植物三維染色質(zhì)構(gòu)型研究進(jìn)展

董芊里，王金賓，李曉寵，宮磊

綜述

植物三維染色質(zhì)構(gòu)型研究進(jìn)展

董芊里，王金賓，李曉寵，宮磊

東北師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院，分子表觀遺傳學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，長春 130024

染色質(zhì)在細(xì)胞核內(nèi)的纏繞、折疊及其在細(xì)胞核內(nèi)的空間排布是真核生物染色質(zhì)構(gòu)型的主要特征。在經(jīng)典DNA探針熒光原位雜交顯微觀察的基礎(chǔ)上，基于新一代測(cè)序技術(shù)的Hi-C及ChIA-PET染色質(zhì)構(gòu)型捕獲技術(shù)已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于動(dòng)物及植物細(xì)胞核染色質(zhì)構(gòu)型的研究中，并以新的角度定義了包括：染色體(質(zhì))域(chromosome territory)、A/B染色質(zhì)區(qū)室(compartment A/B)、拓?fù)渑悸?lián)結(jié)構(gòu)域(topological associated domains, TADs)、染色質(zhì)環(huán)(chromatin loops)等在內(nèi)的多個(gè)更為精細(xì)的染色質(zhì)構(gòu)型。利用以上兩種主流技術(shù)，越來越多的植物物種染色質(zhì)構(gòu)型特征被鑒定、分析和比較。本文系統(tǒng)分析和總結(jié)了近年來以植物細(xì)胞為模型的細(xì)胞核染色構(gòu)型領(lǐng)域取得的重要成果，包括各級(jí)染色質(zhì)構(gòu)型特征的組成、建立機(jī)制和主要影響因素等。在此基礎(chǔ)上，分析了目前研究植物染色質(zhì)構(gòu)型技術(shù)的瓶頸和突破性的技術(shù)進(jìn)展，并對(duì)后續(xù)研究主要關(guān)注的問題和研究內(nèi)容進(jìn)行了展望，以期為相關(guān)領(lǐng)域的研究提供更多的理論參考和依據(jù)。

染色質(zhì)構(gòu)型；高通量染色質(zhì)構(gòu)象捕獲測(cè)序；末端配對(duì)標(biāo)簽測(cè)序；染色質(zhì)區(qū)室；拓?fù)渑悸?lián)結(jié)構(gòu)域

染色質(zhì)(chromatin)是由基因組DNA與組蛋白等結(jié)構(gòu)性蛋白通過不同層級(jí)的纏繞而形成[1]。作為真核生物遺傳物質(zhì)的載體，染色質(zhì)需要填充在微米級(jí)的狹小細(xì)胞核中。其纏繞、折疊及染色質(zhì)在細(xì)胞核空間內(nèi)的不同排布模式，組成了染色質(zhì)空間構(gòu)型(chromatin architectures)研究的主要內(nèi)容。……