甜菜分子標記InDel-PCR引物的篩選

魏茜雅，劉乃新，吳則東，邳植，興旺

（黑龍江大學現代農業與生態環境學院，哈爾濱150080）

0 引言

糖用甜菜是我國主要經濟作物之一,是我國東北、西北、華北地區制糖的主要工業原料,在三北地區甜菜在農業產業結構調整和發展地方經濟中占有重要地位。但由于中國不是甜菜起源國,缺少種質資源，再加之相關研究和資源積淀較薄,所以我國的甜菜研究水平整體落后。而隨著基因組學研究的飛速發展,分子標記育種成為作物遺傳改良的重要途徑之一，新的分子標記不斷被開發和廣泛應用，從而加速了作物基因組輔助育種和設計育種的進程[1]。

甜菜分子標記技術近年來發展較快，已經有多種分子標記技術應用到甜菜的育種工作，如SSR[2]、ISSR[3-4]、AFLP[4-5]、RAPD[5]以及RFLP[6]等。InDel（Insertion-deletion）標記是基于同一物種不同個體基因組的同源序列發生核苷酸片段的插入或者缺失，也是通過對DNA同源序列比對產生空位的現象，根據基因組中插入缺失位點，設計一些擴增這些插入缺失位點的PCR-引物，其本質仍屬于長度多態性遺傳標記[7-8]。InDel作為一種高通量遺傳標記，具有基因組內分布廣泛、帶型簡單、重復性好、準確性高、變異穩定、密度高、數目眾多等特點，與其他分子標記相比，在基因組的同一位置出現相同大小的InDel標記的概率非常低，避免了由于特異性和復雜性導致的后續分析模糊；在作物種質資源遺傳多樣性分析中，可顯著提高其重現性、準確性和分辨率，因此能解決引種材料中名稱混亂不清、種質資源整理困難、親本材料間遺傳重復度高等問題[7-9]；……