絲分裂和基因組穩定性,這些都說明BCCIP與腫瘤的發生和腫瘤的治療有著密不可分的關系。
參考文獻:
[1]邱斌.BCCIP在非小細胞肺癌中的研究[D].北京:中國協和醫科大學,2006.
[2]劉曉霞,劉超英,李曉轅,等.BCCIP在卵巢惡性腫瘤的表達及臨床意義分析[J].中國免疫學雜志,2012(3):213-216.
[3]Meng X,Liu J,Shen Z.Genomic structure of the human BCCIP gene and its expression in cancer[J].Gene,2003,302(1-2):139-46.
[4]Ono T,Kitaura H,Ugai H,et al.TOK-1,a novel p21Cip1-binding protein that cooperatively enhances p21-dependent inhibitory activity toward CDK2 kinase[J].J Biol Chem.2000,275(40):31145-54.
[5]Meng X,Liu J,Shen Z.Inhibition of G1 to S cell cycle progression by BCCIP beta[J].Cell Cycle,2004,3(3):343-8.
[6]Meng X,Lu H,Shen Z.BCCIP functions through p53 to regulate the expression of p21Waf1/Cip1[J].Cell Cycle,2004,3(11):1457-62.
[7]Meng X,Yue J,Liu Z,Shen Z.Abrogation of the transactivation activity of p53 by BCCIP down-regulation[J].J Biol Chem,2007,282(3):1570-6.
基金:吉林大學2019年省級大學生創新創業項目(項目編號:201910183791)