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貴州小麥品種(系)籽粒低PPO活性種質(zhì)資源篩選

2020-05-11 06:06:33晏權(quán)任明見(jiàn)李振華徐如宏

晏權(quán) 任明見(jiàn) 李振華 徐如宏

摘要:【目的】篩選出小麥籽粒低多酚氧化酶(PPO)活性的種質(zhì)資源,為貴州小麥籽粒品質(zhì)的遺傳改良及育種提供參考依據(jù)。【方法】以生產(chǎn)中表現(xiàn)優(yōu)異的135份貴州小麥品種(系)為材料,采用苯酚染色法進(jìn)行染色,在此基礎(chǔ)上以STS分子標(biāo)記(PPO16、PPO18和PPO29)檢測(cè)小麥PPO活性相關(guān)基因,并通過(guò)Fragment AnalyzerTM毛細(xì)管電泳鑒定相關(guān)基因,進(jìn)而對(duì)小麥籽粒低PPO活性基因的組成進(jìn)行鑒定和篩選。【結(jié)果】135份小麥材料籽粒經(jīng)苯酚染色后,有4份材料未染色(A級(jí)),9份呈淺綠色(B級(jí)),65份材料呈棕色(C級(jí)),57份材料呈黑色(D級(jí))。STS分子標(biāo)記檢測(cè)結(jié)果表明,在A級(jí)和B級(jí)材料中檢測(cè)到10份材料含Ppo-A1b基因、4份材料含Ppo-D1a基因,其中4份材料同時(shí)含有Ppo-A1b/Ppo-D1a基因,分別是貴麥2號(hào)、惠水1-23、石無(wú)芒和08-9選單-2-7;在C級(jí)材料中檢測(cè)到3份材料含Ppo-A1b基因、17份材料含Ppo-D1a基因,其中1份材料(貴農(nóng)08-9)同時(shí)含有Ppo-A1b/Ppo-D1a基因;在D級(jí)材料中均未檢測(cè)到Ppo-A1b和Ppo-D1a基因。【結(jié)論】采用苯酚染色法結(jié)合STS分子標(biāo)記檢測(cè)可對(duì)小麥籽粒是否含低PPO活性基因進(jìn)行準(zhǔn)確鑒定。貴麥 2號(hào)、惠水1-23、石無(wú)芒、08-9選單-2-7和貴農(nóng)08-9等5份含有雙低PPO活性基因(Ppo-A1b/Ppo-D1a)的種質(zhì)資源,可作為親本材料直接用于小麥籽粒低PPO活性遺傳改良及新品種選育。

關(guān)鍵詞: 小麥;多酚氧化酶(PPO)活性;苯酚染色法;STS分子標(biāo)記

0 引言

【研究意義】小麥籽粒中的多酚氧化酶(Polyphenol oxidase,PPO)活性與面食加工產(chǎn)品色澤變化密切相關(guān),直接影響著面粉和面食制品的品質(zhì)及商品價(jià)值(司紅起,2008)。顏色是評(píng)價(jià)面食制品的重要指標(biāo),也是小麥品質(zhì)遺傳改良的重要目標(biāo)(孫道杰等,2005)。面食制品在醒面和保存期間發(fā)生褐變,主要是由于籽粒中的內(nèi)源酚酸被PPO氧化,且自身多肽氨基基團(tuán)聚合而形成褐色多聚體酚類物質(zhì),導(dǎo)致其品質(zhì)變差(何克勤,2006;鄭文寅等,2013)。培育和選擇低PPO活性的小麥品種(系)是改良小麥相關(guān)品質(zhì)性狀及防止其面食制品顏色發(fā)生褐變的有效方法(楊雪等,2014;Mangini et al.,2014;Rodriguez-Suarez and Atienza,2014),而從眾多小麥材料中篩選出低PPO活性的種質(zhì)資源是進(jìn)行小麥面食制品外觀品質(zhì)改良的關(guān)鍵。【前人研究進(jìn)展】小麥加工過(guò)程中面粉顏色會(huì)發(fā)生褐變,其中50%~70%的褐變由籽粒中的PPO所造成(常成等,2007)。Jukanti等(2004)通過(guò)分析小麥籽粒cDNA文庫(kù)中的EST(Expression sequence tags)序列CA716843,得到一段與PPO基因緊密聯(lián)系的序列。孫道杰等(2005)在此基礎(chǔ)上篩選出一對(duì)存在191 bp片段差異的引物,并最終開(kāi)發(fā)出適用于小麥籽粒PPO活性輔助選擇的SSR分子標(biāo)記(PPO18)。此外,有研究表明,控制普通小麥籽粒PPO活性表型變異的兩個(gè)主效基因分別位于2AL和2DL染色體上(張立平等,2005;Raman et al.,2005;Fuerst et al.,2006)。He等(2007)利用電子克隆技術(shù)對(duì)國(guó)內(nèi)普通小麥進(jìn)行研究時(shí)獲得一對(duì)等位基因,將其命名為Ppo-A1和Ppo-D1,并根據(jù)克隆的基因設(shè)計(jì)互補(bǔ)顯性標(biāo)記PPO16和PPO29,同時(shí)發(fā)現(xiàn)這對(duì)基因分別控制著小麥籽粒PPO活性,其中,Ppo-A1b和Ppo-D1a基因類型為低活性,Ppo-A1a和Ppo-D1b基因類型為高活性。肖永貴等(2008)運(yùn)用PPO18、PPO16和PPO29等3個(gè)分子標(biāo)記對(duì)我國(guó)4個(gè)麥區(qū)的冬小麥品種(系)進(jìn)行PPO基因檢測(cè),結(jié)果證實(shí)這3個(gè)分子標(biāo)記的檢測(cè)方法操作簡(jiǎn)便,且效果穩(wěn)定,能很好地反應(yīng)PPO活性。孫樹(shù)貴等(2013)研究也發(fā)現(xiàn)使用分子檢測(cè)技術(shù)能準(zhǔn)確鑒定小麥PPO活性。目前,PPO活性的測(cè)定方法主要有染色法、分光光度法、色譜法和精密計(jì)時(shí)測(cè)定法等(司紅起,2008;祝梓博,2017)。孫家柱等(2010)利用苯酚染色法對(duì)小麥進(jìn)行PPO活性檢測(cè)和分級(jí),證實(shí)該方法費(fèi)用成本低、操作簡(jiǎn)便、鑒別力較強(qiáng)且結(jié)果重復(fù)性好,可在實(shí)際生產(chǎn)中特別是基層推廣應(yīng)用;此外,通過(guò)與分子標(biāo)記結(jié)果對(duì)比,發(fā)現(xiàn)苯酚染色結(jié)果能更好地反映PPO活性,尤其是低PPO活性材料(孫家柱等,2012)。因此,采用染色法與分子檢測(cè)技術(shù)相結(jié)合的檢測(cè)方法更有利于低PPO活性小麥品種(系)育種工作的開(kāi)展。【本研究切入點(diǎn)】選育低PPO活性小麥種質(zhì)資源是改良小麥籽粒性狀和品質(zhì)育種的重要途徑,但目前有關(guān)貴州小麥籽粒PPO活性的研究鮮見(jiàn)報(bào)道。【擬解決的關(guān)鍵性問(wèn)題】采用苯酚染色法結(jié)合STS分子標(biāo)記檢測(cè)對(duì)生產(chǎn)中表現(xiàn)優(yōu)異的135份小麥品種(系)籽粒PPO活性基因組成進(jìn)行鑒定,旨在篩選出含有低PPO活性的種質(zhì)資源,為貴州小麥籽粒品質(zhì)的遺傳改良及育種提供參考依據(jù)。

1 材料與方法

1. 1 試驗(yàn)材料

供試的135份小麥材料(表1)部分由國(guó)家小麥改良中心貴州分中心選育提供,其他材料則從貴州省貴陽(yáng)、興義、安順和惠水等地收集。DNF-910 dsDNA Kit/s試劑盒購(gòu)自成都百樂(lè)科技有限公司;2×Taq PCR MasterMix反應(yīng)試劑購(gòu)自生工生物工程(上海)股份有限公司;D2000 DNA Marker購(gòu)自貴州彌勒天根生物科技有限公司;50×TAE溶液購(gòu)自北京索萊寶科技有限公司。主要儀器設(shè)備:Genova Nano分光光度計(jì)(Jenway,英國(guó))、T100TM_Thermal Cycler PCR儀(BIO-RAD,美國(guó))、Fragment AnalyzerTM全自動(dòng)毛細(xì)管電泳系統(tǒng)(AATI,美國(guó))、高速離心機(jī)(Thermo,美國(guó))、水平電泳槽(DYCP-32B,北京六一儀器廠)、電泳儀(DYY-6C,北京六一生物技術(shù)有限公司)、電熱恒溫水浴鍋(DK-98-Ⅱ,天津泰斯特儀器有限公司)、高速冷凍離心機(jī)(Thermo,美國(guó))和搖床(GS-20,杭州米歐儀器有限公司)。

1. 2 小麥籽粒苯酚染色檢測(cè)

參照孫家柱等(2010)的方法進(jìn)行苯酚染色檢測(cè)。選取15粒小麥籽粒置于培養(yǎng)皿中,加水浸泡約18 h,吸干水后加入0.2%苯酚溶液,于室溫下靜置4 h后目測(cè)籽粒的染色情況,對(duì)其PPO活性水平進(jìn)行分級(jí)記錄。所有苯酚染色于同一時(shí)間內(nèi)(含2次重復(fù))完成,根據(jù)籽粒染色程度按不染色、淺綠色、棕色和黑色,分別判定為A、B、C和D級(jí)。

1. 3 基因組DNA提取及STS分子標(biāo)記檢測(cè)

采用CTAB法提取供試小麥葉片DNA(徐如宏等,2005),以分光光度計(jì)檢測(cè)其濃度和純度,保證OD260/OD280約為1.8,然后稀釋至100 ng/μL作為模板備用。利用位于2A和2D染色體上的STS分子標(biāo)記PPO16、PPO18和PPO29檢測(cè)小麥PPO活性相關(guān)基因,引物序列及相關(guān)信息詳見(jiàn)表2。PCR反應(yīng)體系20.0 μL:含2×Taq PCR MaserMix 7.0 μL,上、下游引物各1.0 μL,DNA模板2.0 μL,ddH2O補(bǔ)足至20.0 μL。擴(kuò)增程序:94 ℃預(yù)變性5 min,94 ℃ 45 s,60/64 ℃ 45/50 s,72 ℃ 1 min,進(jìn)行37/40個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物利用1.5%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè),電泳緩沖體系0.5×TAE,120 V下電泳50 min,于紫外燈下觀察、照相并記錄。

1. 4 Fragment AnalyzerTM毛細(xì)管電泳檢測(cè)

根據(jù)目標(biāo)條帶的范圍選擇DNF-910-FR(35-1500 bp)試劑盒進(jìn)行Fragment AnalyzerTM毛細(xì)管電泳檢測(cè),將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物加入到樣品槽中,按Fragment AnalyzerTM全自動(dòng)毛細(xì)管電泳檢測(cè)儀操作規(guī)程進(jìn)行運(yùn)行,電泳結(jié)束后以PROSize 3.0進(jìn)行分析。

2 結(jié)果與分析

2. 1 苯酚染色結(jié)果分析

利用苯酚染色法浸染135份小麥材料籽粒,結(jié)果表明,4份材料未染色(圖1-A),為A級(jí);9份呈淺綠色(圖1-B),為B級(jí),說(shuō)明這13份染色較淺的材料攜帶低PPO活性基因的可能性較大;65份材料呈棕色(圖1-C),為C級(jí);57份材料呈黑色(圖1-D),為D級(jí),說(shuō)明這122份材料攜帶低PPO活性基因的可能性較小。

2. 2 PPO基因分子標(biāo)記檢測(cè)結(jié)果

2. 2. 1 Ppo-A1位點(diǎn)基因型分布 利用PPO18分子標(biāo)記檢測(cè)Ppo-A1位點(diǎn)基因,擴(kuò)增產(chǎn)物大小分別為685 bp(高PPO活性)和876 bp(低PPO活性),對(duì)應(yīng)的等位變異類型為Ppo-A1a和Ppo-A1b(陳杰等,2013)。本研究的擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)在750 bp附近出現(xiàn)兩條條帶(圖2),以Fragment AnalyzerTM毛細(xì)管電泳檢測(cè)可知這兩條條帶對(duì)應(yīng)為685 bp(圖3-A)和876 bp(圖3-B),說(shuō)明利用PPO18分子標(biāo)記可檢測(cè)Ppo-A1基因等位變異類型。在135份小麥材料中,有37份材料擴(kuò)增出685 bp的條帶,為Ppo-A1a等位變異類型;13份材料擴(kuò)增出876 bp的條帶,為Ppo-A1b等位變異類型;其他材料未擴(kuò)增出任何條帶,即未含Ppo-A1a和Ppo-A1b等位變異類型。綜上所述,135份材料中含有Ppo-A1b基因類型(低PPO活性)的材料較少,僅13份(占9.63%),分別是分枝麥5號(hào)、貴麥2號(hào)、貴農(nóng)10-6、惠水1-23、豐優(yōu)8號(hào)、石無(wú)芒、08-9選單-2-7、貴農(nóng)08-6-3、TP08-6-8、貴農(nóng)08-6-2-1、貴農(nóng)08-9、張10選-4和豐優(yōu)5號(hào)。

2. 2. 2 Ppo-D1位點(diǎn)基因型分布 在Ppo-D1位點(diǎn)上,STS分子標(biāo)記引物PPO16可擴(kuò)增出713 bp的Ppo-D1a基因片段,而引物PPO29無(wú)任何擴(kuò)增產(chǎn)物;STS分子標(biāo)記引物PPO29可擴(kuò)增出490 bp的Ppo-D1b基因片段,而引物PPO16無(wú)任何擴(kuò)增產(chǎn)物(陳杰等,2013)。可見(jiàn),用于檢測(cè)Ppo-D1位點(diǎn)的STS分子標(biāo)記PPO16和PPO29可相互補(bǔ)充和驗(yàn)證。本研究的擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)在700和500 bp附近分別出現(xiàn)明顯的條帶(圖4-A和圖4-B),以Fragment AnalyzerTM毛細(xì)管電泳檢測(cè)可知這兩條帶對(duì)應(yīng)為713 bp(圖5-A)和490 bp(圖5-B)。在135份小麥材料中,有66份材料擴(kuò)增出490 bp的條帶,為Ppo-D1b等位變異類型;21份材料擴(kuò)增出713 bp的條帶,為Ppo-D1a等位變異類型;其他材料未檢測(cè)到含Ppo-D1a和Ppo-D1b等位變異類型。綜上所述,135份材料中含有Ppo-D1a基因類型(低PPO活性)的材料21份(占15.56%),分別是貴麥2號(hào)、惠水1-23、石無(wú)芒、08-9選單-2-7、163選-1、興育206、TP中分08-6選-11、貴農(nóng)33-12、貴農(nóng)08-9、貴農(nóng)08-7-3、XU-5-2、安2014-4、10-4-3-1、吉麥1號(hào)、黔990315、張07-10-6、張08-1-2-1、Y-4-1、貴麥1號(hào)、163-25和張10選42。

2. 2. 3 Ppo-A1和Ppo-D1位點(diǎn)基因型分布 135份小麥材料的Ppo-A1和Ppo-D1基因位點(diǎn)檢測(cè)結(jié)果如表3所示。2個(gè)位點(diǎn)基因類型共有4種,分別為Ppo-A1a/Ppo-D1a(中間型)、Ppo-A1b/Ppo-D1b(中間型)、Ppo-A1a/Ppo-D1b(高PPO活性)和Ppo-A1b/Ppo-D1a(低PPO活性)。4種等位變異類型的小麥材料分別有3、3、24和5份,其余材料只檢測(cè)到單個(gè)基因或未檢測(cè)到任何PPO基因。可見(jiàn),135份小麥籽粒中大多數(shù)材料不含PPO基因或含單個(gè)基因類型,具有雙低PPO活性類型的材料僅有5份,分別是貴麥2號(hào)、惠水1-23、石無(wú)芒、08-9選單-2-7和貴農(nóng)08-9。

對(duì)比苯酚染色結(jié)果和STS分子標(biāo)記檢測(cè)結(jié)果,發(fā)現(xiàn)在苯酚染色較淺(A級(jí)和B級(jí))的13份材料中有10份材料含Ppo-A1b基因,4份材料含Ppo-D1a基因,其中4份材料同時(shí)含有Ppo-A1b/Ppo-D1a基因;苯酚染色較深的C級(jí)材料中檢測(cè)到3份材料含Ppo-A1b基因、17份材料含Ppo-D1a基因,其中1份材料同時(shí)含有Ppo-A1b/Ppo-D1a基因;染色最深的D級(jí)材料中均未檢測(cè)到Ppo-A1b或Ppo-D1a基因。綜合兩種鑒定結(jié)果(表3)可知,共有13份材料含有Ppo-A1b基因、21份材料含Ppo-D1a基因,其中5份材料同時(shí)含Ppo-A1b/Ppo-D1a基因,分別來(lái)自A、B、C級(jí)材料。

3 討論

苯酚染色是目前最常用的底物染色法。孫家柱等(2012)研究表明,級(jí)別為0、1和2級(jí)的材料中PPO基因的雙低組合占92.9%,特別是對(duì)低PPO活性材料的選擇,苯酚染色結(jié)果與基因型分子標(biāo)記檢測(cè)結(jié)果幾乎完全吻合。本研究結(jié)果表明,STS分子標(biāo)記檢測(cè)到13份材料含有Ppo-A1b基因,其中10份材料來(lái)自苯酚染色較淺的A級(jí)和B級(jí)材料,而苯酚染色最深的D級(jí)材料中均未檢測(cè)到Ppo-A1b基因,與張立平等(2005)、孫家柱等(2012)的研究結(jié)論基本一致,說(shuō)明含有Ppo-A1b基因的材料相對(duì)其他基因而言,其苯酚染色程度均不高。但需要注意的是,苯酚染色法鑒定過(guò)程中由于染色程度接近,在劃分B級(jí)和C級(jí)時(shí)可能會(huì)造成主觀判斷誤差。在本研究中有3份含Ppo-A1b基因的材料來(lái)自染色較深的C級(jí),其中還有1份材料(貴農(nóng)08-9)同時(shí)含有Ppo-A1b/Ppo-D1a基因,因而對(duì)于染色較深的C級(jí)材料有必要利用分子標(biāo)記做進(jìn)一步鑒定。此外,Mangini等(2014)在四倍體小麥中開(kāi)發(fā)了新標(biāo)記MG18,且認(rèn)為與PPO18分子標(biāo)記相比,MG18分子標(biāo)記能有效檢測(cè)四倍體小麥Ppo-A1位點(diǎn)上的4個(gè)不同等位基因[Ppo-A1b(低活性)、Ppo-A1e(高活性)、Ppo-A1f(高活性)和Ppo-A1g(低活性)]的分布情況,在針對(duì)不同小麥材料的PPO活性基因篩選時(shí)可結(jié)合這一分子標(biāo)記進(jìn)行分子鑒定,以提高選擇的準(zhǔn)確性。因此,在實(shí)際工作中,可利用苯酚染色法對(duì)小麥籽粒PPO活性進(jìn)行初篩,淘汰染色最深的D級(jí)材料后,再利用更有效的多種分子標(biāo)記確認(rèn)A、B、C級(jí)材料中PPO活性基因的組成,進(jìn)而降低成本和提高育種工作效率。

本研究共篩選到含有低PPO活性基因的材料29份,占21.48%,其中含有雙低PPO活性基因的材料5份,占3.70%。說(shuō)明這批篩選的小麥材料中含有雙低PPO活性基因的種質(zhì)資源較少,與蘆靜等(2012)在新疆地區(qū)、陳杰等(2013)在黃淮地區(qū)的研究結(jié)果基本一致。對(duì)于含有雙低PPO活性基因的材料,可直接作為品質(zhì)改良的親本材料應(yīng)用于小麥品質(zhì)育種研究,而其他含有單個(gè)低PPO活性基因的材料可通過(guò)復(fù)交方式進(jìn)一步選育出含有雙低PPO活性基因的種質(zhì)材料。此外,今后有必要加大對(duì)含有雙低PPO活性基因種質(zhì)資源的引進(jìn),為選育含雙低PPO活性基因的小麥品種提供支撐。

4 結(jié)論

采用苯酚染色法結(jié)合STS分子標(biāo)記檢測(cè)可對(duì)小麥籽粒是否含低PPO活性基因進(jìn)行準(zhǔn)確鑒定。貴麥2號(hào)、惠水1-23、石無(wú)芒、08-9選單-2-7和貴農(nóng)08-9等5份含有雙低PPO活性基因(Ppo-A1b/Ppo-D1a)的種質(zhì)資源,可作為親本材料直接用于小麥籽粒低PPO活性遺傳改良及新品種選育。

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(責(zé)任編輯 蘭宗寶)

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